Os12g0578400
| Gene Name |
Os12g0578400 |
|---|---|
| Description |
Glycoside hydrolase family 79, N-terminal protein |
| Version |
NM_001073654.1 GI:115489269 GeneID:4352626 |
| Length |
4248 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0578400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:24135117..24139364 |
| Sequence Coding Region |
24136243..24136452,24136549..24136585,24136999..24137182,24137345..24137493,24137597..24137827 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaggctatggtttctcatacctcttcttctctgtttccctacattgattcgatccgaggattactcggatgtgaccatcgtcgttcggggtgctgagacgatcgcttcgaccagcaacgagttcatttgcgccaccattgattggtggcctccagagaagtgcaattatgaccagtgtccatgggggcaagcttctatcttaaatttggacttgactaatcctttgctagctaaagctatccaagcctttagccctctacgtatcagacttggaggttccttacaagatcaggtggtgtatggcacgccgaatttaggatctccatgcaccccattttcaaagagttcaagtggcctgtttggattttctcaaggatgcataaccatggaaagatgggatgctattaataagatctttatggatacaggtgcagttgttacattcggccttaacgcgcttcaagggcgacagcagatgggcagaggtgtttggggaggtgcttggaattccagtaatgctcgggagttcatggagtacactgtttcgatgaactaccctatagactcatgggaatttggtaatgagttgagtggaagtggaattggtgcaagtgttggagctgaacaatatggaaaagatataattgagctcaagaacatcatcagccagttatatggaaactctaggaaaccattggtggttgccccaggaggattctatgaccaaaaatggtatgctcagcttcttgatatctctggtccaaatgttctcgacacaatgactcatcatatttacaatcttggtgctggtaacgatccgcaagttgcaaataggatcttgaatccgcagtatttgagccagagctctgatacattcagagatctccaaatgacgatacagcggcatggaccatggtctgctccctgggttggggaagctggtggtgcatataacagtggcagccgaaaagtgtctaatactttcctgaatagcttctggtatcttgatcagcttggtcagtcagcaaagtatgacacaaaggtttactgcagacagactttgattggaggcaactatggccttcttgataccgaaacttttgttccaaaccctgattactacagtgccttgctgtggcatcggctcatggggaagggagttatttccttagacaccagcggttcttcgtacttgcgtgcctatgcgcattgcggaaagcaaaagggcggcgtcgcgctcctcatgctcaacctgaacaagaacatgggattcatggtctcagtcagaaatgacctcaacattaatttcagagaaatggcagggataaagagggacaactcctttgtccatggcctgaagaggacagtctcctgggttgggagcaaagcctcggatgggctggagaagagggaggagtaccatctgactccacaggatggcaacccttttgccaggacagtgctgctcaatggagctcctcttcagctcactggagatggtgacatcccttcactgccaccagtgatggtctcagtcaattccccaatctatgtcgccccgctgtcgatcgcgttcgtcgtcttcccagatttcgaggctgaaggttgcgaacgatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRLWFLIPLLLCFPTLIRSEDYSDVTIVVRGAETIASTSNEFIC ATIDWWPPEKCNYDQCPWGQASILNLDLTNPLLAKAIQAFSPLRIRLGGSLQDQVVYG TPNLGSPCTPFSKSSSGLFGFSQGCITMERWDAINKIFMDTGAVVTFGLNALQGRQQM GRGVWGGAWNSSNAREFMEYTVSMNYPIDSWEFGNELSGSGIGASVGAEQYGKDIIEL KNIISQLYGNSRKPLVVAPGGFYDQKWYAQLLDISGPNVLDTMTHHIYNLGAGNDPQV ANRILNPQYLSQSSDTFRDLQMTIQRHGPWSAPWVGEAGGAYNSGSRKVSNTFLNSFW YLDQLGQSAKYDTKVYCRQTLIGGNYGLLDTETFVPNPDYYSALLWHRLMGKGVISLD TSGSSYLRAYAHCGKQKGGVALLMLNLNKNMGFMVSVRNDLNINFREMAGIKRDNSFV HGLKRTVSWVGSKASDGLEKREEYHLTPQDGNPFARTVLLNGAPLQLTGDGDIPSLPP VMVSVNSPIYVAPLSIAFVVFPDFEAEGCER</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1127..1336#1433..1469#1883..2066#2229..2377#2481..2711#2816..3005#3090..3212#3297..3399#3624..4016#ctacttcctcaagaatctctcctcttcttttctatccaagaaccgctcaaaagctcgaaccttgcgcaatctttttaaatcctcccgaccatttcctccgggtttgattctgggcagagattgcgaggggaaagatacgagcttttcttggcttctttcccctgcattgggaaagatacgagctgttgctgttcttgggaagaacagcttgggacattcttgggttggggtttgattcccaggtaatggaactcttcttggtttctcttggattccgtgcagtatttctgctgtttttagtatataaatctgtggcaaattacgctgcgcctgtgttggctttggttgtggttgcttcatttggtttcagtttgttcgagccttcgaggatttgattctgtttaggtgcagttttggaggaagttgggttagcgtgttccatcagccagtttgagaagtttttgttaattcgatgttcagattctgctgggtttattttgggttttgctgaactttattctatgtcagagaaactttgatcttcagctttctcgaatttgagcagaaatggcgtgctcaggtcgatcgtttgcatgttgaaaaggattcctttcttcaagtttcagggtcctctttgcagtttgggatgattttgccaactgcagaatttcaccctgctcaactgataaactttcccctttcttcaatgaaatatcctttctttctttctttcttttttttttttgcattttgttgtttagtgctagttcatggatgatttcctcaaatgttaaaagaattatatttctctggatactgcatttggagatgcctaagttgctccaataattgagatagtaacatagttgtttacttgcatggaaacaaagtttaaactgttcgtttgtaattgatttgacctgttaaacatgtaaatataggacatatagaagatgatgatagggcaggtgtcactttcatccatgttgataaaattaaaacttaaggccttctccttagtccttaccaactagtagttgccttatttaattagcacaataaatctgagacatttctggttgtcttttgggttgggtggacaacaccatttgcaggggaagaaagcatgaggctatggtttctcatacctcttcttctctgtttccctacattgattcgatccgaggattactcggatgtgaccatcgtcgttcggggtgctgagacgatcgcttcgaccagcaacgagttcatttgcgccaccattgattggtggcctccagagaagtgcaattatgaccagtgtccatgggggcaagcttctatcttaaatttggtaaattgctaatttcccaagaatgtgtgtgttttatcatgttgtaattgatatttttgcaaagaactaattttgatccttttgtgaatttcccaggacttgactaatcctttgctagctaaagctatccaaggtgaatattatacctattttctgcgaacaattttctactgtaactaaaaaaaatggacaacagtagggaatttccatactaaattgcaaataggattaaagttacaaagtcaaagactcaaagaattcttgtcaaagatttatctgttcctttgcaactacatatgccagcaactgtgatcaatttcattctaccgtgtggaggtttacttgttacactgactaatataagatattagagggtaaatcccgttttaagaaacatattgacatttgtggttcattctgtacctttatttattaagcttggaatttgtttagagctactttccacaaaatgtatttgccttcttatggttttctacactttcccatgattcatggactttttttcccatttatttgtttttgtagcctttagccctctacgtatcagacttggaggttccttacaagatcaggtggtgtatggcacgccgaatttaggatctccatgcaccccattttcaaagagttcaagtggcctgtttggattttctcaaggatgcataaccatggaaagatgggatgctattaataagatctttatggatacagggtaaggccttccttctccagtagtttctgatgtgcattcttttttctgtagtgaattctgatatattataagataaattgttgaccacatcacaaatcggaacctatcatataccttcattaagtgtgtttcctgacccattttttcatttaatcccttcagtgcagttgttacattcggccttaacgcgcttcaagggcgacagcagatgggcagaggtgtttggggaggtgcttggaattccagtaatgctcgggagttcatggagtacactgtttcgatgaactaccctatagactcatgggaatttggtatgaattataaaaactaaaaccttcatttgctgcctacaatgagtcagaagcatcggtcatttgtgtaatccttacatcagtagttgtgcttatgtactaggtaatgagttgagtggaagtggaattggtgcaagtgttggagctgaacaatatggaaaagatataattgagctcaagaacatcatcagccagttatatggaaactctaggaaaccattggtggttgccccaggaggattctatgaccaaaaatggtatgctcagcttcttgatatctctggtccaaatgttctcgacacaatgactcatcatatttacaatcttggtgctggtaagtacttcctagatataatgttagaaccactccttaattcatctttgtttttaggttgtactacacatttaagatgactgacataaaccaaattttattaggtaacgatccgcaagttgcaaataggatcttgaatccgcagtatttgagccagagctctgatacattcagagatctccaaatgacgatacagcggcatggaccatggtctgctccctgggttggggaagctggtggtgcatataacagtggcagccgaaaagtgtctaatactttcctgaatagcttctggtaattacttgccagttcaacagataattattccaaccatggggatttttcttgttttgttcgtaaacttgctgtttcaactaggtatcttgatcagcttggtcagtcagcaaagtatgacacaaaggtttactgcagacagactttgattggaggcaactatggccttcttgataccgaaacttttgttccaaaccctgattactacaggcaagtattcctatactttgctctgccacaatcatgctttactaccctatataccttttgtactaaaccgcggtatatgttcagtgccttgctgtggcatcggctcatggggaagggagttatttccttagacaccagcggttcttcgtacttgcgtgcctatgcgcattgcggaaagcaaaaggtatgaaccatgatgagtccaaagaaagaattcggttacctacccatttacttccagatacctgaaacaacctaagatgaaactgtaatgctgccatgttatctttttggtaacacaagcatagtactacagtgttctagcatcatatattcatgtggttgattaaactgaaagtgaagataggctgacctatatgctctcgaaatggtttttccgtgctacagggcggcgtcgcgctcctcatgctcaacctgaacaagaacatgggattcatggtctcagtcagaaatgacctcaacattaatttcagagaaatggcagggataaagagggacaactcctttgtccatggcctgaagaggacagtctcctgggttgggagcaaagcctcggatgggctggagaagagggaggagtaccatctgactccacaggatggcaacccttttgccaggacagtgctgctcaatggagctcctcttcagctcactggagatggtgacatcccttcactgccaccagtgatggtctcagtcaattccccaatctatgtcgccccgctgtcgatcgcgttcgtcgtcttcccagatttcgaggctgaaggttgcgaacgatgatttcgagtttagatagaaatatcatgaggtttttcttttctgatgtgatgatataggtgttctcagggttacatccactgtaaagatttttctgtgtttctagttttttccccaattgggctatatatagaataacttgattccagtgtttactgatcagtatgtagcaagcctgcagttccattcccttctatgtttggttgggtcacaatgaagcacatttgatgtagtg</dnaseqindica> |
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