BGIOSGA008340
| Gene Name |
BGIOSGA008340 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:001-114-F01, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008340, complete gene. |
| LocusTag |
P0458B05.20 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA008340-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA008340-PA |
| Length |
8958 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:20667481..20676438 |
| Sequence Coding Region |
20667481..20668035,20668103..20668236,20668331..20668466,20668936..20668989,20669061..20669201 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:20667481..20676438 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGAAGGAGAGGGGAAGGGAGGAGCAGGTGGCGACGGTGCGCGCGGTGCTCGGCGATGGGACGCCGGAGATGGACATCATCCGCGCGCTCCACATGGCCGGCGACGACCCCACCAGGGCCATCAACATCCTCCTCGACTTTCCCCACGGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCACCGTCGCCGTCGCCTTCGCCTCCGGCGGGTAAACCCACCAAACCCCACCCCGAATCGACCCCGCCAACCAAAACCCCTGCCCGTTCGAAGCCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGAGAAACCTAGGCCCAGTGTCGCGCCCGAATCCACCAATGGCGGCGGCGGCGGCGAACATTGGTGGTTGGTGGGGAGCGTGGAGATGGCGGGGCTGTCCACGTGCAAGGGCCGGCGCGTTGCCTCCGGGGATGCCGTCACTTTCTCGTTCCCCAACTCCCCGGTCGCCGCCGCCGCCGGGGGCAAGAGCCGTTCCGGCCGCCCCGCCCTCGTTTCCTGCTCCTCCGAGATCATGCGCTTCTCCACCCCGCGCCATGGGGAGGTCGGTCGAATCCCCAATGAATGGGCGAGGTGCCTGCTCCCCCTTCTCAAGGAGGGGAAGATAAAAATCGATGGCGTATGCAAATCCGCTCCCGAAGTACTTAGCATCATGGACACTGTCCTCTTGTCCGTAAGTGTCTACATCAACAGCTCAATGTTTCATGGCCAAAAGCAATCGACACCCAAGGCTGCTCGGGCTGCTACCGAGGATTCCACGTTTCATCCGCTGCCTGCACTTTTCAAGTTAACTGGTCTTTCGCCCTTTAAGAAGGCAGCATTTACTCCAGAAGATCTCTATTCCAGAAAGCGTCCGCTTGAAACAAAGAGCAGTGCACCTGCCACAAAGTTGACTACTGAGAAGTTGAGATTATCGTCTGATGGAAACGAAGATGATCATGCTGAAAGAATTGTTTCAGATTCAGAATTGGATGATATAATTGGAATCTCAGACAGTTCTGCTTTGGAGGAAAGGGACCCCCCTGATGCTCTGCAGTGTGATTTACGCCCTTATCAGAAGCAGGCACTTTATTGGATGATGCAGCTTGAGAAAGGCAGTTCTTCTCAGGATGCAGCTACAACGCTGCACCCTTGTTGGGAGGCATATAAACTCGAGGACAAGAGGGAGCTTGTTTTATACTTGAATGTATTTTCAGGCGATGCCACCACTGAATTTCCTAGTACACTGCAACTTGCAAGAGGAGGGATTCTGGCAGATGCAATGGGACTGGGGAAGACTATTATGACAATAGCTCTTCTTCTTGCCGACTCTAGCAAAGGATGCATCACTACTCAGCATTCTACTCACATATGTGAAGAAGCTAGTGGACTGGGTGAATTGCCAGTTCAGCCTCATGATGATGTGAAGAAGCTAGCTATCCCTTTCTCTTTTAGTAAGCTTAGGAAACCTAAAACCCCGCTTATTGCAGGCGGCAATCTAATTGTCTGCCCAATGACACTACTTGGTCAGTGGAAGGCAGAAATTGAAGCTCATGCTACACCAGGTTCTGTAAGTATATATGTTCATTATGGGCAAAACAGACCAAAAGAAGCAAACCTTATTGGTCAGAGTGATATTGTCCTGACTACATATGGTGTTCTGTCATCGGAATTTTCAAACGAGAATTCAACAGAAAGTGGGGGTCTGTACTCTATACATTGGTTTAGAGTTGTGCTGGATGAAGCACACATGATAAAATCTCCCAAAAGTTTAATATCCCTCGCTGCTGCTGCTCTTACGGCTGATCGGCGTTGGTGTCTTACTGGTACACCTATTCAGAACAACTTGGAGGATATATACAGCCTTTTCCGGTTTTTGAGGGTTGAACCGTGGAGGAACTGGTCTTTGTGGCATAAACTTGTGCAAAAACCATATGAAGAAGGCGATGAAAGAGGTTTAAAGCTAGTACAGTCCATTTTGAAGCCAATAATGTTGAGAAGGAATAAAAACAGCACAGACAAGGAAGGAAGACCAATCCTTATTTTACCCCCAGCAAATATCGAAGTCAAATACTGTGATTTGTCAGAGACTGAGAAGGATTTCTATGATGCTCTGTTTCGACGATCTAAGGTGAAATTTGATCAATTCGTGGAACAAGGAAGGGTCTTGCACAATTATGCTTCAATTTTGGAGTTGCTTTTGCGCCTTCGGCAGTGTTGTGACCACCCATTTCTTGTTCTTAGTCGTGGAGATACACAGGAGTTTGCTGACCTAAACAAACTTGCAAAGCGTTTCTTGCATGGTGGTAATGGTGCTGTGAATGGTGACTCTTCTCTTCCCTCCAGAGCTTACATTGAGGAAGTTGTCCAGGAACTGCAGAAAGGTGAAGGGGAGTGTCCCATATGCCTGGAAGCCTTTGAGGATGCTGTATTGACTCCCTGTGCTCACCGTTTATGCCGAGAATGTCTCTTGTCTAGTTGGCGGAGTGCATCAGCAGGCCTTTGTCCTGTCTGTAGAAAGTCTATGAGCAAGCAGGATCTTATTACTGCTCCAACTGACAATCGTTTTCAAATTGATGTTGAGAAGAACTGGGTTGAGTCTTCCAAGATTTCTTTCCTTCTACAGGAGCTAGAAGTTCTTCGCACTTCTGGTGCAAAGAGCATCATTTTTAGCCAGTGGACTGCATTTCTGGATCTCTTACAAATTCCACTTTCCAGACATAATTTCTCATTTGCTAGACTGGATGGAACCTTGAATCTTCAGCAGAGAGAGAAAGTAATCAAGGAGTTTTCTGAGGACAAAAGCATTTTGGTTCTGCTTATGTCCCTGAAAGCTGGTGGTGTTGGAATAAACCTAACTGCTGCATCTAATGCATTTGTCATGGATCCTTGGTGGAATCCTGCTGTTGAAGAACAAGCTATCATGCGGATCCATCGAATTGGTCAAACAAAGAGTGTTTCCATCAAAAGATTCATCGTCAAGGGCACTGTCGAGGAACGAATGGAGGCTGTGCAGGCTCGTAAGCAGCGAATGATTTCTGGAGCTTTGACAGATCAGGAAGTACGCAGCGCACGTATAGAAGAACTGAAGATGCTTTTCTCCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
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| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..555#623..756#851..986#1456..1509#1581..1721#1806..1957#2048..2132#2233..2502#2666..2812#3476..3631#3809..3876#4601..4723#4795..4894#4975..5087#5298..5570#5659..5859#6842..6935#7543..7614#8561..8659#8836..8958#ATGGGGAAGGAGAGGGGAAGGGAGGAGCAGGTGGCGACGGTGCGCGCGGTGCTCGGCGATGGGACGCCGGAGATGGACATCATCCGCGCGCTCCACATGGCCGGCGACGACCCCACCAGGGCCATCAACATCCTCCTCGACTTTCCCCACGGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCACCGTCGCCGTCGCCTTCGCCTCCGGCGGGTAAACCCACCAAACCCCACCCCGAATCGACCCCGCCAACCAAAACCCCTGCCCGTTCGAAGCCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGAGAAACCTAGGCCCAGTGTCGCGCCCGAATCCACCAATGGCGGCGGCGGCGGCGAACATTGGTGGTTGGTGGGGAGCGTGGAGATGGCGGGGCTGTCCACGTGCAAGGGCCGGCGCGTTGCCTCCGGGGATGCCGTCACTTTCTCGTTCCCCAACTCCCCGGTCGCCGCCGCCGCCGGGGGCAAGAGCCGTTCCGGCCGCCCCGCCCTCGTTTCCTGCTCCTCCGAGATCATGCGCTTCTCCACCCCGCGCCATGGGGAGGTACATTCGATTCATCACTCCCGCTTTCGCGAATCACCGTGGTCTCACGATTTTTGTTGTTGTTTAGGTCGGTCGAATCCCCAATGAATGGGCGAGGTGCCTGCTCCCCCTTCTCAAGGAGGGGAAGATAAAAATCGATGGCGTATGCAAATCCGCTCCCGAAGTACTTAGCATCATGGACACTGTCCTCTTGTCCGTAAGGTATGTGAAGAATTGCATCTTAAAGTTACTATAATCCATATGCAGTTCTGCTGTTCCATCTATGTTATTGTGATTGTGGTTGTGTGCTCTGTAGTGTCTACATCAACAGCTCAATGTTTCATGGCCAAAAGCAATCGACACCCAAGGCTGCTCGGGCTGCTACCGAGGATTCCACGTTTCATCCGCTGCCTGCACTTTTCAAGTTAACTGGTCTTTCGCCCTTTAAGAAGGTGAGTGTTGTTTGGCTTATGTGTCTCTTGTTCATTGTGTTATCTAGCAAAATATATAAAAAAAAGTGCTGCCAAAGTTTCTTGTTAGAAGAATTGAGACTGCTTTAGATCATGGTACGCATGGGTGTAGAACCCCACTCAGTAAGTTTTAGTCATCTTTGGCTCGAAGTTGAGTGTCAACTGTCTATCATTCGATCAAATTGATGCCAAGTTGCTTCTTGATGCTTCACAAAGTTCACCGCTATAATTACACTCTTGGAATGGATAAAATTATCACTGATAAACATTGTAAAAAAATTGAAAAGTATGAAAAAGGGTACTATTCTGCTCAGCACTGATATATGTATAAATAGGTAACGTAGAAAACCATATGGTTGTTTCTTTTTAAGCCTGCTTGCTCTTTTGCAAAAAAAAAAACAGCATATTTTAATTGTTAAGATCTTCTCTTTTTTGTTCTAATCAAAACCAGGCAGCATTTACTCCAGAAGATCTCTATTCCAGAAAGCGTCCGCTTGAAACAAAGGTAAACTATTACTGTTTCATAAGCAATGCTAGGTACTGTCATAAAGGTTGGCCTCACATCTGCCTCAGCAGAGCAGTGCACCTGCCACAAAGTTGACTACTGAGAAGTTGAGATTATCGTCTGATGGAAACGAAGATGATCATGCTGAAAGAATTGTTTCAGATTCAGAATTGGATGATATAATTGGAATCTCAGACAGTTCTGCTTTGGAGGTAATTGAACTTATCTGTTTGTTGAAAGTTTCAGAGACAAGCTTATTGTATGACTTCAGCAGTGCGCTAATTTATATTTTGTAGGAAAGGGACCCCCCTGATGCTCTGCAGTGTGATTTACGCCCTTATCAGAAGCAGGCACTTTATTGGATGATGCAGCTTGAGAAAGGCAGTTCTTCTCAGGATGCAGCTACAACGCTGCACCCTTGTTGGGAGGCATATAAACTCGAGGACAAGTATGGCTTGGTTATATTGTTTGAGCCTTTTCTCTATTACAATGATTTTTTGAAATTAACATTAGGACGTTTATACTGCATTCATTTCAGGAGGGAGCTTGTTTTATACTTGAATGTATTTTCAGGCGATGCCACCACTGAATTTCCTAGTACACTGCAACTTGCAAGAGGAGGGGTAAGGATCTTCTCAATATTATACATCCTTCCTTTCTTTCGATAATTATAATTTCTGGTTTTAGCATATCCATTTTATTAACTGAACAATAAATTATAAGATTCTGGCAGATGCAATGGGACTGGGGAAGACTATTATGACAATAGCTCTTCTTCTTGCCGACTCTAGCAAAGGATGCATCACTACTCAGCATTCTACTCACATATGTGAAGAAGCTAGTGGACTGGGTGAATTGCCAGTTCAGCCTCATGATGATGTGAAGAAGCTAGCTATCCCTTTCTCTTTTAGTAAGCTTAGGAAACCTAAAACCCCGCTTATTGCAGGCGGCAATCTAATTGTCTGCCCAATGACACTACTTGGTCAGTGGAAGGTATGAATCTGGCACTGTCACCATTTCAACTTTGTCTATTGAGCTATTTTTATGCACATTTAGTACTTGTAGAAATAATTGGAAATGTAAGCTGGACTTGTTCCTAAATGTGTTGTTAGAACTATTGTCTTAAATTCTCAAATTTTTATTTTTTCCCAAACAGGCAGAAATTGAAGCTCATGCTACACCAGGTTCTGTAAGTATATATGTTCATTATGGGCAAAACAGACCAAAAGAAGCAAACCTTATTGGTCAGAGTGATATTGTCCTGACTACATATGGTGTTCTGTCATCGGAATTTTCAAACGAGGTAACATCTGAGATTTTATAGAACACAGTCACACCTGTCTTCAATATATTATTAGTATGCTGAAGCATTTGCTGAAGTCTTTTTCATTGGCACCAGCACATGTGGCTGACTTGTTTGTATACCACTTGACCCATTGTTAGGCTTTGGCATATGCTACTACACCCTCTGTTCATAATTTAGGACAAAATTTGGTCAAACTTTTCAAATTCTTACCATCAATTTTATATTAGAATAAGTTTATAAAATCTGTCATTTATTTTGTTTTTAAACTAAGCATTTTAGAAAATATTGATGGTTGCAATTGTAAAAATTTGACCGAATCTTGCCCTAAGCATAAAATATTTATGATCCAAGGGGGTATTTACTTGGGTTATTTGTAAAGACTAAAGAGAGTTCAATGGAATACAGATAGCACATCATCACTTTGCTTGTGTTCTTCCTTCATTCACATTTTCTGCCAAGGGTAAATATTTGTTTGGTTATGTTGTGCACTTGTGCCTATATAATCTGTTGGTTTAGAAGTTTGGCTTTCTTACAATTTGGTTTAGGGATGAGGATTTTTATATGCAAATGACGAAAACTGTTTTGGTCACTACTGCTATTTTATACTTTGTTTGATTATGCGATCTGATTCTTGACCGAAGTCTGCGTGCTTTCTTGCAGAATTCAACAGAAAGTGGGGGTCTGTACTCTATACATTGGTTTAGAGTTGTGCTGGATGAAGCACACATGATAAAATCTCCCAAAAGTTTAATATCCCTCGCTGCTGCTGCTCTTACGGCTGATCGGCGTTGGTGTCTTACTGGTACACCTATTCAGGTGAATACAGGAGTAGATTTGACTGTCCATATAATTGAACCAATCCTATTTAACCCTAGTTTTCATAAGAATGTTGCAGCAGATAAATAGAATGTGCACTCCTAGTTTTCCTGCATCTATCAGCCTCTTAGGTGCTTATGCATTCAATGTTTTTTACGAGTTTTACTCTGATGGCAGAACAACTTGGAGGATATATACAGCCTTTTCCGGTTTTTGAGGGTTGAACCGTGGAGGAACTGGTCTTTGTAAGTGGATCATTTGTTTACCTTCATTGACTAGTTTTGTTCTTTTGTCAAATTTGTGTAGACCTTGTGAAACTTAGATGCATGTAGTCATAGAAATCAATTGTACTGTTGTAGGATGCAAAATTGAAACTTTTGACGTAATTTACTGTTCAGATTCTCTATTTTAGTGATATGTTTTATGTTGTCTTGTCGATTGTTTTCTTATAGTAGTAGTTCCACCTTTTCTGTTTGAGAACTTTTTTTGGGTTTACCCTAGAGTGTTGCCGTGATAGTTCCAACTTCCAAGGTGCAAGACCACTGTTCTCCTTTCTTCCATTTATTAACTTGGCTATGCACTTCATTTTGTTTTGCTGACCTGAATCTGCTGTTTTGCGCAAACGAAGTATGCTCGTGATGTTGTAGAGTTTTTGTATATTCTGTTAGCCCTTACTCCCTCCGGTTCCATAATTCTTGACGTTTTGGACAATGACACGGTCTCCAAAATGTCTTTGACTTTGTTTTCCTATTATAATATATACAATAAATAAATGCATGTCTATATATGTTGTTCTAGTTCCTTCAAACTTAATATTTTTAAAGTTATTGATCATCAAAGTTACAAAAGTTTGACCTCAACCTTTTCCAAAACGTCAAGAATTATGGAACTAGAGGGAGTACCTTGCAATAAATTTCAAATTTACTATTGTCCCATATACACGAATTTTATTATCGTTATGCTATTCAGGTGGCATAAACTTGTGCAAAAACCATATGAAGAAGGCGATGAAAGAGGTTTAAAGCTAGTACAGTCCATTTTGAAGCCAATAATGTTGAGAAGGAATAAAAACAGCACAGACAAGGAAGGAAGGCATGTTCGACCTTGTCTATGAAATATTTCAATTCCTTAGCTCTGTAATTT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| External Link(s) |
