BGIOSGA008440
| Gene Name |
BGIOSGA008440 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008440, complete gene. |
| LocusTag |
P0435E12.42 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA008440-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA008440-PA |
| Length |
4558 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:22976463..22981020 |
| Sequence Coding Region |
22976463..22976587,22977686..22977761,22977866..22977924,22978061..22978554,22978642..22978802 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:22976463..22981020 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCAGCGGCAGGGGAGGAGCCTGCAGAGGTCGGGCTCGAAGCGTGTGCTCGACCCCACCGGCGGCGGCGGCGGCGACGACGACGACCATGCGGCCAAGCGGCCTCGCGTGCCCGCTCTCGCAAGTGTCATTGTGGAAGCTCTTAAGGTGGATAGTTTGCAGAAGCTTTGTTCATCACTGGAGCCAATTCTTCGTAGAGTTGTAAGCGAAGAGGTAGAGCGTGCTTTAGCCAAGTTGGGTCCTGCCAGAATTCAGGGAAGGTCCTCTCCAAAAAGAATTGAAGGACCTGATGGGAGAAATCTTCAGCTTAAATTTACAACTAGATTATCTCTACCACTGTTTACTGGTGGAAAAGTAGAAGGTGAGCAGGGGGCAGCAATACATGTTGTTCTGCTAGATGCGAACACTGGGGTTGCTGTTACTTCAGGGCCTGAATCGTGTGCAAAACTGGATGTTCTTGTGCTTGAGGGTGACTTCAACAACGAGGAAGATGAGGATTGGACGGAAGAGGAGTTTGAGAGTCACATTGTCAAGGAGCGTGAAGGGAAGAGACCTCTTTTGACAGGTGACCTTCAGGTGACCCTTAAAGAAGGTGTTGGAACCATAGGGGAGCTTATTTTCACTGACAACTCCAGCTGGATAAGAAGCAGAAAATTCAGGCTTGGGCTGAGGGTTGCCCCAGGGTCTTTTGAAGGTATTCGTGTTAGGGAGGCGAAGACAGAAGCTTTTACTGTTAAGGATCACAGAGGGGAATTGTACAAAAAGCACTATCCACCTGCCCTAAAGGATGATGTTTGGAGATTAGAAAAGATTGGCAAGGATGGTGCATTCCACAAGAAGTTAAATGCAAGTGGGATTTATACAGTTGAAGATTTTCTCCAGCTTCTTGTCAAGGATCAGCAGAGGTTACGGAGTATTCTTGGCAGTGGAATGTCAAATAAGATGTGGGAAAGCCTTGTTGAGCATGCAAAGACTTGTGTCTTAAGTGGAAAGCACTATGTATATTATGCTATTGACTCAAGAAATGTCGGTGCAATATTCAATAACATCTATGAGTTCACTGGTTTGATTGCTGACGACCAGTTCATTTCAGCAGAAAATCTCACTGACAACCAGAAGATCTATGCAGATGGATTGGTTAAGAAAGCATATGAGGATTGGATGCATGTTGTAGAATATGATGGCAAGGCACTCCTGAGCTTCAAGCAGAAAAAGAAATCTGTCACAACAAGAAGTGACACGGCTGCAGCAGCAACAAACAGCCCTGTTTCCTATGGTTCATCCAACACACACAAACAATTGTCTCAACCAGCAAAAGCAGGGCAAACTTCTACAGGCACTACAAGTGAAGATGGATCTACAAGTGCATACAATGGAAATCAGGCAGGACGATATGCAGTCAATTCTCAAAGCATACCTGCAAACGTCACTACACAATATGAGCGGAGTTCACTGACACCTGAAAGCCAGTTCAATGGTTCCGCACTGCAGAATCAAGTTTCTAGGGGCTCCAATATACTGGCATTGGGACCACCACAGCAACAACATCAGCAAAATTTTGAATTCTCAGCACTAGGTGGCCAGTCCATGCAGCCCACCGGCTTGAATCCTTTCGATGACTGGTCGCAACCGCAGGAGAACCGGAGTGGGGTTGACGACTACCTGATGGAGGAGATCAGGATGCAGAGCCACGAGATATTGGAGAACGAAGAGATGCAACAGATGTTGCGGATTTTGAGCATGGGTGGCGCGTCAACCAACCTGACGGAAGACGGCTTCGCATTTCCTAACTACATGCCATCAACTCCCCCCAACTTCAACTTTGGGGATGACCGTGCCCGCCCACCTGGGAAAGCCGTCGTCGGGTGGCTCAAGATCAAGGCAGCTATGCGCTGGGGCATCTTTGTCAGGAAGAAAGCTGCCGAGAGAAGAGCTCAGCTTGTTGAGCTCGAGGACTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MQRQGRSLQRSGSKRVLDPTGGGGGDDDDHAAKRPRVPALASVIVEALKVDSLQKLCSSLEPILRRVVSEEVERALAKLGPARIQGRSSPKRIEGPDGRNLQLKFTTRLSLPLFTGGKVEGEQGAAIHVVLLDANTGVAVTSGPESCAKLDVLVLEGDFNNEEDEDWTEEEFESHIVKEREGKRPLLTGDLQVTLKEGVGTIGELIFTDNSSWIRSRKFRLGLRVAPGSFEGIRVREAKTEAFTVKDHRGELYKKHYPPALKDDVWRLEKIGKDGAFHKKLNASGIYTVEDFLQLLVKDQQRLRSILGSGMSNKMWESLVEHAKTCVLSGKHYVYYAIDSRNVGAIFNNIYEFTGLIADDQFISAENLTDNQKIYADGLVKKAYEDWMHVVEYDGKALLSFKQKKKSVTTRSDTAAAATNSPVSYGSSNTHKQLSQPAKAGQTSTGTTSEDGSTSAYNGNQAGRYAVNSQSIPANVTTQYERSSLTPESQFNGSALQNQVSRGSNILALGPPQQQHQQNFEFSALGGQSMQPTGLNPFDDWSQPQENRSGVDDYLMEEIRMQSHEILENEEMQQMLRILSMGGASTNLTEDGFAFPNYMPSTPPNFNFGDDRARPPGKAVVGWLKIKAAMRWGIFVRKKAAERRAQLVELED</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..125#1224..1299#1404..1462#1599..2092#2180..2340#2419..2622#3054..3285#3951..4558#ATGCAGCGGCAGGGGAGGAGCCTGCAGAGGTCGGGCTCGAAGCGTGTGCTCGACCCCACCGGCGGCGGCGGCGGCGACGACGACGACCATGCGGCCAAGCGGCCTCGCGTGCCCGCTCTCGCAAGGTGATACTATGATACTACTATAAGGTGGTGGTGGTGTGTGATCCGGTAGCAGCTTTTGCTTGGATGTGGTGGTTGGGTAGGGGTTGGTGGGTTAGGCTGTAGGCGGCTACAATTGGGAGGGAATTTTGGGCACTTTGCTTTGCTCCATTCTCCATTCGGACTACGGTCGGAATGTTAAATGCTGTTGTCAAACCTCCCATCCCACCAGCTTAACATCAAATAGAGCTCTTGAATTAAGCTTAATCCTTTCATTAGCTCAGCAGGTTAAGTGTGTACTTGGAACCCCAACTCAAATGATTCTGTGAGAACACATGCACTCACTAATGGGAGCTAAAAGAGTGTGTCAGCGTACTCAGGGTAGTACTGTGGTCCATACCGTTGGGTGGGGCTTGGGGCTTGAGTGCTCGGTTTGTGTCACTGCCCCAACTGATAGCAAAAACTTTCAGCTCCCTGCATTCGTGTCTCTGACTCTTTTGTTATGTGATACACGATGGCAATTTTCCGATTTCGTTTGGGCACCTTTAAGCTCCATATGCATTAAAGTGTCTTGGCCTAACTTATTTTTACAACTGATGCTAAGCACTGTATGAGGCATTGGGGTTGTAGATATAATTTCTCCCAAAATCAAGAGAACATAGATGTAGCCATGGGTTATTTGTATCATAAAATGGCATTAACGAACTACAATTTTGTTGCATTGAGCCATCTTGAAGTTCAATTAGTCTGTATCTGTCATATTGCTGCCATGATCTATTGTTGATCTGTCCTAATCCATTTGTTTGGTATGCTGAATTAGAACTTGAAAAATGTGAAATCTTTATATGGTAGGAGTGAGTGCAGGCTGCCTCAGAAATGCTATGCAAAATTTTCCAAGGTTAACCATCAACATTTTGTTGAATTAAAAGGCAATGATCTCACAACCATGTAAGATACTAAAAGAGTAAATGTAATGATTGCTGAGTGGTTGGGATTTGGGGAAAAAAAACTATAACAGACGCTAAATTTTTTTTGTGTATATCCTTGAAATTGCAAAAATATGTTTGTATCTTAGTTGCTCGATTTAGAGGTTGCTCACTTAACAAATGACACGTATTGCAGTGTCATTGTGGAAGCTCTTAAGGTGGATAGTTTGCAGAAGCTTTGTTCATCACTGGAGCCAATTCTTCGTAGAGTTGTGAGTAAAAGAACTCATAGCATTGGATGTTAGACATTTCTTTTCTATAGAGATCATACATTATTTCTTTGTTGATCAATCTAATTCATTATATTCTGGAATAGGTAAGCGAAGAGGTAGAGCGTGCTTTAGCCAAGTTGGGTCCTGCCAGAATTCAGGGAAGGTACAAGATCACTGTAAAACTTGCTTGTTGTGGTGATACTTTTGGATGTGTCTATGTGAATTTCAGTTTTTTCTACAGTTATGGTTTGAGCACAACGAAAAACTTAATACAATAACATTATACCTATTGGAAACAGGTCCTCTCCAAAAAGAATTGAAGGACCTGATGGGAGAAATCTTCAGCTTAAATTTACAACTAGATTATCTCTACCACTGTTTACTGGTGGAAAAGTAGAAGGTGAGCAGGGGGCAGCAATACATGTTGTTCTGCTAGATGCGAACACTGGGGTTGCTGTTACTTCAGGGCCTGAATCGTGTGCAAAACTGGATGTTCTTGTGCTTGAGGGTGACTTCAACAACGAGGAAGATGAGGATTGGACGGAAGAGGAGTTTGAGAGTCACATTGTCAAGGAGCGTGAAGGGAAGAGACCTCTTTTGACAGGTGACCTTCAGGTGACCCTTAAAGAAGGTGTTGGAACCATAGGGGAGCTTATTTTCACTGACAACTCCAGCTGGATAAGAAGCAGAAAATTCAGGCTTGGGCTGAGGGTTGCCCCAGGGTCTTTTGAAGGTATTCGTGTTAGGGAGGCGAAGACAGAAGCTTTTACTGTTAAGGATCACAGAGGGGAATGTATGTTTGCAATGCGTTATTGTTTTACTCATACTGCTAGATGATTTGAATGTTACTCGTTAACCATATTTCTATTGTATCTTGCAGTGTACAAAAAGCACTATCCACCTGCCCTAAAGGATGATGTTTGGAGATTAGAAAAGATTGGCAAGGATGGTGCATTCCACAAGAAGTTAAATGCAAGTGGGATTTATACAGTTGAAGATTTTCTCCAGCTTCTTGTCAAGGATCAGCAGAGGTTACGGAGTGTAAGTTCTACAATTGTTGTTAATAGGTTGTAATTAATGTAGTTTAATTGATGATCAAATACCTCTTTTTTCTTTTAGATTCTTGGCAGTGGAATGTCAAATAAGATGTGGGAAAGCCTTGTTGAGCATGCAAAGACTTGTGTCTTAAGTGGAAAGCACTATGTATATTATGCTATTGACTCAAGAAATGTCGGTGCAATATTCAATAACATCTATGAGTTCACTGGTTTGATTGCTGACGACCAGTTCATTTCAGCAGAAAATCTCACTGACAACCAGAAGGTTGGCATCTTACTTATCTCTTTCTTTGTTTTAAAGTTAAAAATGCAGTATCTTATAAATTTATAATTTTGAAGTGTTGTATAGCTGATTTTTGGCATATTTGGCATGTTGCCACATGACACTGTAAACTTATGTTGCTGTGCTGTTGGCAGTAATGTATCAATGCACAGGTCTGCGTCCTGCATGTTCACCTTGCATTCAGAGCCCTATAGTAATATACATAAATCTGTGGTGCTTCATAACTAGTTTTTGATATCACGTTTCCAGTGGTTGCCACAATAGAATATGCAATTTGTTATAAATTATGTGCCTCTTGAAGGAAATGTCTTCCTGACACCGATATGTTTCTTTTGAATTCAACTGTTGTGTACCCAAGAGCTGAAAATATAAATACCCTATTGAGTGCATAACCTGGCTGAACTCTATTGCAGATCTATGCAGATGGATTGGTTAAGAAAGCATATGAGGATTGGATGCATGTTGTAGAATATGATGGCAAGGCACTCCTGAGCTTCAAGCAGAAAAAGAAATCTGTCACAACAAGAAGTGACACGGCTGCAGCAGCAACAAACAGCCCTGTTTCCTATGGTTCATCCAACACACACAAACAATTGTCTCAACCAGCAAAAGCAGGGCAAACTTCTACAGGCACTACAAGTGAAGGTAATATGATGTTCAGCTCAAAATCCCGGTACATCTATGTATGTTGACAATTTTTATGGTGGTCTCTGCTGTTACTATGTTCCCTGTTATGTTTTTGTTTAGCAGCTACATTTTCTTTGTTATGTTGGGCTCTATTTATCTTACCTAATGCGAGCCAAGTGATTTCGGTTTGTCTTTTTATCCATATGCTCGCTGACCCATCCCTGGAACGTAATGTTGCTGAGCTCCTACTTAATTTATTTATATGGAATTATCCATCTCATCTGGAGTCACTCTCTTGTCTTCAAATTTCATAATCACTAATTCACTGCAATCTTCCTAGTGAGAATAGAAAGATGGGTAGAAAGTGGTCTATGCAATTATGACAAGCACATGCAGAGTAGGGCAGTAGGCCCATTGAGAATGCTAAAACTGGAACATGACAAACTGTAGCAGCACTGGAAGATGTGCGTACGGCCGTACGTCATGACTACAAACTGCTTTAACTACTACCATTCAATACTTTTGTTTTACTTATTGGAACTCAGCCATTGTTGGTTGGAATTGATGTATGCATTTGGAAACATGTTGATGCTTCTGATCATGTTCAGGTCAGATTATCTGTGAACATATTATTGCCATTACTAATACATTGCGCTACTGAATTCCTTTGGTCTTTTCAGCAGATGGATCTACAAGTGCATACAATGGAAATCAGGCAGGACGATATGCAGTCAATTCTCAAAGCATACCTGCAAACGTCACTACACAATATGAGCGGAGTTCACTGACACCTGAAAGCCAGTTCAATGGTTCCGCACTGCAGAATCAAGTTTCTAGGGGCTCCAATATACTGGCATTGGGACCACCACAGCAACAACATCAGCAAAATTTTGAATTCTCAGCACTAGGTGGCCAGTCCATGCAGCCCACCGGCTTGAATCCTTTCGATGACTGGTCGCAACCGCAGGAGAACCGGAGTGGGGTTGACGACTACCTGATGGAGGAGATCAGGATGCAGAGCCACGAGATATTGGAGAACGAAGAGATGCAACAGATGTTGCGGATTTTGAGCATGGGTGGCGCGTCAACCAACCTGACGGAAGACGGCTTCGCATTTCCTAACTACATGCCATCAACTCCCCCCAACTTCAACTTTGGGGATGACCGTGCCCGCCCACCTGGGAAAGCCGTCGTCGGGTGGCTCAAGATCAAGGCAGCTATGCGCTGGGGCATCTTTGTCAGGAAGAAAGCTGCCGAGAGAAGAGCTCAGCTTGTTGAGCTCGAGGACTAG</dnaseqindica> |
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