BGIOSGA008894
| Gene Name |
BGIOSGA008894 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008894, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBB0060O16.25-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA008894-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA008894-PA |
| Length |
3947 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:31129593..31133539 |
| Sequence Coding Region |
31129593..31129751,31130001..31130043,31130211..31130337,31130502..31130590,31130681..31130741 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:31129593..31133539 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCTCCTCCGGCCACGGCCTCCGCGCCCTCCCTGCGCCCGTCCGCGGCCAGCCCACGCGCCGCCGCCGCTCGGTCGGTCGCCGTCCCCTCAGGGCCTCGCACCGTCGTTCCGAGGCGAGACGGGGGCCGCTTCCTCGGCGTCCGTGCTGCCAAGGCTGTCAGTGGCGTGCAGAGTGGTACCGTGGTGGATGATGGAGTGCAAAGACCATGGAAGCTCAGCGATGCTCGGCTCGTTCTTGAGGATGGTTCAGTTTGGAAGGCCAAGTCTTTTGGTGCTTCAGGAACACAAGTTGGTGAAGTGGTATTTAATACATCTTTGACAGGGTATCAAGAGATTTTGACTGATCCAAGCTATGCTGGTCAATTTGTCCTCATGACCAACCCACATATTGGAAACACTGGTGTTAATCCTGATGATGAAGAATCGAATCGATGTTTCCTTGCTGGTCTGATCATAAGGAATCTAAGCATATGTACATCCAACTGGCGATGCACAGAAACACTTGAAGAGTATCTGATGAAGAGAAACATTATGGGAATATATGATGTGGACACACGCGCCATAACACGGAGATTACGAGAAGATGGTAGTCTAATTGGTGTCTTAAGTACTGATCAATCTCGGACCGATGATGAGTTGTTGGAAATGGCAAAAAATTGGAAAATTGTTGGTGTTGATTTGATTAGTGGTGTCACATGCGATGCTCCATATGAATGGTCAGACAAGACTGATTCAGAGTGGGAATTCAAGAAGGGTCAATCGACTGAAAGTTTTCATGTGGTCGCATACGATTTTGGAATCAAGCACAATATTTTGAGACGTTTGACGTCATATGGATGCAAGATAACTGTTGTTCCAGCCAATTGGCCTGCTTCTGAGGTACTTAACTTGAGGCCTGATGGTGTGTTTTTTAGCAATGGTCCTGGAGATCCAGCTGCAGTTCCATATGCTGTGAAGACAGTACAAGAAATAATAGGGAAGGTTCCTGTGTTTGGCATCTGTATGGGCCACCAATTGATTGGGCAAGCTCTTGGTGGGAAGACATTTAAAATGAAGTTTGGTCATCATGGAGGAAATCATCCTGTTTGTGACCTTCGAAGTGGACGTGTCGACATAAGTGCACAAAACCATAATTATGCTGTTGACCCAGAGTCACTTCCAGAAGGGGTGAAAGTAACACATATCAATCTCAACGATAATAGCTGTGCCGGCCTTCAGTACCCTAAGATGAAACTTTTGTCTCTTCAGTACCATCCAGAGTCCTCACCCGGGCCGCATGATTCTGACTTGGCTTTTGGTGAATTTATAGAGATGATGAAGAACAACAGATTGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAPPATASAPSLRPSAASPRAAAARSVAVPSGPRTVVPRRDGGRFLGVRAAKAVSGVQSGTVVDDGVQRPWKLSDARLVLEDGSVWKAKSFGASGTQVGEVVFNTSLTGYQEILTDPSYAGQFVLMTNPHIGNTGVNPDDEESNRCFLAGLIIRNLSICTSNWRCTETLEEYLMKRNIMGIYDVDTRAITRRLREDGSLIGVLSTDQSRTDDELLEMAKNWKIVGVDLISGVTCDAPYEWSDKTDSEWEFKKGQSTESFHVVAYDFGIKHNILRRLTSYGCKITVVPANWPASEVLNLRPDGVFFSNGPGDPAAVPYAVKTVQEIIGKVPVFGICMGHQLIGQALGGKTFKMKFGHHGGNHPVCDLRSGRVDISAQNHNYAVDPESLPEGVKVTHINLNDNSCAGLQYPKMKLLSLQYHPESSPGPHDSDLAFGEFIEMMKNNRL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..159#409..451#619..745#910..998#1089..1149#1239..1306#1394..1522#2315..2421#2505..2852#3626..3791#3904..3947#ATGGCGGCTCCTCCGGCCACGGCCTCCGCGCCCTCCCTGCGCCCGTCCGCGGCCAGCCCACGCGCCGCCGCCGCTCGGTCGGTCGCCGTCCCCTCAGGGCCTCGCACCGTCGTTCCGAGGCGAGACGGGGGCCGCTTCCTCGGCGTCCGTGCTGCCAAGGTGAGCGCGAGTGGATTGCTCCTGCTGCTTTAGCTTCGCCGGCGGGGCCTTGTTACCTACCTATCGTTTGGGAGGAGTGTACTGATTGGTATATCTGGCTTTTGTGCTTTCCCGTGAAGCCTTCGCCATAGTTTTAGTCCCGTTGTATTGCAAGACTGAATCCGTCATACACCATCAACAGCTTCGTCTGTCAATGGTTGTTTTATCCGCGCGAAAATTGAGTTGTTTTGTGTTGTCTTCCGTGTGCAGGCTGTCAGTGGCGTGCAGAGTGGTACCGTGGTGGATGATGGAGGTGAGTCAGGTTGCCTTTTCGCTAGCTGATTCGAATCGCTCTAGTTTTGCAGTCGCAGCGCGGAATATGTGCTCAGGGTTCTGCTACAGATTTGCGATTAGGCAATTGTGCTCCACAGTTAAGAAGATGATGAATACTGTTTCACCATTTTTGGATTCTTCGTGCAGTGCAAAGACCATGGAAGCTCAGCGATGCTCGGCTCGTTCTTGAGGATGGTTCAGTTTGGAAGGCCAAGTCTTTTGGTGCTTCAGGAACACAAGTTGGTGAAGTGGTATTTAATACATCTTTGACAGGGTAAATCAACTAACCGTTTGAGTGATGGCATTTGTTTCCTGTTGTGGTTGAGATGTGCTTATTGTTCTTCCTGATAGAGAAACAACTAACCTCATCAAATAGTTGAGACGCGCATACTGCTTATTGACAACAGGAAACAACTAACCTCATCAAATGGGCTGCAGGTATCAAGAGATTTTGACTGATCCAAGCTATGCTGGTCAATTTGTCCTCATGACCAACCCACATATTGGAAACACTGGTGTTAATCCTGGTCCGTATCTTTTCTATTAGTCAATAATCATGATATGATGCCATTTCCACAATAGCTTGTAAGTTTTAACAAATTAGAATGCTCATGCAGATGATGAAGAATCGAATCGATGTTTCCTTGCTGGTCTGATCATAAGGAATCTAAGCATATGGTAAACCATTTTTTCCTAGTATTGGTTGACATAATTGGAACTTTAAGAGAACCACCTAATGTTGTTAAATTGGTATTCTTTCTCTGTAGTACATCCAACTGGCGATGCACAGAAACACTTGAAGAGTATCTGATGAAGAGAAACATTATGGGAATATGTAAGTAGTGTCACCTGATACATTGCTCTCTATGTCCGACAAACAACAAAAGCAACAATAAACACCATCAATTTGCTTTATATGCAGATGATGTGGACACACGCGCCATAACACGGAGATTACGAGAAGATGGTAGTCTAATTGGTGTCTTAAGTACTGATCAATCTCGGACCGATGATGAGTTGTTGGAAATGGCAAAAAATTGGAAAATTGTTGGTATGCTATGCTCTCTTCAAGCAGTAATGTCCTTGAATAATTGTCTGTCTCCTTTAATAAATATAATTGCACTTTGCATGGTAGATTGTAACATGTTTCTCTTTACGCCAGGTTTAGCACATATTTCTATTTACACCAGGTGCATCGAAATAAGTTTCGCTTAACACCAGGATACATCATCAAACATATAGAAATTTCATGAAATCTAAATGAAACTTCATGAAACATGGTCTAAATTAAAAAAAAAACGTTTTGATAAGATTTGACAAGATTTCCCTTCAGTTATATGAAGCAACCTAGTGCAAAATGAAACTTATTCGATCTACTCTGGTTTAAAGTGAAAGTGTGTGCTAAACTCAGTGCAAAGTGATAATTCTACCTGGTGAACAGTGCAATTTACTCTTAAGTCTTAAAAAATAATTAATTACCTTGCAAACATGATAGTACTAGGCTTAATGAAATTAACGTGGACTATTTATTATTTAACCGCGTACTGGTTCAGGAATATTATTATGTTTTGCTGGTCAAGCAGATTGTTAACTCGATTGAAGTTTCATATGTTTATGACATGGACACATGGTTATGATGCTTGCTATCCTTCACTGATCTATTATAGTAACTATCTGGAGTATTTTTCATGTCCACTTTATGATGAATATTGTGTCACCAGCATTGACATGTAATGATATCATTTAGAATAGTGTATTGGCAAAATTGATTGCCTCCATCCATATTTAGACACTATTCAAGTTACTGGTTATAAAACAAGATCTGGTATTTCATGTTATGCAGGTGTTGATTTGATTAGTGGTGTCACATGCGATGCTCCATATGAATGGTCAGACAAGACTGATTCAGAGTGGGAATTCAAGAAGGGTCAATCGACTGAAAGTTTTCATGTCAGTGTTGGTTTGGTCCCTTTCTCTTTTTTGAAACACTTCAGATGAATCTCATATCTAAACATTAGCTTCCTTTTATTTAGGTGGTCGCATACGATTTTGGAATCAAGCACAATATTTTGAGACGTTTGACGTCATATGGATGCAAGATAACTGTTGTTCCAGCCAATTGGCCTGCTTCTGAGGTACTTAACTTGAGGCCTGATGGTGTGTTTTTTAGCAATGGTCCTGGAGATCCAGCTGCAGTTCCATATGCTGTGAAGACAGTACAAGAAATAATAGGGAAGGTTCCTGTGTTTGGCATCTGTATGGGCCACCAATTGATTGGGCAAGCTCTTGGTGGGAAGACATTTAAAATGAAGTTTGGTCATCATGGAGGAAATCATCCTGTTTGTGACCTTCGAAGTGGACGTGTCGACATAAGTGCACAAGTTTGTTCCTGACCTGACTTCTTGCTGTTTTGATACTGAATGCGATTCATGTTTTTTGACTCTCGAGGGAAATAGCCTTCCGTTTGAATTTCAGTACAATAAACTGTTTTGTCTAACTAGAGGTATAGAAACTTGTTGTAGGATTGCTGTTTTAAGTTTTTAAGTCTAGAAACCATTGATATCCATTATAGTTCTTTTCTGTTACGTATTGATTTATAGATCTATCCTATGTTATTTCCTGAAAAGCTTTCCGTATTACTGGTGTTGGGAGAGGTGCTGGACTTCTCTCTGTGACACTTCCTGATGAAAACTTGGAGCTTCTGAGAGTAATGAATTTGAACCTTTAGGCTGTTAGGTATATCCAATTTAATCAACTACTCCCTCCGTTTCACAATGTAAGTCATCCTAGCATTTCCCATATTCATATTGATGTTAATGAATCTAGTCACATATATTTATCTAGATTCATTAACATCAATATGAATGTGGGAAATGCTAGAATGACTTACATTGTGAAACGGAGGAAGTAGCAAGTCTATCCTTCTAGACTAAAATCATATACACCAAATCAGCTGAGAGTCAGGTAGTATTGTTTGTAACTCTGTATTATTAGAAGTTGTTTTTCCACCAAGAGAAATGTGGGCATCCTTGCTATTTTCCTTTTATTTAATTCATATTTCTGAGTCTTAGCTATTTTCCCCTTTGTTTTACTTGTCATACTTGCATTTACTACTGTGCAATCTGCAATTGTCTTACCGTATTTTTCTCTGCAGAACCATAATTATGCTGTTGACCCAGAGTCACTTCCAGAAGGGGTGAAAGTAACACATATCAATCTCAACGATAATAGCTGTGCCGGCCTTCAGTACCCTAAGATGAAACTTTTGTCTCTTCAGTACCATCCAGAGTCCTCACCCGGGCCGCATGATTCTGACTTGGGTACATTTCCTTGAACAATATAGTACTTCTAGAGAAAAGTGTTGTACCAACACAACTTGTGTTATCACTGTTAAGTGTTGATTTTACTAATCCTGTTTCTTGTGCTTTACAGCTTTTGGTGAATTTATAGAGATGATGAAGAACAACAGATTGTGA</dnaseqindica> |
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