Os12g0600100
| Gene Name |
Os12g0600100 |
|---|---|
| Description |
TPR-like domain containing protein |
| Version |
NM_001073735.1 GI:115489431 GeneID:4352715 |
| Length |
4336 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0600100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:25468846..25473181 |
| Sequence Coding Region |
25468924..25468990,25469422..25469568,25469702..25469833,25469977..25470116,25470328..25470414 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccccctccccttccgacgtcgccctgcaggccgcccaggacggcaacctccgcctcctcaggaagatggcgaagaagttggatttgcgaggagtcaaggacaagaatggcctaagcgcgcttcacttcgctgcaagccatgggcacctggattgctgcaagttccttgtggaggaatcgggccttgatgtcaactcggttggtcacaaaggtgaaacgccagtgttctatgccgcgatcgatgggaacgttcaggttttggggtaccttcttgatcatggtggtgacccggtgaaacccgaggagaggggctgcacgccgctgcacaatgcggcagagaatgggcatgatgaggctgtaagactattgctgtccaaaggagttcatgtggatcctctgaattatcgtggggccccactgcacttggctgcctcaaaggaccgggttcaagccatgaaggttctgcttgaacatggtgctgatcccaacagagttgtcaatcatatcttttcaccactcatgatggcatgctgcgggcactccttgaaatgcgtgaagctacttgttgaggctggcgctgatgtgaacggggctggagctgaccctaacattcctgacgaggaagggaggattcctatcatggtggcagcagctcgtggtcaacgagagcttgttgaaattctatttcctcggacaaaacctattccatgtctgccagattggaatgttgacgggataattagaactatgagaaccacacgtattgaacctcagtctgctattcctgtggaagaacaagtgtctgatgcaaagtcgaaaggaaaggaagcatttgcaaagggtgactaccttacagccatctacttctacaccctggcaatggataaatccccacttgatgccaccttgtttgccaaccggagcctttgctggctgcggcagcgagaaggggacagagctttactggatgcacagcagtgcaggatgctgcgccctggttggtccaaggcatggtaccgtgagggcgcagctctcagtttcatgaaggactacaaaggagcagtggacgcattcggggaggcactgaaacttgaccccatgagcgacgaggtcaagaacgcgttaagggaggcgatcgagtgtctgaagagagctgcttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPSPSDVALQAAQDGNLRLLRKMAKKLDLRGVKDKNGLSALHF AASHGHLDCCKFLVEESGLDVNSVGHKGETPVFYAAIDGNVQVLGYLLDHGGDPVKPE ERGCTPLHNAAENGHDEAVRLLLSKGVHVDPLNYRGAPLHLAASKDRVQAMKVLLEHG ADPNRVVNHIFSPLMMACCGHSLKCVKLLVEAGADVNGAGADPNIPDEEGRIPIMVAA ARGQRELVEILFPRTKPIPCLPDWNVDGIIRTMRTTRIEPQSAIPVEEQVSDAKSKGK EAFAKGDYLTAIYFYTLAMDKSPLDATLFANRSLCWLRQREGDRALLDAQQCRMLRPG WSKAWYREGAALSFMKDYKGAVDAFGEALKLDPMSDEVKNALREAIECLKRAA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>79..145#577..723#857..988#1132..1271#1483..1569#1778..1796#1875..1906#2495..2647#2893..2994#3509..3679#3775..3854#3982..4015#tttccacccgcttcctctcctctccaaaaccctccccaaaaaccacgcccccgccttccagaaccttctggaaccgcgatggccccctccccttccgacgtcgccctgcaggccgcccaggacggcaacctccgcctcctcaggagtaagcgcgccacccacttcgctgcccccatctctctcgtctcgtctcgggggtgatgagtcgatgaaccgtcgcctgattcctcgcgcatctcgcattgtttcggtccgggatcgggacgctcgcgtgatgtttcggggggttgttgcaagtttgatgctctgtgcggttactgttctttttttttttgtgggggaatgacgaattcgggtattgatttcgtacggtttgctggctagtttagatggaaatcctccaattcgaggatagatggattggatttactcgatttctacggtttggactcccatttgtgcggattgctgaattagctacagtatattttcccccctttttttaatctgtttgattcacttacatggctgtgttgttcggattttgctgctgctggtggaatcgatcctttgtagagatggcgaagaagttggatttgcgaggagtcaaggacaagaatggcctaagcgcgcttcacttcgctgcaagccatgggcacctggattgctgcaagttccttgtggaggaatcgggccttgatgtcaactcggttggtcacaaaggtgcgtgcaggcacatttggtgatgtattatttatttacgatttgagagcatgaaccaggagtttattgttttcggaagaatcccagagaggctactgtgtggctaacatctgaaatgccttcctccttgtaggtgaaacgccagtgttctatgccgcgatcgatgggaacgttcaggttttggggtaccttcttgatcatggtggtgacccggtgaaacccgaggagaggggctgcacgccgctgcacaatgcggcagagaatggtctgcttactgtgctcttcggttcacttgccgtatctggattttaaggatggcttatatggcatttcttgcatacaaatgacatgatatctgtctgtggattatcttgtttgaacctttgtgctaattttgttgtgccctagggcatgatgaggctgtaagactattgctgtccaaaggagttcatgtggatcctctgaattatcgtggggccccactgcacttggctgcctcaaaggaccgggttcaagccatgaaggttctgcttgaacatggtgctgatgtaagtggtggttctcgttgttatcgtcgcctgattacatgaaccaataaattgatgaaatgacaaatgcagtaaattttcttggcttgatgattaaatgtcttattttaaaaattagagcagaaacttgggaggcagtgggcttttctctcttattattttgtgatctgactggtcatttttttcaaattgtgattcttttccttttcagcccaacagagttgtcaatcatatcttttcaccactcatgatggcatgctgcgggcactccttgaaatgcgtgaagctacttgttgaggtctggtatcatattcaaccaacttaatgtattctcatgtgtttttctgcttaaatgtgtcctggtttttaaaagatggttgggaggagatcccatattaacaaagccattgtgtcaatttgatgaaagttgatgtctttttagttctatattgagatattgtctctaaagctaccttactttgctatgtatattttcaaatcaataggctggcgctgatgtgaacggtaatagtaccaatggacctacccctttaactgaagcggttgatgacagtttaaccgatgttgtcaaattcttggtaggggctggagctgaccctaacattcctgacgaggtaacggatcctctgcctttgccccatactggttattgacagctcttaggattgaatgttatctgccttgcacatatggtgattgtatacttggctgataatctaaacaaaggtctcttaagaacatgagtgcattgtatagtttgacatgtcaactcaatattgtgtgtatgaactctgattaatatgtttggatttaattctgactacacttagatcagacattccatgattggcagctctagtagatagtgacagttcaccattgcatgttttggaattgtgaatttttaattcgatttaatccatacaataggtttacttatctcatatggtgaaatctctaggtccagagcatgctattggacttccattgttcaggatatttgtctaggctcacccatcagtacttgattggaataatttctctagcttttcttcgagctatgctctgttcctctaacagtttcgcttttcttgcaactgtttcccaaagagtgtcatagtgttgaactgatatcctttttactcttcatactgggatgttttccatcttccattttgtaatgtctgaccaattcaatgcaggaagggaggattcctatcatggtggcagcagctcgtggtcaacgagagcttgttgaaattctatttcctcggacaaaacctattccatgtctgccagattggaatgttgacgggataattagaactatgagaaccacacgtattgaacctcaggtatgtaggtgattgcttgcttcattctaacatatcttgtgttgctgtgttctaacttattcattgtgcctttttatgaacattttatgctgcattccccttgaatcagtcacaagggcataatagttagtttgccaactgcaacacatcgcatactgtttgaactttgtcatacctcatttttttgataatgttgtcatacctcatgcacataatcttcataaccaaacatgctatttgtatagtctgctattcctgtggaagaacaagtgtctgatgcaaagtcgaaaggaaaggaagcatttgcaaagggtgactaccttacagccatctacttctacaccctggtaaatgcacaagtgcacgacacaattattgtctgcttgatacagatttgagatttgggttataatccgaagctgattttcaattttagtatttgtttttatgattattttcgggggtatgtttgtcacttatgttgcccagctctcttttcatgattgctaagaaaagtaaaagttctacttaacaatcatatttggaacagtacaaggttacacaagaaatagctaattctaaaaatatcaagtacgggaaacatgaaggggcttcagttttccttgtagccatacgactttttttgctgaacaataaattgttaataacatgtgttggaccatccgtggtccttgtaaaagaacagtactctttattgtcatctacaagtaattacagtgatttctcatgatatgttaagttgaatgctagggggaaacgctgtattccgtaacctgttagatccactcaaatttactccaaataatcatgtgaaacagcacctgttggtcttgaatgcaggcaatggataaatccccacttgatgccaccttgtttgccaaccggagcctttgctggctgcggcagcgagaaggggacagagctttactggatgcacagcagtgcaggatgctgcgccctggttggtccaaggcatggtaccgtgagggcgcagctctcagtttcatgaaggtataacctcgtcatcgattttgctctcaaaatctagttacattttcacagctgcgcctcactcactcttgtggatggcctttgtctatttaaaggactacaaaggagcagtggacgcattcggggaggcactgaaacttgaccccatgagcgacgaggtcaagaacgcgttaaggtaatgctaaatttatcttctattgctggcttgactgactcaatccacggaacattgacgtctaaaattgataggtgctcttgtaattccaaacagaatttttcactaaaaatttacatgaatgcagggaggcgatcgagtgtctgaagagagctgcttgatctgaagatccgaataacccttgagcagctactgcatcgtccttttggcctcacctcacctgtcagactgcttcacatctttccactgtaactaccaacgactaggttttgcaaaccatgctgactgtttagctatctctgctgtcagagtacgtatggcaggaacatgcactgtctttcggtcagaaaccatatggtttgctaggtcatcatcacccatacatatgcagttgcactttcttccattttgtgcgcaactcatgcaagtgcaaactggcagtaatagtatatgatatgtaaagttcgtcagtttctgaactc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
