BGIOSGA009022
| Gene Name |
BGIOSGA009022 |
|---|---|
| Description |
Pde317 cell cycle and DNA processing |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA009022, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA009022-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA009022-PA |
| Length |
8928 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:32875934..32884861 |
| Sequence Coding Region |
32875934..32876181,32876443..32876491,32877216..32877391,32877855..32877968,32878322..32878430 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:32875934..32884861 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:32875934..32884861 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCACTGCCTCGCCCCCCACTTCCTCCTCTTCCTCCCACTCTCCTCCGCCTCCCGCCACGCGCTCCCCCACACCCCACCCGCTCCTCTCCTCCTCCCCTCCCACCCAGCCCAAGCCCGCGCCGGCCCGCTCCGCCTCCCATCCGCGCGCTCCCCTTCCCGCGCCGCCGCCCCCGTCTCCGACGACGACGAGGACGAGGAGGATGACGAAGAGATAGACATCCGCGAAGACGCGGACGTGGACGAGGAGTTTCTCCTGTTTGAGGCTACATTGGAGATATCTGACGACTCTGAAACGCGCTTGGCTATACAAGCATTTTTGAGAGGCTCATCTGTCGTAGTTTCTGCACCTACAAGTAGTGGGAAGACACTAATTGCAGAAGCTGCAGCTGTTGCAACAGTCGCTAGAGGAAGACGCCTCTTCTACACAACACCGTTAAAGGCCTTATCTAATCAGAAGTTCCGTGATTTCCGGAATACGTTTGGTGATCATAATGTTGGTCTTCTTACAGGAGATTCTGCTATTAACAAAGATGCTCAGATCCTGATAATGACAACAGAGATTCTGCGTAACATGCTGTATCAAAGTGTCGGTATGGCAGCATCAGAAGGTAGATTATTTCAAGTTGATGTTATTGTTTTGGACGAAGTCCATTACTTAAGTGACATTTCACGTGGCACTGTTTGGGAAGAAACTGTGATATATTGTCCAAAGGAAGTCCAGCTTATATGCTTATCAGCCACTGTTGCAAATCCTGATGAATTAGCTGGCTGGATTGGTCAGATCCACGGTAAAACAGAGTTGGTGACATCACACAAACGACCAGTTCCACTTACTTGGCACTTCTCAAAGAAGTTTGCACTTGTACCACTTCTTGATGGGAAAGGAAAGAAAATGAATAGGAAATTGCGAATGTCTCACTTCCAGAACCTATCTTCTCCAAAAAGTGAATTCTATTATGTGAAAGGAAAGAGGAAGCTTAGAACAACTGAAAATGAACAAGGTAACAGAAGCCCCTTGGACATCTCAAAACAGGTTCAGTTGTCAAAGCATGAGCTCACCAATATGCGCCGGTCTCAAGTTCCATTAATACGTGATACTTTATCACAACTTTGGGAAAATGACATGCTTCCAGCTATTTGGTTTATTTTTAGTAGAAGAGGGTGTGATGCAGCTGTTGAATATCTTGAAGATTGTAGACTTCTGCATGATTGCGAGGCTAGTGAAGTTGAGCTGGAACTTAAGAGGTTCAGGATGCAATACCCTGATGCTATCCGGGAAAGTGCTGTGAAAGGACTCTTACGAGGAGTTGCTGCCCATCATGCTGGTTGCTTGCCACTGTGGAAATCTTTCATTGAAGAATTATTTCAGCGTGGCCTTGTTAAAGTAGTCTTTGCAACAGAAACCCTTGCAGCAGGGATTAACATGCCTGCTAGAACATCTGTGATTTCTTCTCTCAGCAAAAGAATTGACGCTGGGCGCCAGCTCTTAACCCCAAATGAATTATTCCAGATGGCAGGTCGTGCTGGACGAAGAGGGATTGATACAGTTGGGCATTCTGTTCTTGTTCAGACTACTTATGAAGGGCCTGAAGAATGTTGCGATGTTATCTTTGCTGGACTTGAGCCACTTGTTTCACAATTTACTGCATCATATGGGATGGTTTTGAATCTCCTTGCTGGCTCAAAAGTTACTCATAATCAGAAAGAATCGGATGATATTAAGGTTAAGCGTTCTGGAAGAACTTTAGAAGAAGCTCGAAAGTTAGTTGAGCAAAGCTTTGGTAACTATGTTGGGAGCAATGTAATGGTTGCTGCTAAAGAAGAGCTTGAAAGAATACAGAGTGAAATACAATATCTCTCTTCAGAAATTACAGATGAATCCATTGACCGAAAGTGTAGGGAAGAATTATCTGAGGAAGACTATGCTGAGATTTCCCTTCTTCAAAAGAAATTGAAGTACAAAGACAAAGATTCAGTTCAGCATACTATTCCTGCTGTTTTCATTGGAAGCCTCAGTTCATTTGCGGATCAAAAGATTGTGAGCTTGGTGGAAAATGATTCTCCTGTTGCTGGCAAGCAGAAAGTTGACAATGAAGGACAGCAATATTACCCATCTTATTATGTAGCCTTGAGTTCAGACAACTCATGGTATCTATTCACCGAAAAATGGATTAAAGCTGTTTACAAGACAGGTCTACCTGCTGTTCCTTCAGCAGAGGGAGGCCCTCTCCCTAGAGAAACCCTGAAGCAGCTCCTTTTGCGTGAAGATATGATGTGGGATAAAATTGCAAAATCAGAATATGGTTCTTTGTTATGCATGGATGGATCTCTGGACACATGGTCGTGGAGTCTCAATGTTCCCGTGCTTAATAGCCTTTCAGAAGATGATGAGGTAGAACGATTCTCCCAGGAACATCAAGATGCTGTAGAATGTCATAAGCAACAGAGAAAGAAAGTTTCACAATTGAAGAAAACAATCAGGAGTACTAAGGGTTTCAAAGAATTTCAAAAGATCATCGACATGAGAAACTTTACAAAAGAAAAGATCGAGCGTTTGGAAGCTAGATCTCGTCGTTTGACTCGGCGGATAAGACAAATTGAACCAACTGGTTGGAAGGAATTTTTGCAGATTAGCAAAGTCATACAAGAGGCTAGAGCATTAGATATCAATACTCAGGTAATCTATCCGTTGGGTGAGACGGCAGCAGCCATACGAGGGGAAAACGAGCTCTGGCTTGCCATGGTTCTTAGGAACAAGGTCCTTTTGGATCTGAAGCCTTCTCAACTTGCAGCAATATGTGGAAGTTTAGTGTCAGAAGGGATCAAACTTCGTCCCTGGAAAAACAGCAGTTATGTATATGAACCATCTTCTGTTGTTACTGGTGTTATAAACTACTTAGAAGAGCAGAGAAACTCACTCGTCGATCTCCAAGAGAAGCACAGTGTAAAGATACCCTGCGAAATAGATGCCCAGTTTGCTGGGATGGTTGAAGCCTGGGCATCAGGGTTGACCTGGAGGGAGATAATGATGGACTCGGCAATGGATGATGGAGATTTAGCCCGTCTGCTCAGACGCACGATTGATTTACTAGCCCAGATTCCAAAATTGCCAGATATAGATCCGGTTCTCCAAAAGAACGCACAAATTGCTTGCAACATCATGGACCGGGTACCGATAAGTGAGCTTGCTGGCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MHCLAPHFLLFLPLSSASRHALPHTPPAPLLLPSHPAQARAGPLRLPSARSPSRAAAPVSDDDEDEEDDEEIDIREDADVDEEFLLFEATLEISDDSETRLAIQAFLRGSSVVVSAPTSSGKTLIAEAAAVATVARGRRLFYTTPLKALSNQKFRDFRNTFGDHNVGLLTGDSAINKDAQILIMTTEILRNMLYQSVGMAASEGRLFQVDVIVLDEVHYLSDISRGTVWEETVIYCPKEVQLICLSATVANPDELAGWIGQIHGKTELVTSHKRPVPLTWHFSKKFALVPLLDGKGKKMNRKLRMSHFQNLSSPKSEFYYVKGKRKLRTTENEQGNRSPLDISKQVQLSKHELTNMRRSQVPLIRDTLSQLWENDMLPAIWFIFSRRGCDAAVEYLEDCRLLHDCEASEVELELKRFRMQYPDAIRESAVKGLLRGVAAHHAGCLPLWKSFIEELFQRGLVKVVFATETLAAGINMPARTSVISSLSKRIDAGRQLLTPNELFQMAGRAGRRGIDTVGHSVLVQTTYEGPEECCDVIFAGLEPLVSQFTASYGMVLNLLAGSKVTHNQKESDDIKVKRSGRTLEEARKLVEQSFGNYVGSNVMVAAKEELERIQSEIQYLSSEITDESIDRKCREELSEEDYAEISLLQKKLKYKDKDSVQHTIPAVFIGSLSSFADQKIVSLVENDSPVAGKQKVDNEGQQYYPSYYVALSSDNSWYLFTEKWIKAVYKTGLPAVPSAEGGPLPRETLKQLLLREDMMWDKIAKSEYGSLLCMDGSLDTWSWSLNVPVLNSLSEDDEVERFSQEHQDAVECHKQQRKKVSQLKKTIRSTKGFKEFQKIIDMRNFTKEKIERLEARSRRLTRRIRQIEPTGWKEFLQISKVIQEARALDINTQVIYPLGETAAAIRGENELWLAMVLRNKVLLDLKPSQLAAICGSLVSEGIKLRPWKNSSYVYEPSSVVTGVINYLEEQRNSLVDLQEKHSVKIPCEIDAQFAGMVEAWASGLTWREIMMDSAMDDGDLARLLRRTIDLLAQIPKLPDIDPVLQKNAQIACNIMDRVPISELAG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..248#510..558#1283..1458#1922..2035#2389..2497#2581..2667#3068..3186#3368..3545#3680..4279#4366..4644#5351..5440#5706..6050#6467..6703#7276..7496#8399..8498#8585..8731#8830..8928#ATGCACTGCCTCGCCCCCCACTTCCTCCTCTTCCTCCCACTCTCCTCCGCCTCCCGCCACGCGCTCCCCCACACCCCACCCGCTCCTCTCCTCCTCCCCTCCCACCCAGCCCAAGCCCGCGCCGGCCCGCTCCGCCTCCCATCCGCGCGCTCCCCTTCCCGCGCCGCCGCCCCCGTCTCCGACGACGACGAGGACGAGGAGGATGACGAAGAGATAGACATCCGCGAAGACGCGGACGTGGACGAGGAGTACGACGACGACGACGACGAGGAGCTGGACGAGGAGAGCGGCGTTGAGGAGGAAGAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTTTCTAATCCTGGATGACTAATTATGAGCGTATAGATTGGGTAATGGCTCTGGATTTTACGTGGTGCGTTTGATTGCTTGGGGCGCTGAAACGGTTGGGATTTGAGCTATCAGCGATATGTTGCTCTGTATATGTTAAGTTCCGTGTAGGTTTCTCCTGTTTGAGGCTACATTGGAGATATCTGACGACTCTGAAACGGTGAAATCGGATTCTGGCCATTTCCCCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTGTCTCGTTTGAGTGATGATTGGTATAAGTAGTTCTGGTGTATATGGTATCGTGGAACTAACAAGTAAAGTCATGATTCGTTGTAAATAGATTTTCTGTACTGGCTAGTAATCCACTGTCGTATGCAATTGAGGTTTATCTGAGTCCTTGTTTGTGCGTTTATTTAGATGGTAGGATTGTGGTCGATTCCTTTTTTCGGGAATACGCAAAAGGATTGTGGTCGATTCCTGTTATACATTGTGTCTTATCATTGGTCTGGTTTGATGATATTATTTATGAGCTACTTGTAAAGCTGTTTTGCACAACAGATAAAACAAAGATTTCCATGTCTTGATTATTAGCGACGCTCTAGTGCTCTCTACTTGTAGTATTCTACTGCTGTTGAAATGTTTGTGTTAAAATTGATTTTAAAAATGTTAGAATATCCATTGGGTACTAAAACAGGAAGGGATAAAAGGGTAGCTTTGGTTTTCTGCCAACAAATCTACCTCTTCACCATTGGTAACAGGAAGACATTTGGAAAATTGATGCTAATCTTTTATGTTGCACGAGGTCACCGGATATTGAACAGTTTTTTCCAAATTCTAGCAACTTGCTACTTGTTGTCCTGAGTGTCACCTCATGTTGTAGAACCCACTACTTTTCATTTTCTTACCTGTTTCCTGTCTTCTCTCAGCGCTTGGCTATACAAGCATTTTTGAGAGGCTCATCTGTCGTAGTTTCTGCACCTACAAGTAGTGGGAAGACACTAATTGCAGAAGCTGCAGCTGTTGCAACAGTCGCTAGAGGAAGACGCCTCTTCTACACAACACCGTTAAAGGCCTTATCTAATCAGAAGTTCCGTGATTTCCGGTAAAATGCTACTTTTGTATGCCCCTCTTTTCAGTTAACGAGTAAAATCTGTAAGATATACTTTTCATGTCACATTAGTTGTTTTTATCTTAAATAGCATGCCCATGCCCCCAATCAATACACAACCTTGGAAGTTGCTCTCCTTTATACTTAGCAACATTGTGGCAAATACTGAAATGGCCAACTTAAATTTTACCATATTCCTTGACTGTCATAAGAAGCAAAAAACAGGTAAATGTACTTACCTTTTCTCTTTCAAAGTTACGTGCTGCACAGTTGAAAGCTGAAAGTTTATGCAATGCTGGTTCACTTTAGCATCCACATGATTGATTTCTGTTGAACTTGTGGCAAGTTGGAGAACTTCAGATCAGTTGTGCTGTTGTATTATTAGATATTTTTCCTAGGTGGCCAGTTTCTGATTAGTAGATTTATTTTGACACATCGCTGCTGTAAATTATTTCAGGAATACGTTTGGTGATCATAATGTTGGTCTTCTTACAGGAGATTCTGCTATTAACAAAGATGCTCAGATCCTGATAATGACAACAGAGATTCTGCGTAACATGCTGTATCAAAGGTATTTCACAGAAGAAGGATATATAGTGTGATTTGTGTGTACTGCTACGAGTAATTCACCCTGCAGAATTTGGCAGTCTGCCTCTTCCACTGTCGCTAGTGATGCATTCCGTGACAGGGACTGTTCACAGTATACTATAATTCAACACTATGTATATCCATGGGCAATGTCTCCCAAGTCATGCATGCGTGTTTAAGAATATCTATGATTTTTATTACAGCCACCTATATAGTTTCCCAAGGAAGTTTTTCTCTGAGATTCAGCCTATAATGGTAGTTAATTACAGATCGCAACTGATGTTGCCTGTCCTGTTTCTATTGAAAGAAAAATGATGTCTTGTATTTGGACTGCAGTGTCGGTATGGCAGCATCAGAAGGTAGATTATTTCAAGTTGATGTTATTGTTTTGGACGAAGTCCATTACTTAAGTGACATTTCACGTGGCACTGTTTGGGAAGAAACTGTATGCTATCTCATTACTCTCTAATTCATCATGTGTGTCATATTGGTCATTTTAATTAAATAAACATTTTTTTATATCTTTAGGTGATATATTGTCCAAAGGAAGTCCAGCTTATATGCTTATCAGCCACTGTTGCAAATCCTGATGAATTAGCTGGCTGGATTGGTCAGGTAATTGTACTTTTGACGTCTCTTTTGCATCATCTTAATTTTCTTTGCAGTTATGCTTTCTGCAACTATGTTAATAAACTGTATTGCATTTCTTTTGGACTTCCAGCAGTATGACAGATTGACAGGTGTAAGAATTTCTCTCTTCCTACTTTAGAATTGTTGTTTGGATTTTCTTATACAATGAAATAGGATTAAAACGATTAAAATAAATTATGGCGATTGGTATAAGAAAACATGCTCAAACATGCACATACCCATATTCATGCATATGTTATGACCATCTGTGTGCTCATCCATATTCAAAGTTGTGTACCCATACATTTTGGAATCCCTTTATTTCTTTTAAGTATTGGTGCTATTTTGTATGTGCGGAACTATTATGAAGTCTGTTCCTTCACAGATCCACGGTAAAACAGAGTTGGTGACATCACACAAACGACCAGTTCCACTTACTTGGCACTTCTCAAAGAAGTTTGCACTTGTACCACTTCTTGATGGGAAAGGAAAGAAAATGAATAGGTTTTTCCTTGTTCTTGTTGGCAACTTGGCATTATATACTTCAGATCATTTGTTAATTTATGTGCATAGAAATATTCATTACTTATTTTCCATGATGGTGCAATTGTTTTTGTGTCCATGCACATTGGTTCTGGTGTACTTGGGCCAAATCATATATATCTTTTGCATTCAATCCATACAGGAAATTGCGAATGTCTCACTTCCAGAACCTATCTTCTCCAAAAAGTGAATTCTATTATGTGAAAGGAAAGAGGAAGCTTAGAACAACTGAAAATGAACAAGGTAACAGAAGCCCCTTGGACATCTCAAAACAGGTTCAGTTGTCAAAGCATGAGCTCACCAATATGCGCCGGTCTCAAGTATGAACCACAATCTCTTTTAAACTCTTTAAGATGAGTATCCTTGCACAATAACTTTAAATTTTCACGTGGTCATATATATATTTTTGTTAGGACTAATGATTGTCATTTCTTGTTTGCCTTTTGCAATGCAGGTTCCATTAATACGTGATACTTTATCACAACTTTGGGAAAATGACATGCTTCCAGCTATTTGGTTTATTTTTAGTAGAAGAGGGTGTGATGCAGCTGTTGAATATCTTGAAGATTGTAGACTTCTGCATGATTGCGAGGCTAGTGAAGTTGAGCTGGAACTTAAGAGGTTCAGGATGCAATACCCTGATGCTATCCGGGAAAGTGCTGTGAAAGGACTCTTACGAGGAGTTGCTGCCCATCATGCTGGTTGCTTGCCACTGTGGAAATCTTTCATTGAAGAATTATTTCAGCGTGGCCTTGTTAAAGTAGTCTTTGCAACAGAAACCCTTGCAGCAGGGATTAACATGCCTGCTAGAACATCTGTGATTTCTTCTCTCAGCAAAAGAATTGACGCTGGGCGCCAGCTCTTAACCCCAAATGAATTATTCCAGATGGCAGGTCGTGCTGGACGAAGAGGGATTGATACAGTTGGGCATTCTGTTCTTGTTCAGACTACTTATGAAGGGCCTGAAGAATGTTGCGATGTTATCTTTGCTGGACTTGAGCCACTTGTTTCACAATTTACTGCATCATATGGGATGGTTTTGAATCTCCTTGCTGTATGTATCTTACTTTAATGCTTCATCATATTTTTCCTGTTTTGTTCATTATCCCTTTATCTCATGTATTAAAATATACTATGCAGGGCTCAAAAGTTACTCATAATCAGAAAGAATCGGATGATATTAAGGTTAAGCGTTCTGGAAGAACTTTAGAAGAAGCTCGAAAGTTAGTTGAGCAAAGCTTTGGTAACTATGTTGGGAGCAATGTAATGGTTGCTGCTAAAGAAGAGCTTGAAAGAATACAGAGTGAAATACAATATCTCTCTTCAGAAATTACAGATGAATCCATTGACCGAAAGTGTAGGGAAGAATTATCTGAGGAAGACTATGCTGAGATTTCCCTTCTTCAAAAGAAATTGAAGGTAATACTGATCGCTTTATCTGGTTATAATAACCCATATAATGGGTCTTAGATTATAACTTTCTCACTTAATAATGCACAAAGATACGTGTCACTGAATGTTATGACAAGGAAACACTCCTTGAATGCATCTTTTGTTTTTTTCTTATTTATTCCATCAAT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| External Link(s) |
