BGIOSGA009085

From RiceWiki
Revision as of 03:25, 28 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA009085| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA009085, complete gene.| tag = P0471A1...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA009085

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA009085, complete gene.

LocusTag

P0471A11.34

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA009085-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA009085-PA

Length

6364

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:33958431..33964794

Sequence Coding Region

33958431..33958598,33959255..33959331,33960009..33960167,33960399..33960612,33960690..33960776
,33960863..33961002,33961221..33961301,33961789..33961853,33962060..33962235
,33963053..33963183,33963279..33963366,33963512..33963725,33964047..33964153
,33964297..33964794

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:33958431..33964794 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:33958431..33964794 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGTGGGTGTTCTACCTGATATCGCTGCCCCTGACGCTGGGCATGGTCACCGTCACGCTCCGCTACTTCGCCGGCCCAGGCGTGCCGCGCTACGTCATCGCCACCGTCGGCTACGCCTGGTTCTGCTCCCTCTCCTTCATCATCCTCGTCCCCGCCGACATCTGGACGACATTAACTGGCCGTGAGAAAGGTGGCATCGGCTTCTTTTGGAGTTGGTCGTATTGGAGCACATTTATCCTAACATGGGCTGTAGTACCTACTATTCAAGGCTATGAAGATGCTGGAGATTTCACTGTTAAAGAAAGGCTGAAGACTAGTATTCATATGAACCTGCTCTTTTATTCTATTGTGGGGGCCATTGGCCTCTTTGGACTCATATTGCTTCTAGTGATGCATAGAGCATGGGATGGTGGTATTGTGGGCTTTGCAATGGCATGTTCAAATACTTTTGGGCTGGTCACTGGTGCATTCCTTCTTGGTTTTGGTTTGAGTGAAATCCCTCGAAACATTTGGAAAAATGCAGACTGGACTCACCGACAAAAAGTACTTTCTCATAGAGTAGCAAAGATGGCTGTCAAGCTTGATAATGCTCATCAAGAATATTCAAATGCAATTGTTGTTGCTCAAGCCACTTCTAATCAAATGTCAAAGCGTGACCTTTTGAGGCCTTATATGGATATTATTGACAAAATGTTGGCTCAGATGCTGCGGGAGGATCCATCTTTTAAGCCTTCTGGTGGAAGATTAGGTGACAATGATATGGACTATGATACAGATGATAAAACAATGGCCACACTTCGACGTCAACTTAGGAGGGCTCACGAGGAGTACTACAGGTGTAAAAGTGAATATATGACTTATGTCATGGAAGCCCTTGAACTAGAAGACACCATTAAAAATTATGAACGACGTGACGCAAATGGATGGAAATTTGTGTCAAGTTTTAGGGAAAGTCGACCGGGCACACTGGGTTCCCTTTTGGACACAATGGAGTTCATTTGGCGCTGTGTTCTGAGGAAGCAGCTTCAGAAAGGATTTGCTATTGTTCTTGGTTGTATGTCAGCTGCTATACTGCTGGCTGAAGCCACTTTGCTGCCAAGTGGTGTTGATTTGTCCCTTTTCTCCATTCTTGTCAAGTCCGTAGGGAAACAGGAGGTTTTGGTTCAGGTTGCTGCATTTGTCCCTTTGATGTATATGTGCATTTGCACTTACTACTCACTGTTTCAGATTGGGATGTTAATGTTTTATTCTCTGACTCCGAGACAAACCAGTTCTGTCAGCTTGCTTATGATCTGCTCAATGGTTGCAAGATATGCACCTCCTATTTCTTATAACTTCCTGAATCTCATTCGACTTGGTGGTGATGCCAAAACTACTTTTGAGAAGAGAATGGGAAACATCGATGATGCCGTTCCTTTCTTTGGAAGAGGCTTCAACAGGATATATCCATTATTTATGGTTGTTTATACACTATTGGTTGCAAGTAATTTCTTTGGGCGTTTGATTAACTTTTTCGGAAGCTGGAAAAGGTTCAAATTCCAGCGTGAGGAAGAAAATATGGATGGTTTTGATCCGTCTGGAATGATCATTCTGCAAAAAGAGAGGTCTTGGATTGAACAAGGATGTAAAGTAGGCGAGCAGGTTATCCCATTGGCAAGAAATTTCAATAATGTCAACACAGATGTTGAATCTGGAAAGGTGCCATTGGTTGAAAATACACTGGAGATGAAATCAGGAGCTACTTCCTCTAGAGCTGACGGAAGAGTAGGTCAATCCAAATATGCTAACAACAGAGAAACTATTGCTACCAAGTATTCAGCTATCAGAGAACAGAGCAGACAGGCAGTGAAGCCAGCAAAAAGGGAAATTTCTTCAACTTCTGTATCCTTGCTTGAGGAAGGGAGTTCTGAACAGCGGTCCAATACTGGTGCACCAGTCGGCTCATCAGCTGGAATTTCCCAAACATGGGCAACGATGAAGATTGGTTTTCAGAACTTCAAAGCAAACATGGGTTCCAAAAAATTCATTCCTTTGCGCCAAGACCCAGGATTTGCTCCACATTCAAATGTCTCTTCGCCCGAATCACTTGATGAAATCTTCCAAAAATTAAAACGACGTCCTGCAGATATGCCTGTGGATTACCTTGACGATGATGATGAAAATACTGGTGACATGGATCCTACATTCCCAGGATCAACAAGATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MWVFYLISLPLTLGMVTVTLRYFAGPGVPRYVIATVGYAWFCSLSFIILVPADIWTTLTGREKGGIGFFWSWSYWSTFILTWAVVPTIQGYEDAGDFTVKERLKTSIHMNLLFYSIVGAIGLFGLILLLVMHRAWDGGIVGFAMACSNTFGLVTGAFLLGFGLSEIPRNIWKNADWTHRQKVLSHRVAKMAVKLDNAHQEYSNAIVVAQATSNQMSKRDLLRPYMDIIDKMLAQMLREDPSFKPSGGRLGDNDMDYDTDDKTMATLRRQLRRAHEEYYRCKSEYMTYVMEALELEDTIKNYERRDANGWKFVSSFRESRPGTLGSLLDTMEFIWRCVLRKQLQKGFAIVLGCMSAAILLAEATLLPSGVDLSLFSILVKSVGKQEVLVQVAAFVPLMYMCICTYYSLFQIGMLMFYSLTPRQTSSVSLLMICSMVARYAPPISYNFLNLIRLGGDAKTTFEKRMGNIDDAVPFFGRGFNRIYPLFMVVYTLLVASNFFGRLINFFGSWKRFKFQREEENMDGFDPSGMIILQKERSWIEQGCKVGEQVIPLARNFNNVNTDVESGKVPLVENTLEMKSGATSSRADGRVGQSKYANNRETIATKYSAIREQSRQAVKPAKREISSTSVSLLEEGSSEQRSNTGAPVGSSAGISQTWATMKIGFQNFKANMGSKKFIPLRQDPGFAPHSNVSSPESLDEIFQKLKRRPADMPVDYLDDDDENTGDMDPTFPGSTR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..168#825..901#1579..1737#1969..2182#2260..2346#2433..2572#2791..2871#3359..3423#3630..3805#4623..4753#4849..4936#5082..5295#5617..5723#5867..6364#ATGTGGGTGTTCTACCTGATATCGCTGCCCCTGACGCTGGGCATGGTCACCGTCACGCTCCGCTACTTCGCCGGCCCAGGCGTGCCGCGCTACGTCATCGCCACCGTCGGCTACGCCTGGTTCTGCTCCCTCTCCTTCATCATCCTCGTCCCCGCCGACATCTGGACGGTTAGATCACCCACCCCTCTGGATCGCGTTCCTCGTCCGTGTATGGATTCCCCCCAACAATTTCTATGCCGGTGTGGTTAGATCCGCTCCGGGCTGAGCTGATTGCATGTTTTAGTACTGTTGCGAATTAGGTTCTATGATTCGAGCATATTAGGGCATGGTGTTTGGGGTGTTCGACGAGAGATTTTTTGTTGAATCACGCATTTAAATTGTTGGTGTTGGTCACCGGAATGAGGTCTGATGAATAGGTTCAACCTGTCGTCTATCAGAGAGGCCACTAGTTCATTACATAGTTCTAACGAATGCATCATAAACGATGAATCTGAGGCAATTCGGTACTATAGAGAAGTGCATATGGCTTTCCTGACCCCATTTAGCCTTGGAGAAGTTTCCCTGTGCACTACTTGACTACCGACAGCTAGTCCTTGTCGCCATTGTTATGTTGATGACGTCATACAAACTCTTACTAGAGGAACAGTTTGCAGAGAGACAAGTTTACTTTTGACGTCTGTGTTTTAAAAATTAAAACACTAATAAACGACATATATATCCTGGCAACAAATATTTCAGTCTCTACGGGGACTTTATCTGATCACTAGGCTAGAAGATGATTTTGTGAATTCATTTGGTCTGAACTTTTACATAACAACTTGCAGACATTAACTGGCCGTGAGAAAGGTGGCATCGGCTTCTTTTGGAGTTGGTCGTATTGGAGCACATTTATCCTAACATGGTATGCTGTCATTAATTTATCACTATCAAGTATCAACATGTCTTGCACCATTTGTTCCATGGTTGTGATGCTTCTGATCCTCACAGCCATCTGCAATAGCTATTGATGTGAATGCCATTATACAATAGGTTGTTTCTTAGAATGATATGTTAGCACTATTACCAAATATTCAAAACGCATGATTCCTTTCTTTTGATATGCTTCTTATTTTTCTGCTGCCAGAGCAGTGATTTAGAATATCATTCCTTTGGTATCAATGCAATTTGTTTGATTTTTAACTAAACTAAGTCCATACTTGAAAAATTATTGAGTGTGTTGCAGTTCTATTGCATGGTCTGTCAATAGAATGCTTGAATAACCCTTCTTTGAGTGCCTTCTCCTGTGATATATTGCCTGTTTGATATTTCATAGTACTTAAGCTCATGCTGTTCCTGTACAGTGGCTTATACTATTTGCAGTAGGACAATCCATGGTCTTTCTTGGCTAGTAATTTAGTTATGCATTAGTTTGTGTTAGCATTTCTAGAATTCTAGACTATATAGATGCTGGGTGTACTAATATTGTTCTATAGCTTGCAATGGTGTTTATATTTCAGAAGAGCGTTTATGTTTATTTTCTCTAAACATGCATTTGCTTTATTTCTCTAAACAATATCCATAACATGTATCCCTAAACAGGGCTGTAGTACCTACTATTCAAGGCTATGAAGATGCTGGAGATTTCACTGTTAAAGAAAGGCTGAAGACTAGTATTCATATGAACCTGCTCTTTTATTCTATTGTGGGGGCCATTGGCCTCTTTGGACTCATATTGCTTCTAGTGATGCATAGAGCATGGTACGTTCTAACCTCCACTTATTGTCCCTGTTCTATGACCCATTTGATATATAAATTTAGCCTTGTAATATCTTGAAGCTATCATTAGCTACCAAGAATACTACTACTGTTCCCAACAAAAACATTTGTCTTGCCCTGAGTCGTTGAGATTACTTCTTGAGATAACTGCATTCATTTAAACTTTTATTCTGTAAAACCCGATCTCTTTATCTGCAACAAAAATTTTGGCAGGGATGGTGGTATTGTGGGCTTTGCAATGGCATGTTCAAATACTTTTGGGCTGGTCACTGGTGCATTCCTTCTTGGTTTTGGTTTGAGTGAAATCCCTCGAAACATTTGGAAAAATGCAGACTGGACTCACCGACAAAAAGTACTTTCTCATAGAGTAGCAAAGATGGCTGTCAAGCTTGATAATGCTCATCAAGAATATTCAAATGCAATTGTTGTAAGTATTTTTTTTTAAAAAAAGAAATAGTGATGTTGTACTTGCAGCAATTTTCTTAATTGTTATTCTTTTTACAGGTTGCTCAAGCCACTTCTAATCAAATGTCAAAGCGTGACCTTTTGAGGCCTTATATGGATATTATTGACAAAATGTTGGCTCAGATGGTACTAATGCAATCAAAAGCACTACTTAATGTTGAACCTAAAATTTTGCAATTAGATGCAACAATTTGTGATTCTGTCCATTTCAGCTGCGGGAGGATCCATCTTTTAAGCCTTCTGGTGGAAGATTAGGTGACAATGATATGGACTATGATACAGATGATAAAACAATGGCCACACTTCGACGTCAACTTAGGAGGGCTCACGAGGAGTACTACAGGTGTAAAAGGTATAATTTCATAAACTACTGGTTAACTGGATGATAATAGCTGCCCTCCACAATTTCACATTTCTTTTACTAATGTCAAGTATGACAAATGCAAGTTATATGGATATTTCAAATACCATAAATCTTATTTGTTTAGAATGCACAACATTGAAGTTGTGCCATTGTTGCCAACTTGCCATTAACTGATAGTTTTATACTTCATTGGTGTGATTTTACAGTGAATATATGACTTATGTCATGGAAGCCCTTGAACTAGAAGACACCATTAAAAATTATGAACGACGTGACGCAAATGGATGGTGAGTTCATTTATATGTTACTGCACTATGCTATATGCTCTAATTGAATACTTATGTCCCATACTCCCATAAACTGAGCATCTACCTTTAGGGGTTTGCAATGCCACAAGGATATTGCACTTGTCAATTGTCTGGTATAAGTGATGCTAAGTGATATGCCCCTTGTGCCGAAGAAGGTTTAGTTGGTTGGTTAAACAGGAAAAAGGGAAATTGTGTACAAACAGAAAATTTCGATTGTTCTGCAAAGGTTTGGTTACATTATTCTTGGTTATTATAATTGTAATCTACACTGGTATTAGCCAAAAAAATACTTGATTTGGTGGGCTCTTGTTGCTGTAGATGCTTATGTTTGTTGACTTGACTATACAATATGCTTCAATGATTTGATTTAAAAATCTTGATTTGTTTTAACAATCAATTATATTTGTCTGATGAGAGATCAGACCACAAGCAGTATGACCTTAATTTCTTTTTTTCCCCTAAACAGGAAATTTGTGTCAAGTTTTAGGGAAAGTCGACCGGGCACACTGGGTTCCCTTTTGGACACAATGGGTATTTCTTTGACCTATACTAACTTTTTTGCACCGGTTTTGTCCTTATTTATTTACTAGTCAAAATGGCTTACAATGAATTCAGAGATGCAATGTTCTTAGTTAGAATATTTCATTGTTCGAAGATTCTTAGTAAATTCAATTTACTGCTTATGGCTGATAAGTAATCGATGGGATTGACTCCGTAATACTTTTTTGTGTTGCCAGAGTTCATTTGGCGCTGTGTTCTGAGGAAGCAGCTTCAGAAAGGATTTGCTATTGTTCTTGGTTGTATGTCAGCTGCTATACTGCTGGCTGAAGCCACTTTGCTGCCAAGTGGTGTTGATTTGTCCCTTTTCTCCATTCTTGTCAAGTCCGTAGGGAAACAGGAGGTTTTGGTTCAGGTAAGAAATTGGGTGCTTCATGTAAATTGTCTTAGCCTCACGTCCACTGTACAGGGCAGTTCTGTTATCTAGTCCTAACTTTCTGTAATGCTTACTGTAGTGTGTTACTCCCATCGTCCAAAGGTATAAGGCGTATTTTGTTTTGTTAGGGCAAGGCAACTAACAATTGTTAATTTATGTGAGACAAAAGCATTATTATAATAAGTACTTTTGAATATGAATCTAATAGTATCAAATTTTATGCCACAAAAATTATATTCTAATGAGTAATTGTTGGTCAAATGAAACAAAATACGCCTTATATTTTTGGATAGAGGGAGTACTTGTGATTACTTAGGTACTTAGTATATACTACACCAATTCTGTGTACTTCTCTCTATTGGTTACTTAAAACACTCGTAAATTTAGTACCAGGGGAAAAATTTGTAGTACAAACAAATATAGGGCCTGTTCACTTTGATGCCAAAAAAACCTTACCAAAATTTGGCATTGCCAAAATTTTGGCATAGTTGTCAAAATTTTGGCAACTTACCAAAATTTTGACAGGATTTCTTATATAGTTACCAAAATTTGGCAGCAAACTAAATGTAGCCACTTTTTGGCAACTTCACCAAAATTTGGTAAGGTTGGCCCATAGTGTCAGAGACTTCCACAATCTTTGTATCAAAGCATGCTATTCTATTTCTCCATTGTTTTTATACAGGATATATTTCCCTTCGAACAAATGAATTGCCCCTGTCTTGTCACACGACTGTACAATTGCTGTATGATATCTATATTGTCCGTGATGATTCACAAACTTTTCATTTGTTTACAGGTTGCTGCATTTGTCCCTTTGATGTATATGTGCATTTGCACTTACTACTCACTGTTTCAGATTGGGATGTTAATGTTTTATTCTCTGACTCCGAGACAAACCAGTTCTGTCAGCTTGCTTATGATCTGCTCGTAAGTTTTCTATGTTTTCCTTTTCATACTTGACTTGATTCCTTTACCAAAGCTGTTCACTCATTCTACACTTTGCACCAAATGCTATTCTGCAGAATGGTTGCAAGATATGCACCTCCTATTTCTTATAACTTCCTGAATCTCATTCGACTTGGTGGTGATGCCAAAACTACTTTTGAGAAGGTAAAAGTTGTGCAGTTCTTCTGATATTCGTTTGCTATTTAAAGGTGTTGGTAGTTAACATTGAAAAGGAAATGGTCTACCCCTTTTTTCTTTATTACCATGATATCTTGTACCTGATAATCTTTGAATGGACCTTGTGTTGTAGAGAATGGGAAACATCGATGATGCCGTTCCTTTCTTTGGAAGAGGCTTCAACAGGATATATCCATTATTTATGGTTGTTTATACACTATTGGTTGCAAGTAATTTCTTTGGGCGTTTGATTAACTTTTTCGGAAGCTGGAAAAGGTTCAAATTCCAGCGTGAGGAAGAAAATATGGATGGTTTTGATCCGTCTGGAATGATCATTCTGCAAAAAGGTAACGACTGACTAGATTTGTCTGGGTGGATTCCAGCCCTTTCTTTCTCTTTAGATCATATACTAGCCTTTGTTTTGTTCTTATTCTTCTTACTGCTTGCCCCTTCCGTACACACTGGGACTTTTCTTATTTCTTCTCAAACTAAACACAATGTGTATGTCACCATTCAGTATACATCCTTGTTCATTATTGAAATTAGTGGCTTATCCTATCACTATCACCAATCTCTTTGTATAAACACTGAAAAATCTGGTGCAAGTACTCCCTTTGGTTCTCTGAAAAGCATGTTCCGCTGAAGTGATTTATGCACTTCTCCCGCAGAGAGGTCTTGGATTGAACAAGGATGTAAAGTAGGCGAGCAGGTTATCCCATTGGCAAGAAATTTCAATAATGTCAACACAGATGTTGAATCTGGAAAGGTGCCATTGGTGCGTAAGGATGCTTACTCTGCATTCACAAGCTTGTGTTATTCTATTTTTCAGCTTCCTATTGTTTCTGGCTGAATTATCTTTTGCCGTGTCACTTACTGGCATTTCTCCTTTCCATTCTTTTATCTACATGTTGTACACAGGTTGAAAATACACTGGAGATGAAATCAGGAGCTACTTCCTCTAGAGCTGACGGAAGAGTAGGTCAATCCAAATATGCTAACAACAGAGAAACTATTGCTACCAAGTATTCAGCTATCAGAGAACAGAGCAGACAGGCAGTGAAGCCAGCAAAAAGGGAAATTTCTTCAACTTCTGTATCCTTGCTTGAGGAAGGGAGTTCTGAACAGCGGTCCAATACTGGTGCACCAGTCGGCTCATCAGCTGGAATTTCCCAAACATGGGCAACGATGAAGATTGGTTTTCAGAACTTCAAAGCAAACATGGGTTCCAAAAAATTCATTCCTTTGCGCCAAGACCCAGGATTTGCTCCACATTCAAATGTCTCTTCGCCCGAATCACTTGATGAAATCTTCCAAAAATTAAAACGACGTCCTGCAGATATGCCTGTGGATTACCTTGACGATGATGATGAAAATACTGGTGACATGGATCCTACATTCCCAGGATCAACAAGATAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA009085