Os12g0606100
| Gene Name |
Os12g0606100 |
|---|---|
| Description |
Spc97/Spc98 family protein |
| Version |
NM_001073761.2 GI:297613499 GeneID:4352744 |
| Length |
6377 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0606100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:25831432..25837808 |
| Sequence Coding Region |
25831432..25831558,25832432..25832592,25832720..25832911,25833068..25833162,25833492..25833654 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:25831432..25837808 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:25831432..25837808 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcaaccataacaatagtgcgcatcacgataggggaggagaaaaagatatgtcggttcctaaaggttaaggccgcgcatgtaaaggcaaaggggagaaacgattgtggctcatggagaaagagcgggtctcgagtggatccacccatggttcttccccagcaaaacgcgggattgatggaggccgatggctctgcgagctttatacgcaagctgcagctcagcgtttctgatggccttcctcatgcggcgcctgttccagaactgagtacgcaagagcatgaattggttaaaagtgttttccaagtgctccaaggctttgacacggtcttgctctactgggataagactgcacctggatactgtgagaaagcaggggtctatgtttcgcacctgtcgcagacgagcctcagagctgtgctcaagccttttctgtttgctgcgacatggttgaagcaggtggagctctttgttgggaggaggctccgcaaagcagctctgaaggaggaagagcagttgtttctttcagttgacaggactataactctgctgggattgactgattctatgtcaagtttatgttctggagcagaacatttgtatcaagttgtgcaaggagctgtgcctgatgccttttggaattctggcgcacagatagcatctagtgaagtggcggttcatgctgtaaaccatctttttaagaagttaaatgaagtctgtcttgtggaagatggcgagggtgaaccttatcatatgctgcttgtgatattcgctgaaaccttgttaccatatctccagtgtcttgattcctggctctatgatggtattcttgatgacccttatgaagagatgttcttttacgcgaacaaagcagttacaatagatcaaccagcattctgggaaatgagttatatgctcagagtacgaggaccacgaactgatagctcatcaacattagctgacaatgaatctatcaggaaaaaggaattaatcaaccaggaagcaactgctgcagcagctctcttgaaatctagcaatcaaggttgcgcggacatattatgcccagtgttcttgaaagatattgcaagagccattttatctgctgggaaatcatttcagcttgttcagcatgttcaagagacacatcggattcaaactcgtgaagtcgtacatgagtttaatgttgatcagcatggcaattacattagtcaacagaagtttcggcctgatacctcaagtataagaattcaagataagcgtgaagatattattgaagaatctgcaggccagtttggaaataatgcttgcaaaatgggtttcttaaccttgtctgagagtttcttgatatgcctatctggtctgttggaaaatggtgaccatgttgatgattacttaagaaagttgtgtgctgatcatgctccagttaacaaatcaattgtgcacagtaagagtaatgtacaagaaacagaagaggtatgtggagaaaacagctctgagaagacttggttaaagctcctaagagatgctacatcaggtagggactatgacggcatggagaaaactttagcaaaaaatgctgttatgagggatccaacatttgtccctggagatcatcaagatgtatcttccactgcagtagaaagccatttcaacctatcttgctatgaaaaccctggcatcactgcttgtcaagaaatactagagaggaacaaaaactcctggagcgacttaaatatctctaaaagtttccatcttcctccactgaatgatgagaacatacggaagtctatatttggtgatagagactcttcagggactagccctggtgataccctatctacaacatatttccccagactagacggaactgattacaagtttggttttcagtttgatgattcagaatatatccgccaagaggatgacaggagaaccttggagtctctctatacattcccgactcttctgccatgtgtaaatgaaaatgtcccgctgtcagagatcttacctttgcagaaagatagcacacttgcctcaagagctttgaagtttattcagagcatgagtttgagagatcctcttcaaccagttggtatcatccaagaatgcctttctaaatgtataaagagacaggttgatcacattggcaagcaaatcttgtcaaagctaatgggtgactggagattaatggacgaactctttgttttacgtgctatttatttgctagggtcaggtgacatgctgcagcagtttctggtaacaatttttgacaagctcgataaaggaaatccctgggatgatgattttgagttgaatactttgctacaggaatccataagaaactcagctgacaaaatgctcctgactgcgccagattctttggttgtctcgttagcaaagcatgatacgcgcaacgatgaagaaactacatcaatttctaggaaaggtcgtgcacaaggttttggcattgaggcacttgatgtgcttaattttacatataaggtgtcttggcctcttgatctgattgtcaatacggaggcactgaagaagtataaccaggtcatggcattcttactaaaggtcaagcgtgcaaagtttattttggacaaaactcgaaagtggatgtggaagggcggaggtagcactacgcataattttaagcaacatttaatagttgagcagaagctccttcattttgttgatgcatttcatcaatatgtcatggatcgggtataccatagtgcgtggactgagctttgtgatggcatggcatccgccactacactggatgaagtcatggaagttcatgaagcatacctctcttctattcagcgacaatgctttgtggcctctgataagttgtgggccctcatagccagtcgagttaagaccattcttggattggcacttgacttccacaacatagaacagactcttggtactggtggaactgctccagccgtcaaggcaagatgtgagatggaagtggatcgcatcgagaagcaatttgacgagtgcgttgtatttctcctgcggatcctatctttcaagctcaatgttggtcacttcccccatctggcggatctcgttacgagaatcaattacaaccactattacatgtctgacagcggaagcttctctgccatccctggatctcggccacggtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATITIVRITIGEEKKICRFLKVKAAHVKAKGRNDCGSWRKSGS RVDPPMVLPQQNAGLMEADGSASFIRKLQLSVSDGLPHAAPVPELSTQEHELVKSVFQ VLQGFDTVLLYWDKTAPGYCEKAGVYVSHLSQTSLRAVLKPFLFAATWLKQVELFVGR RLRKAALKEEEQLFLSVDRTITLLGLTDSMSSLCSGAEHLYQVVQGAVPDAFWNSGAQ IASSEVAVHAVNHLFKKLNEVCLVEDGEGEPYHMLLVIFAETLLPYLQCLDSWLYDGI LDDPYEEMFFYANKAVTIDQPAFWEMSYMLRVRGPRTDSSSTLADNESIRKKELINQE ATAAAALLKSSNQGCADILCPVFLKDIARAILSAGKSFQLVQHVQETHRIQTREVVHE FNVDQHGNYISQQKFRPDTSSIRIQDKREDIIEESAGQFGNNACKMGFLTLSESFLIC LSGLLENGDHVDDYLRKLCADHAPVNKSIVHSKSNVQETEEVCGENSSEKTWLKLLRD ATSGRDYDGMEKTLAKNAVMRDPTFVPGDHQDVSSTAVESHFNLSCYENPGITACQEI LERNKNSWSDLNISKSFHLPPLNDENIRKSIFGDRDSSGTSPGDTLSTTYFPRLDGTD YKFGFQFDDSEYIRQEDDRRTLESLYTFPTLLPCVNENVPLSEILPLQKDSTLASRAL KFIQSMSLRDPLQPVGIIQECLSKCIKRQVDHIGKQILSKLMGDWRLMDELFVLRAIY LLGSGDMLQQFLVTIFDKLDKGNPWDDDFELNTLLQESIRNSADKMLLTAPDSLVVSL AKHDTRNDEETTSISRKGRAQGFGIEALDVLNFTYKVSWPLDLIVNTEALKKYNQVMA FLLKVKRAKFILDKTRKWMWKGGGSTTHNFKQHLIVEQKLLHFVDAFHQYVMDRVYHS AWTELCDGMASATTLDEVMEVHEAYLSSIQRQCFVASDKLWALIASRVKTILGLALDF HNIEQTLGTGGTAPAVKARCEMEVDRIEKQFDECVVFLLRILSFKLNVGHFPHLADLV TRINYNHYYMSDSGSFSAIPGSRPR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..127#1001..1161#1289..1480#1637..1731#2061..2223#2321..2431#3027..4157#4229..4381#4476..4575#4749..4843#4924..5097#5167..5223#5303..5374#5567..5665#5736..5867#5965..6138#6246..6377#atggcaaccataacaatagtgcgcatcacgataggggaggagaaaaagatatgtcggttcctaaaggttaaggccgcgcatgtaaaggcaaaggggagaaacgattgtggctcatggagaaagagcggtgcgtagagtggcagttaattagcggttgctggtggtatgaggaatttgttcttgacacaatcgtttaattttttcctaagtattgatgatacgttggtcaccagttatataaagaaatagcactagctagttttaaaataccgtgttgtcccaaaataagtgcaaccatgacaatccgtgtcgaacttttgatcgtccgtctttgaaaagtttatgaaaaaattaaaataaattagtcacatgtaaaatattattcatgttttatcatctaataataaaaaaaatttaaataagacaaaagttaaacattggacggagggagtggtaaataaaaatattgagtcgagtatcgcgtaaaagagaaagaaatctctggttgtctcctccgctccttgcgccgccgccaagacgagtcgcggctgaacaggggaggggagggctgggcggcgatctctatcgcagcggaggggaggggaggggatcctggtgcgtcctctttctgattcatctctctctctctctccctcccaccccaccgggactggaatctgcttgcgcttctcttctagatcttctcctcctccttgatttgatagccttaaacctctcttaaataattcaagtaataacagtttgtttgttcacccagaagtcccaagttggatccgcccctgtttattttgtgattttgggtggccattttggggacttgggtgcaatgtttctctgcccaccctggtacaatctgcatttaatttttttttattcaacctgcaaagttatgcaaatttatggcgtcaattgaaatggatggccaatgtacctagctcaatgtgcaattaactctttttcattcacgcaaatgtcgcagggtctcgagtggatccacccatggttcttccccagcaaaacgcgggattgatggaggccgatggctctgcgagctttatacgcaagctgcagctcagcgtttctgatggccttcctcatgcggcgcctgttccagaactgagtacgcaagagcatgaattggtgggtaattcattctgactgccttcacgtctgttcctttcattctcagtgggaattggtgctatgcttcttttatgtgtatgatatcatgtagatatgcactatattggtgttgcacatgttacaggttaaaagtgttttccaagtgctccaaggctttgacacggtcttgctctactgggataagactgcacctggatactgtgagaaagcaggggtctatgtttcgcacctgtcgcagacgagcctcagagctgtgctcaagccttttctgtttgctgcgacatggttgaagcaggtggagctctttgttgggagggtaagatcgtgcggtcatggaactccgacgctgagtgcatttgctagttcggtcgattcttggctaatggtgaggttgcaattcagactgtgcatagatttttcggggatgatgtttgttttgtccgaaattacattgttgtcatgttaatatcagaggctccgcaaagcagctctgaaggaggaagagcagttgtttctttcagttgacaggactataactctgctgggattgactgattctatgtcaaggtcatggtctattctactataacattactgttgtacgaaatggataactaggttagtttttagtagtgatgttgtatgctactataggtgattctagagacatcagcaactctatgtaatgtgtgatggcaaaaaaagttgcatagagatatgagattatagagacatgatagtatagtccttttttttttcctttttacctttttaggtaattttctaaaagccggagaggactgtacaactgacaacttgtgttttcagtttcatgcttctttatcacttgacagattgttgctttcactcaccccataatataaaatcttatgcagtttatgttctggagcagaacatttgtatcaagttgtgcaaggagctgtgcctgatgccttttggaattctggcgcacagatagcatctagtgaagtggcggttcatgctgtaaaccatctttttaagaagttaaatgaagtctgtcttgtggaagatggcgaggttgccacaaaaaagccagttgtccaaatacttggtcttatttgtttattaacagaatgttcaactctcttacatttgaaatctttataaattccagggtgaaccttatcatatgctgcttgtgatattcgctgaaaccttgttaccatatctccagtgtcttgattcctggctctatgatggtattcttgatgacccttatgaagaggtattgaaggaagacattttttgaactacattttgaaattattaactggtattcttaaatttaaagttttctctacacgttagctgtgaaatactgtaaggatggccatcctttgcttgacctgagctaccttggttcaaacataaatcatgataatatcattatgttataaacgcaaatgtttttttttgttggattggcgcttggcagagatcttaatcctattcgatttgtctcctgaaagtcacatataagtatatgcaattatgatcctgacctgtatatcttctactccgtatgagcatactataatcctttctagtataaggttattactcttgtgtctgaaatgtttctttgtgttgggctcattttttaagtttggtgagtcttataaacccttccgttttattaatgcctgctgaggagttgcgtgtgatcatgtagttaaacattacctcgatgcctaatgtaatcctgttagggatgtaagtcctttaattttaattttattgagcaactgtcatgaaatgtgttacttaaatttgcatttttaaaacttccctgttgtggtttgggaacctgttttctgcagatgttcttttacgcgaacaaagcagttacaatagatcaaccagcattctgggaaatgagttatatgctcagagtacgaggaccacgaactgatagctcatcaacattagctgacaatgaatctatcaggaaaaaggaattaatcaaccaggaagcaactgctgcagcagctctcttgaaatctagcaatcaaggttgcgcggacatattatgcccagtgttcttgaaagatattgcaagagccattttatctgctgggaaatcatttcagcttgttcagcatgttcaagagacacatcggattcaaactcgtgaagtcgtacatgagtttaatgttgatcagcatggcaattacattagtcaacagaagtttcggcctgatacctcaagtataagaattcaagataagcgtgaagatattattgaagaatctgcaggccagtttggaaataatgcttgcaaaatgggtttcttaaccttgtctgagagtttcttgatatgcctatctggtctgttggaaaatggtgaccatgttgatgattacttaagaaagttgtgtgctgatcatgctccagttaacaaatcaattgtgcacagtaagagtaatgtacaagaaacagaagaggtatgtggagaaaacagctctgagaagacttggttaaagctcctaagagatgctacatcaggtagggactatgacggcatggagaaaactttagcaaaaaatgctgttatgagggatccaacatttgtccctggagatcatcaagatgtatcttccactgcagtagaaagccatttcaacctatcttgctatgaaaaccctggcatcactgcttgtcaagaaatactagagaggaacaaaaactcctggagcgacttaaatatctctaaaagtttccatcttcctccactgaatgatgagaacatacggaagtctatatttggtgatagagactcttcagggactagccctggtgataccctatctacaacatatttccccagactagacggaactgattacaagtttggttttcagtttgatgattcagaatatatccgccaagaggatgacaggagaaccttggagtctctctatacattcccgactcttctgccatgtgtaaatgtgagactgattctgaagtatagtgtcttgttcatgttttcttattagttgttaaccttttcacccttcaggaaaatgtcccgctgtcagagatcttacctttgcagaaagatagcacacttgcctcaagagctttgaagtttattcagagcatgagtttgagagatcctcttcaaccagttggtatcatccaagaatgcctttctaaatgtataaagagacaggtctgctcaaacattatactagcatttagttatttacgttatatatcttgttagtcgtccgtataacaggtttttgcattttccccctcaacaggttgatcacattggcaagcaaatcttgtcaaagctaatgggtgactggagattaatggacgaactctttgttttacgtgctatttatttgctagggtcaggtattatgctatcaacctatcattgagttgttcttaacctctcgtaatattttccctgaaaaaatctttttactatgtctaggttaaatacatgtttcatcaaagaaacaaacattattttcaaaccaaatgtagaaataaatacaattctattgaccaacttgagccttcaggtgacatgctgcagcagtttctggtaacaatttttgacaagctcgataaaggaaatccctgggatgatgattttgagttgaatactttgctacaggtgattcactatgctaatctagtgcgacaaaattgatgccacataaggatcttaatagctttatcaatttttgtctgcaggaatccataagaaactcagctgacaaaatgctcctgactgcgccagattctttggttgtctcgttagcaaagcatgatacgcgcaacgatgaagaaactacatcaatttctaggaaaggtcgtgcacaaggttttggcattgaggcacttgatgtgcttaattttacatataaggtatgcacaaaacagcaccaatattctgcgttctttaccatgtgttcatgttatgctgttgggtggcaggtgtcttggcctcttgatctgattgtcaatacggaggcactgaagaagtataaccaggtacttactttctagactaattatttaacagtgccatgtatttgatggcttttgaccttttgctgttttgctcgatcaggtcatggcattcttactaaaggtcaagcgtgcaaagtttattttggacaaaactcgaaagtggatgtggaaggtacttatccatcctataaccctgtcaccatcttatggaatctatttatttatttatttttcatgttgtcgtctgataaatctggaaacagtataaactcatatagtgtttgatagttgggtacttgaacctgctctaacttctcaatatgatagattcattctgatgtatcaaacctttccccactggcagggcggaggtagcactacgcataattttaagcaacatttaatagttgagcagaagctccttcattttgttgatgcatttcatcaatatgtcatggatcgggtgagttgggtatttttgatccattcctttctacatctctctactgtactcatgacacagttttgagtaggtataccatagtgcgtggactgagctttgtgatggcatggcatccgccactacactggatgaagtcatggaagttcatgaagcatacctctcttctattcagcgacaatgctttgtggcctctgataagttggtgagtaacttgtcgttcttattacaatcatcaaagcttaattccaaaaactttattctagctaagattgttcattgcggcaattgcctgtgtgcagtgggccctcatagccagtcgagttaagaccattcttggattggcacttgacttccacaacatagaacagactcttggtactggtggaactgctccagccgtcaaggcaagatgtgagatggaagtggatcgcatcgagaagcaatttgacgagtgcgttgtatttctcctgcgggtatgtttcctgtttccatctactaccagcaaaactcgatgatctcctatgttgtctgaacttggtattttcagtagattcatgacaatctcaatatcctttttcagatcctatctttcaagctcaatgttggtcacttcccccatctggcggatctcgttacgagaatcaattacaaccactattacatgtctgacagcggaagcttctctgccatccctggatctcggccacggtag</dnaseqindica> |
| External Link(s) |