Os12g0606600
| Gene Name |
Os12g0606600 |
|---|---|
| Description |
DNA-binding HORMA domain containing protein |
| Version |
NM_001073762.2 GI:297613501 GeneID:4352745 |
| Length |
5413 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0606600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:25849291..25854703 |
| Sequence Coding Region |
25849342..25849413,25850635..25850731,25850829..25850909,25851174..25851266,25851371..25851491 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:25849291..25854703 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:25849291..25854703 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgagcgcagaggcgaaggacggggaggaggtcatgggggaggcacgcgagggcgatccagtggacaagataaggaggttactccgtattgctatctacaacattggatatgttgaaggattttttccagatgcctacttcagtgacattgtagttcgagaagatgacatggtgataaagcagcttgtcccaatcgtagattctgaatcaagaaggctgatgaatttgatagatgaagctgaagcatgtttgtgtgatgcactgaagaagaagtatttgaaaacactggtcttttccatctgtgaaaaatacgaaggcccggtgcttcaggaattcattttctcgtttagctaccccagcacaggtcctgatgaagttgtgatgatgatgactcgcacaggaagcaaagtgattacaaagttcgaagcaagtgctgtcaaagtaactcctaatcaaatgaggagctctgcttgtaagatgattcggttgatagttcagcagacaaggacatacccggtacaagaggagcatgctattgaaatgaagctatcgttctacgaggatacaactcctgaagattatgagccaccttttcccaagtattgtgttaacagtgaggatgtagccatatggaacaacaacatcttgaagatggaagtagggaatataaacaacaagcacgttgtgttaacattgaaggttaagagtgcccagtcctactgcaagaacagtatagttgatgattgttctgactatgagatgtgcgaatgcgaaacatatggttacacttcagctcccaatgatgatactgaagaagactatcacacgggaatgctagcatcaccaattaaagcatggtacccacaagacactggaactcaaatgacgcgtaaaaggaaaactggatttgtgctggtatcttcttcaaaaaagatcaagttccttttggattcaggtgcctctcaccatatttgtaatgataaagccatcatgcgcaatttgaaggacgtgaagaaggagtaccaagtttcacttgcttcatgtggtgggttagagctgaaagcggaaatgatgggaactgtggtcacaaaagatatgaaactcagccaagtgggctatatacctgaaatggaattcaatgtcgtatccattggacaattggcagtccaaggtttgataacaacaggcggggatggtcggttcagtgtcattgatgcaaaggaagcgagagtggttggtgaagggcatttacaaagaaaaacagagaaagttgatggcagagtataccatgaatatgtattcaaatcattgatccgggagattgaaggtgatgatgagaagttaattgaacccttgcgggcagatgatgatgaaatcgatgaggaagaggagaagaaatgctgggtaattgacacagggtgcgggagacacatgattccagatattagtatactaacccaagtcaagcgtgaggaggtcacattccaagcagcatgtggaatcgtgtcatcaacccataaaggattggtcaaggagggaaatctcatattgagggatgtgttgtgctgcccaaaagtcacaagaaaaatgatatcaggcccaatgttggatttaagcggccataggttcacttttaacgataagaaatgctgcatagtgcacaaggatgggttggagctgagaggggttggcaaactggatagggcgactagaacgtacttgttgaaacccggtgaagacagtagagcagcagcagcagcaaaagaggagccaaagatgttggcagcagcagcagaaggatatggtggaccaaaacaagaagccgacacgaagaatatgaggggcaaaggcaagaagactgcccaagcaactaagaggctgcgacttagttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASAEAKDGEEVMGEAREGDPVDKIRRLLRIAIYNIGYVEGFFP DAYFSDIVVREDDMVIKQLVPIVDSESRRLMNLIDEAEACLCDALKKKYLKTLVFSIC EKYEGPVLQEFIFSFSYPSTGPDEVVMMMTRTGSKVITKFEASAVKVTPNQMRSSACK MIRLIVQQTRTYPVQEEHAIEMKLSFYEDTTPEDYEPPFPKYCVNSEDVAIWNNNILK MEVGNINNKHVVLTLKVKSAQSYCKNSIVDDCSDYEMCECETYGYTSAPNDDTEEDYH TGMLASPIKAWYPQDTGTQMTRKRKTGFVLVSSSKKIKFLLDSGASHHICNDKAIMRN LKDVKKEYQVSLASCGGLELKAEMMGTVVTKDMKLSQVGYIPEMEFNVVSIGQLAVQG LITTGGDGRFSVIDAKEARVVGEGHLQRKTEKVDGRVYHEYVFKSLIREIEGDDEKLI EPLRADDDEIDEEEEKKCWVIDTGCGRHMIPDISILTQVKREEVTFQAACGIVSSTHK GLVKEGNLILRDVLCCPKVTRKMISGPMLDLSGHRFTFNDKKCCIVHKDGLELRGVGK LDRATRTYLLKPGEDSRAAAAAKEEPKMLAAAAEGYGGPKQEADTKNMRGKGKKTAQA TKRLRLS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>52..123#1345..1441#1539..1619#1884..1976#2081..2201#2672..2738#2818..2859#3012..3140#3231..3290#3444..3486#3755..3837#4053..4559#4645..5145#gcacgcaaactctcgggcgagatcagcgcaggccgtagagaggggagggaaatggcgagcgcagaggcgaaggacggggaggaggtcatgggggaggcacgcgagggcgatccagtggacaaggtacgcgcgatttcctcgccctcctcctccagccgctgctagggttcgtcgcgagcttgcggctagccgcttgctagggttcgtcgagagcttgcgatttgaggcgttttgctctactggcttcccgctccccaccagttgattccgcttggtttttgtttgatccgttgtgaaatatgcatacctcagtgcagtgctgattaggtcaccccgggtacgtgtttgctcgcgagctgcggattgttgtttgatttgggacccgggatcgcgtgtaacgagttgatgtgtgatctccgttttgcgaattttgtcggtgggattttagacatttttgcgtggggattcaagccgatttggagcgtgatatgtgtgtgtgtttgttgggtgggtgggggggaggtggtggtggagtgtgggccgccaagggcgggcccccggactagttgattcccaactttgatagttgtcaattgtctcagaattgtgtggtatatgcatatagttccgatcggacggatttccatacaagctcgttgcttcaattatttattttttgaggggatgcaaaccatatacatataggaatctctagaaaatgttatctaattgaagtcccacttcatttctgttgatcaattagtgcgtcatcgttcttaatttattgttttacaagcaggtttggtacttaccttttattaatctctttaatgctgcttgcatgtggaactgagagtaagagacacattgatgtatcatgtgtattgtctttgttatgtaggaatttggtctgaacagcacaatgtttatttcaatttagccagacattgatgcaatataagttatttactgaatggtttatttgttacagaaattcccttggaaatggtgggtgggattttaatgtgtgatgctattccttgcaactgcacaatgctctagaccattaggataccgtttatattacaagaatcagtgcataagctcatctttatatgtttttagaaattatgtacggtgtaactttctgtttgaacaaaagaaacccatagtatgttgcttattctgtgtttcagtagcgaatggcacaacacatctgatgtatttctttatgacattgactcattctcaatatttctttatgtcggtagcaataatttgtgacatgttgacgtttcaatttcttcaatctgtgataacagtcatgttacttttataaaacagataaggaggttactccgtattgctatctacaacattggatatgttgaaggattttttccagatgcctacttcagtgacattgtagttcgagaagatggtaacaattggatatgacgtcaaattaaggctttgtatccaaaatctagtatatatgatatcaagttatcatatcaaatgaccttttgttgctatagacatggtgataaagcagcttgtcccaatcgtagattctgaatcaagaaggctgatgaatttgatagatgaagctgaagcatgtactgaactcactcaatgattttactgttcttttttttaatgtactatctatctcttgccttacaatagacctttgttgtttctgtggtccaacatgtctttcaccattatgtttctaaatttacacgagcaaatcatagtcagaatgcaacgacaccaaagtactttgatgaaaattctactgctataaattctagcacagagtgtgtgatgataattttctaatttgttatttcaacaaacttttgaaatcaaaattttaggtttgtgtgatgcactgaagaagaagtatttgaaaacactggtcttttccatctgtgaaaaatacgaaggcccggtgcttcaggaattcatttgtaagttatgccttgtggaatctgaataacctgtaatatttataatttggattgggaatcatatgtcacacatttgccttttatgtgccaatgtttacctgcagtctcgtttagctaccccagcacaggtcctgatgaagttgtgatgatgatgactcgcacaggaagcaaagtgattacaaagttcgaagcaagtgctgtcaaagtaactcctaatcaaatgaggtggtttcataccttaaatgcaattttcttacatgaaattgcattttccgtacaaaagtagttgtcttcacaaacattatgattgtaagaactaagaagttggcagcacaaactaggagtctaaagacttaaaatgtcacatgtttttttctttgtgcaagaactaaggacatactgaaaattgctaggcacatagcttatgatgtggaagtctttaaaaaatgaatggcatcataagaacttattcagttccattagcggacactacggccacaaactattcttggttttcttcatttggcttacaagcctgtagtattgaaggttttgaggtagtcatctttgtagaattgatgtttttcatgtcctaaagattacttcatccttttctgatatgtgcctgttaggtgggaaagtaaaattgtcacctatgatggtcatatattgacattgccacggttttgtttcaggagctctgcttgtaagatgattcggttgatagttcagcagacaaggacatacccggtacaagaggaggtacttttttcacattctacttttgttgcaaagtcacaactgattgtgatgagatgatattgtggtttgttatgttcagcatgctattgaaatgaagctatcgttctacgaggatacaactgtgagtaaaactttttttgttgtttatttatttaaccttattgattcctgggaacctccactacatataaccttatttttttatctcaacaaataaggagataaattccattgttctatttaaatttgttggtttattttctatgttggcagcctgaagattatgagccaccttttcccaagtattgtgttaacagtgaggatgtagccatatggaacaacaacatcttgaagatggaagtagggaatataaacaacaagcacgttgtgttaacattgaaggtaaaatggagaataaggcggaagggctttgccatgtttttccccttttaattaaagatgattcttatcacagtttgttcctttatgcaggttaagagtgcccagtcctactgcaagaacagtatagttgatgattgttctgactatgaggtgaacatcaaacaaatcatacaatgagaacaaattttagtatcattaatgtgcaatgctgtgtgttactaccattaagatacagtaaatctatattcctgttttctttattatttgaagtgttccttgacataatctttcattgtaccacagatgtgcgaatgcgaaacatatggttacacttcagctcccaatggtaattgtttcctcaataatgtttctttgtacttggtgtttctgtaactaatgcaaaggtccaagtaccggtactattgcagaaggtatatttggtgtgtgtagcttaatgtttgccaatgcgtaggtttattcattccttaccacttagagagccatattttgttaattgagtgatgtatttgtatttccagcacttctgaattcgatacatgttactgctgttattctacatgcatgtttgctcttttgacatgctatgtttgcagatgatactgaagaagactatcacacgggaatgctagcatcaccaattaaagcatggtacccacaagacactggaactcaaatggtaatttactattgttccttatattgctattttttgtgcaaagtttataaggtcacacaaaagcatttaaaacaaaccatgccttgatactgaaatttgtctgtattcttccttgaaatgctttgtggtgtattttcagatataattgttgtctatcagttgccttctccaatacttgttttgagctgagctaacatgtgtgaattgtggtgcagacgcgtaaaaggaaaactggatttgtgctggtatcttcttcaaaaaagatcaagttccttttggattcaggtgcctctcaccatatttgtaatgataaagccatcatgcgcaatttgaaggacgtgaagaaggagtaccaagtttcacttgcttcatgtggtgggttagagctgaaagcggaaatgatgggaactgtggtcacaaaagatatgaaactcagccaagtgggctatatacctgaaatggaattcaatgtcgtatccattggacaattggcagtccaaggtttgataacaacaggcggggatggtcggttcagtgtcattgatgcaaaggaagcgagagtggttggtgaagggcatttacaaagaaaaacagagaaagttgatggcagagtataccatgaatatgtattcaaatcattgatccgggagattgaaggtgatgatgagaagttaattgaacccttgcgggcagatgatgatgaaatcgatgaggaagaggaggtgagtcactcataactctctctctaagttctcaataactttggtttcatatattatcttatcctttattttggtcaatatgcagaagaaatgctgggtaattgacacagggtgcgggagacacatgattccagatattagtatactaacccaagtcaagcgtgaggaggtcacattccaagcagcatgtggaatcgtgtcatcaacccataaaggattggtcaaggagggaaatctcatattgagggatgtgttgtgctgcccaaaagtcacaagaaaaatgatatcaggcccaatgttggatttaagcggccataggttcacttttaacgataagaaatgctgcatagtgcacaaggatgggttggagctgagaggggttggcaaactggatagggcgactagaacgtacttgttgaaacccggtgaagacagtagagcagcagcagcagcaaaagaggagccaaagatgttggcagcagcagcagaaggatatggtggaccaaaacaagaagccgacacgaagaatatgaggggcaaaggcaagaagactgcccaagcaactaagaggctgcgacttagttagacatgaaacctgagagtccaccccacacacgggagaatcggatacttcactagaattggtgttcatcttgaatgttcattgtcaacccaatcttgattgtcaaccgttttggcatattttcagtgcaactgcttacagtactttggtagggttgtactgtgtacctgatgagtggactacttatctgatttcagtcattgattgagtacatttaagtgtactgactactgacaagcttcatttatcacactgattgttccaattgttt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
