BGIOSGA009335
| Gene Name |
BGIOSGA009335 |
|---|---|
| Description |
Japonica Group Os02g0827200 (Os02g0827200) mRNA, |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA009335, complete gene. |
| LocusTag |
NM_001055126.1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA009335-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA009335-PA |
| Length |
3997 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:37705306..37709302 |
| Sequence Coding Region |
37705306..37705569,37706024..37706089,37706202..37706300,37706379..37706443,37706529..37706613 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:37705306..37709302 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:37705306..37709302 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACTCCGCCGCCGGCGGTGGCGGCCTCACGGCCATCCGCCTGCCCTACCGCCACCTCCGCGACGCCGAGATGGAGCTCGTCAGCCTCAACGGCGGCACCCCCCGCGGAGGCTCCCCCAAGGACCCCGACGCCACGCACCAGCAGGGGCCCCCCGCCGCCCGTACCACCACCACCAGGAAGCTCGTCCTCGCCTGCATGGTCGCCGCCGGCGTGCAGTTCGGCTGGGCGCTTCAGCTCTCGCTCCTCACGCCCTACATCCAGACCCTAGGAATAGACCATGCCATGGCATCATTCATTTGGCTTTGTGGACCTATTACTGGTTTTGTGGTTCAACCATGTGTTGGTGTCTGGAGTGACAAATGCCGTTCAAAGTATGGAAGAAGGAGACCGTTCATTTTGGCTGGATGCTTGATGATATGCTTTGCTGTAACTTTAATCGGATTTTCTGCAGACCTTGGTTACATTTTAGGAGATACCACTGAGCACTGCAGTACATATAAAGGTTCAAGATTTCGAGCAGCTATTATTTTCGTTCTTGGGTTCTGGATGTTGGATCTCGCAAACAATACAGTTCAAGGTCCTGCTCGTGCCCTTTTAGCTGACCTTTCAGGTCCTGATCAGTGTAATTCTGCAAATGCAATTTTTTGCACATGGATGGCTGTTGGAAACGTTCTTGGTTTTTCATCTGGTGCTAGTGGGAATTGGCACAAGTGGTTTCCTTTTCTAATGACAAGAGCATGCTGTGAAGCTTGTAGTAATTTGAAAGCCGCTTTTCTGGTTGCAGTTGTATTCCTTTTGTTTTGTATGTCTGTTACCCTGTACTTTGCTGAAGAGATCCCGCTGGAACCAACAGATGCACAACGATTATCTGATTCTGCACCTCTCCTGAATGGTTCTAGAGATGATAACAATGCATCAAATGAACCTCGTAATGGAGCACTTCCTAATGGTCATACAGATGGAAGCAATGTCCCAGCTAACTCCAACGCTGAGGACTCCAATTCAAACAGAGAGAATGTCGAAGTTTTCAATGATGGACCAGGAGCAGTTTTGGTGAATATTTTGACTAGCATGAGGCATCTACCTCCTGGAATGTACTCTGTTCTTCTAGTTATGGCTCTAACATGGTTGTCGTGGTTTCCCTTTTTCCTTTTTGATACTGACTGGATGGGACGTGAGGTTTACCATGGGGACCCAAATGGCAACTTGAGTGAAAGGAAAGCTTATGACAACGGTGTCCGAGAAGGTGCATTTGGTTTGCTATTGAATTCAGTTGTCCTTGGAATTGGGTCCTTCCTTGTTGATCCACTATGCCGACTGATGGGTGCTAGACTGGTTTGGGCAATCAGCAACTTCACAGTGTTTATCTGCATGCTGGCTACAGCAATATTAAGTTGGATCTCTTTTGATTTGTACTCAAGTAAACTTCACCACATCATTGGAGCAAATAAAACAGTGAAGAATTCAGCCTTGATTGTTTTCTCCCTACTTGGACTGCCACTCTCGATCACATATAGCGTTCCTTTTTCTGTGACTGCTGAGCTGACTGCTGGAACAGGAGGTGGACAAGGTCTGGCAACAGGAGTCCTGAACCTTGCAATCGTTGTTCCGCAGATAGTAGTGTCACTAGGAGCAGGTCCATGGGATGCTCTCTTTGGGGGAGGGAACGTCCCTGCTTTCGCCTTGGCTTCCGTTTTCTCACTAGGAGCTGGTGTCCTCGCGGTCCTTAAGCTACCCAAGCTGCCAAACTCTTACAGATCTGCTGGGTTCCATGGATTTGGCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDSAAGGGGLTAIRLPYRHLRDAEMELVSLNGGTPRGGSPKDPDATHQQGPPAARTTTTRKLVLACMVAAGVQFGWALQLSLLTPYIQTLGIDHAMASFIWLCGPITGFVVQPCVGVWSDKCRSKYGRRRPFILAGCLMICFAVTLIGFSADLGYILGDTTEHCSTYKGSRFRAAIIFVLGFWMLDLANNTVQGPARALLADLSGPDQCNSANAIFCTWMAVGNVLGFSSGASGNWHKWFPFLMTRACCEACSNLKAAFLVAVVFLLFCMSVTLYFAEEIPLEPTDAQRLSDSAPLLNGSRDDNNASNEPRNGALPNGHTDGSNVPANSNAEDSNSNRENVEVFNDGPGAVLVNILTSMRHLPPGMYSVLLVMALTWLSWFPFFLFDTDWMGREVYHGDPNGNLSERKAYDNGVREGAFGLLLNSVVLGIGSFLVDPLCRLMGARLVWAISNFTVFICMLATAILSWISFDLYSSKLHHIIGANKTVKNSALIVFSLLGLPLSITYSVPFSVTAELTAGTGGGQGLATGVLNLAIVVPQIVVSLGAGPWDALFGGGNVPAFALASVFSLGAGVLAVLKLPKLPNSYRSAGFHGFG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..264#719..784#897..995#1074..1138#1224..1308#1450..1483#1569..1668#2134..2209#2370..2711#2822..2965#3236..3469#3545..3608#3693..3736#3827..3997#ATGGACTCCGCCGCCGGCGGTGGCGGCCTCACGGCCATCCGCCTGCCCTACCGCCACCTCCGCGACGCCGAGATGGAGCTCGTCAGCCTCAACGGCGGCACCCCCCGCGGAGGCTCCCCCAAGGACCCCGACGCCACGCACCAGCAGGGGCCCCCCGCCGCCCGTACCACCACCACCAGGAAGCTCGTCCTCGCCTGCATGGTCGCCGCCGGCGTGCAGTTCGGCTGGGCGCTTCAGCTCTCGCTCCTCACGCCCTACATCCAGGTATACCCACTACCCTTTGCTCTCCCTTCTGCTTCAGAATGGAGAGTATCCGCATTTGGGAACGGGAGCGGATCGCCCATATATGCGTGGCTTGATGCTCCCTTTTCTGTTTCTGCTGACGCAACCGTATCAGAGCACCAAAATTCGCGCCCTACATATTTTGTGCTTTGAATGCAACTGCTTACTGAAATCAAGGTTGCTGCCAAATGGCAATAAGTGAAAAATCAGCCAGGGGAAGACTTGCCTGCTTAGGAATTTCGATACCGTAAATTTCGATACACAGGAGAGGTTTAACTAGATGAAAAATTCACACTCTTCACATGTACATGTTAGAGAAATGGTTTCTTAACACCGAATAACTTGGTGGGCTAATGAGTATTTAGGTAGTATATCTGTTTCACATGACACATCTTTCAGATCTATTTACAGCTATTCATTGTTGATTTTGATGCAGACCCTAGGAATAGACCATGCCATGGCATCATTCATTTGGCTTTGTGGACCTATTACTGGTTTTGTGGTAAGTTTCTGCAATAATTAAATTCCTCTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTCATAACCAGGCATGTCCAACACTCCAAACACAATAGTATATTAATGTCAGGTGATTCTCTGCAGGTTCAACCATGTGTTGGTGTCTGGAGTGACAAATGCCGTTCAAAGTATGGAAGAAGGAGACCGTTCATTTTGGCTGGATGCTTGATGATATGCTTTGCTGTGAGTTAGATGAAGTTTGATAGGTTATCATATGTTCCCATTCTTTCTGTGCTCTAATAGGAAGAAATTCATACGTAGGTAACTTTAATCGGATTTTCTGCAGACCTTGGTTACATTTTAGGAGATACCACTGAGCACTGCAGGTAATCTTTGATACTTCTACTTCCTTTGATAGTTTTCTTCACATCAAGTGTGCCGCCACTAAAATGACGAGTACTGTTTGTTCAGTACATATAAAGGTTCAAGATTTCGAGCAGCTATTATTTTCGTTCTTGGGTTCTGGATGTTGGATCTCGCAAACAATACAGTTCAAGTAAGCCTCTTCAAAAGTTTGCTTGTCGTCATTTGTATTTGCACCAAATTTGTCAAAATATATGCCATGAATTAATTGGATTACCTCACCATGGATGTTCTCTAATATCCTGTTTCTCCTTTCCTTTTTCCCTACATACAGGGTCCTGCTCGTGCCCTTTTAGCTGACCTTTCAGGTAGTTAATGTTTTCATTTTGAATGTCTACCATACTGGACCCACTTAAATATCAGTGACTAAATGATATACCTTCTATTACGTAGGTCCTGATCAGTGTAATTCTGCAAATGCAATTTTTTGCACATGGATGGCTGTTGGAAACGTTCTTGGTTTTTCATCTGGTGCTAGTGGGAATTGGCACAAGTACGTACTTCATGTGTCCTTTATGTGCTTATGTTTACTTGAAGTTTGTTGCTCATAAGTTTGCGCTGTCCTATACATGCTACTGTTGGTAAAGGGTTGAATTGACTTGTTCTACTCAACCCAAATGGATCATTGTACAATTGGTAACATCTGACGGCTGGTAGTCAATCTATATTAATAAACAAAAGCTATATATACATTTAGCAATTTCAGTACCATTTGTTTCAAATACTGGTGATGTTGTTTACCCTTTAAATGATACAAGGTAAAACATTGTCTCAGCATCTTTCTCTTCTGTGGAGAGAGTATCCTATCACATGTTGAAAAGTACTATACGGTGATTACCTGTTTGAAAGGACTACTGTCTTGGTCCTCTTGTTTAGGCATCTTGCTTGATGAAGTCCCTCTAGTTAGTAAGGTTTTTTTTGGCATGAAATCTGAGTTTATTTCTCATAATTATTGCAGGTGGTTTCCTTTTCTAATGACAAGAGCATGCTGTGAAGCTTGTAGTAATTTGAAAGCCGCTTTTCTGGTTGCAGTTGTAAGTTCTCTTAAATCCCGCTGCTGCGCCTGCAGTAGAAATTTCAAGCTGTTTTGTAACAGCCTGCAGAGCTAGCAGGTCATTCTTAGGAATTGCATGTGATATTATTTTGTGGAGTGTGGACTGTAATGTGTGCAAGCTGATAAGCCCTACTATGCAGGTATTCCTTTTGTTTTGTATGTCTGTTACCCTGTACTTTGCTGAAGAGATCCCGCTGGAACCAACAGATGCACAACGATTATCTGATTCTGCACCTCTCCTGAATGGTTCTAGAGATGATAACAATGCATCAAATGAACCTCGTAATGGAGCACTTCCTAATGGTCATACAGATGGAAGCAATGTCCCAGCTAACTCCAACGCTGAGGACTCCAATTCAAACAGAGAGAATGTCGAAGTTTTCAATGATGGACCAGGAGCAGTTTTGGTGAATATTTTGACTAGCATGAGGCATCTACCTCCTGGAATGTACTCTGTTCTTCTAGTTATGGCTCTAACATGGGTATGCTACCTTAAGACATCTATGCATGTATATCAGCTGCATGCTGATTGTCTCTTACTGTTTTGGAATTTGTAGATTGATGGTGTTCATCCATATCGTTTGCTTTGCAGTTGTCGTGGTTTCCCTTTTTCCTTTTTGATACTGACTGGATGGGACGTGAGGTTTACCATGGGGACCCAAATGGCAACTTGAGTGAAAGGAAAGCTTATGACAACGGTGTCCGAGAAGGTGCATTTGGTTTGCTATTGAATTCAGTAAGAACCCTTGATCAATGTGTTTACTATAATTTGTAGTATGTCGCTATGTTTAGATGCTGTTACACCCCAATCATTTCTAGCCTTTCTGTATTTTTATTGGATACTGCTAGTTGTTGCTCTTACTCTATCAAACAACTAGCTGAAAGTCTTAAAACTTAGTTCATGTGCTTTCCTATTCTTTGTGCCCTGTAGTGGTTTAAGCATTTCAGTTGGATTCTAGTCTGAGGTGATAAGTTGGTGGCTTCAACGTTTGGGTCTTTAATACAGGTTGTCCTTGGAATTGGGTCCTTCCTTGTTGATCCACTATGCCGACTGATGGGTGCTAGACTGGTTTGGGCAATCAGCAACTTCACAGTGTTTATCTGCATGCTGGCTACAGCAATATTAAGTTGGATCTCTTTTGATTTGTACTCAAGTAAACTTCACCACATCATTGGAGCAAATAAAACAGTGAAGAATTCAGCCTTGATTGTTTTCTCCCTACTTGGACTGCCACTCTCGGTAAGTACCAGACTTCACAAAATCCTTCCTTGTTGGGTTGGAAGCTTTCTTACACTTGGCTCTTGAATGTCACAGATCACATATAGCGTTCCTTTTTCTGTGACTGCTGAGCTGACTGCTGGAACAGGAGGTGGACAAGGTTTGTGTTGCTGATGTTTTTTTCTTTTACACTATGCTCATGTGATTCTCATTGATTGAGGATATTTTTTTTATCAATCTCCAGGTCTGGCAACAGGAGTCCTGAACCTTGCAATCGTTGTTCCGCAGGTTAGCATGTTCATAAGAAACAAAATGTATTTCTATATGTGCTGTCACTGAAGATGTCTTGACCATCTAATACTCCATTATTCTGTGCAGATAGTAGTGTCACTAGGAGCAGGTCCATGGGATGCTCTCTTTGGGGGAGGGAACGTCCCTGCTTTCGCCTTGGCTTCCGTTTTCTCACTAGGAGCTGGTGTCCTCGCGGTCCTTAAGCTACCCAAGCTGCCAAACTCTTACAGATCTGCTGGGTTCCATGGATTTGGCTGA</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
