Os12g0616600
| Gene Name |
Os12g0616600 |
|---|---|
| Description |
Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S family protein |
| Version |
NM_001073815.1 GI:115489591 GeneID:4352801 |
| Length |
4860 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0616600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:26406577..26411436 |
| Sequence Coding Region |
26407704..26407793,26407875..26407997,26408235..26408322,26409934..26410008,26411000..26411106 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:26406577..26411436 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:26406577..26411436 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>gtgttattggaggattctagtgggaatagttatttgaaggaaggaaggctagtagggtgtgatccatcgtatgatcttgctgttctgaaggttgatgttgatggtgataagttgaggcctgctctgattggaacatcaaagggcttgcgagttgggcagagctgctttgccattggtaacccttatggatatgagcacaccctaactactggggtggttagtggattggggagggagataccatctcccaatgggaggccgattcgtggggctatacagacagatgctgctataaattctggtaactcaggtggcccactaattgactcatatggtcatgtaattggagtaaatacagctacattcacacgtaaaggaactgggatctcctccggggtaaacttcgccattcccatcgacactgttgtacagtcagtccctaacctcattgtgtatggaacatctgtgagcaataggttttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>VLLEDSSGNSYLKEGRLVGCDPSYDLAVLKVDVDGDKLRPALIG TSKGLRVGQSCFAIGNPYGYEHTLTTGVVSGLGREIPSPNGRPIRGAIQTDAAINSGN SGGPLIDSYGHVIGVNTATFTRKGTGISSGVNFAIPIDTVVQSVPNLIVYGTSVSNRF </aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1128..1217#1299..1421#1659..1746#3358..3432#4424..4530#gatagcgcgcgtccaacgagcgccactccagccatggcggtccacccgctgctccgccttctcctcctccggccaccgccaccgccgccgccgccgcctcccaactcaccacccttcgccaccacacgccgcgcttcctccgcctccgccgccgccgcagcggcgctcctcctcctcgcggcctcccctcggccgcgccccgcccgcgccgaccccggcggcggaggcggcgaggacatcgacgaggcccgcgttgtgcgcctcttccaggtggtagtagattccagcacgccgcgtcctaaaccctaacgcgctgatccgaccatcacctttttttcctcctatatatgcaggaggcgtcgccgtcggtggtgttcatcaaggacctcgtcgtcgggcggacgccgggacggggaggcgggcaagcggtggaggcggaggacggcgaggaggggggcgccacggtggaggggaccggctctgggttcgtctgggacaccgcgggccacattgtgagcaagcaccgaccatctccatttcacccccaaaaagatatcatcatcttgttttaaaaagaaaacaattactccctccgtttctaaatatttgacaccgttgactttttagcacatgtttaaccgttcgtcttattcaaaaacttttatggaacatgtaaaactatatgtatacatataagtatatttaacaaatgataaaaaagaattaataattacttaaatttttttgaataagacaaacggttaaacatatttaaaaaagtcaacggcgttaaatatttagaaacggaaggagtatcaccttatggattatttcttgctaactttgttcaaaatatggaatcctgatgcattcatatgcgcaaatatgtgatcataatgctagagtattgttctttaatgtttcaaaaactgattggtcacattggtcgttcaggtgacaaattaccatgtggttgcaaaattagctggggatggatctgcatttcatcgctgcaaggtttcctgttgctgttatacactgaagtgttattaactaaagatagtgaccttccttgttcttgccttttaagttttaaccattggctaattgtttagtgtttcctttaggtgttattggaggattctagtgggaatagttatttgaaggaaggaaggctagtagggtgtgatccatcgtatgatcttgctgttctgaaggtaatgcaccttttgttgatgaagtttcagttatgtgaatctggttccaaattcaatatttgaagtctattggtgctgcaggttgatgttgatggtgataagttgaggcctgctctgattggaacatcaaagggcttgcgagttgggcagagctgctttgccattggtaacccttatggatatgagcacaccctaactactggggtaattatgccttaaaatttttctaagtttttgtttagtacaaagctctgaaattgccagagtcccatattccaaggtggatccatttgtgaaattacctgttagtgcaacattcatatgtcaaaactagagtatttggtaaatctgattatatatatatatatatatatatatatatttgaccgggaaacagtaggggagtaaatatgattatatgatcactgaagtatcttataggtggttagtggattggggagggagataccatctcccaatgggaggccgattcgtggggctatacagacagatgctgctataaattctggtaatctcttgcttcattccatgtcatgtagggcttaaatatcaccttcaattatatagagtaaatcatctttccttgtgacatactccaagtaccaactagttctgaaatggtgtagtgtactgattatttaatttgaaatatggccgatggcaacatttcatattttgcttttgctctatctcagttgagatacatttaatttaattttaaatgtactgatgtagtctttcagattcacttctttttgggcttatcttgtgccttagtggttacttcttttttggtacttgacgtatggactgggttgtctgttctctatgtgagtagaaaccaggggcatggtcctccaaatagaaagctcatctgagatgtgctttcgtgttatattactagtgctgtgctttcctagaagaacgttagatctatggaacttgttctgtttggattagatgcatgaacagagcatatttcagtgtggtggtgtgaattatctgactgtaaggttgaaatagggactaacacaagcatcagctaaatatgtacgccatatggcgagcatggtgaaaaactgtttgtgttgtaagtgatgttggaagatacgttcactgttctaaaaaaatatatgtataaaagggcataacttgttgccttgttggtgcgttgttttgtggccagaccttaaagggtatgattgggtgaacttgatatgggctggcctaaatgcccaagagtccaggtgtcaaagcctatgaattagagttggatgcaatcatggtatagcttctcaatgggccttgagaaaagagaatgggaggtggactggtggcccaaccgcccaacaaatataattcctttgaaaataagatctatagataattctaaatatgattttaactgcacagaaattttctgatcaatttattagtgtataaactaacctataggttagttgacagccacggatttagctaccgaggagctgaaagtggtgctatatattcgtaatgatctggatgtgatttcattgctcaatgaaatatccactatctacaaaattcgtgatgatcatctcattcacaaaactttggtgttgttggtatgccatgaacaatttgataagaaaaagctgagaagaaatgaatggaaaataagtgtaaagtgtttataaattcaattccattccaggaatataattgttcttttcttttcttttctgaagtggaaaataattgttctgcacacaccattcaattccaggaattttaaagatttgcagggcagcttttgattcttattccacaattcttcatttcacatctacttcctccatttcatattataagactttctagcattacccatagtcatatatatgttaatgaatctagacatatatgtgtgcctagattcattaacatctatataaatgtgggcaatgctagaaagtcttataacttgaaacggaggtagtatttgttttttcatgttccttagcttcgtcgcttaatatccagagttcattggtcatataagctgggtatttgtattatgtcaaaaagcacaatttccccttatttcacataattttctaacattgacaaatgacaggtaactcaggtggcccactaattgactcatatggtcatgtaattggagtaaatacagctacattcacacgtaaaggtaatgctcctatattaagatcagcactgcctaaatatcaaaagatgtacagctcacatgattttcatttgcctgctttaatctgtcacgaagagtataaaatggaccgatactttctgtttttatgcgtgccacattttgctgtgcattcagtacaaagattctagtcattgagaatcctttgttgggagaaaccaagaataacagaagtaactgtagagctaacagagaccatgcagcatcatgccttgttgaatccttttcataagtcctcgttcctgtatgatgaaaggaatagttaacagactgtcaggatcaaaaattaattctccttatcataatattgcccaagcagcaggcaaagtcttgttaccatgtagtcaatacctatggtcaaagatcttttctccattctgccttgatttgctgggaagctagattttctctagaaatacaagttgtggccttgctgagatatttcattagaattgaatagttggttcggtgtcgcattgttatttggtgatactgataccctatgcaggtcaggttatgcgatgtaaaactatctaattcaaaccgctgttatccccagcattttctgtacctgtccaaacaattattagcttggaacagaagttgggtaatacccctttctcccaaaataaaaaagaaataaaaggaaaaaaaacacttatctgtttcagttctttgttcttttcactcaatttaaggaaaccggatgtactacacacaagaaaatggctgttgtggattgccagctcgtgtgatcttctgtactagatggccatgatatgatactgctctttatgttgaacgtagcaaacaattaatgcaaatctcacgaattaaatgtagacatttctgtaaccattaatgggtcatctcagtggtgcaaagatactgtgcagaaggtgtactgaaatgctgctgtgccaattaatggacggatttctgtcttgtgtttcaggaactgggatctcctccggggtaaacttcgccattcccatcgacactgttgtacagtcagtccctaacctcattgtgtatggaacatctgtgagcaataggttttgattcttctgtagtacattatccgctagtaaatgcaaggtctccctctgccatgttgattgctctgaaatatatatacttctgctgctactcggatcagtgcattcaaaagaacatctgcttaatggtgatcgtactagaaactttagagaacaaattaaaacgaagccggagccggagttcagtataaaccagtaaggaagaaactaacatatttttggacatgctctggtaattcctctgttgctgaactgatccaatatccatgaagcatttgctgctgaatgctggcttcaaggaaaggaattatcagatgagcctgattacactatt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
