Os12g0621100

From RiceWiki
Revision as of 10:37, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os12g0621100| Description = Similar to Filamentous flower-like yabby protein (Fragment)| Version = NM_001073831.1 GI:115489623 GeneID:4352818| L...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os12g0621100

Description

Similar to Filamentous flower-like yabby protein (Fragment)

Version

NM_001073831.1 GI:115489623 GeneID:4352818

Length

9605 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os12g0621100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:26704085..26713689

Sequence Coding Region

26704631..26704702,26709208..26709345,26711538..26711700,26712056..26712104,26712206..26712281
,26713239..26713364

Expression

GEO Profiles:Os12g0621100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008405:26704085..26713689 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008405:26704085..26713689 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgtctgcccagatcgctccggcagagcaagtgtgctatgtgcactgcaacttctgcaacacgattctcgcggtgagtgtcccaggaaacagcatgctgaacatcgtgaccgtccggtgtgggcactgcacgaatctgctgtcagtgaacttgagaggactgatgcactcagccccagcactacaagatcatcatcatcatcatctccaggagagtggtctgagcggatgcttccgtgatcaaagtggctatccggagtttggtttttctgcagcttcgtcgtcttccaagctcaggctgcctcctgctgctgctgccatggtttcctactcgcagcaaaaccagcagctcgagcaagctctccatgctcgccctccagagaagaggcaaagggtaccttcagcctataacagatttattaaggaagagatacgaaggatcaaagcaaacaaccccgacattagccacagggaagccttcagcacagcagccaagaattgggcacattatccaaacatccattttggcctaagccctggccatgagggtggcaagaagctcgtcgacgtcgaccccatcccaactgctccatcttccaagaagatccaaggtttctactcatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSAQIAPAEQVCYVHCNFCNTILAVSVPGNSMLNIVTVRCGHCT NLLSVNLRGLMHSAPALQDHHHHHLQESGLSGCFRDQSGYPEFGFSAASSSSKLRLPP AAAAMVSYSQQNQQLEQALHARPPEKRQRVPSAYNRFIKEEIRRIKANNPDISHREAF STAAKNWAHYPNIHFGLSPGHEGGKKLVDVDPIPTAPSSKKIQGFYS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>547..618#5124..5261#7454..7616#7972..8020#8122..8197#9155..9280#acatgagccacaagaaataaaagcacttgctagctatgcactgtagcagcattgccgctttgctttgcttgcttgcccccacacgctctctctctctctcactagctaattagctgctactacatcttccatctctctcctctctctctctctctagaaataaggaaggagagaaagagaaagagagagaaaaccagaaaagaggaaagtgagatagctcaatttctccttccttcctctctccatctaatctacacatgcacaaatgttgcagctgatatatggcttagctagcatatgcaaagcaagccttcctgcagtctagtcacctctcaagctacatactcccagtactgcttcatctagctctctctagtagctagctctatcatcatcgatcatcctcctctcaccggccggccaacccaagaagagattattcctcttcatcttcttcttcctctctgttcatcactggcttcggcggcggcggccgcggcggcgatcgatcagctgtgagaagaagaagaagaagaagaagaagaaatgtctgcccagatcgctccggcagagcaagtgtgctatgtgcactgcaacttctgcaacacgattctcgcggtaagagatatatatgtcctgcctgcatctctacctgtatatcatttgcatgcatctctctcttctaatttctctctaatttgcctgcacatgtgttgatgtgtagctagatctgccttcatgagagagtttcatgaagtgattggtctggctcatgcatctgtcctcttccaagtcttatgtgatgtgtgtatatagcttttgatttgaagtgtgtgaaaatttgatcattcttcttgttttgtgttggtaattcttcttgtttcgctttggttgctccttcttctaatttgatttcttctttcttcatcaatattgttgatttcttgaagactgaaagattctcaccaaaaagagaaccatgctctccctgccctgcaggatattatgaattcttctttcttcagatttcactgttattcacaaattccatttaattaaggtggattcattttcactccagaaacatttgctagagaatccacaatatatacaacatatagatgttcttcttctttttccaatgtttctcctctagtgtttttcagtcttcaaaatttccaatattttctcttgtaattttttttcagttttctattgacacagtattttcctcatgcataaaacatcagcatgatccttgtgttgcacactgtgagtcggtggtttcaaattaatcgccttgatttttgaaactagtatctggagagaaacagtgttccacactaacaaacaagaatcaaaataaaaccacacagtattacggtgtctacacgcatgtgcctgcttgcgccttacttgtgcatacatctatgtgcacgatattccaaaaagatttccataaaataatttatttttacttatctttgatgatccctttcttttcccacattgcttgcatgaagggctcttcctttatcttcgcattatttttgtctcttttgggttggaaattgaactacacatgaattcatattttgttttaaaacatatattgattcattgattagtaagttcctatatgacatatattgatttatattgtgtctacaagatatctttctcagaactcgcaaccatgtctaggatgatgttttgcacacatgcctagctagatatataaataaatctggtggatggactgatcaaattaattacaaggatctctgattttttttatctgaactattccttggtttattatcagaaaattcctcagttttacatgtgcatatatatgcaagaggtttgaaaaaaaaaatcgacaccatgtaataataacacagtataatcctattattgttaattaagaatcctcttctgaatcgaagttaactgaaacacatcttgctatgctactgcttatgtgccaatatataattatttgtgcatgaaaatgtcttacaagttagaacaagaagatttagagggggatcggattaattaataagatctcatatagtataatttcagagagagtggaaattaaaggatgtttcagttgtttttaccttgtgaataacaataattaatctatcaacttatatacaaatgatcagcaatacatcgatttcgcactatcacaggaacatgcagctagatttgcatgcacggcatatatagatcgatgcatgtcaagattgtgagatgatggaattaatataattcagccttttattttagatggagcttagaaaataaattgaatcactattgaaaaaaaaagaggtgcaatataatattcagtatccatgtgaaaacatgaaaactattgcaaacaaaacggaggagattatatataatattgtgcgaatggatttaatttggttcctctatgattaatctacacatcatgcttgcatatatacatggtagccgataaatagaagtgactctagtaagtgacggactgctcaaaagtgatctctcttttgttcttggtttaatttggtgcgaatattgcagatagattaaccttaattttatcatagatctgtgtcatcaaggataacacatcatcatgatttagcttttagagtgatttacatatagaatatatagattgatagtctaatacacacgcgtgttttattaaaaaagaataagcttttttttacttgttgatgggtttcactaatttaagcatgactcgaacaaacgcagtagtgtacccgtcagtggtacggttagtggtgttatgaacgatcagatctaattaattaacagagtggccagtacaaatgtcgactggtaagctaaataatcatgatctagtcagtacatctggtactgtgtgtatgcatgtgttcagaatgtatagaagggaaggtttttttttgttttttttatcacacattgtatactacccaactagctgaagttcaagttaaacctagcttataagacaactaatttagtgttaattaaacatgagtttatatttttcattttattagctaacttgaaacttgtcgtcaaccatgttaagtttacttcagctagaacgcaaaagctgaagcaagatttatggtatgattaactaactagggtttacaggatatataggatcaatatatgtccaagtttaactataacacttataactactgattttataattaactaaggccctgtttaaatcccaccctgaatttttttaccctatcacatcgaacgtttgaacacatgtatgaagtattaaatatagactaaaaacaaaactaattccacatattgtgactaagttgtgagacgaatcttttaagcctaattgctccatgatttaacaatgtgttgctacagtaaacatttgctaataacggattatttaggcttaataaattcgtctcgcagtttacaggtggattctgtaatttgttttgttattagactatgtttaatacttcagatgtgacacgccaaaactttacacccctgaatctaagcacccttaagctgtaataagataggagtagtatttctaaaggacatgcaccaccaggtaggcatgcatagcatagagctatatatactgtaccaatagatgagcatagcatgcatatgctatacatagcatagagctgtgaatgtgtaaaatcttgtgcatgtgagtgtgtgaagtggtctctgcatgaagtgtcactatctgctccatcttttcccttagtgtaggggacacacatctctgctccttcactagtttaacatattttgccttgttgggctgagagatgggggcagccattgtacactgtagctgggaagccaatgagcatactctttcaaagcaatgcatatatgaatttttacttctcatactctctctgccaatacagacatggactgtagatgaacttttcaatccatatcttggccttttaatcaattgtatgtgtatatatgtgcatgggcaaattaaataaaacagcagccctacatacacaatgattgttagggatcatgcatgggatagtttattatttgttatgggagtgagtgcccaaaaagagatgaaaagaatcaaactgatcaagccatgattctcatctatctcagctagattgagtgagtgtgatcctgcagcagctgcatgctcccaaaagagaaaagaatggggaacaagagaacaaaagtgatcagctgtatgcaggtattataaaaggaggaaccaatggtggttcaggccagagggtgcaagcctctgataaaagtcataaactgggtcagcataacatgttaaagctagtactataataaaaacaaccacaaaataaaagtagggcaagaaaagtcactgatcaacacaaccctgctgtgaatctcactatcagtgcttttcaatctaccttgatatctgacatttatccactgcttttttctcttattcatgtactgttctcatgtggaactttattacctcatgttaatcacactaatcacaatgaacagtgccgcctcttcgtttcattaatttcttgcatgtgctcacgcagcagaagctactctagcagcaaatacccttcatgtattaaatgccagtaatctaattatagcatgactcttggttaattactacctccatcccaaaatacttgtcgatttgagtttttatttttaacttttgatcattcatcttattcaaaaaattatggaactattatttattttgtctgtgatttgctttattatcaaaagtattttaagtatgacttaattatcttttttttatatttacactaatttttcaaataagacgaatggtcaaaagttacaagaaaatagtcaaagcagccactaatttaggatggaggtagtacttcatttgtattaaaatatattaacccattatctatgaatctgaacattgtccatagattcatagttaaaagttggtatattttaagagagggaggactatctatattctgattaattatatacgcagtaatttaattaattagctactacatatatattaattgttgcatatatacatgatgatccaggtgagtgtcccaggaaacagcatgctgaacatcgtgaccgtccggtgtgggcactgcacgaatctgctgtcagtgaacttgagaggactgatgcactcagccccagcactacaagatcatcatcatcatcatctccaggtttaattaattaattattaatcataaatatttcacccaatgaatatatagtaggtgatgtgcctacacttgttgtctgagttgtctctgctatccattatctgcatatatacataaccacacaccacacaaattatagtactataatttctgtaagagactgtaattaaccatcgtatcagttaaccaccaacaagctaagctaattagctaggacagattaatacgtatgtacttgtgtgatcgattgtgacatgtcattgcacgccaagctcctatagcaaatagtagcttttgttgttgttgttgatgatgtgttgctagctagcagaaaaaaggctactgtagatatgccgatcgatgctgccaagcatgcacaagtcatgtctacagtgattctcattactcatgctatgttgctagtagctagcaaaacaacaagttaatctaactactgtagctcatatagctaggcatctatctacaagaacaactttgcatgttttactgcacgcatgcatgcatagatatgaatatccatgcaaatatgaccaattaatttatggagctatgcatatggacgcatacctgtgttttacactttttaatttactccatatatctaaatacttaaataaattagataacagcgccctccatcctaaaatgtactcaatcctttctaaaatgtagcaacgtattgtctattattcagtactatagattacaatattttgatatgaatggatacatagtaacttgttcagatttaaatctgaacaaatttgtagctaatagttactgccctttagcacactggtggagaaagggttattactatcggttcgtaaccctcctatagtcccggtttttgaaccgggactacgaatccgggactaaagatcgctatctttagtcccgggtaaaaaaattgggagtaaaaatccatttttagtcccggttggtaacatcaaccgggattaaagataaagcatctttagtcccggttggtgttaccaaccgggactaaagaggctaatccggttgctctttccggttcctctttattattttcttttcttcattatttttaaatatattgatttcaccccattccatccccaaaatcccaaatcaatcatcctcaaattgcctccaaatccacaaatcgatcatctcaaatactcaaatacatcacaaaatcttaaaaaaaatacatcacaacttctacaaaattcatcacatattcacatcacacacaaatcaaatacatcacacaataatctcagatccaatcaaatacattcacacaacaatctcagattcttcaaaaaaaaagaaaaagaaaaaaaagaggagaagacgcgcggcgaggcaccgccgccgcgccggctggccggccagccctccgcgccccgccgccgcgcggccgcccaccactgccgcgccggctggccggccggccctccctccgcgccccgccgccagctgccgccgcgccgccgtgccggccggccggcccaccgcgccccgccgccgcgccggccggccgccgccacaagccgccgcctcaccgcgcaccgcgccggccggccagccctcggcgacctgccgccctcgcgccggcttggcagtagagaggagaaggagaggagaagaagaggagaagaatagagataagaatgagaagaggagataaggttgaagagatgagttaaaaatgagaggaggagataaggttgaggaggagaaaggtgttaaaggagaggaggaggtacctcaatccgatcgtgcacacctctccgatctccgcgtcgatctttactcccggttggttttaccaaccgggactataaatagatctttagtcccggttggtgttaccaaccgggagtaaagcgtatggcgatcttttttcctggttgatgttatcaaccgggactacaaatagatctttagtcccggttggtaacaccaaccggtactaaagattgaaaagtatcctgtagcttttaaaccgggactaaagatatttttagtcccggtttttaatacaaccgggactattgtaaaatctggtcgaccgaccaaagatggtttctccaccagtggcatgatgaagcgagtataaacatattaatgttagatttgttttgattagtagttttgatcagtctttaattatactgcaggagagtggtctgagcggatgcttccgtgatcaaagtggctatccggagtttggtttttctgcagcttcgtcgtcttccaagctcaggctgcctcctgctgctgctgccatggtttcctactcgcagcaaaaccagcagctcgagcaagctctccatgctcgccgtaagttaattaattgcatcgatctccttatatattcttttccttattcatttcccttttttttttcttggcctgaaccatgaaaatgtacatgcatatatacatacgatcatgaatattgatcgacgtccatagttaattactttcattgatgttgattaacaagggatgggtatatatattaatcgatacatgtgctgaccatatatatactccaagtaatgtaatgcatgtgatcgagttactggttttaatcctccaatataaatatttatttctacatcctggccatcgtataccttcagcctgtaacagatttattaagttagttttttcatactatatatgaaaacagctccagagaagaggcaaagggtaccttcagcctataacagatttattaagtgagttttttttttcactttactttctgttcatgcgttctctggataaattgttagctatagttgactgaagcatctgtgggttattaatgtttactcagggaagagatacgaaggatcaaagcaaacaaccccgacattagccacagggaagccttcagcacagcagccaagaatgtaagcattttgcatatatatgttgtcatgtcaagtatagtgtacttccctctatcccaaaatatacccaagattccttatattttgggatgtagagagtatattgtagcacgtttaaattatagtcgtagtgctagctagctagcaaacaaaacatatatttgggatttgcctcgcgctgtttaattttgtttttctagttatttagtcacaataattttggttaaattatgtgcatatatatatatatccaatccgtaagatatggggatgtcgtccatatttcttattgagaaaactagctaattaactaaagtgaaaacaaatagcgtctaatccataatgcataacatgatacccaatgatcaatttttcactttgtccataatgcatcatgtggggtgctcatacatagcatctcttctttcagttcgcctctgaccatttatactcctttaaaagacactaatggtgattcactgccacctaccactccttttgcagtttttacaaattatctcctgatattttctgatattatggaatagttcaatatttgtttcaaacaagtgactggcatatttaaataagcaactaaatgatactaacatatttgataaaaaaatgtattttgtctataacatattataatatattttcttttactaatagctaagcatgttcattttgctagttaaattaaatgtgaataacctggattccatactcacttggctcaaaagggggttaatctaagaattatgttactaaaaggtagttacaaagtgtgtcctcacaaaaagttgaggttatgctggtagatcttaaacttgttttttaagtgagccttcaatttcttggtgctaagtttcaactaattaattccaaaaaaaagtcatcctttttcaagaaacaaattaattaggaactcaaaaatttcatttattttgcatgcagtgggcacattatccaaacatccattttggcctaagccctggccatgagggtggcaagaagctcgtcgacgtcgaccccatcccaactgctccatcttccaagaagatccaaggtttctactcatagattgaggggatcaatctgccgataccgataccgcaaataggaggaagagcatcaagagcacaaaacatatatatactgtgagtaaagaagcaaaggaaaaaagaaaagaaatgctgccaccttacctttgttcatgaccaaaaaacttgtgaagacgtatgtcataagtacatagaagaaatcaactcatatagagtgaaaaaaaacatacaaaaaatcaagctactatagctcatcgatcgactgaaaggctgaataaaccattcgaccataatgttgttacatgtataagtatgtttgaagctagctagctggctagttcttt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os12g0621100, RefSeq:Os12g0621100