Os12g0621900

From RiceWiki
Revision as of 10:37, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os12g0621900| Description = Conserved hypothetical protein| Version = NM_001073837.1 GI:115489635 GeneID:4352824| Length = 7381 bp| Definition ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os12g0621900

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001073837.1 GI:115489635 GeneID:4352824

Length

7381 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os12g0621900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:26774914..26782294

Sequence Coding Region

26774915..26775344,26775422..26775438

Expression

GEO Profiles:Os12g0621900

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008405:26774914..26782294 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008405:26774914..26782294 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ttcatttccacaccgaggaagccagggagagagcttcagctctccctctccacctcttgctcgtcgtcgaccgccaagaaggaggagctcgcattcatcgtcgagccatcgtcatcaccaactctttctcgttccatattcctcacttcatgcctaccactttaccctttgacaccatctcatttcatccattgcagcgacggaaacgccgccgtggcccccggagctctgcgcaccgccgcagccgacatcgtcgtcgttccgaccgctgtagaccaagccgagccgagccatcacgccaacgtcttctccttgaagtcctcttcaaaacccctcaataatcccaggcaatggcgcagcaagtacggagatcggccaccgtcttcttcacctccggtcgccgtcgccattgtcgattccgcctcctccgatcttggagtcttttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>FISTPRKPGRELQLSLSTSCSSSTAKKEELAFIVEPSSSPTLSR SIFLTSCLPLYPLTPSHFIHCSDGNAAVAPGALRTAAADIVVVPTAVDQAEPSHHANV FSLKSSSKPLNNPRQWRSKYGDRPPSSSPPVAVAIVDSASSDLGVF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>2..431#509..525#cttcatttccacaccgaggaagccagggagagagcttcagctctccctctccacctcttgctcgtcgtcgaccgccaagaaggaggagctcgcattcatcgtcgagccatcgtcatcaccaactctttctcgttccatattcctcacttcatgcctaccactttaccctttgacaccatctcatttcatccattgcagcgacggaaacgccgccgtggcccccggagctctgcgcaccgccgcagccgacatcgtcgtcgttccgaccgctgtagaccaagccgagccgagccatcacgccaacgtcttctccttgaagtcctcttcaaaacccctcaataatcccaggcaatggcgcagcaagtacggagatcggccaccgtcttcttcacctccggtcgccgtcgccattgtcgattccgcctcctccggtgagccattgtccgattcttcgcgtatacactatccctgggacctcactaacctcatggacacacatgcacgctagatcttggagtcttttgagctgtcgccgtcaacccgaaggagtttgccgccgccggacctgttcgcgagctattacggatgaccaagcttcgccaaccttttctagaatctcggtgagcatcctgcagcctataaaacatacatgcatgcatttctttgggtagatcaagtctatagcacgacatgcaccaccacccgaaaacgttttccgcccggactcgccgccggcgttactccgatgtccactaaccgagaaaagtagagggatggaatcgcaataatatgaccttcattttgtcttttggtcgcaccctcaaacgagccaccgtttgtcgctggcaagcttgagatcgagctcggccatggcctgccctgtctctgcccgactggagaggaaggcagggactttgttttgaaaatttgaacaatcatagggttaaatatgaaaacatacaaaccaatgacatgtggatccatggacctaagtgaacttcacatgaagggcctgttcactttgttgccaaaaaaaaaccttactaaattttagcattttggcaactgtgcagctaaaattttggtaacttgtcaaaattttgacagaatttcttatatagttactaaaatttggcagcaaactaaatgtagccatttttttgacaactttaccaaaatttggtaaggttaaaaatggcatcaaagtgaacaggcctaaagtctagggacttctttgaaagatggtaagagactgacagtggaccgcctggagataaaatctgagaatatacaagagagatacctagaacttgtaaaatccatataaaatcaaatatagattattttgagatgattcaaatttcagtgaactcaccagaatatgaactttaaagctatgaaataaaaacttgcactcacggtacaaatttcacctctaaaatttatctaagttaaatcagacataaagcatgcacaaacttataaaatgcatagaaaattaatttcaactcaaattgaagcaaacttagtttctacagatacaccaacatattctctaaaaacaaagtaaaataaaacatatacacactttatatcaaatgcctctaaaactattacctctaaaatgactagttttagataagctgaactttagaagtttatataaaattcatcttagatcctttttgagtaaactcaagttctgtagaatcaccaaaatatttatttacaagttataaaataaaaatatatacttgctgtataataaaagcttctaaatatttatataaggaataaacaacattagagcatacgttaatttgtaaaatgtgtagaaaattcatctttagtccaaatggagtgaaccaaatttctatagaaccagcaaatagtaagcttcaacatagtaaaataaaatatagcaccttttgtacaggttatagctctaatatttaaatagataacctagaagttaatcacctagtaatggttaagcaaaaaaaatgtgtagaggtatttaaaatgtactctagctatgaataaaccaaaacagaacttgttagaccagagaggtcatatttccagccttagttcccaaaaacttagcatacttaactcatataacaatttctaggttggtatgttaagtaactaacatagaacatccctaattataaaatgtgtcgtaaaataatataaactctaaaattatgaactaagattagattagtcaactaaaataatcattttaaacatcactagcaggatggagcaagttatggacctaaatctccaaagccatgtacacatagcggactatatgcctagaacacgttataacttgcaaaatacataaagaattttggaaatacagatgagtcgtataagaaatctctgtaaaaaagacttgcatgataacttgacatgattttctagaaaaatatatattcaagtgaattctcatagtgaactaataataagattaaaatagccttcactcgttgttttttttgcatgctaacttgacatgattttgtaaaaaaatatacattcaagcgaattctcatagtgaaataataataagattaaaatgcggaggggggagacgggtatgtttttttagttactagcaataaaataaaaagcgggtatgtttttttttttaaaaaaaaagcaaagtggggggggggggggtttgggtttaataaaatgcagtgtgagagatcgatccctagtcggctggatgtaatggcaactcacccaccagcatgctaatctggttgttgtgaaatataatgaacagttaataaataatacatagaatggtggaccgggaacgtccggcccgagtccgagtaactcggggaaccgaacccaccaccggttcaactatgtattggagttgtattagctttggtaacatccacaacgtactatttgaagtgtcaagccaaaccaaaactagccctaaaactcaagggtaccccaaattccccatcgccgccgcccccgatccggcgatgccgctgcgcccgccgcccccgcctcagggattcctcaccgcgtatccatccgcagctttccctccggtgaagcggccgcatgaggacgacctcggcgccggtgacgtgctgaccttcaggttccactccctcgccgtcttgaaattattcgaccgcatccgcgagtaccgtctgcacgattaccggtaccaggcaacgcgaggctggtacagctccgggacggcgccggaggatgctcttcttccctgtgcggttgctcgaccaccgaggatgtatgggtgcgtgatcggggtgcagcgcggtcggacggtggaggtcgtcgacacctccgacatcttgctcgacaccgaccccggaaccctcgaccgcgacttgttgaagaagaagctcgagacctgtaagttgttaaaccctagctaggactttgccggtgcttaattgtttgtgttgtgatgtacattgtttggttatgcagacaagaaggcgttccctggcttggccattcttgggtggtactccattgacactcatgtgacgaacaccgatatggaaaccaaccaggctgtgagtatttacagccattcatttaattcaactatatttgttcaactgcttaatctgtcagactgtcatttggcttagtgtttggtcatattatgaagaaatgttgctgttggtatgtgagacgttggtcatattatgaagaaatgcaaacaatttttttcccctaaggttgcattcaaagtttaacattggggataaaatgttcactgactgctgtacgaatgaaaactcaaaaatgttgatgaggttacaggacattgggatatagttttagcatttgcttgagctcttatagaatctgagtaatatttggttttaaacttgtacacggaatgattatggctggtgtaacagccagcaataatagacaattagatatgctatgctgggatgtgcactgttcttaaactttatgtaaagctctagcttgtttgtgtggatggatggaatggttgaaatttggttttagcttgagaatgtattggaaatatttatcaaatgtatgtctgtgtgatctgtgctatacattttgattttactccttgcatgacatttcttcccttgtactatttttatccagttgatggatgctagtggaacaaccttttatcttctattcaatcctgcaatgaacctttccctgaaggatctcccagtgactatttatgaaaaaggtaagtgaagtttgaaatcgttgaatatttcctaccgtgtaaaccaccaagtttagcactcagcttcttatttaattgctatgttcattaacttaactgtttagagcaataaatggttgttgtttagtgatatgaagattaacttttttgtctctgcaatttttcaagtgcactctaccaataggagtcccactccgttaatctttgtccaaggcaaatataaaactgaggttggttttctcccttttgtttgttttgttacaaatgttatgtacttatgtactaaattacaaccttctttgacagactgtagaggcagagaggatatctttagaccatacgtgtcctgtagtttctgatgttagtgtgccacctcttgttggaaaagggtaagtaaaaaaatctttttcctttttctgagatgacttgaatcacttagagataaatgtggggtatacaaaatcacaaacaaaaaaaataaatgctgtaactttggttttgcacttgcaggcaacatgcaaatattatgcagacttctggatttaagctgatgctgtttgaaattccttctggtttcgcgatgtttgaagtttcacaggaactgattgcacgccctaaggtactaaacttgtcctccaccaccctaatttgatgtaaccttaacttgtcctccaccaccctaatttgatgtaaccttatttctcataatcaatttttttttttgcaggacatatgggcacgatttgcttatcaggatgacattacaaatgtacattttacttttttcaatgctaatgtgtttatttctgttctcgatctcttagtttttaggccatattttgatgtgtttcttgccatcctatttgcaggttattgttaccctgggttctattcagatccataacaaatctgttgctagggatattattgttggtcctggtgacgaactgaaagaatttatcctaagcttttgcactcacaactacttaattgttcaagatgtagagcttaaagatgttatcgagaagaaacttgtgagtttatttctatcgattttgctaaatctttgtcgacaaaattctcctttgaaatcacttgatttttccacctccaactggtgttgagattcgtgctaataatgctccaaaaaattaaaggtagcttacccaccaacatcggggcagtaggattcgattcgatataattacaatgtaacttctatagatatgttgataagttactagttcagcgttcttttagtagtgtcatggtttcgagtttttggctgtccacgtagggtgcctgttaatctgaacctggacgttgcttggtagcgtcaagtagtttgtagatatataattcatctattttagtctgaacagtacgctgcttgttgcatgtttggtggttacaaaaatccgggtgatttgattggaaaaaattgtcgagtgctatatagctagtcccatttctataactagttgatacccttgtgctttgctgcgggatatgggatatgtggatgaatgcatattatatattataaaaatggtagataatgaattgacattgcttcatattgagttctgaaaatacaataaaattgtaaatgatatgtcatgtttgcatgatatttataataattgctagtaggtcataatgtggcatacttacatatgatttaaatactttaaataatgattgctaatgggtgatgatgtggcatacatgtttagctttaggagttagtaagcatcaactttataatcagatacttatgggtggatgtgatgatgttttgggatggagggagtaggattcttttgttttttgtggaataatcattgtttacctaatatatcatattcttataatttttcagaatatctattgttactgtaatccaactgttgtcggtgaattgacatggggactgaactatgtcctacataagttgttacctcaagagcaaagtttaactcatgagccttatcttccactaagcaaggcaatgtctaagcagataaaagaatatggattcaaaatctcgccacgagaggtaattctcttttctacgatagtttcattttgattggtgtgacttgaggtctagcaaatatctaaatatctaaatatttcagtggcggatccacaggtgggtggggcttggtgcgcaagccagctccatccctttcctctaattagcgactaacgactctaattaattagccattagatgtataccagtacggcaaagaaactagctgaagcgctcattgtctaaattacgttgcaagtgtgaaatatgctcaccatacaaattgttcataggtatgtgtgaatataatgtatagctgcaaattaaaacgaagaaattataagcaataggttgtcttttgatctaatgtgttttgggtttcatctaataatatttgtttggtatatgttagtttgtttcaatcacataactatttctatacacgagctcctcaatcacacaactattatatatattaattgatgtctcattatttcagattgacagagagttcctaagagctatgagttttttaaattatttggggtatatgtcagagcgttattcactgctgctagatcatttgtttggacaatatcgtaagaataatatgtccgacattgaatttgctaaatcaattgcatctcatcttcattcctctgaggtcagtgggcaataaactgatagttaactgaagatttaatttggttattggctaatatgatttattttctttgatttaatacagggaattgtaccaagagatgagagatacactagagcagagattatggagttcattgacttcataattgcagctcctgaaaacagaagccggacgctatcgttcctgcggcgcatcgaggcagcttctattgatgattctcctccaccgccttcactgccaggagggatgggtgtttcgttgttgaagcgtcttcgtttggattggataactgtttgttgtctaggatgtgcagttgctctttaccctttctaccgcagagtatgaatgactttgttataaaattcactatgttttgaggacaaatacatattctctgacctgcttgattagtacc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os12g0621900, RefSeq:Os12g0621900