BGIOSGA014983
| Gene Name |
BGIOSGA014983 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J013058P10, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014983, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0006M15.13 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA014983-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA014983-PA |
| Length |
4417 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:20891349..20895765 |
| Sequence Coding Region |
20895665..20895765,20894899..20895449,20893455..20893693,20891349..20891903 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:20891349..20895765 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTACCTCTGGTCCGGCTCGCGGGTGGCTACCGGCGCTTGCGCGAAGAATCGCTTCAGTCACGGGGACGCTTAACCCTCCTGCCAGTCGTGTTTCTCGATTTCCTGGATCTCGGAACATGGCCAGCGGCAGTGGAGTGGAAGGCGAGGGATTGGGTATACCATACAGGCGCCGCTTCATCCCATTTGCCAACGATCCTATCCACACAACCAAAGATAATATCATTTCTATGGACAAGCACTTTCCCATCACCCAAGGCAAGGACAGTGCTGCAACTAAGGAGTTCATCTCTAGTTATGGCCATTGCCGTCCTACCACGTATGGCGATGAAGATGCTTCTAGGACAGCTGTGGAGGTCACCGGTGGTAAACAAGATCCAAGGGGGGCAGTTCAGAACCTAATAGATGGTGAAGTGGCAGTTCAGGAGCTAATAGATGGTGAAGAGATTGCAAGGAACCAAAGGGCCAGTGAGGTTAGTGACAACGATGGATATGAAGAGTTCAATGATCGTGCCGTTAACTACCACTGTGACTGTCATGTTTGGACGCCACTTATTGCAAGCAGCCACCGTGACGGTTCTATATACGATACCAGGGGCACCTTTGGATCTGGGTGGAAATGGGATTATCGTATTGCAGATCGTAACGAGACTCGGTTGGAGGCAATGATGTTATCACATCCCACGAAAGATTGCTACATGAGGGATGGAACTTGCATATGGCATCCTGCAAATGGCATGTTGCAAATTTTCTCAGTAAAGTTGGCTAAAACTCCTGTAGTTGATGGCTCAATTGAATTGTATGGATACATTGCTGTGCGGGACCTTCAGGATCCATTACTTAATTATATAGTCAAAATTGGCAGGGATGATCCCATCATTGTGGAGCAGGGTTCCCTCATCGAAATGACTGGCCCTAAGCGAGGGATCGACTTTTCTTGTGCTGTTCTAGTTGAATATGACATGAGAATCAAGACAGGAGAACGAGAGGAAGATGATCTACAACTGATTGATGGTGCAACAGATCTTGACCATATATTGACATCACATGTACCAGTGAGAAATCGCATTTATGGAGATTGCGGCGCAGTTGACATAACTCAAGCGAATCTTTTGTATGCATTTGAGGCGACTGTAGAAGTCGTCATATCAGAAGTGCAGACTAGTTTTGATTTGTGTCTCAGCTGTTTTACCAGTGGGTTACATGAGGAAATTCGGCTCTTTGATGGTGCGATCAGTGAGTCACGTGACTTGAGGAGGTATGTGATTGCTGTCATGGAACATGAGTGTATGGATTTGAAGTTCAAGGTAGGTTTAGGGTCTGGGTGTTTCGCTGAACATTGTCGATCCTTCAAAGCAACTAATCATGGATGTGCCAGTGAACAAATAAAGATTGAGTTCGCCTCAATCTCGGTGAAGGTCACTTGGTCGGCTATGGAGTTCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATSGPARGWLPALARRIASVTGTLNPPASRVSRFPGSRNMASGSGVEGEGLGIPYRRRFIPFANDPIHTTKDNIISMDKHFPITQGKDSAATKEFISSYGHCRPTTYGDEDASRTAVEVTGGKQDPRGAVQNLIDGEVAVQELIDGEEIARNQRASEVSDNDGYEEFNDRAVNYHCDCHVWTPLIASSHRDGSIYDTRGTFGSGWKWDYRIADRNETRLEAMMLSHPTKDCYMRDGTCIWHPANGMLQIFSVKLAKTPVVDGSIELYGYIAVRDLQDPLLNYIVKIGRDDPIIVEQGSLIEMTGPKRGIDFSCAVLVEYDMRIKTGEREEDDLQLIDGATDLDHILTSHVPVRNRIYGDCGAVDITQANLLYAFEATVEVVISEVQTSFDLCLSCFTSGLHEEIRLFDGAISESRDLRRYVIAVMEHECMDLKFKVGLGSGCFAEHCRSFKATNHGCASEQIKIEFASISVKVTWSAMEF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..101#317..867#2073..2311#3863..4417#ATGGCTACCTCTGGTCCGGCTCGCGGGTGGCTACCGGCGCTTGCGCGAAGAATCGCTTCAGTCACGGGGACGCTTAACCCTCCTGCCAGTCGTGTTTCTCGGTGTGTTCTCCTGCTCTGATCCTAAAGTTTGGGCCTTTCGTCTCTTGCTAAAGTTCTCGATATAGATTCTGTTGAATTTAGTTTTTTTTTGTTAGAACTATTTGTTCTTATATCATGTTGGTGTTTTGAGTATAACTAGGGAAATTATTTCAATCCCGACTGATGGCACTTGAATCGGACGCAAAGATTTACCCTTTTATGCTCTTTGTTCATAGATTTCCTGGATCTCGGAACATGGCCAGCGGCAGTGGAGTGGAAGGCGAGGGATTGGGTATACCATACAGGCGCCGCTTCATCCCATTTGCCAACGATCCTATCCACACAACCAAAGATAATATCATTTCTATGGACAAGCACTTTCCCATCACCCAAGGCAAGGACAGTGCTGCAACTAAGGAGTTCATCTCTAGTTATGGCCATTGCCGTCCTACCACGTATGGCGATGAAGATGCTTCTAGGACAGCTGTGGAGGTCACCGGTGGTAAACAAGATCCAAGGGGGGCAGTTCAGAACCTAATAGATGGTGAAGTGGCAGTTCAGGAGCTAATAGATGGTGAAGAGATTGCAAGGAACCAAAGGGCCAGTGAGGTTAGTGACAACGATGGATATGAAGAGTTCAATGATCGTGCCGTTAACTACCACTGTGACTGTCATGTTTGGACGCCACTTATTGCAAGCAGCCACCGTGACGGTTCTATATACGATACCAGGGGCACCTTTGGATCTGGGTGGAAATGGGATTATCGTATTGCAGATCGTAACGAGAGTAAGTGATATATATCTATTTTCCTGTTGTTATCTATTTTATAATTAGGACATTTGTCAAGCTATAGGTTCAGCTAATATATTCTATGTTGAAAGGTTAGTGTGCATTATATTTTGTACTTAAAATGATAAATTAAACTACTAAAACCGGGTCACTTCACCCCTGCTTTAAATTGAGATTTTGTACCATAATATGACACTCCACTCTATGTCATGAATACTTTCGCAATTTCTCATGATTATCTGCATACATTATCACATCCCAAGGGTTTGTGTCCAGGAGGAAGGTGGCAGCAATGCTGCCACTTATGCAACCCTAGGGTGCCAACCAGTCCTATGGCTGCTGGGGCCCACCATGTGGCCATCTGACCTACATGCCCTAAACAACAAACAAGACGAGAAATTCTGTCTATTATTAAGAGTCTGGAGTCTAGTAGACTAGGAAGTTATCAATTAAATAGAAATATATCTCCCATTTAAGTTAAGGGTGGCATAATAGATGATATTTATATCAAACCACAGCTCTAAGTATCGGAAGAACTTTTTATTTGCCACTACAGAGTGTCCTATTCTGGGATACGCCATTGGAAAATATCTTATACGGTCTATGGCATCCACCTCACAAATTTCACCCTTATTTGCAATTGTTGACCAGTCAAGACATGGGAAAGGTGTAAAATTAGGATGCCTCATCCACCTCCTAGGTGATCATTCCCACGATGGCCATGATCTAACTGGTGATGCCTCCTCGATGGCACTATTGAACAGAGGCAGCATTCTACCATGACCACAATCGATGAAGTGTCACAGAATAAATTGCAGACTTTGTGCTTGAGGGGGACAATTGTGGACCAGTGGAACAGAGCCCCCTCAACTCCAAACCATGGTGGTTTGTTCCCTTGTTTGGGACCTGATGTTCTTTTCTTTTTCCCCTTTTTTTTTATTTTCTTCTGTCAGTCTGAATTGGTTACTAGAAATTACATTGGACAGAAGGTGTTTTTTTTTTTTTGCCTTATATTGTCCCACATGAAGTGATCTGGTTTTAGTAATTAGGTGGGGGAGTGAAATGAGACGGGAATTATCTAGACAACCAAAAAGCTTTAGTCATTAGAATGGACTTTCTACCTTTATTTTTATTGTACCATGCATGTATTTTATCTACTCTTTAAGTTTCCGTTACAATTTGGCATGTCATCTTTGTTGTAGCTCGGTTGGAGGCAATGATGTTATCACATCCCACGAAAGATTGCTACATGAGGGATGGAACTTGCATATGGCATCCTGCAAATGGCATGTTGCAAATTTTCTCAGTAAAGTTGGCTAAAACTCCTGTAGTTGATGGCTCAATTGAATTGTATGGATACATTGCTGTGCGGGACCTTCAGGATCCATTACTTAATTATATAGTCAAAATTGGCAGGGATGATCCCATCATTGTGGAGCAGGTATGCTTCCATGCTCTCTACAATTATTTCAAATTACTTTATTTGTTTCACATTATAAGATCAAACTTACAGCATGCATGGAACAAATGTGATTAGAGCTTACCCAACATTAACCTTAACACTAAACCGTCCTTCACCCATGGTTAGCCAATTTTGTGCTAAATGGTCATTTAAACAGAAACGGCTAACCACCATGTGGCGTTTAAACAGGCTAAATGACCATTCAGTTGAACAATGAGGTTACCTTTTGTTGTTACTCCCTCCGATTTCATTTTAATTGACGTTTTGGACAATGACACGGTCTACAAAATATATCTTTGACCTTATTTTTCTATTATAATATATGCAATAAATAAATGCATGTTTACTTTTATTATAGTGCTTTGAAAGATAAATCTATATATGTTGTCCTAGTTTTCTTTAAACTAGATATTTTAAAAGTTATTGATGGTCAAAGTTATAAAAGTTCGATCTCAACCTTGTCCAACACGTCAATTATTTTATAGAGCCGGAGGGAGTATTTTTACAGCCACAAAATATCTTTTACATTACTGAATTTAGGATAGAGTGGAAATGGTGTATTAGGCTCAGTTTGATAGTGTAGGCTCAGTTGCAATCTTTTTTTCTTAAAAAGAAATGAAATAGTAGTAGTCTATGGTTTCCGCCATATTTCTCATGTGAATGTTTTCTTTTCTTAACAGAAACAGGCTGCTACTATGATTTTCATTGTCCCACCATGATCTAACGGCTTAGTTTTTTTTTCTTTGATAATGTGGTAATTTTTTTTCTGAACAGAAACATGCCGCTACTATGATTTTCATTGTCCCACCATGATCTAACAGCTTAGTTTTTTTTTCTTTGATAATGTGGTAATTTGTAGGTCTTCAAAGTGAACATAGTGCCTCTTTTTCAAGCTTTCTTTATAGTATAATAGATACATAACATACGTGCCCGAAAAGGCAGCTAAAATATTATAGTGTTATAGCTGCAAAAAATTTGCTTCCATAAACACATGTCTGGACAGTGAGGAAGGTGAGTTGGGATGCGATTAGTGTGTCCAAAAGTAACAAAATAATATTATGGATTGATAAGACCTTTATCAAGTACTATATTGTGGAATGATAATTATGATCAGACCTGTATTAATCATGAACTAGGTGCAAGTGAGTGTACGTGTTGCAAACAGAATCAAATAGAATAGTTTCGAACCCTTTGGTTCCTGCCTAGTACCACATAAAATTGTTCTTTTTTTGGTTGTCTACAGACATATGAATGACCCTTCACAACAAAGTCCTTTTTTGTTTACATTTCACACAAGCTTATATGATTAATATTTTGGAATTCAAAATTAACTCAAATAAATAGCGTGGGACAAACCTTCTCTAACATTCTTGCACACATTGTAACCGTTCTGTTTGACACATGACGAATATCTTGGGCATCAACTGTAAAATGATCCGTTTAGCTAGGCATTATTGTGACTAAAACGTTAATATTTTCTTAGTTACTTACTTTGCTATGAAGAGCTACTAAATATTAATATTTTTTTAGGGTTCCCTCATCGAAATGACTGGCCCTAAGCGAGGGATCGACTTTTCTTGTGCTGTTCTAGTTGAATATGACATGAGAATCAAGACAGGAGAACGAGAGGAAGATGATCTACAACTGATTGATGGTGCAACAGATCTTGACCATATATTGACATCACATGTACCAGTGAGAAATCGCATTTATGGAGATTGCGGCGCAGTTGACATAACTCAAGCGAATCTTTTGTATGCATTTGAGGCGACTGTAGAAGTCGTCATATCAGAAGTGCAGACTAGTTTTGATTTGTGTCTCAGCTGTTTTACCAGTGGGTTACATGAGGAAATTCGGCTCTTTGATGGTGCGATCAGTGAGTCACGTGACTTGAGGAGGTATGTGATTGCTGTCATGGAACATGAGTGTATGGATTTGAAGTTCAAGGTAGGTTTAGGGTCTGGGTGTTTCGCTGAACATTGTCGATCCTTCAAAGCAACTAATCATGGATGTGCCAGTGAACAAATAAAGATTGAGTTCGCCTCAATCTCGGTGAAGGTCACTTGGTCGGCTATGGAGTTCTAG</dnaseqindica> |
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