BGIOSGA015454
| Gene Name |
BGIOSGA015454 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015454, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBB0067G11.13 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA015454-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA015454-PA |
| Length |
11707 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:8940981..8952687 |
| Sequence Coding Region |
8952589..8952687,8951611..8951640),complement(8951182..8951277,8950404..8950523),complement(8948810..8948910 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:8940981..8952687 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCACTTGGCTATGCCGAGAAGCTATCCTACCGAGAGGATGTGGGAAATGTCGGCATGCCTGAGATCTTCGACTCTCCTGAACTCCTCCACAAGAAGATAGAAGAGCTTGCAGTCATGGTGCGAGAGAGTAAGCATTTGGTGGTGTTTACTGGAGCAGGCATATCAACTTCATCAGGCATACCTGACTTCCGAGGGCCCAAAGGCGTGTGGACACTGCAGGTGCGTTCAGGAAAAGGTGTTCCTGGTGCATCACTGCCGTTTCACCGAGCTGTTCCAACCTTGACTCATATGGCACTGGTTGAATTGGAAAAAACAGGACGATTAAAGTTTGTCATAAGCCAGAATGTTGATAGCTTACATCTCCGCTCTGGCCTCCCAAGGGAGAAGCTGGCTGAATTGCATGGAAATTCTTTCAAGGAGATCTGCCCAAGCTGTAAAAAGGAGTACCTTCGTGATTTTGAAATTGAGACGATAGGACTGAAGGATACTCCAAGGCGTTGTTCTGATAAGAACTGTGGAGCTAGATTAAAAGACACAGTTCTTGATTGGGAGGATGCTTTACCCCCTGAGGAGATGGATGCTGCCAAGGAGCAGTGTCAAACAGCTGATCTTGTCCTATGTTTAGGAACTAGTCTGCAGATTACTCCTGCTTGTAATATGCCTCTGTTGTCACTGAAGAATGGGGGGAGGGTGGCTATTGTAAATCTTCAGGCAACTCCGAAGGATAAAAAGGCAAGCCTTGTCATTCATGGACTTGTGGATAAGGTCATTGCTGGGGTTATGTATATGATGAATCTGCGTATCCCTCCATATATTCGTACTGACTTTGTTCAAATTAGTCTCCGGAACTCGGTCAAAAAAAAATGCGTGAGATGGACTCTCCGAGTAACAAGCATTCATGGCTTGCGAGCACCTTTGCCATTTCTTCGATCAGTTGAGGTTTCCTTTCCTGAAAGACCTGACATGAAGCCTGTAGTACTAAAGGAGCAACCATTTTCTTTGCAGAGAGAAACATCAATGAATAGACCGTTTGTCATGCTATTGACATTCAACTTTAGTGATGGTTGCGGCTGTTCGAGCTCTTCCATTGAATGGCCTGTTGATTTTCTGAAGCAAAAAGACAGCTTTGTCAGGGATAGAAGTCTAGTCCTGCAAGAGTTGCAACATGCTGCAGAGCATCGATCACGTGCAGGGCAGCATGCAATTCTGGAGAGGGAGGGTGTGCCAAGAGCTGAAACGTCAATTCATGCACTTGTGACCAACATCGTCAGGTATGATACTGAAGATAGCAAGGCGGCAGTTCCCATGGCTACATGGATGAACAGCAACGGCAGCCTTTCGAAACGGCATATGGATGCCATTGGTTGCAACCCAGCATCGTCAAAAAAGCAGAAGTTGGTTGCTACTCGTCATCGGCGAAAGGGCTTGAACCCTGCTACTCAGAAAGTTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSLGYAEKLSYREDVGNVGMPEIFDSPELLHKKIEELAVMVRESKHLVVFTGAGISTSSGIPDFRGPKGVWTLQVRSGKGVPGASLPFHRAVPTLTHMALVELEKTGRLKFVISQNVDSLHLRSGLPREKLAELHGNSFKEICPSCKKEYLRDFEIETIGLKDTPRRCSDKNCGARLKDTVLDWEDALPPEEMDAAKEQCQTADLVLCLGTSLQITPACNMPLLSLKNGGRVAIVNLQATPKDKKASLVIHGLVDKVIAGVMYMMNLRIPPYIRTDFVQISLRNSVKKKCVRWTLRVTSIHGLRAPLPFLRSVEVSFPERPDMKPVVLKEQPFSLQRETSMNRPFVMLLTFNFSDGCGCSSSSIEWPVDFLKQKDSFVRDRSLVLQELQHAAEHRSRAGQHAILEREGVPRAETSIHALVTNIVRYDTEDSKAAVPMATWMNSNGSLSKRHMDAIGCNPASSKKQKLVATRHRRKGLNPATQKV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..99#1048..1077#1411..1506#2165..2284#3778..3878#3999..4107#4558..4637#6442..6520#8300..8353#8427..8520#8912..8991#10186..10253#10337..10439#11366..11707#ATGTCACTTGGCTATGCCGAGAAGCTATCCTACCGAGAGGATGTGGGAAATGTCGGCATGCCTGAGATCTTCGACTCTCCTGAACTCCTCCACAAGAAGGTTGGTTTCACATGCCATTAAACTTTTACCTCCAGTTTGTGGATTCTTTGCTTCAGGGTGGCAAGTTACGAGGGAATCATCCATGGGTTTTGTATTTTTTTTGAGCTAAATTATGTGGTCAAATTGATTCTTTTAATGGGTTTTAAGCATATTTTACTTTAGATTTTTGGACAAAGTGAGATTAGCTTGAAATGTAGTCACTCAATTCTTTTTTATTCATCAGTTTGGGCATTGACATGGTCCATAACCTTTTCCATTTTATGATTGTGAAAACTTTTAAAAGTATAATCATGTTGAAGTACTTTTGGTAAGAAATACGCTAATACCATTTTCATATGACAAATCTAAATAGCTTTACTGGTAAAAAATATCTTTGAATGTTGATTACATGCATTCTGGTATGATGAGTAGAACATAATGGAGAGTATACTAAACATGAGTGAACTTAGAAGAGAGAAAACATTTAGCCTTTGCTGTTTTTTACCCTTAGAGCTGTATGTGGGTATAATGCAGAGCATGTGTGTGATCTTTGAAAGAAGAGAGTTCTTTATTGTCTACTCAAAGTTGATCCCTTTAATGTCATTTCCTGGTGGCAAATAAGTTGACACCTACTGTCTTTGTTTGGTGCCTGAGTTCTATCCTCATCTTATAATTTGATCATGAACATGTTAGCATAAGTTATGCTCGGCTCCATGACAGTACTGAAGCAAAATTGATATCAATAATGGTTATGGCATGGCTCCAGCGCTCAAAATATCCTATCGCGCTGGAAAATATACTAAAATGAACTAATGGCTGTGAAATATCTGGCAGGCATTTGATCTATCCTCTTGTGGCTTTGTACACTCCATGTTGTAGTCAATATTTCTATATACTGATAGGGGTGCGCCAGTGAATTTATTTCACATTTTAGACTTGTTTTAATTTTTTTACTGGGTTGTTGTCCAGATAGAAGAGCTTGCAGTCATGGTGCGAGAGGTTTGTTTTTCACTGTGAATCTCAATAAATTTTGTAAATTATGATTTATATATATACTCCTCCGTTTTTTAAAATATGACACTGTTGACTTTTTGAGATACGTTTGACCAATCGTATTATTTAAAAAATTCATGTAATTCTCATTTATTTTATTGTGACATGATTTATCATCAAATGTTTTTTAAGCATGACTTAAATATTTTTATATTTGCACAAAAAAAATTGAATAAGACGAATGGCCAAACGTTTATAAAAAAGTCAACAACATCATATATTAAAAAAAAACGGAGGTAGTATATAGAAATTTCAATGAATTGGTCCTGATTGCTGCAGAGTAAGCATTTGGTGGTGTTTACTGGAGCAGGCATATCAACTTCATCAGGCATACCTGACTTCCGAGGGCCCAAAGGCGTGTGGACACTGCAGGTGGTACTGCTGTTTGTGCAGCTATATCTCACAATAGGTCAATAGCTCTCTTTTAATGGACTAGCAAAATGCCCATGCTTTGCTATGGGTAAAACAAAATATATGATATTGTCATAGATAATTTTTTTTAATCAAATATGGTACTATTACTTGCTTGCTTATTTGAATACTATTACTTTAGTATATTCACCTGATTCAAACAAATATTACTAGGCATAATATCAGAAAAAATCAGGGACTAATTTGTAAAAGGTGTAAAAGTAGTGGTGTTGGCAGAGCCACCACCACTACTAGTGTCTGTTACAGTAGTATAGATGAATTTATTCTTTTGAGATGGTTTTATGATGCTTGATTGCAAAGATGTGTCTGCACATACTGAAGTAGTTAAGTAAATGCAGTCTATTTTCAAGTGCATGATAGCTGAGTCTTCGCTTGGTTATCTTTTAATTTTGGTACCTTAAATTTATGCTTTATTATTATTTTTGGATTTTTTATATGCCACGGAACAGGTTTAGGAAAAAGGTTATTGAATGGTATTTGAATGTTATAATTAAATTTTAAATATTTGCAATTCCTATGGATTATAGTATATTTTGTGATCTTTTACATTTGAATTAATATTATGACACAGTCATTTACACATGTTGCATATGTTGTCTAGCGTTCAGGAAAAGGTGTTCCTGGTGCATCACTGCCGTTTCACCGAGCTGTTCCAACCTTGACTCATATGGCACTGGTTGAATTGGAAAAAACAGGACGATTAAAGTTTGTCATAAGCCAGGTTCATATACCTAACTCAAGTTGTATATACTGCACTTTGAATTGGTACCTATGCACAAAACCAGTCTCTACAACTACTAGTATAGTTAAATCAGTTCGTAGGAGTTGCAGATATTGACTGCTCACTTATTGTAGTGGTAAGGTGTTAGGATATTGAAATCAACACGCAATACAACTGTTACAGACTTGGGGCTGCGTGTCCCATGGGCATGCCACGCATCATGCCAGCAGTAGTGATTTGTAGGAAAGGCACCCCACAACTAGGAAGCCCTTACAATTAAAGGACATTCAGTCTTGTAAATATTGAGCGCAATCACAGCGGAGGAGGCCCTGCAGTTAAATTTTATTGAAAAAAATATTTGTAAATAGTACAAAGGAAAATTACAAGGATCTAAGCCAAGATTCTAAAAGATCTCTCTCTGGTCTTTTTAGTTTTAAAAGAAGATCCTCTTTAAAAAGACTTTGCCAACATGAAAAATGAGGGAACGCTGCTTCCAAAGATTAGATCATTTCACTGCTTCCATATATTCTATGCTGTATAAAGCACCTTTTCAATGAAGCACACTTGCTGGTGTTGTGCCTTAGCTGTGAATTGTGATCATTATGTTATTGAAACTCAGGGATGTATCCCAGGTTATCCCTATCTTGCCCCAACATTCTAAAAAAAAATGCAAACAAATTTCTCTTACTCCAATGTTGCACAAGACACAAAGAAACTCACTTTAACCTTGTAATTTGCCAAGTGAACGTGAAAACCCTTCCATCTATCTCATTCCCAGGCTTAGCCTTAGGGTGCATTCGTTTCTGAGGTTGGGGGGAGGTTTTCAGCTACATGCGAAACGAGAGCTCATTAGCAAATGATTAATTAAGTATTAACTATTATAAACTTGAAAAATTGATTTATTTGATTTATTTAAAGAAAATCCTATATAGAAACTTTTTGCTCAAAACACACCGTTTAGTAGTTCAGGAAGCATGCTAACGGAAAATGAGGAAGTTGTTTGCAGTTGCCGCTTAGGACTCAGCATTAGTTCTTTTCTGATTATTCACCTGATTATTGAAACAGATTATTTGCTCCACGCTTCGAAAAATACATTTTCTCAAAAAATTCTTTTACTGAATTTCTTAGACCACTTATTTTAAGCTATTTATTAAGTTAATTTATCAATATTTACTTTATCCCTAAAATTAATTAGATAATCGGCAGCAACAATCCACTCAATAATCTGTTTCAAACTAAGCCTTAGCCTTGTAATGACCATCGCCATGGAAGAGCAGCTAGCACCGAAGACCGAGTATGTTTCTATCTCTCCGGTCACTAATACCAATAACTCCATTTTCCATGTTTGACAAACTTCAGTACTAACTTTGTTGTGTTTTAAATTTAATTACAATGTTCTGTCGTGTGATGAACAAATTGATTTTATCACGATCAAGCTTATGGTATTTATGAAACTTAAGCTTTCACGGAGCTGATGGAGTTGTCTTTGCCAGAATGTTGATAGCTTACATCTCCGCTCTGGCCTCCCAAGGGAGAAGCTGGCTGAATTGCATGGAAATTCTTTCAAGGAGATCTGCCCAAGCTGTAAAAAGGAGTATGCTTTAGCCTGCTTTACTTGACTATACTTTATCTGGGACTATAAACACCAAAATATTTCCTTTTTTACTGTGGTGGTTTATTTAATTGGCTTATTCCAGATCCCACTTGTTTGAAGGTACCTTCGTGATTTTGAAATTGAGACGATAGGACTGAAGGATACTCCAAGGCGTTGTTCTGATAAGAACTGTGGAGCTAGATTAAAAGACACAGTTCTTGATTGGGAGGTACGTTTCAAATGTGCTGGACTTAAGTTATATTTATATTTCTTTGTTAGTGGGCCATACTTGCTTAGCCCTTTAGCCCATCTGCAACAGATTCTTGCTTTTGTGTTTTTTCCAAAAATTGCCAAGGTGGGTGGTTCATTTGTTGGCAATTTGGCCATAAAAGCTGGCTTTCTCCATTTCAACACAAATCAAATTTACAAACAATGCATGCTTAGGGTATTCACTGTGAAAAGCTTTAAGCTGTTTTACAGACTATTATGTTTTTCTTACGACTAGTATTCAACATGATATCCTCTGTACGTTCACTATAACAAGAAAATAAATAGAGAAGTTGGTTAGTGATGTGTTTGCCTTGTTATCAGTTAAGTAGTGGTGTTCTGAAATGCTATCTTGTTCTCATGTCTTCGCTCGCTGATAGACAATGAATAAGTGGGTAAGGACATTTTGCAGGATGCTTTACCCCCTGAGGAGATGGATGCTGCCAAGGAGCAGTGTCAAACAGCTGATCTTGTCCTATGTTTAGGAACTAGGTATTGGCCATGGTACCTGTACACACTAGCTAGAATTGCTTTCACGTGGTTTTATTTCATTACTGAAATTAGTGTGTTTACATGCAAGTTCTGTGATTCTATCTCCTGCAAACTTAATTTTAAGAATTTGGTACTTCCGTACTTTTGCGAATGGCGGTATTCTGGTGTGATGTGATATCATTGTAAATAGTGGC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| External Link(s) |
