BGIOSGA015707

From RiceWiki
Revision as of 04:18, 28 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA015707| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015707, complete gene.| tag = OsI_146...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA015707

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015707, complete gene.

LocusTag

OsI_14608

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA015707-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA015707-PA

Length

6089

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:823395..829483

Sequence Coding Region

829386..829483,829174..829295),complement(827926..828046,827748..827829),complement(827591..827661
,826402..826443),complement(826120..826244,825263..825356),complement(824521..824900
,824340..824448),complement(824152..824257,823976..824062),complement(823395..823502

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:823395..829483 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:823395..829483 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGGCGATTCCCCGGGAGGCATGGGAGGGCTGCAGCGTCCTCCTCGACATCAACGACGGCGACCGCCTCGCCTTCTTCCGCCTCACCCCCGCCGCGACGGTCAAGGTGGGGAACAGGACCTGCTCGCTGCAGCCGCTCGTCGGTCGCCCCTTCGGCTCCCTCTTCAGCGTCGGCCCCTCCGGCCTCGTCCCCTGCGCCGACGCCCCATCTTCTCGCGATGATACAACGCAAGATGCTGCTGATGGTCCCTCGCAGGATGAAACTAGGGACAATAGATCTCTTGTCGATAATAATACAGCACAGAATTTATCTAGCGATGACATAGAGGCAATGAAGAGAGATGGTGTAAGTGGTGATGAGATTGTAGAAGCTTTGATAGCAAATAGCTCCACATTTGGGAAGAAGACCCTTTTTTCCCAAGAGAAATACAAACTAAAGAAACAGAAGAAATATGCACCCAAAGTGCTTTTACGGCGCCCCTCTACCCGAAGCATTTGTGAGACATATTTCAAGAAAAGCCCAGCTCGAACAGGGTTTATGCGAGTTGATGCACTGTCCCTCTTGTTGTCTATGGCAAATGTTGGTCCATATTCGGATGTCCTTGTGGTTGATATGGTTGGAGGTTTAGTAGTTGGAGCTGTAGCTGAACGCTTAGGAGGTACTGGGTATGTTTGCAGCACATATCTTGGATCTGCTGCTAGCTCCATAGACATTATAAGGATGTATAATTTGAGCAGTGACATGACTACCAGAGGTCCATGTGAAGCCTTTGAAGTTATTACTAAAGTAGGAAACACCCATTATGTTGTTGAAGTGGTGCTTAAGAGTTGGGCTATAGCAGGTAATATTTTGATAAGCTTACCTTTCAGGATTGTTCAGGCACCACTAAGTGACCTCTGCTCCTTGCAAAACTCTGTCGATGTGTCTTCTGGTCTTAATGATAGCATTCAGGGTGAGGCACAAGAGCCCACTGCAGTACCAGTGGAGAATACTCAGCCATCTGTACCACAACCAACTGACACAGCAGTACCAGATGAGAAAACACAGTCACCTAAAGAACAATCTATTGATATAGATATCCCTGAGCCCTTATTGGATGAGCACATTAATCAGGATGGCAATTCTTCTTTAGATAGTAAAGGAGATGAGGATGGAAGTTCAATAGGTCCCAAATCACTCAAGGCAGGAAAGGCACCATCACCAGAGAGGATGAAATATTGGAGTGAACATGGATTTAGCAGTTTGATTGTTGCTGCTCCGGGGCATGATGTTGAAAGTTTTGTTGCTGATCTGCTTCCCCTCTTGTCTTATTCAGCTCCATTTGCTATCTATCACCAATACCTTCAGCCTCTCGCAACATGCATGCACAGCTTGCAAGTATCAAAAATGGCTCTCGGATTACAAATTTCTGAACCCTGGCTTCGTGAATACCAGGTCCTTCCATCACGAACTCATCCACACATGCAAATGAATGCATTTGGTGGTTATATTTTGAGTGGCATTAGGATACACAATGGCGATGCATGTAATGGAAGCAAGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAIPREAWEGCSVLLDINDGDRLAFFRLTPAATVKVGNRTCSLQPLVGRPFGSLFSVGPSGLVPCADAPSSRDDTTQDAADGPSQDETRDNRSLVDNNTAQNLSSDDIEAMKRDGVSGDEIVEALIANSSTFGKKTLFSQEKYKLKKQKKYAPKVLLRRPSTRSICETYFKKSPARTGFMRVDALSLLLSMANVGPYSDVLVVDMVGGLVVGAVAERLGGTGYVCSTYLGSAASSIDIIRMYNLSSDMTTRGPCEAFEVITKVGNTHYVVEVVLKSWAIAGNILISLPFRIVQAPLSDLCSLQNSVDVSSGLNDSIQGEAQEPTAVPVENTQPSVPQPTDTAVPDEKTQSPKEQSIDIDIPEPLLDEHINQDGNSSLDSKGDEDGSSIGPKSLKAGKAPSPERMKYWSEHGFSSLIVAAPGHDVESFVADLLPLLSYSAPFAIYHQYLQPLATCMHSLQVSKMALGLQISEPWLREYQVLPSRTHPHMQMNAFGGYILSGIRIHNGDACNGSK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..98#189..310#1438..1558#1655..1736#1823..1893#3041..3082#3240..3364#4128..4221#4584..4963#5036..5144#5227..5332#5422..5508#5982..6089#ATGGCGGCGATTCCCCGGGAGGCATGGGAGGGCTGCAGCGTCCTCCTCGACATCAACGACGGCGACCGCCTCGCCTTCTTCCGCCTCACCCCCGCCGCGTCCGCACCTCCCTTCCTCCTCGACCTCGCGTCTCCTCCCTTCCCCCCCAAAAACCCTAGACCTGATTTCCCTCTCTTCCGGTCGTGCAGGACGGTCAAGGTGGGGAACAGGACCTGCTCGCTGCAGCCGCTCGTCGGTCGCCCCTTCGGCTCCCTCTTCAGCGTCGGCCCCTCCGGCCTCGTCCCCTGCGCCGACGCCCCATCTTCTCGCGGTATGCAATGCCCGATGGGGGTGATTTCCTTTTTGTACTGCTTGTTTGCTCCTGCATTCGCTGTGGGCTAGACCCGCACAGTACTGAACGAGTGCTCAGAACTGAACTAATTGCTAGTAGTAGTGAATACTTGAAGCAGGGGATTGTCATTTGACTTGATGTCGTATTGTTCACTAGTTTAGTTTAGTTATTTCTTTGTCTGCAATCAGCCGAACTTGTATCGGTTTATAGCTTATACAGGAGTTAGATTTGGTGAAACGTTATGTAAATTGTGAGTTCATCTGTAGTTTGCACTCTTCTTCAGTTCTTTTCCTTCCTTTTCTTTTCTTTTTTACATCACCTTTCATCCAGCTTCACCCTATATAGGATGGTGACTTCTTAATTAGGCTCTAGTTGTTTCAGAATTTCAGGGCTGGTGTGCATATGTTGGACTGTGATGTGTCAATTGTCATTGCTTATAGTCTGCTAAGATTTTGATTTAATGATGGGTTCTAGTTACCAAATGTACAAATGTGGACCTTAACACATGCACTGTAGTTACCAAGGCATGATTTCACATTGTTCAGTTCTCTCTTTTGGCAGGCAGCACATAGAATTTGTTGGGTTGTTTCACAAGGAATTTCATAGCTCCCATGGAAAAAAAAATAACATATACATTTGCAAGGTGACATCCATGTGCAGTTGTATCTAATAAAGCCACCGTTTCCATAACGCAAGCAATATCTGGAAAATAGTATAATCGAAGAATTTAAATTTATTATGTTAAACCATTTTCTAAGAAAACTAAAGTATGAGTTAAAACATGCCTTGTTTCATCAGGACACATTCCCTCTTATCAGGACACCAATTTGTTTCAAAATTGTAATCAAGTTCTATTCCCTTCCACACGTTCCCTCTCTTCTTACTTCCACTGTTCCACATTTAGGACGAATGGTGGTGGTGGTGCAATTGAGAAAAAGTACTCTCAAAGTCAATTAGCTTATCCTTTTTAAAAAAATGTCCTGCTACAAATATTGTTCTTGTTGAGTTATCTTACACATGGTTTTTGATCAGTTCGTGTACTCATCGATATAGTTCATAGTTTGTACTATTTCTTGTTTGTAACAATGGTTCCCATTTACACATAGATGATACAACGCAAGATGCTGCTGATGGTCCCTCGCAGGATGAAACTAGGGACAATAGATCTCTTGTCGATAATAATACAGCACAGAATTTATCTAGCGATGACATAGAGGCAATGAAGAGGTGAGGGTTCAGTTATCTTTGAGTAAGCTATGCTTGATTGTTTTGTGTAAATGATTCCAAATCATGATTTATGTACTGTTTGATTGTCCAAAACAGAGATGGTGTAAGTGGTGATGAGATTGTAGAAGCTTTGATAGCAAATAGCTCCACATTTGGGAAGAAGACCCTTTTTTCCCAAGTTAGTATAATTTGTTGTCTAGTTGCTTCATTACTTTTTTTCTAAGAACACTGGGAATTGAATTGGTTCAATAATTCTGATTACAGGAGAAATACAAACTAAAGAAACAGAAGAAATATGCACCCAAAGTGCTTTTACGGCGCCCCTCTACCCGAAGGTAATCCTTCTATCGTTTCCTTGTAGTTGGGAATATGCTATATCATTCTAGAAATGAATATTATCTATTCACATTTTATCATTTAGAGAATCATCTTTTACCCTCTTAATTTAACTGCAAGGTTGCATATCCACTTTAAGCCCCATTTGGAACACAGGAATTTCACAACATCTTTTTGCAGAAATTTCAATTGGAAACAGTTTGAATAGCAGGAACAGAAAATTGTCCGGGTTCGAAATAAGTCCCTATGCTGAATATGTGATTGAAGTTTGTGAAACAGCTTTTTAAAATTATCGTGTCAATGGAAGATTGCTTCAGATTAGGAGTATAGCACAACCAGGAAAACAATCTTTGTTTTTATTATAAATTTTCCACTTGATTGAATGAAATATGCTCTGCTCCCATTATGTTTAGTACTTCCTCCGTATTTTAATGTATGATGTCATTGACTTTTTGAACAATGTTTGACCATTCGTTTTATTCAAATTTTTTGTGTAAATATGAAAATATTTATATCATCTTAAATAACATTTAATGATGAATCAAGTCACAATAAAATAAATAATAACTACATAAATTTCTTGAATAAGACGAATGGTCAAACATTGGATAAAAAGTCAACTGCGTCATACATTAAAATATGGAGGTAGTAATTAGTACTTTTGTTGTTTGAATGTCACTGTAGCCTCTAAAATACAAAACAAGGTGCTAATCAGTTCTTCTCTTTATGACCTATTTACTCCTCTTTAATGTAGCTCCAACAGGAAGCACCAAGTCCACCCACAAATTCAATTTTTGTTCCTAATGCCAGTAAGAATAAAGCACATCGAAGGGAAAAAAGACTACCTAAGAAAGCCTAAAAAACATCTGTTGAGAACAAGACCAAGTTTTTTTAACATCATCTTAAAGATAATGGGAGTATGATGCTTGTTGGCTTTTTGATATTTTTTTTCTCCTCATTACCAATGCAAAATATAATATCAAATGAAGTGTTTTTTCAAGAAAGTTGCCCTGAATGCCTGATCTTGAACTAACTCCTTACATCTGATCTGTGAAATGCGTTGCACATTACAATTTGATTGCCAGATGCTTATCTAGAAGGTGTCATATTTATCTGACCCTTTCTTTTTTCCTTTCAATGCTGCAGCATTTGTGAGACATATTTCAAGAAAAGCCCAGCTCGAACAGGGTAAATATTTTGCTAGTTCATTTGCAATCCCTTATTGGCATTGCCATTATACTCCATTTCAGTATTACTTTTGGCTCATATGCATATACCTTGCTTTTCTAAAACAAGCAAATTACACATAGCACAACCCTTAGTTACTATATTCTTTCCTTTCTAGGTTTATGCGAGTTGATGCACTGTCCCTCTTGTTGTCTATGGCAAATGTTGGTCCATATTCGGATGTCCTTGTGGTTGATATGGTTGGAGGTTTAGTAGTTGGAGCTGTAGCTGAACGCTTAGGAGGTAACATATTCCTACTTTTTTTATTTTACTGATACCAGTAGATTAAATTACATGTACATTAACAAATTTAATATAATTCAACCGTACGCATGTATATGCCTCATGTAATAGCTTTTGCTGAAAATGCATTACTCTTTACCTGCTTGTTTTTTAGAATGCTAGATTGCTAGTTCTACTGATTGCTAGTTCTACTCACCATAACTTCAGTCAGTGGACGTAGAAATGTCATTTATTTTAGTTGGTGTATTCAATAACAAGTGATATGCATGTAGTTATCTATTCCTTAAGTCACACTGCCTGTTGCTACAAGCGCTCAATGTATATTCACGATGTACAGAAGCTACAGGCACCCATGAACTTGAAACGTGCTCATATATATTCATATACGAATTAGAACTGATTTTCAGGTTTTTCTAAGCATCTCTATTATAATGCATCTATTTGTTAGTTGCCACTATCACAGTGCCTGCTATTGTGAGGGATTGTATAAATATTTTAGAAGATCTTAAATTAAAATGCCAAATTTTTGAATAAAAAGATTGAAATTGTATACACAGGATTGTATGAGATCAATCAGACACCTATATACACGTATGCAGATAATTCAATTTTATTTATAAATCTTTCAAAGCACACCTGTACATGTATTCAGCTGCAAAATGTCTTCTGGAGTGGGGATGGCTGTACTCTCGTAGAGTACTATGACCCCCAAAGCTGCTTTTATGAGTAAAGATTATTTTTAGTGATTTTCTCTGTATTACAGGTACTGGGTATGTTTGCAGCACATATCTTGGATCTGCTGCTAGCTCCATAGACATTATAAGGATGTATAATTTGAGCAGTGACATGACTACCAGGTAATTTCTTTATTTAGCATTATGTGGATTTTCTGATGATAAAAGAAGTTTTAATTAGAGGGCTCCTGAAATAAATATGTGCTAATTTTACATCTATACTGGATTATGTTAAGGAAATAGTAAAAAGTGCAAAATGGTTATATATTTTTCTAGCTATGCAGTTCTTACACAACTATTGCTTATTGAATCGTGGTTGCATTTCTCAGATATAATACAATACACTGTCTTTAACTTCTTGTATCATGAAATAATCTTTGTTCTTGAGCAATTAGGGCGAACTATAATATTACTTATATGTTCATCTAATTTTATACCATGATTAGTGCCATGTAGAACTATTATATTCTCATTTGAACTTATAGAGGTCCATGTGAAGCCTTTGAAGTTATTACTAAAGTAGGAAACACCCATTATGTTGTTGAAGTGGTGCTTAAGAGTTGGGCTATAGCAGGTAATATTTTGATAAGCTTACCTTTCAGGATTGTTCAGGCACCACTAAGTGACCTCTGCTCCTTGCAAAACTCTGTCGATGTGTCTTCTGGTCTTAATGATAGCATTCAGGGTGAGGCACAAGAGCCCACTGCAGTACCAGTGGAGAATACTCAGCCATCTGTACCACAACCAACTGACACAGCAGTACCAGATGAGAAAACACAGTCACCTAAAGAACAATCTATTGATATAGATATCCCTGAGCCCTTATTGGATGAGCACATTAATCAGGATGGCAATTCTTCTTTAGGTAAGCAACTGATAGCACTAACATGAAAAAAGTATACATTTGTGACTTATTTGATGCTGTGTTGGTCTGTAGATAGTAAAGGAGATGAGGATGGAAGTTCAATAGGTCCCAAATCACTCAAGGCAGGAAAGGCACCATCACCAGAGAGGATGAAATATTGGAGTGAACATGGATTTAGCAGGTAACACTGTAAATTATTGTTGAAGAAAACTGCACTAATAGCTACATATTCTCATTGATAAACTGATTTCATGTTGATGCAGTTTGATTGTTGCTGCTCCGGGGCATGATGTTGAAAGTTTTGTTGCTGATCTGCTTCCCCTCTTGTCTTATTCAGCTCCATTTGCTATCTATCACCAATACCTTCAGGTAAATCTTTCTTAGCTTCAATTTTTTTTAATCATGATTTCTGCTTCCTATGTAAAATATGTGTGTGTTTTTCTATTGCCTTCATGCAGCCTCTCGCAACATGCATGCACAGCTTGCAAGTATCAAAAATGGCTCTCGGATTACAAATTTCTGAACCCTGGCTTCGTGAATACCAGGTCAGTGCTCTGCTCAGTACATTAGCAATGAGGAAGTTAGACCTGAAATTGTTGTTCCTGAGTTATGGCATGGTTTTTCTTACCAATGTGCACATAACCAAAGACTATTTCACAAGTTATGTTTAGCTGGCAGCTAAATTGCAAAGAGTAAATTGAATATTTGAAAGTACATATGGAATTGTCAAGGCTATTCTAATAGGGCTGGTTACAATGCAAATTCCTTTTGTCATTCTACTATGCATGATATGCCCACTAACTTTGCTTATAACAATAGCATCAACATATTTAGAAACAGATTTTATTTACTATTATATGAGACACAAGAAAGATAAGGTTATTGCTTTGACATGATGACATCCAACAAATCTTTTATCGCTTTTCCGGTTTTCGCAGAATTTTTATTTTACTGCTGTCCACAACTTCTAAGAAATAGCTGTTAGAACTTATTACGGTATTCCCTTTCCTTGTTACAGGTCCTTCCATCACGAACTCATCCACACATGCAAATGAATGCATTTGGTGGTTATATTTTGAGTGGCATTAGGATACACAATGGCGATGCATGTAATGGAAGCAAGTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA015707