Os08g0109100
| Gene Name |
Os08g0109100 |
|---|---|
| Description |
Similar to SAC domain protein 1 (FIG4-like protein AtFIG4) |
| Version |
NM_001067343.1 GI:115474422 GeneID:4344468 |
| Length |
7085 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0109100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:450143..457227 |
| Sequence Coding Region |
450235..450306,450420..450624,451083..451248,451376..451598,452329..452405 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:450143..457227 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MTAEADDPTAAETLEKFRLYETRARFYLIGTSREKRWFQVLKID RSERSELNISEDPVWYSQQEVKNLLQRISEGNRSTGGLTFVTKAYGIAGCIKFLESYY LILVTKRCQIGCICGHPIYCIDESQMITIPHSSVQTDVATSKNELRYKKLLASVDLTK DFFYSYTYPIMQSLQQNVTSAGMKEMPYENLFVWNTFLTQPIRSRCRNTLWTVALVHG HFKQVKLSIFGRELNVVLISRRSRHFAGTRYLKRGVNDHGKVANDVETEQIVFEEEAG SWKGRMSAVVQMRGSIPLFWSQEAGRLSPKPDIIVQRYDPTYEATKLHFDDVAQRYGH PIIILNLTKTFEKRPREMMLRREYFNAVGYLNQNVPEEKKLRFIHWDFHKFAKSKSAN VLGVLGGVASEALDLTGFYYSGKPKVQKKRSTQLSRTTTARDGSIDIRASSGDLSRLS SNADSLGPTASQDIRKDDSKQELLGDGPCYQTGVLRTNCMDCLDRTNVAQYAYGLAAL GRQLHAMGATNVSKIHPDSSIASALMDLYQSMGDALAHQYGGSAAHNTVFPERQGKWK ATTQSREFLKSIRRYYSNAYTDGEKQDAINLFLGYFQPQDGKPALWELDSDYYLHVTT YGDDLISDSYHMTAPGESGAALSPGATLSPVPACKEDFSRMKLTSFDKLIERTCSSIR NVRLHCDADLKQSGTVGTSGMAPDAVEIQLRTPNWLFGQRKHAETVPTVKVIPVENAN EGNGEDTNVSLCGELNWLSSADTCEEDNFRRYLAFTTADVENGWYGGTLIYDQDENSG AYKHYSEFCQGSVMDPLEHDPEKEMHYAEALSVDIDITDDATVEAEMQAALDDYQIIG SDLSIIPSCGSLAEDPSQLTRWIIGDDKLQVAQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>93..164#278..482#941..1106#1234..1456#2187..2263#2575..2762#3050..3147#3407..3540#3626..3760#4468..4837#5102..5223#5360..5479#5619..5831#5911..6099#6183..6294#6398..6643#gcttcagtgcagcctgcgccatcgtcgtcctcctcctcctttcctctcttctcgcaacccttcctcctcctctcgctcgctcgccggaggcgatgacggcggaggcggacgacccgacggcggcggagacgctggagaagttccgcctctacgagacgcgcgcggtaagccccctcactctctcactgcctctatatctctctctatctaagatgaggatgaggaggaggaggaatcacttgatcgattggggttggggggaaccctggatttgcagaggttctacctgatcgggacgtcgcgggagaagcggtggttccaggtgctcaagatcgaccgctccgagcgctccgagctcaacatcagcgaggaccccgtctggtactcccagcaggaggtcaagaacctcctccagcgcatctccgagggcaaccgctccactggcggcctcaccttcgtcaccaaggcctatggcatcgctggtacttggattttccctctattttgtcggaaattaaaattcaatttggtcctcccatgcggcagtacatcattctattcatcgttattcacttcatgaaattctggatagttttcttccaattagattatcctagctaggaacattgcctacttaatatgccatagtgattattttcgctcccgaagaaagaggcggaaaattgcaaatgcccttattgtctcctgtgtcagtaatgtaatgggttcttactgtaaatctgcaatgacagtagctacctattcacccaaccagatgtcggaagtggttccgaacagaaatgaattggataaaatttgatttaaatgggagataatttagtaacactagatttcttattcatcttgtcgaattcacaagacccggttcctctttccattgttcctcaagctatttctttttgtttcttctgttatgtaggttgcatcaagttcttggagtcatattatctgattttggtcaccaagcgctgccaaattggttgcatttgtgggcatcctatttactgtatagatgagagccagatgataaccattccacactcatctgtgcagacagatgttgcaacctctaagaatgagctaaggtgattcttcctgtgccttctctaacatttcttttttcattcatttcctcatcttttctatgctcctttacagtttcaacttgtgggtactcgtatatatttatttaacttaaggaaatattaacaggtacaagaaacttttggctagtgttgatctcaccaaggatttcttctatagctacacataccccattatgcagagcctgcagcagaatgttacttctgcagggatgaaggaaatgccttatgaaaatttatttgtctggaatactttcctgacacagccgattcggtcaaggtgccgcaatactctctggacagtagcgctggtccatgggcatttcaagcaggttatgtctaacaaacaatccacaatttggttttgccactattcttgtttctggtgtgtacttctgcaaaacagataactcattctatttagagctttacgtactcccttgatcattccaagaatgcgtttgcttcaaaatgcctgggaactgggaatttatctgtagagtcattctagttataatgtggataccagataccgaatacctacttatttaccagagtatattgcattcgaaatgaagcgcttggagctttatccgcaaagtcctactaacttatattcctatttctcatttgttggagtagaatgctaggtgagttgtggtataagaaaaaaggtaccaccacgatttcaattccaaagttcattttcatcagtattttttttaaaaaaaatccaacccataataagaaaaaagtgcaactactatgatgttgtaccaagtctttgttgtcatcatctgtctgttccttactaactgtagctattattacttgaaaactaaaggctttgggagttggaaattgttgcttggttgatgactgatgactgatgagtgttgatactgtagagtacttatttagcttatctatatttctgtcaaaattatatctcccaactttcatctgacctgtgcaaatattcataaataaatatgctacaactatttttgaaattatgcgtactacatactagcataatatattttccatttgattttccaggtcaagctatcaatatttggcagggagctaaatgttgttctcatttctagaagatcacggcattttgcagggacacggtaggttgtatgtgctttaagatttctggaagcccttctatttggcatgtgctcagctcagtccattatgcatacttgcatcctcacccattgaccctttttatttgattgctgttgactaatgacaacttgtgtaagattttgttttcatgaattcatgctttacttttaaatcaacgcttggtgctcctctactatttgtttcctctactttgtgactgaaaccaagaaaaatattgtctatgctttgttagtagtatcttagttttattcaatttgaaattttactacctttctgatgatacctgtaggtatttgaaaagaggcgtgaatgaccatggaaaagttgctaacgatgttgaaactgagcaaatagtctttgaggaggaagctggttcctggaagggaagaatgagtgcagtagtacagatgcggggatcgatccctctcttttggtcgcaggaggctggccgacttagtcctaagcctgatattattggtaaatagagtgtttttttaaaaagaaatatcttatgacatctaacatgaagccaacttacatggtttgattggagaatattcataaatcaattctgtcaaaaaaatattcatatatgaaaaccaaatttcctatctgaccatgcttctattagacctgcatgtccagcaaacactctgaattttaactattagatgcttgttcaatctcctctctgatatgcttctaaaatatgggaatacataaaatttcttgagaaatcttaaatttaatgtacatttctgcagtgcagagatatgatcctacatatgaagcaactaagttacattttgatgatgtcgctcagcgctatgggcatcctatcataatacttaatttaacaaaggtattttctttcttcttgattttgggatctcagcgtgagtattctgttgtccttccatcttaaatatgagactgatgaactgaactgaatagttgatcattgtacatcttaattgttccatttttcctgaataagtctcatttggtcatgatcaatttgtcgaggtacagtgttgtttaatcagttgtttctatatccaacctcttgattttatgtttcaatatattgctcatcaagtttctttgtgctatttgtgtagacttttgagaaaaggccccgagagatgatgctcaggcgtgaatattttaacgcagttggatatcttaatcaaaatgtcccagaggagaagaaattgagattcatccactgggatttccataaatttgcaaaaaggtttacattggttcttcataaattccaaatttgcttgagttagcgtgtgtttcatatgctaatggttctccatctcttttttcagtaagtctgcaaatgttctgggtgttttaggaggtgttgctagtgaagcactggatctcactggattttactacagtggaaagccaaaagttcaaaagaaaaggtcaactcagcttagtagaactaccaccgcaaggtaccaatatttcattaagtttatgagttcatgtaaaataaatctctctctctctctctctctctacctgggtgatttcgatggccaaatataacaaaatttgttttctaccaaattccggtcggttaatgtccggtcggtctgttcttttgccaattgataaaaattgcagtaaattcaaatttgaaattttacagattgagatcacccctcactctgccagtgttttggttgctgcttggattttattctggcattcacacactggtgtcatagttgtggtagtaaaaaggccaacatcagtagctcacaaccagtagtgttagctatgcacagtgcaccttacaagtgttacgaatccagcaatttgatggtattgttgcatggtccaactgtaggtgcgtggtaagttagattttacattgcttgtgtaaagtgagttgtgcagtggtgctaatgtataattcttattgagccaaacattcttttaactaaaaggagaatccaaaaaatagtaactcaatgtaatccttttacacagtgagaactgaagtgtaagcctgccacatgagcttagggtgtcagataatgccatacttgctgtggcgtccaactgtccaaattatgttcaaaattagaagtgcacattttgtgttcaaaatcaatatgttatgagcagacgatatttcccatatttcttttcacagggatggttccattgatataagagctagttctggagacctttcaaggctttcgagtaatgcagattcacttggtcccactgcttctcaagatataagaaaagatgacagcaaacaagaacttcttggtgatggtccttgttatcaaactggagttcttcgtacaaattgcatggattgcctggatcgtacaaacgttgctcagtatgcttacggccttgctgctttgggaaggcagcttcatgcaatgggagcgactaatgtttcaaaaatccacccagatagcagcattgcttcagctttaatggatttgtaccagagcatgggtgatgcacttgctcatcaatatgga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