BGIOSGA016497
| Gene Name |
BGIOSGA016497 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016497, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_16078 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA016497-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA016497-PA |
| Length |
4012 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:20545145..20549156 |
| Sequence Coding Region |
20545145..20545247,20546098..20546798,20546898..20546984,20547335..20547394,20547944..20548885 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:20545145..20549156 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACCGAGGTGAGCCCTCGCTGAAGCCAGAATGGCTGGTGCGGGGGCATGGCGCAGTGGCTGCCACGAGCCTCTGGACTGGAACTTCTTCGCCGCGCGCTGATGATCAAGGTAGGAGCATTTCATCAAGAAACCAATCATCAGGTCGTGACCGTGAACGGAGCTCACAACAGTCCATCTCACGGAGGAGTTCTGGCTCAATTGGACCTAGACGGCATGACCGGGATGGTACAGCAAAGTCAAGAGGCTATGCCAGTTTTGGAAGGAGCAACCGGGACAGGGGGGGTGAGAAGGACTCTGAATCCCGTAATTGGGAGAGTAGGTTGGGTCCACCTGATGATCCCTTGTATGATGGCTTCAAGCCATTCAGCTCATGCAGACCTGAAAGGGACAGGCTTAATCATACTCGTTTGAAGGTAGATACATTGAATCAGGCGGTAGGAGAAAGTTTAGACAATGGTGTTCGTAGTGTATCAAGAAAGGTTTCTGGTGGTGTCTCCTTTGAGCGAGAATTTCCACACCTTGGTTCTGACGACAAGAATGGAAAGCAAGATGTAGGTAGAGTTCCATCTCCTGGAATTAGCACCCCGATTCAGAGTATGCCTTTGGGCACTGCACTTGATGGGCGGAGTTCAGTGCTAGCAGAAGTTCCTGTACTTAGTGGACCAACCAACTGCCCTGTTCCATCTTCTTTGTTACGCACTGGTTCCAGTAAGCAGATGGAAGTGCCAAACTGCGGGACTGCATTAAGTATGGCTGAAACAGTGATGCAAGCTCCGTTAAAAATCTCGACAACACCCCAGTTATCGATCGATACTCATAAGATTGAAGAAAGAACTATGAAGCAGTGCATCCTAAGACCTCGGACACCTTCTTCGAACAAAATTTCTAACTCTTACAGGATAAAATCTCCACATTCAGGAAAAGAAAAACAATCACTACAGCTTTATGTATCAAGTTCTTCAGATAAGTTAAAATCCAAAGGTGCAAGAGCTGGAGATTCTAATGGCCCTGTCAAGGGTGCAACGCAACTGCCATTACAGCTTTCTGGCAGCTTTATTCGCGCTCCAGTAAAACATGAGCTTGTAAAGCCAACTCAATCAGGAAGCTTTCAAGTCCTTAGCCGTGAGCAGAATGGTACTGTAAATACTGCCAAAGAAAGTACTAGCAATCCTGCGAGCCCTGTTCTAGGCCGATCATATTCAGTAGAACCACTGAGAAAGCCTATTGTAAACCAAAAGCTAAAGGGTGTTGCTAATGGTCTCCCTTTACAACTGCAAGGATCATTTGGTGAGAGAAAATCAAGTGCGAAAGATAAGCATAAATTCTTTGAGTTGCTGCGCAGCAAATCATTGAATGGTTCGTGCACTTCTACTGTGTCTTCATCTACATTGCTTGATGAGCAAAACAACTCTTGTCTTGAATTGTTTGATTCTGGAGTCAAATGTATGGAACATGGAAGTAGTTCTTGTGAGGAAGCAAATTCTTGTGAGGGATCTCAGCAGCACCTTTCTGACAACGAGGAAATCAATCCACCATGGGAACCACATGATGTTTTTGATGAAGGAATGCAAGAGGTTCTGTCTGACAACAGGGATTTTAACTCTTCATCAGAAATTGCTGACACACAAGATGTATATATGAAGCCCCATACAAATAATGCTGGTTCCTCTCCGTCCATCATACCTGCAGAAATTTATGATGGCTCCATGGGGTCCAACTGTAGTGATGATGAAACTGTTATGTTGTTTGAACCCATTGGAACAGGGGAAGAGGAATCCTATCCTGCTCAAGACAGACCTAGTCCAGAGGAGATGGCTTTCTTGGTTTCTCTTGGCTGGAAAGAGGATGAAATAGTTCCACCTCTGAAACAGGAAGAAATTGCTGATTGTTCTTACATGGGTGGTCTAATGGGATGGCTTGCCATGTCAGCAAAATGGATTGATAGTGTGGCCTGCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDRGEPSLKPEWLVRGHGAVAATSLWTGTSSPRADDQGRSISSRNQSSGRDRERSSQQSISRRSSGSIGPRRHDRDGTAKSRGYASFGRSNRDRGGEKDSESRNWESRLGPPDDPLYDGFKPFSSCRPERDRLNHTRLKVDTLNQAVGESLDNGVRSVSRKVSGGVSFEREFPHLGSDDKNGKQDVGRVPSPGISTPIQSMPLGTALDGRSSVLAEVPVLSGPTNCPVPSSLLRTGSSKQMEVPNCGTALSMAETVMQAPLKISTTPQLSIDTHKIEERTMKQCILRPRTPSSNKISNSYRIKSPHSGKEKQSLQLYVSSSSDKLKSKGARAGDSNGPVKGATQLPLQLSGSFIRAPVKHELVKPTQSGSFQVLSREQNGTVNTAKESTSNPASPVLGRSYSVEPLRKPIVNQKLKGVANGLPLQLQGSFGERKSSAKDKHKFFELLRSKSLNGSCTSTVSSSTLLDEQNNSCLELFDSGVKCMEHGSSSCEEANSCEGSQQHLSDNEEINPPWEPHDVFDEGMQEVLSDNRDFNSSSEIADTQDVYMKPHTNNAGSSPSIIPAEIYDGSMGSNCSDDETVMLFEPIGTGEEESYPAQDRPSPEEMAFLVSLGWKEDEIVPPLKQEEIADCSYMGGLMGWLAMSAKWIDSVAC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..103#954..1654#1754..1840#2191..2250#2800..3741#3944..4012#ATGGACCGAGGTGAGCCCTCGCTGAAGCCAGAATGGCTGGTGCGGGGGCATGGCGCAGTGGCTGCCACGAGCCTCTGGACTGGAACTTCTTCGCCGCGCGCTGGTGAGCTCGCTTTCAATGCTGACTTTCTATTGCATGACATATAATGGTTAGCATTGATTGTATACTGCTTGTGAGATTAGCGGCGGGTATGTTTTGTAGCATTGTATAATGTTGCGGTGGCTGTTGATTATTAAGTTAGGATGATTGGTGCGGTTCATAAGTTCATTTGTGCATTTTTTAAGTCCATTCCTTTTGTGACTTATTGAGGAATTCCAGATTGTGGTTTTACCTTGTTCTTATGACAAAGGTCGTTGTTCAACTCTTCATATGCATTGTTGTGGCTGTTCGTCATGTTAAGTCTAATGTTTAGACCACAAAGTGCTTATTTAGTATGTTACATTAAACCTAGAGATTTTACTGTGTTACAAATGTATAGCAATTGTGGTAGGCAGTTAAAGAATCCTGTTGAGAGACATTACTTTAGATATCAACCTCATATTGGTGTCTATTAAACTACCTCAGTTCATGTAACAAATTAACTGCAGTAACTGTTTATGAGTATGAGATTCTTTTATATGGAAATTATTTCTGTTATTGGGGCCTTTTAGTTAAAACTCAAAATATTTTATTGCCTGTTGTAACTTGGGCTTTATTGGGCAATCATCATGTAAGCATGATGATGTATATTCTTCCTGTTGATTGCTCAATGTTATTGCTCGCCTTCAGTGTTTAGGAAATTTGCTGTTTCCAGTTATTGTTGTTTTAATGCCTTCCTAATTGGTTTAACACAAGGCTGCATGATTGAGCTTATCATTTGTGTGCATATGCTTGAATCAACTACTAGGGAAATTGCTTTTCATTTTGCGGTTTGCTGTGTATTGTTCTAATAAGCTGTCTCTTGCATGCTTAGATGATCAAGGTAGGAGCATTTCATCAAGAAACCAATCATCAGGTCGTGACCGTGAACGGAGCTCACAACAGTCCATCTCACGGAGGAGTTCTGGCTCAATTGGACCTAGACGGCATGACCGGGATGGTACAGCAAAGTCAAGAGGCTATGCCAGTTTTGGAAGGAGCAACCGGGACAGGGGGGGTGAGAAGGACTCTGAATCCCGTAATTGGGAGAGTAGGTTGGGTCCACCTGATGATCCCTTGTATGATGGCTTCAAGCCATTCAGCTCATGCAGACCTGAAAGGGACAGGCTTAATCATACTCGTTTGAAGGTAGATACATTGAATCAGGCGGTAGGAGAAAGTTTAGACAATGGTGTTCGTAGTGTATCAAGAAAGGTTTCTGGTGGTGTCTCCTTTGAGCGAGAATTTCCACACCTTGGTTCTGACGACAAGAATGGAAAGCAAGATGTAGGTAGAGTTCCATCTCCTGGAATTAGCACCCCGATTCAGAGTATGCCTTTGGGCACTGCACTTGATGGGCGGAGTTCAGTGCTAGCAGAAGTTCCTGTACTTAGTGGACCAACCAACTGCCCTGTTCCATCTTCTTTGTTACGCACTGGTTCCAGTAAGCAGATGGAAGTGCCAAACTGCGGGACTGCATTAAGTATGGCTGAAACAGTGATGCAAGCTCCGTTAAAAATCTCGACAACACCCCAGGTAGTTTAATATTTAAGATATCCGTGTTTCCCCTTTGATGTATCCACTGCATTCACTTTATTGAACTAGTGCTCTGTGTTCCATCTCTTTTTTACCCAGTTATCGATCGATACTCATAAGATTGAAGAAAGAACTATGAAGCAGTGCATCCTAAGACCTCGGACACCTTCTTCGAACAAAATTTCTGTACGTCTCTTATAAGTTTCATGCCTCTGTTGCAATACTAATGATTTCGTTTTGTTTCTCTCTATTTACCATTATCATTAATGTGTTTAGATTATGATTGCTCACTTCAATCTTGTTTATCAAGTGATTTAAGCATTTAGCCTTTGAAAACAGCTAAAGCGTTAAAGTTTCTTGTATTTAGTACTTCCTTGATTGCTTCAACGTACTGTTTGGATCCCTTGTGATAATGCTTCTGTATACTTGTCACATCCTTTTTGCTTATCCACCAAAACTTATCTGCTTCAGGAACCAGCCCTTACCTGTCCCTATAATATATTTTATGCTATTTGTCATCATTTTTAAAACTATAGAACTCTTACAGGATAAAATCTCCACATTCAGGAAAAGAAAAACAATCACTACAGCTTTATGTGAGTCTAAACTATAACATGCAGATTTATCTTACTTCAGTATTTGGATATTATGTTTACTTTCTTAATTTTTGATTTATTGTGATTGGAGGTATCAAAGCTATATCCTTAAACACAATTGTATATAGTTTTGTACGCTGTGTAGCCAGTGAGCATATATTTTTCTACTTTTTGATAGCTAACCAATTGAAAGCGCCTTTTTCATGGATTGGAACCACATGAATGAAGCCTTACTACAATTGATAAAGGTTCCAATGAAGATTCCAGCGCATTGCAACTGACCCTTTCTATATTACTTGATCTGTGCTGGATCATCTGGATGCATTTAATAAAATATCTTAGAGCTCGGTCACATCTTTTGTGTTTTTGTGGGATCCTATACTAATCTCTTCTCCCAGATGCAGTTCCTTTTTGAACTTATAGCAAATGCTGTACTCTGGCAGTATTTTTTTTTCACTTATTTATGGAGTCATGTTCTCTTGTGGTGATTCTCTTGTGGTGAACTAGTGACATATTGGTTTGCGCTAATTCATTCAAAATGCTTTACAGGTATCAAGTTCTTCAGATAAGTTAAAATCCAAAGGTGCAAGAGCTGGAGATTCTAATGGCCCTGTCAAGGGTGCAACGCAACTGCCATTACAGCTTTCTGGCAGCTTTATTCGCGCTCCAGTAAAACATGAGCTTGTAAAGCCAACTCAATCAGGAAGCTTTCAAGTCCTTAGCCGTGAGCAGAATGGTACTGTAAATACTGCCAAAGAAAGTACTAGCAATCCTGCGAGCCCTGTTCTAGGCCGATCATATTCAGTAGAACCACTGAGAAAGCCTATTGTAAACCAAAAGCTAAAGGGTGTTGCTAATGGTCTCCCTTTACAACTGCAAGGATCATTTGGTGAGAGAAAATCAAGTGCGAAAGATAAGCATAAATTCTTTGAGTTGCTGCGCAGCAAATCATTGAATGGTTCGTGCACTTCTACTGTGTCTTCATCTACATTGCTTGATGAGCAAAACAACTCTTGTCTTGAATTGTTTGATTCTGGAGTCAAATGTATGGAACATGGAAGTAGTTCTTGTGAGGAAGCAAATTCTTGTGAGGGATCTCAGCAGCACCTTTCTGACAACGAGGAAATCAATCCACCATGGGAACCACATGATGTTTTTGATGAAGGAATGCAAGAGGTTCTGTCTGACAACAGGGATTTTAACTCTTCATCAGAAATTGCTGACACACAAGATGTATATATGAAGCCCCATACAAATAATGCTGGTTCCTCTCCGTCCATCATACCTGCAGAAATTTATGATGGCTCCATGGGGTCCAACTGTAGTGATGATGAAACTGTTATGTTGTTTGAACCCATTGGAACAGGGGAAGAGGAATCCTATCCTGCTCAAGACAGACCTAGTCCAGAGGAGATGGCTTTCTTGGTTTCTCTTGGCTGGAAAGAGGATGAAATAGTTCCACCTCTGAAACAGGAAGAAATTGCTGATTGTGTAAGTGTTTCTTATGTTTTGCTAATTTCAGCAATAATTTTTTATTCTCTTCCCATACACAATTTACATGTTTAGGGGCTTAACTTTTTAAAAACATTTTCACTAATATTCATAGTTGACCCAGCACTTAAATTGACCCCATTCATTCAGCTTCATAAAAAAAATCTAGTTGAAGATTCCCATTCTGGTATTCACTTTGTAGTCTTACATGGGTGGTCTAATGGGATGGCTTGCCATGTCAGCAAAATGGATTGATAGTGTGGCCTGCTAA</dnaseqindica> |
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