BGIOSGA016716
| Gene Name |
BGIOSGA016716 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016716, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0029H02.30 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA016716-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA016716-PA |
| Length |
7295 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:23682769..23690063 |
| Sequence Coding Region |
23682769..23683182,23683867..23684067,23684161..23684343,23684793..23684902,23685135..23685194 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:23682769..23690063 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:23682769..23690063 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGCCCGGCGTGAGCATCGAGTCCGGGTCGGCGATCCGCGTGGCGGTGCTGCCGGTGGGCGGGCCGATCTCGCCGGCGCGCCTCCGCGACTACGCGGCGCTGGTGGCGCGGCACGCGCGCGTCGACCTCGCCTCGCTGCGGCCCTACTACTCGGAGCACCAGAAGAGCCCCTTCGCGCACCAGCCGTGGGGCGGCGGCTGCCTCCGCCTCAAGTTCGTGCTCGGCGGCTGCGTGCCCTCGCCGTGGGAGGACTTCCAGTCCTCCCGCAAGGTGCTCGCCGTCGTCGGCATCTGCCACCTCCCGTCCTCCCCCGATCTCGGCCGCGTCGCCGCCGACTTCGTCGACGCCGCGCGCTCCTACCCCTCCGCGCTCGCCAGCCGCTGCTTCGCCTTCTGCCCCACCGACGCGCAGCTGGTGCAGAAAAAGAGGGATAATATTATTATGTTCCCTCCTTCTGATCAACAATCGTTGGAACTTCATATGCTCACGATGATCCAAGACCTTTCTGCTTCGCTGTTGATGGAGTTTGAGAAATGGGTCTTACGTGCAGAATCAACGGGAACTATTCTAAAGACTCCTTTGGATTCACAATCCAGTCTTGGCTCAGAGGAGGTGATTAAGGCTAAAAAAAGAAGGCTGGGTCGTGCGCAAAAGATAATTGGAGATTATTGCTTGTTGGCTGGATCACCTGCTGATGCGAATGCACATTATGCCACTGCAATAGAGCTTGCAAGATTAACAGGAGATGTTTTCTGGCATGCTGGAGCCCTTGAGGGTAGTGTCTGTGCATTAGTGGTTGATAGGATGGCCGAAAGTGACCCTGTTTTGGAGGACGAAGTGAAGTTTCGTTATTACACCATTATCCAGCTATACAGAAGAGCAACTTTACAAGACAATGCTCAAAGAGTTTCACCAGTCAGCTTTGAGCTTGAAGCTGCATTGAAGCTGGCAAGATATTTGTGCAGGCGGCAATGTGCCAAGGAGGTGTCAGATTTACTAATGGGCGCTGCCGATGGTGCCAAGGCTCTGATTGATGCCAGTGATCGCTTGATACTCTATATTGAAATCGCGAGACTTTTTGGTACACTTGGTTATAAACGCAAGGCGGCCTTTTTTTCAAGACAAGTTGCGCAATTGTATCTCCAGCAGGATAATGCATATGCTGCTATGAATGCTATGCAGGTCCTAACCACAACTACAACTGCATACCATGTTCAAAGCAGGAAGACCAGCAAAATGGATCATGGTTTGCTCAAGCTTTACTGGTTATCCTTATTTGATTCTGGCAATACTGATCCTGGAAAATGGCATCCTCAGTCTGTAGTATCACTATTTGAGTCACAATGGAGTACCCTTCAAATGGTTGTTCTAAGAGAGATACTGATGTCTTCAATCCGGGCTGCGGATCCCTTATCGTCGTGGAGTGCTGCAGCCCGGCTTCTTCGGTTGCATTCTTTCCCACTGCACCCTTCACAAAGAGAGATAGTGAAGCGCAATCCAAATAAAAAAGAGTGGTGGACTGGTGGTGGTCCTTCTGGACCTTTTATTTACACACCTTTCACCAAGGGGGGAACATCTGGAACTAGCAAACAAGAGGTAAATTGGATTGTGGGAGAGCCAGTTCAAGTTATGGTAGAGTTAGCAAATCCCTGCAGCTTTGACCTAATTGTTGAGAGCATTTATCTCTCTGTTCATTCTGGAAATTTTGATGCCTTTCCGGTTAGTGTTAATCTTCCACCAAACACTTCCAAATTGGTTCTGTTATCTGGAATTCCAACACAAGTTGGACAAGTATCAATTCCTGGGTGCATTGTTCATTGCTTCGGTGTTATCACAGAACACCTATTCAAAGAGGTCGATTGTCTACTCCTTGGAGCTGCACAAGGGCTTGTTCTTTCTGATCCTTTCAGATGCTGTGGCTCTAGCAAGTTTAAGAGCGTTAACTTTCCAAGCATTTCTGTTGTTCCTCCTCTGCCATTATTAGTTGCCAATGTTGTGGGCGGAGATGGTTCTATTCTTCTATATGAAGGTGAAATCCGTGATGTTTTGATAACACTGACAAATGCTGGAACTGTACCTGTTGAAGAAGCAAATGTTGCATTGTCAGGGAAGAACCAAGATTCTGTTATTTCGATTGCCCATAGCACATGGAAATCTGCACTTCCTATTAAACCTGGTGGAGAAGTGACATTCGCAGTGACTCTCAGAGCCTGGCATCTTAGCCCGACAGATTTGGAAGCAGATGGCAGCAGATCTCCTGCAAACTCAAGGAGGATAGCAAGAGAAGGGAGTAATCCTTTCTTGGATATTCACTATGCCGGTCCTTCAGGGAACTCTGAGAGCAATGATGTTTCTCTCCCACCTGGAAGACGTCTGGTTGTTCCGTTGAATATTTGTGTTGTACAGGGCATGCGACTTGTAAGAGCACGCCTGTTGTCCATGGAATTACCTGCCCGGTTTACTGATGCTCACTTAAGATCTGTCAGTAGCAAGGACAATCTAAGCAATGGCAGTGATGCGATTCGTAATGACATTAGCTTATTGAAGATTGATCCTTATAAAGGAAGCTGGGACCTCCGTCTTCTGGAACTTGAGCTGTTTAATCCTACTGATGTTGTTTTCGATGTTGATGTCTCAGTTCATCTCGATGGCACAAGTGTCGAGCAAAAAATTCTTCCAGAGGATAAAACGGCCAGTTCGGCTTGCCACAAAACTCGAATTGATCGTGACTACTCTGCTAGAGTTCTCATACCTCTTGAGCACTTCAAATTACCTGTTCTTGACACTTCCTTCTTTGTGAAGGAAAATGGAAGTGATGAACCTCTTGGATCCAGAGCTGCCACGTTAGCAGAAAAGAATGCCAAGGCGGAACTAAATGCTTCAATCAACAACTTGATTTCAAAGATAAAAGTGAAGTGGCATTCTGGGAGAAATAGCTCCGGTGAGCTGAATATTAAAGATGCTATTCAGACAGCATTACAGGCATCTATTATGGACATACTGTTGCCTGATCCGCTGACATTCAGCTTTAGACATGCCAAGGATGGAACAACAGCCAAAACTGACTCTTCGAAGGAGCCTGGTGACGGTTCCAGTCGTTCTGCTGATGAGAGTGTTCTGAGGTGTAAGGATCCTATATTTGCTAATGAAATGACCCATATGGAAGTTCAAATTCGCAATAACACTAAGGAAACTATTCAGATGAACCTAAGCATTTCATGCAAAGATGTTGCTGGAGAGAATTGCTTCGACGAAAATAGCGCAACTGTCCTCTGGGCTGGTGTTCTTAGTGACATATATCTGGAGGTTCAACCACTGCAGGAGGTAGTACATCCTTTTTCTATCTACTTCCTGGTCCCCGGAGACTACTCGCTGCAAGCTGCTTCTGTTATAATTGACGCAACCGATGTTCTTCGTGCTCGGGCAAAGGCAGAGTCGCCCGACGAACCTATACTATGCCGTGGATCTCCATTCCATATCCATGTAGTTGGTACAGCTTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEPGVSIESGSAIRVAVLPVGGPISPARLRDYAALVARHARVDLASLRPYYSEHQKSPFAHQPWGGGCLRLKFVLGGCVPSPWEDFQSSRKVLAVVGICHLPSSPDLGRVAADFVDAARSYPSALASRCFAFCPTDAQLVQKKRDNIIMFPPSDQQSLELHMLTMIQDLSASLLMEFEKWVLRAESTGTILKTPLDSQSSLGSEEVIKAKKRRLGRAQKIIGDYCLLAGSPADANAHYATAIELARLTGDVFWHAGALEGSVCALVVDRMAESDPVLEDEVKFRYYTIIQLYRRATLQDNAQRVSPVSFELEAALKLARYLCRRQCAKEVSDLLMGAADGAKALIDASDRLILYIEIARLFGTLGYKRKAAFFSRQVAQLYLQQDNAYAAMNAMQVLTTTTTAYHVQSRKTSKMDHGLLKLYWLSLFDSGNTDPGKWHPQSVVSLFESQWSTLQMVVLREILMSSIRAADPLSSWSAAARLLRLHSFPLHPSQREIVKRNPNKKEWWTGGGPSGPFIYTPFTKGGTSGTSKQEVNWIVGEPVQVMVELANPCSFDLIVESIYLSVHSGNFDAFPVSVNLPPNTSKLVLLSGIPTQVGQVSIPGCIVHCFGVITEHLFKEVDCLLLGAAQGLVLSDPFRCCGSSKFKSVNFPSISVVPPLPLLVANVVGGDGSILLYEGEIRDVLITLTNAGTVPVEEANVALSGKNQDSVISIAHSTWKSALPIKPGGEVTFAVTLRAWHLSPTDLEADGSRSPANSRRIAREGSNPFLDIHYAGPSGNSESNDVSLPPGRRLVVPLNICVVQGMRLVRARLLSMELPARFTDAHLRSVSSKDNLSNGSDAIRNDISLLKIDPYKGSWDLRLLELELFNPTDVVFDVDVSVHLDGTSVEQKILPEDKTASSACHKTRIDRDYSARVLIPLEHFKLPVLDTSFFVKENGSDEPLGSRAATLAEKNAKAELNASINNLISKIKVKWHSGRNSSGELNIKDAIQTALQASIMDILLPDPLTFSFRHAKDGTTAKTDSSKEPGDGSSRSADESVLRCKDPIFANEMTHMEVQIRNNTKETIQMNLSISCKDVAGENCFDENSATVLWAGVLSDIYLEVQPLQEVVHPFSIYFLVPGDYSLQAASVIIDATDVLRARAKAESPDEPILCRGSPFHIHVVGTA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..414#1099..1299#1393..1575#2025..2134#2367..2426#2670..2961#3831..4018#4325..5199#5896..6855#7075..7295#ATGGAGCCCGGCGTGAGCATCGAGTCCGGGTCGGCGATCCGCGTGGCGGTGCTGCCGGTGGGCGGGCCGATCTCGCCGGCGCGCCTCCGCGACTACGCGGCGCTGGTGGCGCGGCACGCGCGCGTCGACCTCGCCTCGCTGCGGCCCTACTACTCGGAGCACCAGAAGAGCCCCTTCGCGCACCAGCCGTGGGGCGGCGGCTGCCTCCGCCTCAAGTTCGTGCTCGGCGGCTGCGTGCCCTCGCCGTGGGAGGACTTCCAGTCCTCCCGCAAGGTGCTCGCCGTCGTCGGCATCTGCCACCTCCCGTCCTCCCCCGATCTCGGCCGCGTCGCCGCCGACTTCGTCGACGCCGCGCGCTCCTACCCCTCCGCGCTCGCCAGCCGCTGCTTCGCCTTCTGCCCCACCGACGCGCAGGTACCTTTTGCTACCGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGTCTCTTCCCAAACCTCTGGATCACGTGGTTGTTTTGGTAGTGCGCGGCTCAGCAACCACTCGTGAATTGAGTTGGCCATTTGGTTGTGTAGTTGCTATACTGAATACGTGTACCTATGCCTTGCGCATTGGGTAGAACCTGGCAGCTTCAGAGTGTTCCGATGCTTGTTACTTTCGGGTGAGATCTGAGTATCTGACCTCTCGATCATGCAATCCACGCTGAACTAATACACTGATTCTATTGCTTGAGAGTTGGCTATTTTGCATCACAGCAGCTGGTCTCGTGGTGTTAATTCAGCCATCTATGTGTTGTTTTAGTTGATGACTAGGCTGTGCTCAGTTTTCTTGTGATGCATTCCGCTAGCATTTCTATCCTTAAACTAATGTGTACTTGTTTATATCATCATATGCCAGTCTTTCTTGCATAATCATATTAAACTTCACCAAATCTTGTATCTACATTCCTTGTGTAAGGAACTAGGGAAGGTCATGATTTACTACGCACCAAGCTTCTATGTAGTGTTGCTATGTTGATGGATTATATTCATAGCTCTTGCCCCAACGTTCTGATGCCAGCCTTGATGAATTGTTTATTTGATCACTCCATGATCTGATGTGATTATTATTTGCATTGTTTGTTCTGTAGCTGGTGCAGAAAAAGAGGGATAATATTATTATGTTCCCTCCTTCTGATCAACAATCGTTGGAACTTCATATGCTCACGATGATCCAAGACCTTTCTGCTTCGCTGTTGATGGAGTTTGAGAAATGGGTCTTACGTGCAGAATCAACGGGAACTATTCTAAAGACTCCTTTGGATTCACAATCCAGTCTTGGCTCAGAGGAGGTTCGTACTTTAGGTGTTCCGAGTATTTTGACTAGTGTATGTTGATGACATAATAGTACAACATTTATTGATATATGCTTCCACATTTTCTAGGTGATTAAGGCTAAAAAAAGAAGGCTGGGTCGTGCGCAAAAGATAATTGGAGATTATTGCTTGTTGGCTGGATCACCTGCTGATGCGAATGCACATTATGCCACTGCAATAGAGCTTGCAAGATTAACAGGAGATGTTTTCTGGCATGCTGGAGCCCTTGAGGGTAGTGTCTGTGCATTAGTGGTAAGCATTTGTATGCCTTATTAAGCTTTGGGGTTGAAAGCATTCCTTGTATCAGATCATACTGCATGATAGCTGTAATGTTATACACTGCATATTCAGTATGATAGCTGTCATGCTTATACACTGCATCTTCAGTGTTACTTGACATAAGATATCTAGATCTAATGTGAGAAACACTGCACTTGAAATTTCCACCAGACCCCACTTTAACCCCACCCAAATTTTCTTTGGGTCTAGATTCTCCAATGTCTGAAACTTTTATAATGTTTAACTCCAAACAACATATTTCAAGGACTTGTTAAATCATTGAGAAAGGGATCCAACAATTACATTTCCATTTCTTTCCAATATACTGAGAAGTGAAAACTGGTTCATTCTCGCTTCTTTTCCTCACCTGGTTAGAACATTCCCATGACAAGGTTTGGCGATAATTTTATGCTTATAATCAGGTTGATAGGATGGCCGAAAGTGACCCTGTTTTGGAGGACGAAGTGAAGTTTCGTTATTACACCATTATCCAGCTATACAGAAGAGCAACTTTACAAGACAATGCTCAAAGGTATTGAATTTGTCTTGTCATTCCTTCACATAATGATTGCTTTACCCTTTTACATGCTCAAAAGTATGTCACGAGGCACAAATGAAAGAATTGAATTATTTTTATCCCTTTTGTTTTTTCTTCTTAGCTTTGCTGAAAACTGGATAGAGGATTGCACTCCCTGAAATTTTTACTTGGTGAATTTACTTAATAAACTAATATGTCATTTGCACTTGTTCTTTTTCTTCCTTAGAGTTTCACCAGTCAGCTTTGAGCTTGAAGCTGCATTGAAGCTGGCAAGATATTTGTGCAGGTGAGTCTCCCTATTATTATATGAGCAGCACTTGGTTAGCCAGGTTCTTTGTGCTATATTAACAATTGATTTCTATAGAATGAAAATCCCAATATCTCCTTTGGTGCTTGAGTAGATTCTTATGCTTCTTTAGTTATAATTATTTGACTGGAAAAACTAGGGTGGAATGGGGGTCTGAGATTGTTGAAAGTATACTTTACTTAGGTTTGTTTTGTCCATTGAATTTTGCTCTTTCTTTATAAGGCGGCAATGTGCCAAGGAGGTGTCAGATTTACTAATGGGCGCTGCCGATGGTGCCAAGGCTCTGATTGATGCCAGTGATCGCTTGATACTCTATATTGAAATCGCGAGACTTTTTGGTACACTTGGTTATAAACGCAAGGCGGCCTTTTTTTCAAGACAAGTTGCGCAATTGTATCTCCAGCAGGATAATGCATATGCTGCTATGAATGCTATGCAGGTCCTAACCACAACTACAACTGCATACCATGTTCAAAGCAGGAAGACCAGCAAAATGGATCATGGTTTGCTCAAGGTGAGATTTTGAGAGCTTGCAGCATTGAGAATTATTTCCATTATTCAGAATACTGCACCATATTCATATGTTCTCCTCAACTTCTCCAAACATGCCTCGCATTTTATCAACTTGGATACTGCTTTACTCAGTGAAATCATGCCATCATCAAAATGTGCTTTCTTTTTATGCTGGAAATTTCACGGAAATAAACTTTGCTATGCTAGTCACGAGTTAACTGCACAACATTTTGCCTTTTATTCATCTTTATATATTAGTACTCCCTCCGTCTCATTTTAAGTGCAACCATGAGTTTCCATGCCCAAATTTGATCGTCCGTCTTATTTGATTTTTTTTATAATTAGTATTTTTATTGTTATAAGATGATAAAACATGAATCGTACTTTACGCGTGACTTATGTTTTTAATTTTTTTCAAAAAATTTTGAAATAAGACTGACAATCAAAGTTGGGCACGGAAAATCATGGCTGCACTTAAAATAGGACGGAGAGAGTAGTTGCTTTCCTTTTATTTCTGTTGATGTGGTGAGCAGGGTAGAATAAATGTCGTTGACAAGAAATATAACTCAATTTAAGCATTTTAGGACGGGTATCAATGGTTAAGAAAGATACATGAACCCCAATGCAAACTGTATTAATCATGTTAGTAAACATTCCTGCTTTATTAAAGAGCATGTGAGCACTTTGCCAGCATATATTTTTTATTTTATGGTGCTCATCTTGTTATACCAGAAATGATCATTCAGATATCATTCGTTTAATCACACAAAGGACGAGCGTAATTATTATATTGACAAATTGGTGTTTGAGTTTATATTTTATTTTACATATAATGATAATGACGTATATTGAATAGTTTTGCATTCATAGCTTTACTGGTTATCCTTATTTGATTCTGGCAATACTGATCCTGGAAAATGGCATCCTCAGTCTGTAGTATCACTATTTGAGTCACAATGGAGTACCCTTCAAATGGTTGTTCTAAGAGAGATACTGATGTCTTCAATCCGGGCTGCGGATCCCTTATCGTCGTGGAGTGCTGCAGCCCGGCTTCTTCGGTCATTTTACCCACTCATCACCCCAGCTGGTCAGAGTGGCTTGGCAAGCTCTCTTTCAAACTCAGCTGATAAGCTTCCATCGGGCACACGTTGTGCCGATCCATGTCTTCCTTTTATCAGGCATGTCAAATTAATGAATACTCTTATTGCTATGTTTGGGGAAACTTAAAATAGATACTGTAGGAGTCCTTTTATTTTGTTGCAAAACTGTAGGAACTACTGTTGAATCAGGAAGAAGATTTTGATCGAGCATGTTTCTTTATTTGTTTTCTGAGTTTTTATTTCTGGTGTCCTTTTTAAACTCAGGTTGCATTCTTTCCCACTGCACCCTTCACAAAGAGAGATAGTGAAGCGCAATCCAAATAAAAAAGAGTGGTGGACTGGTGGTGGTCCTTCTGGACCTTTTATTTACACACCTTTCACCAAGGGGGGAACATCTGGAACTAGCAAACAAGAGGTAAATTGGATTGTGGGAGAGCCAGTTCAAGTTATGGTAGAGTTAGCAAATCCCTGCAGCTTTGACCTAATTGTTGAGAGCATTTATCTCTCTGTTCATTCTGGAAATTTTGATGCCTTTCCGGTTAGTGTTAATCTTCCACCAAACACTTCCAAATTGGTTCTGTTATCTGGAATTCCAACACAAGTTGGACAAGTATCAATTCCTGGGTGCATTGTTCATTGCTTCGGTGTTATCACAGAACACCTATTCAAAGAGGTCGATTGTCTACTCCTTGGAGCTGCACAAGGGCTTGTTCTTTCTGATCCTTTCAGATGCTGTGGCTCTAGCAAGTTTAAGAGCGTTAACTTTCCAAGCATTTCTGTTGTTCCTCCTCTGCCATTATTAGTTGCCAATGTTGTGGGC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| External Link(s) |
