BGIOSGA016736
| Gene Name |
BGIOSGA016736 |
|---|---|
| Description |
Isocitrate dehydrogenase [NADP] |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016736, complete gene. |
| LocusTag |
OSIGBA0101P20.6 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA016736-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA016736-PA |
| Length |
5397 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:24047842..24053238 |
| Sequence Coding Region |
24047842..24048052,24048170..24048213,24048307..24048416,24049518..24049555,24050157..24050234 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:24047842..24053238 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:24047842..24053238 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTCCTCTCTACGGCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCGACCAAAGCCCTCCTCTTAAACCCCGCCGCCGCGCACGCCTTCGTCCCTTCTTCCCCCGGACCCCGCGCGCTCCGCCGCGGCGGCGCCTCCCTCCGCTGCTATGCCGCCGCCGCCGCGGCGGTGGCCGAGCAGCACCGCATCAAGGTCCACAACCCCATCGTCGAGATGGACGGTGACGAGATGACGCGGGTCATTTGGAAGATGATAAAGGATAAGCTCATCTTCCCTTACCTGGAGCTGGATGTCAAGTATTTCGACCTTGGGCTGCTCAACCGGGATGCCACCGATGATAAGGTCACTGTTGAGAGTGCCGAGGCTACGTTGGAGTATAATGTTGCTGTTAAGTGTGCTACCATTACACCTGATGAAACAAGAGTTAAAGAGTACAAACTCAAGTCAATGTGGAGGAGCCCAAATGGCACCATCAGGAATATTCTAAATGGAACTGTTTTCCGGGAGCCCATCTTGTGTAAAAATGTACCACGGATACTTTCTGGCTGGAAGAAGCCCATTTGCATTGGAAGGCATGCATTTGGAGACCAGTATCGAGCTACTGATACAATAATTAATGGTCCAGGAAAGCTTAAAATGGTTTTTGTCCCAGATGGTGCTGAACCTGTGGAGTTAAATGTTTATGATTTTAAAGGGCCTGGTGTGGCTTTATCAATGTATAATGTGGATGAGTCTATTAGAGCTTTTGCTGAGTCATCAATGGCAATGGCACTTTCCAAAAAATGGCCTCTTTATCTCAGCACCAAGAACACAATATTGAAGAAATATGATGGCAGGTTCAAGGACATCTTCCAGGAGGTATATGAAGAGAAATGGAAGGAGAAGTTCGAGGAAAACTCGATATGGTATGAGCACCGGTTGATTGATGACATGGTGGCATATGCTGTGAAAAGTGAAGGTGGATATGTTTGGGCTTGCAAAAACTATGATGGAGATGTTCAGAGTGACTTCCTTGCCCAAGGTTTTGGTTCCTTGGGTTTGATGTCATCTGTTTTGTTATCTTCTGATGGGAAAACATTAGAAGCTGAGGCAGCTCATGGGACTGTCACTAGACATTTCAGGCTACATCAGAAGGGACAGGAGACAAGTACCAATAGCATTGCTTCTATATTTGCTTGGACTCGTGGACTAGAACATAGAGCAAAGCTGGATAAAAATGATAGGCTGCTGGATTTCACAAAGAAACTTGAATCTGCATGTATTGAAACAGTTGAATCGGGGAAGATGACAAAGGATCTTGCACTCCTTATCCATGGCCCCAAGGTAACAAGGGAGTTCTACCTTAACACCGAAGAATTCATTGACGCTGTGGCTCAGCAACTGCGAGAAAAGATTCAAATACCAGCTGTGGTTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPLYGSSSSAAATKALLLNPAAAHAFVPSSPGPRALRRGGASLRCYAAAAAAVAEQHRIKVHNPIVEMDGDEMTRVIWKMIKDKLIFPYLELDVKYFDLGLLNRDATDDKVTVESAEATLEYNVAVKCATITPDETRVKEYKLKSMWRSPNGTIRNILNGTVFREPILCKNVPRILSGWKKPICIGRHAFGDQYRATDTIINGPGKLKMVFVPDGAEPVELNVYDFKGPGVALSMYNVDESIRAFAESSMAMALSKKWPLYLSTKNTILKKYDGRFKDIFQEVYEEKWKEKFEENSIWYEHRLIDDMVAYAVKSEGGYVWACKNYDGDVQSDFLAQGFGSLGLMSSVLLSSDGKTLEAEAAHGTVTRHFRLHQKGQETSTNSIASIFAWTRGLEHRAKLDKNDRLLDFTKKLESACIETVESGKMTKDLALLIHGPKVTREFYLNTEEFIDAVAQQLREKIQIPAVV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..211#329..372#466..575#1677..1714#2316..2393#2799..2852#2934..3035#3124..3209#3309..3412#3827..3895#3976..4091#4228..4262#4353..4495#4649..4771#5304..5397#ATGGCTCCTCTCTACGGCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCGACCAAAGCCCTCCTCTTAAACCCCGCCGCCGCGCACGCCTTCGTCCCTTCTTCCCCCGGACCCCGCGCGCTCCGCCGCGGCGGCGCCTCCCTCCGCTGCTATGCCGCCGCCGCCGCGGCGGTGGCCGAGCAGCACCGCATCAAGGTCCACAACCCCATCGTCGAGATGGACGGTGCGTTGTTCCACCCCCGATCCCACCCGCGGCTCGCCCCGCTTCCTCGCTCCTTGTTGTACAGGGCTCTGTTGTAAACCTCGCTCGGATGACGACTCTCGTGTGTGCCCTTTTCAGGTGACGAGATGACGCGGGTCATTTGGAAGATGATAAAGGATAAGGTGCGGGATTCCGCGATTGCCTCCTCGTTTTTGATTCTATTGGACTTTTCTACCTTGTTTGATGCTCTGATGACGCGACCTGCTTCGTGTTAGCTCATCTTCCCTTACCTGGAGCTGGATGTCAAGTATTTCGACCTTGGGCTGCTCAACCGGGATGCCACCGATGATAAGGTCACTGTTGAGAGTGCCGAGGCTACGTTGGAGTGAGTGGATCCATTCCTTGCTCTCTGTTCACATCTCACGATCTCAGTTGCAACCAATTCGATGCAAACCCTTCATGCCAGCATCATAGTAATTAGCATAAATTGAAGATGAAGTACACGCGTAATTCATTCGGAATTCGTATGCCAGCTTTTGGAGATGTCATTTGGTTGTCATGTAAGTTAAGCTGTCGAGTTCGTAAATGTGAGGTTCAACTAGTATAGAGATGAAATTATCACTTACGTAGCTGAATGCAAGTTTGCCATGGCATTTTAGCTTCCTGCAGGCATGGAGGTCTAGCACCTTTTCCTTAGAAATGGTTCGGTCAATTTCAAACCAAGTGCTTTATTAGATCCAATTATTATTGGACCTACCCTTGATTTAAACTAGATGACCTTAAAACAGGCTTACATGCCCCGGTTTTTGGGAGGAAGGCTTAAAGTGAAATGGCCTGATGGGCTGGTATTCAGGACAACGAGGGGCATGCCTTTTAATAGGGTCGTCTTAATTAGACTGAAAGCAGTTAGATCATGTGGAGTAGTTCCCACAGAGGAATTGTGCATGTAGTGAAGTACTCTCACTTCAGACTTTGGAGAAGTTTGCCCTGGCAGAAGCTAGATTTTGGCTTTACTGTTCCTTTCTTCTCTGCTATTCAGTGTATTTCAGGGATGTTCTATTCTATATCCAGCGGTAGGTTTCTTCTCTCCAATTCAATATCTAGCAATAGGTTTTCAATGACATGTCTATATCTTTTGTACTCTGCTCCTTAATGGTGGTTCTCTTTTTTTCTACACATATCTCATTGTGTGACTAACTAATTGAAACGAGTGCTCTGTTGCACTGTTGTTATTAAGTAGGACTACTGCAGCTATCTCCTGTCTGTAGACCTTATGGTGTAAGTAGTGTCATCCTTCACCAAATGCAACTTCTTACGGAAACTGTTATTCTAGGTAGATAGTCCTGTGTAAGAGTGTCAATGCTTTGAAAGAGATGATCGTAAGTTGGTCGCAAAAGTTACATTGAACCTTTTTGAAGTAAATCTCTCTTTGGATTTTCTTGTTGCTTCAGTTTGTATTCAAATTCCTTCTTTATGACTTTAACAGGTATAATGTTGCTGTTAAGTGTGCTACCATTACACCTGGTAGAGTCCCTTAAACTTTTGTTCCCATATTTGATTATATTTCCTTTTGCATTAAGGTGCACATATTTCACTAGTATTTATGTTTTATTTTTCCAGTGTCCCTTTTGAATTTTTTTTTATATATATGTGCTTCTGTCATAAGCATATGATTTAATTTCTGTACCTATTTCTGGGACATTATTTGTTCTCTGAATATTTTCCCTTGTCAGCTTGGTTTTGATGAGTTCAAAAGTTACATTTTAATTTTCTTATGATCCCCACTATTTTCATGATGCAGTACTAGCATTATTTTGCTAGAGCCATAGTAAAAAATGTTATATATGCGACAATCTTTGAGAAAAACTATTCCGCATACTTCAAAAGAAACAAATTAAAGGTTCTATACTTTGTAATACTTATTTGAGTTATTTGAGCTGTCAGCAAAGCCAACTATGATTAGCCACCTTTTCCTGGGCTACGCAATTCTACCTTAAATGAAGTTGATAGTACCTATAGATATACTATTTCTGAACTTCTTTTGGTTGAGTGTATGTAGATTGTATTTTTAATCTTGGGTACTTTGTTTGTCTTATTTTCCTCTTCTCTTTATGCCTATATGCAGATGAAACAAGAGTTAAAGAGTACAAACTCAAGTCAATGTGGAGGAGCCCAAATGGCACCATCAGGAATATTCTAAATGGTTAATTTTTCAACTCTTGAGATGCCTTTGATCTTTTATTTACTTGGTGAAATGATTCTCGAACTGAATTGACATGCACTCTGTGAATTTTGTTAGTGGGATAAATTTAAATTTCTAGTTAATGCTTATAATAAAATTTTATGGGGTCAAAATTGAGAATTCTGGTTGCCTTAATGTTGGAAATTTTACACACACATATTTTCATATGTACTATACTTCATCCTAATGTGGAGTGTTTAAATATACCTGTAGATTCTGACAAGTAGCAATAACATGAAATTTACTTGAAATATACTTATTTTAGCACAGATACTGATAATCCTGAGTAGCAATAATATGTCAGGAACTGCAACAATATAAAAAATATTCTGTACCATGATCACTAATGTTCACCATGACATACAGGAACTGTTTTCCGGGAGCCCATCTTGTGTAAAAATGTACCACGGATACTTTCTGGTAAGGAATTATTGAAATATTGTCATGGGAACAAGTGACTAAGTGACTGTTTTCCAGACTAAAGGTAATTTTCTTCTATAGGCTGGAAGAAGCCCATTTGCATTGGAAGGCATGCATTTGGAGACCAGTATCGAGCTACTGATACAATAATTAATGGTCCAGGAAAGCTTAAAATGGTTTTTGGTGAGCTTCAGTTGACAGCTACTTATTTGTATACCATCTAAAGCTGTTTTGTTGCTCATCAGTTTGTTCTTTTGGTACTGAAAATCAGTCCCAGATGGTGCTGAACCTGTGGAGTTAAATGTTTATGATTTTAAAGGGCCTGGTGTGGCTTTATCAATGTATAATGTGGATGAGGTATGATAGAAAATCAATGCAGTTCACTGCCTTATTATTCTCTTGAAAGCTATGCTAACTTTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAGTCTATTAGAGCTTTTGCTGAGTCATCAATGGCAATGGCACTTTCCAAAAAATGGCCTCTTTATCTCAGCACCAAGAACACAATATTGAAGAAATATGATGGCAGGTATCTGGGATTGCCATTATTTCCAGTTATTTATTATGTACCAGTACTATAGTCAAGCACTCTTTTGTTGCCACAAGGAGTGCCTTCTGACTTCTATTGCAAAGTTGCTCTCTTAACCTTTATCCTCTCGGTACACTGCTTCATATGTGTCTTTATGATTTCTCTGGTCTCTTAACAATTTATAAATTAGTATGAGGGGCACTAAATCTCATTGTAAATTAGTGGACAATAGCAGTGTACCGAGAGGATAAAGCACTCTTTAGTATGATGGTTATTGTCCTCGGTACATATGAAAATATCAAGCACTCTTTAGTATGATGGTTATTGTCCAATGATTTAAAAACCATACTGCAGCTGATTATATTATCATAAACAAGTCCAAACCTGACATAGGCAGTTTTGATATCACCAAAGGTTCAAGGACATCTTCCAGGAGGTATATGAAGAGAAATGGAAGGAGAAGTTCGAGGAAAACTCGATATGGTATGTGATATTTTACATTACCATATTTTACCACTAAAGTTCTTCGTGAATTCCAAACAATATTTGGATCATGCACCCAGGTATGAGCACCGGTTGATTGATGACATGGTGGCATATGCTGTGAAAAGTGAAGGTGGATATGTTTGGGCTTGCAAAAACTATGATGGAGATGTTCAGAGTGACTTCCTTGCCCAAGGTTTGTGCTTTCTAGTTGTAGCTTTCATGAAGCTGAATGGTGATATTTGGCAGTATAATTGCTTTGCAGTGTGGATTTTTCTCCTATTCCTCTTTCTCATTTGATACTTTTTCCCCTCACTGAGCACTTGTTTCAGGTTTTGGTTCCTTGGGTTTGATGTCATCTGTTTTGGTAGGTCACACGAATCCTTTTGCTCCATTGTAGAATCTATTCATCTATTGTGTTTTATTGGTCCCTAAGTAAACATGCTTTATTCTGCAGTTATCTTCTGATGGGAAAACATTAGAAGCTGAGGCAGCTCATGGGACTGTCACTAGACATTTCAGGCTACATCAGAAGGGACAGGAGACAAGTACCAATAGCATTGCTTCTATATTTGCTTGGACTCGTGGACTAGAACATAGGTAATCACAATAGTTGGTGTAAATGATGAATTCAATGCACAAGCAAGTTGATCTGCTAGGATATTCCCCCTTTTGCTTCTTGTTCATAATCAATAGAAAACCGGTATACCTTTTCTTACCCACAGATATAATGACTGCCCTTTTCTTTTTCAGAGCAAAGCTGGATAAAAATGATAGGCTGCTGGATTTCACAAAGAAACTTGAATCTGCATGTATTGAAACAGTTGAATCGGGGAAGATGACAAAGGATCTTGCACTCCTTATCCATGGCCCCAAGTAAGCCAATTTATGCATATGTGTGAGTTTTTTCATGGTAGTTCAGAAACTTAAATGTGTAACAGCTCAAGACAAAGTGTTAATATAATAATACAAAGTAGATAGTCCTACAGTGACATGGTTTCTCAAAAAGTAGAGTTGCAGTGATCATAATAGAAAACTTAGGCAGCTAATATTACTGTAGCTTTTCTACGGATGGTGATAGATCATAGCAAGCATCAAATAATTGTTCTTGCTGATTGCAAGGCAGTTAGTACACCAAATAGTTTAAATATTTTTCAGAAGTGGAAATTTTAAGCGCTTGTTCTGCTGCACATTTTTAGACCAAATTCCTGTATACTCGAACCTTTTCTTTTTTTGGATCTGTGCGGTAGGGCAGCCTGTTTCACATATAACAAGAAAAATTTCGGTGTTTGTATCAGTGTGTTATACTGGTTGCTGCTATTGGCTTATTGCCTCCGCTGCTCTGTTTTATGTATTGCCTGGTTTTCACATAAGCTTGATAACAAGTGTGCACTGTTCCTGTTGTCAGGGTAACAAGGGAGTTCTACCTTAACACCGAAGAATTCATTGACGCTGTGGCTCAGCAACTGCGAGAAAAGATTCAAATACCAGCTGTGGTTTAA</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
