BGIOSGA017316
| Gene Name |
BGIOSGA017316 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017316, complete gene. |
| LocusTag |
H1005F08.14 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA017316-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA017316-PA |
| Length |
3918 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:33088478..33092395 |
| Sequence Coding Region |
33088478..33088567,33088955..33089371,33091763..33092395 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:33088478..33092395 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCAAGAGCAGCAGCAGGACTTCAAGAACGTCTTCTGTATGGAGGGTGGCCAGGGCGAGTCCAGTTACATCAACAACAGCCAATCTCAGTCCCGAAACCTGAAAATGATGCTGTACGCCCTTGAGGAGACACTGGACAAGATCCAGCTCCCTCGTCACCGTCCGGGGAACAAGCCGCTACTGACGGCCGCCGACCTGGGATGCTCATGCGGCCAAAATACTCTCCTGATCGCGGACGTGATCGTCGACCACATGACCGACAAATCCTTCGGCAGCAAGGACGACGACGGCCTGGAATTCTGCTTCTACTTTTCCGACCTCCCGAGCAACGACTTCAACACCCTATTTCACCTCCTCCCACAGCAAGCTGCTGCCGCGGGCAGAGATGGGCGGCAGAGCCGGCGCTACTTCGCCGCCGCCGTACCTGGCTCTTTCCATGATCGCCTGTTCCCCGAGCGATCCATCAACGTGTTCACCTCCACCTTCTCATTGCACTGGCTCTCACAGGTGCCGAAGAGAGTCGTCGACAAGCAATCGCCGGCATACAACAAAGGTAAAGTGTTCGTGCATGGTGCCTCTGAGGAGACGGGCACGGCATACCAACGACAATTCCGGTCTGACATGATGCGCTTTCTACACTGTCGTGCCGCCGAGATGAAGCCTGGTGGTGCCATTTTCATTGTCAGCCTTGGCCGCCTATCATCCACCCGCGGCCCCACGGAGCAAGGCTACATCTATGAAGTGTATTGCAGCATGTTCGAGGACTCATTGCGTGATCTCATCGAAGAGGAGATGGTCGATGGCGAGAAGATGGACAACTTTAACGTCCCCCTTTACGCTGCTACAGTAGAGGAGTTCAAGGAGGCTGTGGACGCCGACGGCTCGTTTAAGATCAACCAGTTGGAGCTCGTGATGGGAAGCCCTCCCGTCGTGGATGATCCCGCTAACCGCGGCGTGGTCGGGCGCATGGTAGCGAACTACATGCGTGCCCTCTTTGGGCCACTCGTCAACACGCACATCGGCGGGGCGATGGCTGACGAGCTGTTCATCCGGATGCAGCGCCGCGCAGAAATACGTGCCGAGGAGCTTGTGGATGAAATGTGCTTCGCCCATATTCTATGCTCGCTTTCACTGGTGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MQEQQQDFKNVFCMEGGQGESSYINNSQSQSRNLKMMLYALEETLDKIQLPRHRPGNKPLLTAADLGCSCGQNTLLIADVIVDHMTDKSFGSKDDDGLEFCFYFSDLPSNDFNTLFHLLPQQAAAAGRDGRQSRRYFAAAVPGSFHDRLFPERSINVFTSTFSLHWLSQVPKRVVDKQSPAYNKGKVFVHGASEETGTAYQRQFRSDMMRFLHCRAAEMKPGGAIFIVSLGRLSSTRGPTEQGYIYEVYCSMFEDSLRDLIEEEMVDGEKMDNFNVPLYAATVEEFKEAVDADGSFKINQLELVMGSPPVVDDPANRGVVGRMVANYMRALFGPLVNTHIGGAMADELFIRMQRRAEIRAEELVDEMCFAHILCSLSLV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..90#478..894#3286..3918#ATGCAAGAGCAGCAGCAGGACTTCAAGAACGTCTTCTGTATGGAGGGTGGCCAGGGCGAGTCCAGTTACATCAACAACAGCCAATCTCAGGTAATTAACAAATTAAGCAAGACTAATTAGCTAAGTAATACAAGCATAACTATATGCAATTAGAGGTGGCTATTAATTACTATTCCCTCTGTCCCAAGATATAAGCATTTTTGGACTTCGACATAATTTTCGAGATACTATTTTAACTAACAAATATCTATAAAGTTAAGATTTTTTAAATAAAAAGAGTTGCATATTATGATAGCTTGTTTAATGATTAATCTAGTAATATCAATTTTAAATGATTGATTTTTTTTATTTTTAGTGATTAATAGTAAAGTTGAAAATGTTTGACTTAGTATTATTTTAAAAGTAATTATATTTTTGGACGGAGAGTATTAGTAAGATTGCTACGCCTGATCGAGCAAAGTAAAACTGCCGGTGCAGTCCCGAAACCTGAAAATGATGCTGTACGCCCTTGAGGAGACACTGGACAAGATCCAGCTCCCTCGTCACCGTCCGGGGAACAAGCCGCTACTGACGGCCGCCGACCTGGGATGCTCATGCGGCCAAAATACTCTCCTGATCGCGGACGTGATCGTCGACCACATGACCGACAAATCCTTCGGCAGCAAGGACGACGACGGCCTGGAATTCTGCTTCTACTTTTCCGACCTCCCGAGCAACGACTTCAACACCCTATTTCACCTCCTCCCACAGCAAGCTGCTGCCGCGGGCAGAGATGGGCGGCAGAGCCGGCGCTACTTCGCCGCCGCCGTACCTGGCTCTTTCCATGATCGCCTGTTCCCCGAGCGATCCATCAACGTGTTCACCTCCACCTTCTCATTGCACTGGCTCTCACAGGTACGCTGTATAATATACAGTTTAGGTTTTTTTTAGAGTACATCAAATTAATCATAATGAATCGGGAGTAGATTCTAATCCGTCGAGGGGAGATATCCCCTCGTGTACCTTTTTCTTTTAAATTCGATGCAAATGGTTGTGAAAAATTTTAAAAAAAATTGACAATATAGAGTATAGCGATATCTACTAGTCCACCAAAAATAAAATTCAAATTCGACCTACATATCGAGAAAAAAAAGACAAATTCAGATATGAACATTATATTACTATTCATATACTAAATTTGTCTTTTTTTAAATCTCAACGTGTGAATTGAGTTTGGATTTAAGATTTTGTGGAGTTGTATAGATATATAGTATGAGTGTTGCCAATTTTTTCCAGAATTTTTCATAACCGTTTAGATGGTTTTGAAGTAAACGAGGGACATCCCCTTTGAGGAATCAAAATAGTTTCCCCAATGAATCCTCCATTTTGTGTTGATCTTCAGACTAACTAGCATATCTTCTCACCCAATTTTGCGTGGAGATAAATATATTGTACATCTTTTCAGTAGAATTTGATATGTATGCAATTTTTGCTTCAGTTTCCAATCAGTGGTGTGAACGTAGGATTCTGAGCGTGTGTATTCAAGATTTTCACAGTGAAATTAAAAAAAAACATTTTCTTTTGCGAACGCAATTTTTTTCTTTTAAAAAAAGAAGGGATAGCACACAAGTACTACTGAAAATTAAAAAAACGTTTGTGTTACTAATGAAAATATGTGTTAAATTAGGAAGATAGTACAGAAAAGAAAAACGTTTGTGTTACTAATGAATATGGATTATATTGATTCCAATGTGTTGTTCAATCTGAGAAAAATTCTTGCACGTTATACATGTAGTTAAGTATGGTTGGGATCAAAGTGAGCTACTCGACTGGTAAAATTCAGGTTTTGACTCGAGCAGTTAATGATCGAGTAGGATCATTAAGTTCAATATTTCGATCATTTGCTTAGTCAGCTACCTTGAGCTAATTTGTGAGTTACTTGTGTAGCTCGTTTAGCTTGTGACGTGTTGAAATTAAAAGTCCACTCCACATGCTAGATAGTGTCACGTATGACACAAGCAGCTCACAAACCACTTATTATAGTACAACCTTATATTGTCATGATACATAGCACGTCGGCCATAACTCCAATTACATAGGCCTATAAATCATACCAAATGTAAATTTAAAGGGAGTATATATCTATCTAACGTTCTATAGAAATTCCCCCAAAAAAATTTAAAATGTAAATTAATACGATACATTATAGTACAATAACAATGTAAGTACACATGTACCTAGAATATACTCCCTTCAGTTTCATTTTAATTGATGCTTTGGACAATAACACGCTCTACAAGATATACTTTTGACCTTATTTTTCTATTATAATATATACAATAAATAAATGCATGTTTACTTTTATTATAGTTTTATTATAGTGTTTTGAAAAGACAAATCTATATATGTTTTTCTAGTTTCTTTAAACTAAATATTTTTAAAGTTATTGATGGTTAAAGTTATAAAAGTTTAACCTCAACCTTGTCAAAAACGTCAATTAATATAGAACCAGAGGAAGTAAGCGGTATGTAAATAAAAAAAAAAGTTGCACTAGCTCAGTAGGGGGACGCACGCAGGAGCTATTGGTGGTTGCGAGCTAGTTCGATCGACGCCCACCTCACGCAATACGCTTTGGTTTTTAACCCATCCAACGGTCAGGGATCTTAAAGCCCATCAGATATGACGAACAATATAAAATATTAATTTTCTCCCAAAATTTATGTCAAATTATAAATAGCAAATCCTAAATTTAAAATCACTAGAAAAAAATACCCGTGCGTTGCGGCGGGTGAAAGCTATTTTAATTTTATTATTGTTATACAGTTTAATTAAGGTGAAATTCACTATTAGAATTCGCTTAAAATCATGAGCTGTAATTAGAGTCTGATCGCCTCAAGTTAGCATACGAGTTTTTTTACAGAGATTTCTTATATGACTCTTCTGTGTTTCCAAAAGCAAACATAATAAACGACTCAAATAATAATATGTATTTCCAAAAGTGAACGAACTTGAAAACCGACTTATACACAGATGATGTACTAAAGTACCGGTAAAAACGTCTTCAATTTTTATAATAATAAAGATGTATTGCATCGTAGCAAGTTTAATAGTTTCAATGAGTCTACTCGAATTTCTTAGCGAACTAAGCTGGGCTCATTTTTAACTTGTTATGTTAACGAGTTGAGCGAGTCGGCTCATTAACTCAACCAATTTTCGGCAGTCAAGCTACGGTTCGAGTTAGCTTATCAACCACCCTTAAATGTAAGCAATAAGTGAAGAAGTTTAATTGGTTTAATTATTACACAGGTGCCGAAGAGAGTCGTCGACAAGCAATCGCCGGCATACAACAAAGGTAAAGTGTTCGTGCATGGTGCCTCTGAGGAGACGGGCACGGCATACCAACGACAATTCCGGTCTGACATGATGCGCTTTCTACACTGTCGTGCCGCCGAGATGAAGCCTGGTGGTGCCATTTTCATTGTCAGCCTTGGCCGCCTATCATCCACCCGCGGCCCCACGGAGCAAGGCTACATCTATGAAGTGTATTGCAGCATGTTCGAGGACTCATTGCGTGATCTCATCGAAGAGGAGATGGTCGATGGCGAGAAGATGGACAACTTTAACGTCCCCCTTTACGCTGCTACAGTAGAGGAGTTCAAGGAGGCTGTGGACGCCGACGGCTCGTTTAAGATCAACCAGTTGGAGCTCGTGATGGGAAGCCCTCCCGTCGTGGATGATCCCGCTAACCGCGGCGTGGTCGGGCGCATGGTAGCGAACTACATGCGTGCCCTCTTTGGGCCACTCGTCAACACGCACATCGGCGGGGCGATGGCTGACGAGCTGTTCATCCGGATGCAGCGCCGCGCAGAAATACGTGCCGAGGAGCTTGTGGATGAAATGTGCTTCGCCCATATTCTATGCTCGCTTTCACTGGTGTAA</dnaseqindica> |
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