Os08g0292600

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Gene Name

Os08g0292600

Description

Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type domain containing protein

Version

NM_001068001.1 GI:115475739 GeneID:4345190

Length

4793 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0292600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:11816319..11821111

Sequence Coding Region

11817181..11817952,11820669..11820880

Expression

GEO Profiles:Os08g0292600

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggtgttgccttcatcaaataccagggccacttcttccatggcttaccctgtttccctgagcagcctccaccaccaccccaacaaccaccatgctttttttcttccctcgaaaacaaaccatgataatactcataaacctattgaatcctctagaatttctagacggtctctcatcttcctccctgtcctcccttctcttctatacgcttcatcatcccctgccttagatgacgcaaacattccatccacctctgccattgataccaccatcacagatcggatcttcatggacttcagtgtctgccctagctactttcgctctgaccgcactttaggagctgagcttgctacatgtcctgattctgaacctcttggtcgtgtaatttttggtttgtatggtcgactcctccccctcactactgccaacttcaaagctgcttgcacttctgctgcataccggggaacacttgtccacaagctccttcagggccagttcttcgttgctggccgccaaggtcctcggcgtgacaggggcgaggtccaacctcccaccggacttgtgaggaatgctgagactattgaccctaaagcatttgaactaaagcatgcaaggcctggcaccctctcattgtgccttggacagaacgatgacgatgatgacatcaagctcaatcctaattatcacaatgttgaattcttggttaccactggaccagggccctgcccagagcttgatggacagaacattgtctttggaactgtattggaaggaatgaatgttataaccagcattgcaactattcctacctataaaccagctgaaaggatccgcttcttcaatgattttgcccagttgattggtgatgaaagagctcaaactgctcgagcgttgtgggatcgcccgctaaaaactgtttatatcagtgattgcggagagctaaaagtgaccaaaccatcactttcccctccaagtctgccataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MVLPSSNTRATSSMAYPVSLSSLHHHPNNHHAFFLPSKTNHDNT HKPIESSRISRRSLIFLPVLPSLLYASSSPALDDANIPSTSAIDTTITDRIFMDFSVC PSYFRSDRTLGAELATCPDSEPLGRVIFGLYGRLLPLTTANFKAACTSAAYRGTLVHK LLQGQFFVAGRQGPRRDRGEVQPPTGLVRNAETIDPKAFELKHARPGTLSLCLGQNDD DDDIKLNPNYHNVEFLVTTGPGPCPELDGQNIVFGTVLEGMNVITSIATIPTYKPAER IRFFNDFAQLIGDERAQTARALWDRPLKTVYISDCGELKVTKPSLSPPSLP</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>863..1634#4351..4562#gttctcctccgctccttgcgccgccgccaagacgagcggagggccgggcggcgatctccatctggcaagcagagcagcggaggggaggaggggatcctggtgcgtcctctttctgatccatctctctctctctctctctctctctctcccaccccaccgggacctggaatttgcttgcgttcgtgaatttgatagccttaaacctctcttatttcaagtaataacagtttgtttgtttacctaaaagttcgggggttcaaccgaacccccatgccccaagttggatccgcccctggtttgaattgctgaaacataatttcgagctagttaaacgaagagacaacatgcctggaaatgtaaaaaaaaagtatgctgatttgaatttgattgttggaactgccctataggaaactggtaaattttagaacaaaaaaccttgcttatagtaaaatcgtgaatggatgatatgcaaagacatggtgagaaatattcactcgctcatactacaactacttaagaggaccatatttgctcactctggaatagctgctgacctgctgtgaccatcatacaccccctcaccgcaatgcaggttccatttgaagtaatcggagaatggtatgttgagaattagattaaagcttccattttaaaattgtaattgtttgggctgtcagctatttgccattattcacaagtgataattgtgaccctacaacgaagaggctaacagtaggttttagaatttcagtaatgttatatctcaaaagccaactattacatttgcagggaaggatattagtgattttctactgctgtttcgtcagaaggacaagaactgaagaattcagttagcaacagtatggtgttgccttcatcaaataccagggccacttcttccatggcttaccctgtttccctgagcagcctccaccaccaccccaacaaccaccatgctttttttcttccctcgaaaacaaaccatgataatactcataaacctattgaatcctctagaatttctagacggtctctcatcttcctccctgtcctcccttctcttctatacgcttcatcatcccctgccttagatgacgcaaacattccatccacctctgccattgataccaccatcacagatcggatcttcatggacttcagtgtctgccctagctactttcgctctgaccgcactttaggagctgagcttgctacatgtcctgattctgaacctcttggtcgtgtaatttttggtttgtatggtcgactcctccccctcactactgccaacttcaaagctgcttgcacttctgctgcataccggggaacacttgtccacaagctccttcagggccagttcttcgttgctggccgccaaggtcctcggcgtgacaggggcgaggtccaacctcccaccggacttgtgaggaatgctgagactattgaccctaaagcatttgaactaaagcatgcaaggcctggcaccctctcattgtgccttggacagaacgatgacgatgatgacatcaagctcaatcctaattatcacaatgttgaattcttggttaccactggaccagggccctgcccagagcttgatggacagaacattgtctttggaactgtattggaaggttagttgctttcattttctgaacttttactaaatggttcttgcacactttgtgttaaattctgtcttgcaagaatttcaatgtctttccctcgaacaagttgggatttgacctgtgcgtaatctactaatgcaaggttggcatgattaaattcatgcataaatctattttctttggttcaaacagagaaaaataaaatgtatttcaaaccgtttcattttttgtcaagtataattatatgacatcttccattctccttttggtatagttatatacacttgctaaggtaaacatgttttcattgaagtaatcaacattagtacataacagagaagaaaaaaaatgcaaattttgcagctttgcatgagtattaacaaaataacaaacagttgtgtccgtattctggctaggacttcatccatgcagaacataaagttagatgttttattattaccaatttctgcaagtaatataagcttgtaaagaaattgtcattttatttcttcctttttgttgtctcaacaccaaggatggttatcacactaagattaattcttttttttttcttctctgcacttcaccacagtataactcatcatcaattcctgccatggtttgttctaacaatgtgccacattgtcaataaacaacaccagagagtgtatcatcctcatatagtcaaatttggtgcatacttcattgtttttccctgttctgatttattagatctctggtggttatcagaagtagattgaactaaaccaagcaactcatcaatgagatttatactgccactgaacatgtcaccccaaaagagaatctacttctagctaatttaagactgacatgtctgctttgacagtttgatttgtaatttaataaactttacaacaacaaccagggcagtagttaactacaaagcagttcatatttaagttttatgcatcaagaacttaaaagcacggcccttctatccccaaaaaagcacatgcccacgttctgcatctgcatgcccatgcggcatgctctcatgcacatgcatgggcagacgcaacaaatgcatgcgcacatacaactatataacttatattcacatgacacttgaggcacactaatgcttgtcattaggacccattgccacttgaagtgtaatagtgttactcatttgaactgaactagctacttagtctcagtttcagtatttgattattaccaacagttttttcttaagcatccatttttcttcttctataagcaactttgattgtcaagttctgcattcacatgcacacataggcgactaaaacagactttcaagcactgagttaaacaagtgtattaattggatatattccagtggaattgacatgaagcttcaattttgtacgagttgctttctgttgtcttaatggaaactagtattgccactgtatgattaatgatgatattgttgattcagattaacagaaagcggctaattcgaaagattttacatgataatttgtacatatgtaatttgtaactattatatagttttaatatatcgcagtagcagtctctcctgctgttttcatcgtcaaaaaaaaaaaaaactgttttctccgcaattcctttttttaactatttggtcttgcaacttgtgtttttatcagattatttctgcacgattggcagtccattcaattcaaggttgaaattttttacagaagagctaatgtgttaatagtataaatcaagtggatacttctagcataatagagaactgtcttgatttccttgcccaaaaaaaaagaggaccgagtggtttttaatctatttctgattaagtcagtgtatgaaaaaaaaaatcagctaccacttatctttctttcatgaagaaccccctttttcttaacaaagcatactctccgtatagccatggaagtatatattaattacataaaacagaaagactgtatgacattttttttgtgaatatgtaaaggtagccattactatctttttattagcctcatttttcttgagcaaatgagaaaaaagtataaaatacaaaaagtcaaatcatgtggtgaacgattatgttctcaatagtgctttcattaaagtgtttgggaccatgtattgttgggtagcattgccatactccactgatatgtggttgagaatggtgatgtggatgcacatttaaggccgatagtttgatgctgcttctttttttctccaagtggcagatttatcacatgtggataatagatattaggttcatctgtttggaatgcatatgtacagtgaaagatgtactatggcaccgacatcttatgaaataatttagagatcacattgtcttatgaacatattgaatatggttaaaacttgtgaatatcagattatcagttcagtataaattaatttacttctggagtttatctgtattgaaatttattccgtaaattgtatctgttaactgtagtagtgctgcagaaactctgcctgaggcagtccatatcttttctccttttactacattgtagactaccgtagaccatatgatcctgccattcttaacatgcatgcaattgaagcaatttggctatgatacttactagattgcccagtaaatatatgctaattttaggaaaatagttgttatgcattaacagtcccccgactaaattagtctaatcttttcgtaatgtttatttaatttattgtgcaggaatgaatgttataaccagcattgcaactattcctacctataaaccagctgaaaggatccgcttcttcaatgattttgcccagttgattggtgatgaaagagctcaaactgctcgagcgttgtgggatcgcccgctaaaaactgtttatatcagtgattgcggagagctaaaagtgaccaaaccatcactttcccctccaagtctgccataaaaaaccacagaggcaattttgtgtacctacacttattcttctccctccaatgtcaactgtatatatgccatctagtattaactgacatctgctgtgtttctggcccaaaatgtgtacgacgggtctctgattcatcgaagtaaatatattacagtgctgtgcaaaattcttgacctgtcagctttcatcttggataaccgttgagactatgatgctaatgattagcttctc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0292600, RefSeq:Os08g0292600