Os08g0305300
| Gene Name |
Os08g0305300 |
|---|---|
| Description |
Protein prenyltransferase domain containing protein |
| Version |
NM_001068036.1 GI:115475809 GeneID:4345227 |
| Length |
8224 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0305300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:12812382..12820605 |
| Sequence Coding Region |
12813857..12815900,12815983..12816224,12817454..12817576,12817685..12818257,12819931..12820005 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:12812382..12820605 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:12812382..12820605 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatgaccgttccgatggataaagctactgcttccccatcatcaagggagcttgcacagcggctcttaaagaagaacgctgaacatgaaagtcgtctgcgaaggtcagcacagtccaaagtgccatcagatcctaacatatggtttcagatgcgtgagaactatgaaaagataatccttgctgatcatgacttctctgaaaaacgtgagatagaatatcttctgtggcagttgcactacaaaagaattgaggaattccgagctcatattgtctctgctgggaagaacaatgccaatcctgatcggatcaagaggatcagatcttctgttagaagtttcctctcagaagcaactggtttctatcatgacttgatgctgaaaattcggtctacttatgggcttccgttgggctacttctctgagggtcctgatagttctgttgttcctgataaagatgggaagaaagtggttggggtgaaaaaaggcttgttgtcatgctatcgctgtttgatatatttaggagatcttacccgatacaaaggtctgtatggggatgtggattatgcaagtcgtgaatatgctgcagcctctatctactacaaggaagcagcttcgctgtgcccttcgaatggcaacccacatcatcagcttgcaatactggcatcatatgctggagatgaggtaacagctatctataggtacttccgtagcttagctgtggataatcctttttctgcagcgagggaaaacttgattctcgcatttgacaagtttcatatgcagaatcatgatatctatgctcagctatcaggtaatagcaaggttcccaacgctaagagcttgccatccagatcagttggtagggccagaggaaggggtgagacaagatttcagcccaaaggttctagtacagaagaaaattcaaaggagcgagagcacagtattcaagaaatactgaaggctttctatattcgatttgttcgcctcaatggaattcttttcacaaggacaagcttggaaacatttggggagttgtctgctacagttatcagcgatttgcaaattcttctttcatctggtccttacgaggagcttaattttggtgttgaggctgctgaaaacgcgctttctgttgttaagcttattgctatccttatattcacagtgcacaatgcaaacaaagacgcagataatcaatcatatgctgaaattgtgcaacgcagagttcttcttcaaaatgcatttgctgcagcctttgaatttgttggataccttctcaaaagatgcgcagagcttcatgatgttgcatcaagtatctacttgccagctattttggtcttcattgaatggctggcgtgccatccagattttgtggctagttctgagatggatgaaaagcaagccgatgcaagatctttcttctggagtcaatgcgtgccatttatgaataagctcattttgactggtctcgcacatgtcgatggtgataatgatgaaacttgcttttttgacatgggcacatatgaggagggtgaaactgggaacaggcttgcgttgtgggaggatgttgagttaagagggttttcgcctttggtacctgctcaaggtatcttggacttctccaccaagcaaggttttggaagtgatggaggtaccaaggagaaaaaagcacgtgtagaaaggattcttgctgcagggaaggcgctgttaaatttcgttcaaattgatcagctgcgaatatattttgatgcatcctcaaaaaagttccttatggcttcagaacctcctcctcctgcttcttctgttcctcttgttgtatcttccaatgcgcagacaacaaatcacatacaacaggaacctgaagtctccagtaaaattggttctgtcgcagaagatctaggtgtgcttcagtcaaaggcacaactctttcttgatggagatgatgatgaagaaatagttttcaagcctccagtttctgaaaagcttccgagagttacttcagaacagactagtaatgagttattacagccagtggtggtgtctgatgtcaattggtcaaatgatggtgcaccaccaccaatgacatttcagagcaatggaccggttctgactcccaatgtttatgttcaatctctcccaatctcttctcttggttgggcagccaatgctgggcaacatgtgattcttgatgttggtgcaaggtcaacatctgatatttttgagtctctgaaagcacctgatcataactgggtaagcactggtgcaccacttgttggctcactggatacagtccctatggcgagcttttccaatataatttcggatcagcgtacacctccatcgtcactcggttgtttcagtaacccagataatacagccatactccctgggcaagattcattcttattgagtgcattaaacaatgttaacataggtgcaagtggatttctggatcaaagagtgaatggtggactcagtggattacagtctgtgggaaatgtgcctcaggtatctgctcaagctactatgaatagtacaaatccaatgattggtcagtataaacatactgaagttaccatcccttctgccttctattcagttctgccgtcagtagtatcttctgatggtgtatcaaagaaaaatcctgtcagccgtcctggaagacatgttggccctcctccaggatttaacaatgcccctccaaagcgacaggatgattccattttagctggcaatggccagcatgttcagaccaatgacggcatctggttggatggctacaggtcatcactggattatgtcaataatcagcgttttgcacattcaaatgttaccactgccagcagtactttcaccactccctttccttttcctggaaaacaagctttcagcatgcatcctagaggtagcgatgaaaaacagtggcaggatttccacctttttgggcccacaaagcaacttccagaacttaattttcagcaagggaaccagcaaaatggtccactggcggaacaattaccagcacaatctgcatggtctggcaattaccttgtgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MMTVPMDKATASPSSRELAQRLLKKNAEHESRLRRSAQSKVPSD PNIWFQMRENYEKIILADHDFSEKREIEYLLWQLHYKRIEEFRAHIVSAGKNNANPDR IKRIRSSVRSFLSEATGFYHDLMLKIRSTYGLPLGYFSEGPDSSVVPDKDGKKVVGVK KGLLSCYRCLIYLGDLTRYKGLYGDVDYASREYAAASIYYKEAASLCPSNGNPHHQLA ILASYAGDEVTAIYRYFRSLAVDNPFSAARENLILAFDKFHMQNHDIYAQLSGNSKVP NAKSLPSRSVGRARGRGETRFQPKGSSTEENSKEREHSIQEILKAFYIRFVRLNGILF TRTSLETFGELSATVISDLQILLSSGPYEELNFGVEAAENALSVVKLIAILIFTVHNA NKDADNQSYAEIVQRRVLLQNAFAAAFEFVGYLLKRCAELHDVASSIYLPAILVFIEW LACHPDFVASSEMDEKQADARSFFWSQCVPFMNKLILTGLAHVDGDNDETCFFDMGTY EEGETGNRLALWEDVELRGFSPLVPAQGILDFSTKQGFGSDGGTKEKKARVERILAAG KALLNFVQIDQLRIYFDASSKKFLMASEPPPPASSVPLVVSSNAQTTNHIQQEPEVSS KIGSVAEDLGVLQSKAQLFLDGDDDEEIVFKPPVSEKLPRVTSEQTSNELLQPVVVSD VNWSNDGAPPPMTFQSNGPVLTPNVYVQSLPISSLGWAANAGQHVILDVGARSTSDIF ESLKAPDHNWVSTGAPLVGSLDTVPMASFSNIISDQRTPPSSLGCFSNPDNTAILPGQ DSFLLSALNNVNIGASGFLDQRVNGGLSGLQSVGNVPQVSAQATMNSTNPMIGQYKHT EVTIPSAFYSVLPSVVSSDGVSKKNPVSRPGRHVGPPPGFNNAPPKRQDDSILAGNGQ HVQTNDGIWLDGYRSSLDYVNNQRFAHSNVTTASSTFTTPFPFPGKQAFSMHPRGSDE KQWQDFHLFGPTKQLPELNFQQGNQQNGPLAEQLPAQSAWSGNYLV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4706..6749#4382..4623#3030..3152#2349..2921#601..675#ggtacggacaccccccgctcttcctccctccctccctcccccgcgcctcgcctcatcgaatcccctgtgtcccgcggggattcggcgccggcgtccgcccaattggtcggcctcggctcgggagaccaccgattcagcgcctcgacttggtcgggctccccgcgggatctttggtggttccttttttcgggggattgttctttcatgctggctgctcgattcgcctcttgggggtttcgatccgctagcgttagttgttcctagggtttcttgggcgatcgtctgggtcggtaggtggattcttcacctagggtttctagtgaaattgcgtttaggttttgggatgatgttgtgcgccggcgatgggtcgagcagctttttgggttgttacggtcgcggaagcttcatcccgtcgtggatgcagcgtagttcctcggttctgtttaggctatttcccccctttagcgcggtagttgagtgtggtgtctggtaggctttactttgtactactaagctgcatgtttttacctcttgagatttggtgttgacttcttgttaattcccctccgcagcgtagttgaccccatatgtgattgatggatgatgaccgttccgatggataaagctactgcttccccatcatcaagggagcttgcacagcggctcttaaagaaggtttgctcttttcaatgtttctgcaatctgcattgcctgtgagtttctgtagtagcatgcaaggaaaagattaatggtatatgtgtgaagttgtcatgaaccctcttcaaacagctaacatgcaactgtttttggcatactgtggtcctgtgagctgagttgcgcagatgatctcctgtcaccatccatctcattccatgtttacagtcatctctatgtgactgttccttctgtccttcgtcccagacattgcttactgagcgttgactttccctatctgtgtgtgctatcgctgtatacatcgcattgctttgtcttcctcgcaccagatcatacgatcctatctaatgctcactatttcatctatctgtaactgcaattgtctaattgtgtttgtcggtttgtccagggctgttatattttcttgtaaacaatgcaatagttacatctttggttattttctttctcctaaaaacatcttttgttacctgcctttgtcacctgttcatgcatgtgtgtaggacatttttctgtatgtacttttaccattagggaaaatgcagcagaactgtgcacattatgtcttgtcccctttgtgatatgcccttggttctggcttcttcccatttataccgcattcgtcccacggtgctagttagcttgcacattaatcgatagttgcacacacgtgcttgagttgtaactgaacttttgtgcccacaaatttccatcccctttaaacagtttcacttgaccaaatgaaccacattagcatggtcagcattacaatttgcttgattgaaaaatggaaatgttccaggtgatgaatttaaaacattcacttgtattaaagctaacagttttatgttcctgtgctttgtgatgtggcatttgctagctacagctagctgtgaagtggattaattatggggcaattatttagtcatattggtaaatagatatagagcaaatggggtggtagctatatattttatatttcatgtttgtaacatatgtattttgtggtatatatatgggttcctgtgttgatggggtaaactgtgtttcaaacaatgctgtatttttaattcatatttgttgaagccttgtggaaaaagcgccaagaagtgaaaaacctctgtataatctactactagttggcatactggaatgtgtattcgttttcctctctgtgggttaatgctatctgacgatgtccgagagaagtttatgaccataatcacgttgttcatggaactgagttaactttaaactagatgcagatttgaaatgtatgtgatctccaccaaatgaaaaagctgtccatggttttgtggaacagttgactgctcattgttcataatatgtatatagataggtcaccttttttggcttctgagttgagatgttaaagcttttagaattttgatgtccttgatctagctttggagtgcctatttccttttactatttattggatgcatatggcctatttccttttactatttattgaatgcttatgtctgttccttttaattccttcactaaaattctctcctggtgctttcacatggtgtttcttccacttctatagtttatttcaagacatgaaaccttatgttgaaatagatagtgtatacgagtgagtaatgataatgatgttacttctgcagaacgctgaacatgaaagtcgtctgcgaaggtcagcacagtccaaagtgccatcagatcctaacatatggtttcagatgcgtgagaactatgaaaagataatccttgctgatcatgacttctctgaaaaacgtgagatagaatatcttctgtggcagttgcactacaaaagaattgaggaattccgagctcatattgtctctgctgggaagaacaatgccaatcctgatcggatcaagaggatcagatcttctgttagaagtttcctctcagaagcaactggtttctatcatgacttgatgctgaaaattcggtctacttatgggcttccgttgggctacttctctgagggtcctgatagttctgttgttcctgataaagatgggaagaaagtggttggggtgaaaaaaggcttgttgtcatgctatcgctgtttgatatatttaggagatcttacccgatacaaaggtctgtatggggatgtggattatgcaagtcgtgaatatgctgcagcctctatctactacaaggaagcagcttcgctgtgcccttcgaatggcaacccacatcatcaggtatgcagcatgtcgctgtagtaattttctgcaccattagtacaaaacttgttttgtgtgcttgaatggcgatggtactgatgaaaaggtttttgtgttcttgctcagcttgcaatactggcatcatatgctggagatgaggtaacagctatctataggtacttccgtagcttagctgtggataatcctttttctgcagcgagggaaaacttgattctcgcatttgacaaggtattatgctaccttcatgatactactttagtatgatccttgttttccagtattgtgattgggtgttgaagctatttttccttggtgaaccttgaaatgatactgcatgattttatctagctaggagatagtcgatcttgttggattccgttgttcaacagtttgtacacagaaaattcgtatctttactggtgtttagcctattattatccacttgtggaattcttatttagactagaaaaaatgcccgtgtgttgcaacgggtgaaggctattttagtcttatttttattgttatacggtttatcttgggtgaaaatcattgtgggaattcgcttgtatatatatatttttagaaaatcatgagttgtaattaggagtctgactctcgtctcaagttagcatgcgagtttttttaaaatgatttcttatacgactccttttgtatttccaaaagcgtcccaagttagcatgcgagattttttaaagagatttcttataagatgtcttttgtatccaaaagcgaacgaacttaaaaaccgactcaaacacagatctgtatttctaaaagtgaacgaacttaaaaaccgactcaaatacgaatgacctaccaaaatactgataaaaacatcttcaatttttataatcttatttagattccataagataagaaatgttctgcagtttaccaactgggtcaataaaaacgttcttacttatattattattgtacagctgttctttcattgattgcagcgtgtctttcatacttcctccctagaaaactatagagtgtactccctccgtggggtggaggaagtataatattttgaaaaggtcacttttttttttattttgaccaacggttgtcaaattataagtatatttagtgcatagaagttataccaatagattcatccttctaagagcttttataaaacattattagttttataagtattgtaaatatattttataataaaacacatcatataattttctcaaaagacttcttcaaataatatacaccctataattttttgagggagttctttatagtatctgatgcacataacacaagaatggagaaatgcaccgtttagccttgcagtagatttggaccagtgtgtacaagtgcctagggggtttctcctgtcagcttcttattatatttgatgagcaaattcagaatccgaattttgctgtgcggtggatctcaaacgcttatagtttcatatgcagaatcatgatatctatgctcagctatcaggtaatagcaaggttcccaacgctaagagcttgccatccagatcagttggtagggccagaggaaggggtgagacaagatttcagcccaaaggttctagtacagaagaaaattcaaaggagcgagagcacagtattcaagaaatactgaaggctttctatattcgatttgttcgcctcaatggaattcttttcacaaggacaaggtacttcgtaaaacacttctgtgactcatcttattctctctttctttgtctcctaaaatgtcttgcttttttcctctaatagcttggaaacatttggggagttgtctgctacagttatcagcgatttgcaaattcttctttcatctggtccttacgaggagcttaattttggtgttgaggctgctgaaaacgcgctttctgttgttaagcttattgctatccttatattcacagtgcacaatgcaaacaaagacgcagataatcaatcatatgctgaaattgtgcaacgcagagttcttcttcaaaatgcatttgctgcagcctttgaatttgttggataccttctcaaaagatgcgcagagcttcatgatgttgcatcaagtatctacttgccagctattttggtcttcattgaatggctggcgtgccatccagattttgtggctagttctgagatggatgaaaagcaagccgatgcaagatctttcttctggagtcaatgcgtgccatttatgaataagctcattttgactggtctcgcacatgtcgatggtgataatgatgaaacttgcttttttgacatgggcacatatgaggagggtgaaactgggaacaggcttgcgttgtgggaggatgttgagttaagagggttttcgcctttggtacctgctcaaggtatcttggacttctccaccaagcaaggttttggaagtgatggaggtaccaaggagaaaaaagcacgtgtagaaaggattcttgctgcagggaaggcgctgttaaatttcgttcaaattgatcagctgcgaatatattttgatgcatcctcaaaaaagttccttatggcttcagaacctcctcctcctgcttcttctgttcctcttgttgtatcttccaatgcgcagacaacaaatcacatacaacaggaacctgaagtctccagtaaaattggttctgtcgcagaagatctaggtgtgcttcagtcaaaggcacaactctttcttgatggagatgatgatgaagaaatagttttcaagcctccagtttctgaaaagcttccgagagttacttcagaacagactagtaatgagttattacagccagtggtggtgtctgatgtcaattggtcaaatgatggtgcaccaccaccaatgacatttcagagcaatggaccggttctgactcccaatgtttatgttcaatctctcccaatctcttctcttggttgggcagccaatgctgggcaacatgtgattcttgatgttggtgcaaggtcaacatctgatatttttgagtctctgaaagcacctgatcataactgggtaagcactggtgcaccacttgttggctcactggatacagtccctatggcgagcttttccaatataatttcggatcagcgtacacctccatcgtcactcggttgtttcagtaacccagataatacagccatactccctgggcaagattcattcttattgagtgcattaaacaatgttaacataggtgcaagtggatttctggatcaaagagtgaatggtggactcagtggattacagtctgtgggaaatgtgcctcaggtatctgctcaagctactatgaatagtacaaatccaatgattggtcagtataaacatactgaagttaccatcccttctgccttctattcagttctgccgtcagtagtatcttctgatggtgtatcaaagaaaaatcctgtcagccgtcctggaagacatgttggccctcctccaggatttaacaatgcccctccaaagcgacaggatgattccattttagctggcaatggccagcatgttcagaccaatgacggcatctggttggatggctacaggtcatcactggattatgtcaataatcagcgttttgcacattcaaatgttaccactgccagcagtactttcaccactccctttccttttcctggaaaacaagctttcagcatgcatcctagaggtagcgatgaaaaacagtggcaggatttccacctttttgggcccacaaagcaacttccagaacttaattttcagcaagggaaccagcaaaatggtccactggcggaacaattaccagcacaatctgcatggtctggcaattaccttgtgtgactagcttgtaccatgaaggttaattttttttcttgggtgcctcaattttgatagagtttttggatgcagaactcacctccttttgttgtacaaatacactgaaattctctggttcaaatgtattatattctcttttggtttcaggatttgctgagaatctgttgggagtaagtggcgaagattgacacttgaattcggccttgataagtacagccctgtcatgtaatgtttcttttggaagatgcttgtcttggaagcataacaagtgctacccttggaactggtaagttttgaatgcacttaattgtggtactccatttcattttgtaatgcttctattccttgttttgtcctcatttatcagtctctctcttacactaatatctcacctaatacacctcactaacaccatcatctctcctattaccaagaaatttaagtatagtatgggtagcatggtcattttactcctttttcgctttgtttcatactcttatgaatgagaagacgcataaactttatctagccctacctttgccccattagactgtttatctaagattatgtgtttcttgataaatgaataattgaattacatctccttgattcaatcatttatttccttgctaatattaggagttcatttgtaatcccctggagacgattgtctctgtcacaattctttaattgatttataccagctaaattaatagtgcagtttaattactttttagttttgatattttgttttttcctattaatttctgcctcatgatacgctagaatctgaagttattatcaaattttaacttgaaaatttgtctaatcttttaattgaacgtcagtccccaaataattcaactaccaaccacgtgctcagatgatgtaattatccagagaagattcttcaactaataaccaaacgtatcatctaaacaactaatgtatgctaaacaatcagattatgtcaattacagatgtttacctgttgacttactgatttacagggtatggcaggtcttccaggctatgaaggggattttagatgatcccttccattgtctgatgagaatatgtacggagagttctttaacttctcagacccagggttttgacctaatgagtaatctgcaattctgcatacgggcagttactgagatgcgtcaggtaagtccgtggattggttgctgccgtggaaactgaagccttcacgaacgaatggatgaaattctgtttttggtggtactcttgtcgatcagagctatgaataaagttggtgatgactgcttcatgcttgtggatgttctttccagctatattgttcatgtggtacattgttactgcaaagtcattaaatacacttaaggataaatcattatgcagttgctatcatatgatgtgctatggtagcaacgtttcgtgttggtatttgtgtgtgaaccaaatgtattatcagcttgatgagctgatctttt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
