Os08g0338200
| Gene Name |
Os08g0338200 |
|---|---|
| Description |
BSD domain containing protein |
| Version |
NM_001068118.1 GI:115475973 GeneID:4345313 |
| Length |
8733 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0338200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:15291211..15299943 |
| Sequence Coding Region |
15291511..15291591,15291936..15292004,15292274..15292321,15293151..15293228,15293337..15293450 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:15291211..15299943 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:15291211..15299943 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggggtccatgacgatcggcgccaagtacaagaccacgctcaaggaccccggcaccaccggcgtcctgcgcatgaacgaggataagttcaccttcactccccatgatccacggtcagcgatgaagctcaatgttgatttccggagcatcaaaggccacaagttcaacaaagtagatggtagcaaaccagctccaccattactgaatctttcaaaagactctgacaagggtggaggctacatgtttgagtttgacaatgttactaaccgcgacctatctcgtgactttgtagctaaagttttaggtaagcaacaaggtacgataccgcctaaaccaaatgtgccccctgaaaattcagttacttcaactggtgaagaacagcttagtgctgcagaaatgcaacgtcggatgaaattgctgcaagaagatagtgaattgcagaagttacatatgaagtttgttcttggcaatattctgcaagaatctgaattttgggcaacaagaaagaatttacttgaggacgaagcaaataaaggatcaaaacaaaggccaggtttcaaaagtgccatgctagctgatgttaggccatcggctgatggtcggacaaataaggttacttttagtctcactaccgagataattcatcagatatttgcagaaaagccagctgtgcatcgagcgtttttagattttgttccaaaaaagatgtcagaaaaagatttttggacaaaatattttagagctgagtatcttcttaggacaaaaaatactgtggcagcaactgctgaggctgctgaagatgaagagttagccatttttctgaagaatgacgatatactagcaaaggaggcaaggttgaagataaaacgagtcgatccaacattagatatggaggcagatgctggagatgactacatccatcttccggaccatggcattattcgtgatggcagtaaagagacgattgataatgatggtgaattggccaggagaacactttcgcaggatctgaatcgccatgctgctgttgtgcttgaaggaagatcttcagacgtggaattaactgatacgaagactgttgctgaagcaattgcaaggtccaagaaagaaccaccttcaagttctatttctgatgataccaatcatgagaggttggtaaaagtggcccgcatgactgagatagaggatctacaagctccacggagcctcccatacgcaccactttgtataaaggatcctcgagaatattttgattcccaacaagcaaatgctctgagatctttaggtggcaacaatgatggaagacatgctcgtaattgcaggctgagtacagatgatgcatttgatcatttgttgggccaaatatcttctataaaagttaatgggttgaactatccggttattcagtctgatgtggctcttaaggttctgaatgaattgaatgaaggaatttcacgttcaagaagacttaatcttaagaatcctcaagatagtctgcttggtcaaatccctcgacgcacacgagatgaacttatggatcactgggcagctatccaggaattattgcagcatttttggtcatcatatccaataacaacttcagttctttataataaggttcaaagaattaaggatgcaatgacccagatatatcaaaagttgcaggatataaaggaatcagcacaacctgatgtgagacacgaaatatctcaactagtaaagcccatgacccaggctttggatgctgccttcaaccatgacttggagcagcagcaaaaatcatcgaaatccgggaataagcccaatgggttttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSMTIGAKYKTTLKDPGTTGVLRMNEDKFTFTPHDPRSAMKLN VDFRSIKGHKFNKVDGSKPAPPLLNLSKDSDKGGGYMFEFDNVTNRDLSRDFVAKVLG KQQGTIPPKPNVPPENSVTSTGEEQLSAAEMQRRMKLLQEDSELQKLHMKFVLGNILQ ESEFWATRKNLLEDEANKGSKQRPGFKSAMLADVRPSADGRTNKVTFSLTTEIIHQIF AEKPAVHRAFLDFVPKKMSEKDFWTKYFRAEYLLRTKNTVAATAEAAEDEELAIFLKN DDILAKEARLKIKRVDPTLDMEADAGDDYIHLPDHGIIRDGSKETIDNDGELARRTLS QDLNRHAAVVLEGRSSDVELTDTKTVAEAIARSKKEPPSSSISDDTNHERLVKVARMT EIEDLQAPRSLPYAPLCIKDPREYFDSQQANALRSLGGNNDGRHARNCRLSTDDAFDH LLGQISSIKVNGLNYPVIQSDVALKVLNELNEGISRSRRLNLKNPQDSLLGQIPRRTR DELMDHWAAIQELLQHFWSSYPITTSVLYNKVQRIKDAMTQIYQKLQDIKESAQPDVR HEISQLVKPMTQALDAAFNHDLEQQQKSSKSGNKPNGF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8353..8433#7940..8008#7623..7670#6716..6793#6494..6607#5270..5461#5054..5178#4918..4974#4365..4488#4154..4219#3886..4041#3661..3717#2990..3034#2761..2856#2590..2665#1681..1819#1351..1414#1170..1243#774..852#150..224#gagtcgacggccggccaccgacttgggggaaaccaagccaccgccgccgcagccgccgtaccccaccctccctcccggcggccgcgggccatagccgcgttctcccccgcgcgtctgcctgcggcgtggaggcgtggggggcgacggcgatggggtccatgacgatcggcgccaagtacaagaccacgctcaaggaccccggcaccaccggcgtcctgcgcatggtgcgtcgcgatcccccctctgttcctccctccctctctctctcccgcatagcgtcgcctctctccctccagctccgattggtcgggtttaacccttgcggccgtgccctactggatacacactccgcgggaggtgcggtgggtgtgctgattctgtggagggatgtcgcttgacgggagggttttgatcgggtgttggtcgcggtagtgtttgattgggtatgctagggcttctgatgctttcggaggggtttgtggtggaaaggaatcgaaccgatctgcggtagtcggatgtataagagggatgagcttctggagacattggtttagctagcttggtggttagttatttatgttgggttcatgtagtggagcgttttgtgcctagtttctgtggatcagatgcaatgagttgcatatctgtttgattcgctgatgagttttgcgtagttgcgttgtaaattttgcttgagtatttctacctgcttaatttcatgcacagcttgctgggtctaaatggcatctatcgtttgatacttttaattgtagaacgaggataagttcaccttcactccccatgatccacggtcagcgatgaagctcaatgttgatttccggagcatcaaaggtaatttcatttggtctatttatagttgggtacagtgggagtactatgaccgtcccagtggtttagtaaataacaaactgaccaattcgtgattgccatttgtcagaccaggctccatatttcttatatctgattccttttgtggataatttgaaatatgttttctgcaaaggcattaattaacgggaaatcaagataatatatagctattctaaggtagaccatgcatagtaaaacagatggattgatttgatgcttgtgaccaacttgtctgatgtcaactttgtactttctgtgcacatgcacttctgattcaggccacaagttcaacaaagtagatggtagcaaaccagctccaccattactgaatctttcaaaagactctgacaaggtataggcaattctaccttaaactttatcttgttgaatttctattcatgatctacatttgtttctgtcattgagaaaaattgaaatttctatgtgttttttctttagggtggaggctacatgtttgagtttgacaatgttactaaccgcgacctatctcgtgactttgtaggtaaagtgaatggaacctaaaatagcttcttttatttcagtttgatgtcaaatgtaggttatgaaagttagaaataacagtattttgttatttgcctgagtattgattattgtgtaagcatcaagtgggaaattgtccacttagtgtaaaccaatccaccagctgagtcctttttaccgattgacttgaagattctgaatttgagtccaacagtacatttataccctgacacagcatacaaataaccaatggctttctcttttcagctaaagttttaggtaagcaacaaggtacgataccgcctaaaccaaatgtgccccctgaaaattcagttacttcaactggtgaagaacagcttagtgctgcagaaatgcaacgtcggatgaaattgctgcaagaagataggtaatgtgattatgtggaacatcactattgtattttttagttacagcaacatgatgtagttatgataatccagtgcaaggccagtggttacttgttttttgcaaaaatatgatctcagatgaaacttcccttaaaactcttatgcgtctataatgtaaaaaaatttgccaacactataatggacaattcaaaatgtaagctatccactgaaaatctcaaattgtatgcggaacacagacagtaatatccaggcttaggaatataaccttggcaacagccttgagcgggaataactaaacaagtatttggtttattcagattttgttaggttaaggcagcattagatttttcatgtcttaactgcatctattggtctgtttcatgagctttgctgcaattaaacggtagatacctgccagattggcaaaacgaaataatagagataatatatgccttctatccagtttattttatattgaattatagttggcttgaaatctgtggcattggaatagcattgtgcatccatttccatttaatggcttttgcttgtcatctgatgttagtgtgatataaatatatatatttttgatttcttctttttgagaacatggttatgcagctatattgattaagttttactatatggatgaaattgtagttctcatatatcttacaagagaaagtgatgcaaaattatgcaaactgtcgcacccacaaaaatttacatggtgtattacaatcttgagcttttttttgggtcttcacagtgaattgcagaagttacatatgaagtttgttcttggcaatattctgcaagaatctgaattttgggcaacaagaaaggtaaaattcactcactcaagcaaaatatgtttcttcctgatatgcttgtttaatttattctcatgaaactatcatgtctttatgaacttttacagaatttacttgaggacgaagcaaataaaggatcaaaacaaaggccaggtttcaaaagtgccatgctagctgatgttaggccatcggctgatggtcgggtacgttatttattttgtgtaaattatggtttattatgttctagtctgttgtatcttatcttgccagacattcactttggtgatagctggtgatattgatgttatttctttctttttcctactcctctcacagacaaataaggttacttttagtctcactaccgagataattcatcaggtacgttcatttgactttgatgattctttaggacaggccatcttagtattgttttactgtttcctcaactgttgtaggtgcagttctatgctataagaaataagttatatctacagatctactttgtgggatggaatttcagaattactagaatctttctcattgcacaatagactctacacctatttggcagggctccaactcctgtattcttgcatatattgattcaagctaaaacaaagtggttcaagcttcttagcttttatatctaaacaggcttgcaatttgctgtatttttagtccccatatagaatggtttgatccctacttaagccattttttattcatgaaactatatgattttgttgtctggagtatacatccagcatgtcagctagatcaggccaaagggcttgtacggttgtaccacttgaaagcattcttgcatccatgcctaggcttacaagtctgtaatgctcctaaatcagggctttgtctaggtcattgggcttggctatgtttgctcaatataatacttgcttatgtttggcatgcattatataatgggtatgacttcaaattgttgaacaattcaaatgttctgaatataccttaatgttctgcagatatttgcagaaaagccagctgtgcatcgagcgtttttagattttgttccaaaaaaggcaagatcttacccatttgtattataccttcattctttgtttcgcatgtactttagaaatttcggtatgatggtgttgagtttatactatttctgtattgatgtaaatggattttttttttgcgtccttttcccttgatcctccatgcaatcatctccctcaaaacagatgtcagaaaaagatttttggacaaaatattttagagctgagtatcttcttaggacaaaaaatactgtggcagcaactgctgaggctgctgaagatgaagagttagccatttttctgaagaatgacgatatactagcaaaggaggcaaggttgaaggtacagttttcgatgtcttgaaatactgcttatattattccaattcatttgtgctattgcttgggagttggatttcttcattcctcttaagcggttctgttcttccctgcagataaaacgagtcgatccaacattagatatggaggcagatgctggagatgactacatccatcttccggtgcgtctgtattctctacttctgttgcatatgcaacttgatgaagacgaaagtgatatatctttattgagcaaggatatctgttctttttatcgaaatcatgagttgcttatcctgttttgataatattttgttgggcatgtaggaccatggcattattcgtgatggcagtaaagagacgattgataatgatggtgaattggccaggagaacactttcgcaggatctgaatcgccatgctgctgttgtgcttgaaggaagatcttcaggtaaaagttttggatctgtcagaaatatttcatcctttctacgatcatttgatactaaataattgtgcaaatattttcatctgttataagagaactgccctcaggtatttgagggtgcttttatttgtttgcaactgaatagacatttttttcgtgctaccctgttgattgaagtcttctgactattctttggaactgagtcttaaagaattaatttcctgataataattatataaacaactaccctaagctactagccacttgtaatttcactgtgctgttcctgtactttctccacagtggagttcatacgttgatgctatgctgcattttcttgctctgcatatgcctgttaacttttgcatctttaacatatatgcgcagtccagtatgtgactaaattggatgggtgcctgtgtgtttttgcagacgtggaattaactgatacgaagactgttgctgaagcaattgcaaggtccaagaaaggttacaaattatgtttcaacgtgttttttttggtagtaacacttctgtatttatgctgatgaaatattattagctgcagaaccaccttcaagttctatttctgatgataccaatcatgagaggttggtaaaagtggcccgcatgactgagatagaggatctacaagctccacggagcctcccatacgcaccactttgtataaaggtaaaaaatatttcatggcttcatcgtagatcgatgaatcggaataatatattttaacttgtagattatcatctcttatttgtcttattaggatcctcgagaatattttgattcccaacaagcaaatgctctgagatctttaggtggcaacaatgatggaagacatgctcgtaattgcaggctgagtacagatgatgcatttgatcatttgttgggccaaatatcttctataaaagttaatgggttgaactatccggttattcagtctgatgtggctcttaaggtaaatgattttacacagtacactaatatggatatttaattatgttaagccatctttgtggagtaggccatatctccctgaaataggcaacctccttaagctggtacattattgctaatagtctactacctccagtgaaaaaagtgatgtttcaggatgcagtcaaacatcatactttgcatattgggcatttttttactatgcattttataagtattgtacaataatttgattgttctaaaatttataattcattggtcaaagtcatgttttgtaaactaccaatgtcatgggtagtggccgagaggttgaggccctagtgtccctagggaacggttcccttgtcttacggtagctcacttggatagtctagactggatccttccctccatctatataaggatggattgtatcgttattctaattaagcaatgaatcagaattagtctcccccaaccctaagtccctctctcatccctttcagccgtcgccgcctagctatcctcccagtggtatttaccctctatgccctaacccataacaaccaatgtcccaaaagcacttttgtggcttaggaaattattgctaaacataattgttggatactaagatcaaggggaaatatagaacaagggtttagaaactagtttgaatagcacaaacttttgaaataactgtcttgttagttttcttacatgtactagaccagaagttgatgatgaaagctgcatttgaggaccatgttgatatccaaattacttgtgactggagggtaattcttgaaacttgtttggattttgggtgatgtagcatttcagattgtacaaacattttaagaaatttactatgttgaccaacaaagttttagttaactgtgcagtatgtagctatgagaaagcctctgcacatctgatttttccatccacacatgttctgcatgacgttgcactactgttactgtggcttctctattcttaagctattaaattgcatgagcaggaaaacctaactacctgcatggtatgggcttaggttctgaatgaattgaatgaaggaatttcacgttcaagaagacttaatcttaagaatcctcaagatagtctgcttggtcaaatccctcgacgcacacgagatgaacttatggatgtgagatgctgacttcattttctgtactgaatattttctgcatttatttgttttatgttttttagttcctgtattacagaattacttattgtaaactctgtttcttagcactgggcagctatccaggaattattgcagcatttttggtcatcatatccaataacaacttcagttctttataataaggtatattatcagtcccagacttttctgcaccattacgtaatttatgtgtagcatttggatggtaatcagtatcagtagattactgggtcacaataaatttggttcctatagtgattttgtcaatgtagttttcctttcctagagtgaaaggaaaattttgcccattaattatgagcggtaagttaactaaatattaagtctggcactcagaagaaaaaaagggttcccaaagtgaacagtttcaattgtggattcaggtggtagcagcatggttatctgttcactgttgcgaatttatttgtaaaagtaaatgcaacatcatgagaaattcatcatagcctagtttttatgtttgttttggctgtacaacagctctttttgttttttctgcatattgcactgaattctgtaagaaaaaaaatattactgaaagcagactaagtaattttatacttcattcatctgaaaatataaggcttattttgagttgatacatgaaatcaagtagggtatgaaactgaggaagagaagataaaatgactactctattgctacttaaatgaaatatctttgaaacaggatagggaatgttaatgagatgttctgagaaatgtaggagaatatgtaaaggcaaataaggaaaaccaccaataacttccaatgcatgccttatattttgcaacaaattttgaaaaattctgccttataaaaagaaacaaaaggggaatgcagtcatgtgggtggaatagctgtacaaccaagactaagccttgaactatatttgcaagattaagaattcagtgtttatgtttttgtacttctgtggcaggttcaaagaattaaggatgcaatgacccagatatatcaaaagttgcaggtaatctccatcacaattgcctctttatcttcttcgagttcatcatgtggagtaccttagtttttaccttttgagcatgagttactgataagatgatagctagctggaattgctcttccttaaactatagtttccctcaaacatgttacagaaatgggtttgtattgaaattgacttcaaactttcttatgatgttatggaactgtaccttgttttggtgatgaaattctcactggacccctattcatatgcataacttccacctgcaggatataaaggaatcagcacaacctgatgtgagacacgaaatatctcaactagtaaagcccatgacccaggttcttatctatatccttttttgtcccatttccaattttccatatgcaaaatagatttatttcagcttcattatgacgactcaatcatgctactgtactgcatgagtttccacattcttttcgagctaccctttgtttagcatttctttatgctcattgtgttgcagcttatctgtattagcattgcttgacagttgatattttaactactactacctattaactgttcagcggtgctcacttgctgtctttgtacacgtatcagcatgtcttctttcatttgcatattgatgatcttcttcaactgctgaaatgccatcaatctggttatatttactttccaggctttggatgctgccttcaaccatgacttggagcagcagcaaaaatcatcgaaatccgggaataagcccaatgggttttaactttagccgagaagactagcttcggcgacggattagggattgatttactgctagagcaagagggctacttgcagttctggaggggttacctccttgagccttgattctcatgtatatttacctgagctttatagtggtgggcataacgtgcttactaaacgccccaatttttcagtgcctgattcattccaggcatactctgggatggtttgtgttcatcacagttccaggtagaaccaaaattttgtgtacactttggaaagaaggaaaaaaaatgagcacgcgttgatgctgcgttcc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |