Os08g0373400

From RiceWiki
Revision as of 12:58, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os08g0373400| Description = Disease resistance protein family protein| Version = NM_001068197.1 GI:115476131 GeneID:4345409| Length = 8585 bp| ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os08g0373400

Description

Disease resistance protein family protein

Version

NM_001068197.1 GI:115476131 GeneID:4345409

Length

8585 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0373400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:17558313..17566897

Sequence Coding Region

17558313..17560383,17566068..17566897

Expression

GEO Profiles:Os08g0373400

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008401:17558313..17566897 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008401:17558313..17566897 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggaggctcaaggtgccatggactccctcctaaagaaactcaccaatctgcttgttgaggagtgtgctcgactgaaaggagtccgccgtgaaatccgcttcctccggtcagagctgaacaacatgcacgcccttctccaaaagtgtgctgcaatggagaaccctgacatccaagtgaagacctggacaaaggagttgagggagctctcacacgacatcgaagactgcgtggacgagtatgtccacggagttgacaccaatgaccaccacggtcacggaggcatcaaggagttctttcgccgatgtgctcggcgtttgaagacactgtgcactaggcaccgcattgcaaagcagatccaagaactgaaggcccgtgttgtcgaggtcaaagaccagagggagagatacaagctcgatgatgttgctggcagcagttacaccagcttgacaatagatcctcgcatgggtgctcttttcactgaggaggctcaccttgtgggcatcgatggcccaagggatgacctagtgagctggctgatggagggtgaagctgagcatttgaatcatcggaaggtgctgtccatctatggctttggtggtttgggcaagaccacgctagccaatgaggtccgtcgtaagattggaccgcaattcggttgtgcggctcttgtatctgtttcccaaaagcctgattttaagaaaattctctggggcatactctctcgtataactccgaaaggcactaatcttgtcagagatctgagagagacctgggatgagagtgagacaatgcttattgaaaagataagagaaatcctacaggataagaggtacttcatcataattgatgacatatggtctgcttcagcatgggatgtactgaaatgtgctcttccagagaacaaaaatggtagcagagtaattactacaacacgtattgagtctgtcgcaaaggcgtgttgttctctgcccagtgaccgctgttacaaaattgagcctcttagtgagctccactcaagaatgctacttttcaaaagagtttttggccatgtggatggttgccctgtgcaaattacacatgtttcagatgatatattgagaaaatgcactggccttcccctggcgatagttagtatagcaagcttattggctagcaggtccaatacaaaggagcaatgggaaaaggtgagtacatcgacaggatctgtattacaagaaaatcatgatcttgagggcatgaaaactatattgtctctgagttataatgatcttccccactatctcaaaccttgtttactctatttgagcatatttcctgaggattatgacattgaaagaggtagtttagtgaggagatggatagcagaaggattggtcagtgaagattatgggcaaaatgtggaggatgttgctgaaagctacttcaatgagctcattaataggagtatgattctgccagtggacattgactacgatggaagggtgcgagtttgtcgcgtacatgacatgatgctagaacttatgaaatcaaaggcaagagaagagaattttcttacaatcataggtccgagcccgatctcaacaaaaccaaaaggtgttgttcgccggctctcaattcaatataatgatggagatcagaagttggcaccccaagaagtaacatcgttaaaccatgttagatcattcagcacctttggtgactgtctcaatcagacactgccatttgcttatttcagagttttacgagtcctgagtctcgattgtgagttgaatgaggatgtcgatttgaagattatttgcaaactacatcagctgaaatatttgagactaaatgcctttaagcttcctgcagaaatcggggagctgcagtgtcttgagacactagaatggtgcagtttctcatggaatagtttgctgccggatgggatttctcagctacaacatcttagacatctccttgtggacaatgaggggatgttaccgaaagacattgggagcatgcaagcacttcggacactgtcacaattcaacatctgtgacagcccagtaaatgcagtgcaggaacttggaaatttgaggaacttgagagagctctcgatatcttgggatgaggacgagccaagtgatgcaagatacaaggagtacttgtcctcttctctcagcaaattgagcagctgtagcctcaaatcactaagtattctgagtgccagacctattcctgttgattttctagcatctttgtcacccccgccatgcctccttcaaaggttctggatgtggaactcctactttcagcggtgccccaagtggattgcaccgctcgataggctcactgagttgaaacttgatgtgtgggagctggaggatgaagatttggatttgcttgctcatctgccggtgctgcttcagttccatctttgggtggtacctcttcgtaaagagaaaattgtcattaaggaaacaggtttccgtagtcttgtcttattcctcctgtggtccgggttgccatgcttaagtttccaagagaagtccatgccaaagcttgaaaccctcaagttgatgtacagtgcttgcggggcagaattatatggaagcacgcattctggcattcagcacctcaagagtcttaaaaatgtccatgttgagatgtatacagctggtgccatacaatcaaacattgaagctgcgcatcgcaacatcaatcacgaaattgctaagcacccgagtaatctcaagaccaatattactattagtagttatatatactttggggaggtaatgaatgatggcaatgttgatgaggaggatagtgcacatctcactgacaacaatggtggcaagaatcaggatgaggacaacaaagtcatcagtgcactaggatgtgatggctgtgcttactga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEAQGAMDSLLKKLTNLLVEECARLKGVRREIRFLRSELNNMHA LLQKCAAMENPDIQVKTWTKELRELSHDIEDCVDEYVHGVDTNDHHGHGGIKEFFRRC ARRLKTLCTRHRIAKQIQELKARVVEVKDQRERYKLDDVAGSSYTSLTIDPRMGALFT EEAHLVGIDGPRDDLVSWLMEGEAEHLNHRKVLSIYGFGGLGKTTLANEVRRKIGPQF GCAALVSVSQKPDFKKILWGILSRITPKGTNLVRDLRETWDESETMLIEKIREILQDK RYFIIIDDIWSASAWDVLKCALPENKNGSRVITTTRIESVAKACCSLPSDRCYKIEPL SELHSRMLLFKRVFGHVDGCPVQITHVSDDILRKCTGLPLAIVSIASLLASRSNTKEQ WEKVSTSTGSVLQENHDLEGMKTILSLSYNDLPHYLKPCLLYLSIFPEDYDIERGSLV RRWIAEGLVSEDYGQNVEDVAESYFNELINRSMILPVDIDYDGRVRVCRVHDMMLELM KSKAREENFLTIIGPSPISTKPKGVVRRLSIQYNDGDQKLAPQEVTSLNHVRSFSTFG DCLNQTLPFAYFRVLRVLSLDCELNEDVDLKIICKLHQLKYLRLNAFKLPAEIGELQC LETLEWCSFSWNSLLPDGISQLQHLRHLLVDNEGMLPKDIGSMQALRTLSQFNICDSP VNAVQELGNLRNLRELSISWDEDEPSDARYKEYLSSSLSKLSSCSLKSLSILSARPIP VDFLASLSPPPCLLQRFWMWNSYFQRCPKWIAPLDRLTELKLDVWELEDEDLDLLAHL PVLLQFHLWVVPLRKEKIVIKETGFRSLVLFLLWSGLPCLSFQEKSMPKLETLKLMYS ACGAELYGSTHSGIQHLKSLKNVHVEMYTAGAIQSNIEAAHRNINHEIAKHPSNLKTN ITISSYIYFGEVMNDGNVDEEDSAHLTDNNGGKNQDEDNKVISALGCDGCAY</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6515..8585#1..830#atggaggctcaaggtgccatggactccctcctaaagaaactcaccaatctgcttgttgaggagtgtgctcgactgaaaggagtccgccgtgaaatccgcttcctccggtcagagctgaacaacatgcacgcccttctccaaaagtgtgctgcaatggagaaccctgacatccaagtgaagacctggacaaaggagttgagggagctctcacacgacatcgaagactgcgtggacgagtatgtccacggagttgacaccaatgaccaccacggtcacggaggcatcaaggagttctttcgccgatgtgctcggcgtttgaagacactgtgcactaggcaccgcattgcaaagcagatccaagaactgaaggcccgtgttgtcgaggtcaaagaccagagggagagatacaagctcgatgatgttgctggcagcagttacaccagcttgacaatagatcctcgcatgggtgctcttttcactgaggaggctcaccttgtgggcatcgatggcccaagggatgacctagtgagctggctgatggagggtgaagctgagcatttgaatcatcggaaggtgctgtccatctatggctttggtggtttgggcaagaccacgctagccaatgaggtccgtcgtaagattggaccgcaattcggttgtgcggctcttgtatctgtttcccaaaagcctgattttaagaaaattctctggggcatactctctcgtataactccgaaaggcactaatcttgtcagagatctgagagagacctgggatgagagtgagacaatgcttattgaaaagataagagaaatcctacaggataagaggtaattatcttatttctcgctcattgttaaacattttaggtctattgtttctccatatcaatcttagcgcgacaatattattacgcttgtacgcaattaaggtgcagtttgcgcgcggcttctgcacagcaggacatatctgactaactagtttcatattaaatacttttcaaaaagatatttacaatattctgttgcacgtcagatttgccatcttacaactactaattcgagagcttccacgttaatcctcatgagatgggcttgaaaaagagattaatcctgggaataattaccacaaaaatctggaaaaatctgactgtatatttggttgattctatctttattgacaactagaaaggtagtccgtgcatatgcgcgggtatcttatttaatattgctttaattttgagtacaaacatttatgtgtggatgatatctttcaaatactctttgactctattttaaacatgttttttataataattggtttatgcatattacttgaaaccgtacaaccttgaatttatgagaaaaaagtcacaataatgaagttggttcatatatatttgtactatgtgtgattctttttaggaatatttagcatatcttatttttggagtttacaaactttaagtaacattttattcttatccttgtatgctatagatgacgatggactttatgatatattagtgaatggtattttctattaaaattatatctaatagaactacttcatctaattaaagatagacttatattacttatacaccctgtgttgcataaatccaaagagtcaaattttgtcccaaaccaattggggaatttatatataatcaaaacaaagtgaatttttaaaatagtaccacgataatctccagagtattgtgttatcgtttatattttgacaaatgtctcctggtttttttcaacacctatgattcataatcacatgagacatatttactaatttaaagaatgcatttattttcccaaactatgattcgttgaagtatagttatagtcacgtcaatagagtgtatgacatattgacatacatccatcaattatcctgaaatattgaatcttatcaactataaaaaaatataccataagtagtttattggacatgttacttgattattcatttattgtcaaaactatttgccaaataaaaaaacatactatatggccataaatctcaaaaatggactaatgggttggattatagcaagattattggctagaaatatttttgattttttttcaaatgtatgtaacatttgtgctggtcacttctcaaataccaatcaaatagttcaaattttttttgagaatcttaattcaaataatttaaaattaaaataagatttacttgaaaaacacaactaaattgggttgtttatatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtagatttaaattagcgttgtatatttaccaaatgatatttgacgccctaaatatgatgtgaaattatttaaaattatcatagcattaattattatatgtcggcctcatgcattgtgatgtctttaggaccttaaacaacaatagtttatttaattaaaggaatacaacagtatcacaaattggatatatgattttaaaataatttaaaagatagaacattcatagagcattgattagatattatagatctatagtttaacatcgtatatttgtgtaaatttgtaaagtaatgtattttatctctaaattgtagaagattctatttctttccagctatggaaatcacttcaagagagactttgctttgcttgtgcacagagcaaaattgttagatcaacctttttggaaatcatggcttgatactcttatgtaatctcctcctgtacatatgtaatttgtaacttttatatagttctaatatatcagtagaagtctctcctgttgttttaactaaaaaagttgtagaaaatcctattctaaagacaaacgatttttttttcaatggtactatatacgtatctttttttgtatcgtaagtctgtgcatagtttttttttccttctcgtgaactgtaggtaatctttattgttttttcaattgtatgtaggaagtaattttttttcttttgccggccaacaattattactttttaataatacatctaatctattgatccaaaatatcgggtcaccaatttaagttaaaatcgatggtgagattagatagagctatgtgacggtctaagagtgtttgtaggagtgtcacgtggcggctcaagagtgcttgtcggaagttcaattaacttcttaatatatataatagaagatgtgtttggaaaaattgttcatttaatttggcatggctaattgttaaactaagcgcaaagtcgagaattccccagcatagtgctcctgaataccataatgacttgtttggttactaattatctgtgtatatatcaatattttcgtcacctctttttatgaagatgaaaactctataattcagcgcaaacatgcaccagtgcacttttttaaaaaaaaaaacatgtaccgctgaactcatatctttttcttcgcaagaagaaacgttgagtacgtaaatatgctatgcttggtttggttacggtacaaaccattgtatatatggaacttgattcattaaaacctaaattaacggcagaaatcacgtacgtatgtaaaatagtagtagcgtatgcatagaggaggaagttataattttttaataatagatctaatccaatgatgtaaattaatgggtccactaatttaagtgaaaatcaatggtgagattagacagtgccacatggcggacaaagagcatttgtaggactaccatgtggcggtttgagaacgttcgtggaaagtttaatggacttttaatatataaaatcagatacgtatgtaaaatagtaggagcgtatgcatagaggaggaagttataattttttaataattgatctaatctaatggtgtaaattaatgggtccactaatttaagtgaaaatcgatggtgagattagacagtgccacatgacagactaagagtatttttaggagtgccatgtggcgatttaagagcgtttgtagaaagtttaatggacttttagtatataatagatagatagatatcaaccattggatctaatttgcttctcaattactcacttctcctagtataaaaataaccctatagtaatcgactaatgatctatatctaaatagcccaccctctaccatttggaaagataacctaattgtaagaagtataatattttgaataagtgtaactttatagattttgagcaacaatcaattgaactgtaattatatttagtacaaaaaagtcataccaatgaatttatttttcaaacagttttcatccgaacatattttgtaagcaatcaatatcacagactttttccaaataaaatacaccttataatttcatatggagcagacaacagatctgaattcagtattgtgatatccataactcgagaacaacacatatgaatcatctcaaaataacccaaataacatcggataatcatatatatactaatagagtattcctaaatttcaaatggctgaaaatttgtgaaatttcggtacatcacctaaaaggtgcatttgcctaagattaaaattgcagcagtgtggaatatgcaattctacttcatttgtactgtaattatgttgttatatatggttctacattaatttattattatctgagtttgaatattttttacatttaattttgtaaatctttatgaattggaggtttatttcatgtagtttggtatttctttttaaatttttataggttaaaatagtttatctaataaagagaaatgagtgatgagaaccatcagattgtcatccaaggaaatagaaaagtgacagaagtcacctacgtacaatcctctcatattaatatacacacaagaggagatcttcccaaagtatttttcattaatatacacacaagaggagatcttcccaaagtatttttcctaacaaaaacatcgaataagaaaccatgacaactgttgtgaagatgacaataaactccattcacgtcctcaaaagagtgcagggaattgtcacactttgagaatgctctctaactttttacaaccatcagattttttttcgctgtacaagaacctagtgctcaacgttaatttttgaatcacgttgttgttgtgaacaattccattacctattgatgcatgttctaacattcttacctcagaaatactttgggaagataaggcagcatttatggttaaatgaattctatgaaatgtaattattgtagtctaatatggtatggactaatgtttccttaatatgatattagatttataataccaaataatataaaaatcatatgacattttgaactaattttcaatatttcttatactaacgttaggtttataacaaaagttcaattcacaagtttgaatcatatttaatttaggaaaaagttggttcgcgttttgcaattataattagtatgtgaaatggataattaattttaattcttcaaaatcatgtatatcttcatatagaatggaaattctaaaaactattcattacttcgattaattcaaattgaatatagaataccaatgttcaaaactatattcacttaaattagtttagtaaattgaaatatttcaaaatctggaaatattttattttttctcacatcagaaatatgtgactttgaaaaaactatttattttgttttatactttctaatgtattactttgcaccttctttgcattcttggttggaatttagaaagaataactatgggctttaatgctcctttatatgttattcattaggaggtttcggtgtctctgttctagactttgatatcatatgaattttggatagaagagaaatctggtgatttcaagcgttatcaaggcccttagggctgatatgtatcgatacaacagatgtgaaatgactaaaaaagcccctacaaactacacttaataatcttaacacgagagtcaaaaaaaaacataagaaaaaatattcatgaataccgtttgagatgctactagttagattaatcttatgattcaattcgacaagttggggaacctaaattacaaccttgtaaaacgaattagcaagtatactatcagtgcttgcaatgtcgatacctgaattttgaaaattttgtgaatttcggtgtcttctgactgattttctttttgaaattttaacatattttgacagaatttaaacaatttattgaccagattcataaatatttgaaaaaatccgaaaatttcgggggagatttgatcttgcttatagggtccaaaatttcggaaattcctgaaattttgaaccgaaatttcaaaccatgtatactatcaaatttatgaatctggcatgggcactttcattcatgttcatgtacttccccaactctatagtttcttttctaaatctttcagcgaaatgaattgatcatacaaaaactttaagtgatgatgttagtgccaattattattgctatattgtgttcacttaaaaaagcatgttttggttctcagtccaatttcttttcaaaaggaattcgttttgggacattttctgattcacatttttgaataggtacttcatcataattgatgacatatggtctgcttcagcatgggatgtactgaaatgtgctcttccagagaacaaaaatggtagcagagtaattactacaacacgtattgagtctgtcgcaaaggcgtgttgttctctgcccagtgaccgctgttacaaaattgagcctcttagtgagctccactcaagaatgctacttttcaaaagagtttttggccatgtggatggttgccctgtgcaaattacacatgtttcagatgatatattgagaaaatgcactggccttcccctggcgatagttagtatagcaagcttattggctagcaggtccaatacaaaggagcaatgggaaaaggtgagtacatcgacaggatctgtattacaagaaaatcatgatcttgagggcatgaaaactatattgtctctgagttataatgatcttccccactatctcaaaccttgtttactctatttgagcatatttcctgaggattatgacattgaaagaggtagtttagtgaggagatggatagcagaaggattggtcagtgaagattatgggcaaaatgtggaggatgttgctgaaagctacttcaatgagctcattaataggagtatgattctgccagtggacattgactacgatggaagggtgcgagtttgtcgcgtacatgacatgatgctagaacttatgaaatcaaaggcaagagaagagaattttcttacaatcataggtccgagcccgatctcaacaaaaccaaaaggtgttgttcgccggctctcaattcaatataatgatggagatcagaagttggcaccccaagaagtaacatcgttaaaccatgttagatcattcagcacctttggtgactgtctcaatcagacactgccatttgcttatttcagagttttacgagtcctgagtctcgattgtgagttgaatgaggatgtcgatttgaagattatttgcaaactacatcagctgaaatatttgagactaaatgcctttaagcttcctgcagaaatcggggagctgcagtgtcttgagacactagaatggtgcagtttctcatggaatagtttgctgccggatgggatttctcagctacaacatcttagacatctccttgtggacaatgaggggatgttaccgaaagacattgggagcatgcaagcacttcggacactgtcacaattcaacatctgtgacagcccagtaaatgcagtgcaggaacttggaaatttgaggaacttgagagagctctcgatatcttgggatgaggacgagccaagtgatgcaagatacaaggagtacttgtcctcttctctcagcaaattgagcagctgtagcctcaaatcactaagtattctgagtgccagacctattcctgttgattttctagcatctttgtcacccccgccatgcctccttcaaaggttctggatgtggaactcctactttcagcggtgccccaagtggattgcaccgctcgataggctcactgagttgaaacttgatgtgtgggagctggaggatgaagatttggatttgcttgctcatctgccggtgctgcttcagttccatctttgggtggtacctcttcgtaaagagaaaattgtcattaaggaaacaggtttccgtagtcttgtcttattcctcctgtggtccgggttgccatgcttaagtttccaagagaagtccatgccaaagcttgaaaccctcaagttgatgtacagtgcttgcggggcagaattatatggaagcacgcattctggcattcagcacctcaagagtcttaaaaatgtccatgttgagatgtatacagctggtgccatacaatcaaacattgaagctgcgcatcgcaacatcaatcacgaaattgctaagcacccgagtaatctcaagaccaatattactattagtagttatatatactttggggaggtaatgaatgatggcaatgttgatgaggaggatagtgcacatctcactgacaacaatggtggcaagaatcaggatgaggacaacaaagtcatcagtgcactaggatgtgatggctgtgcttactga</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0373400, RefSeq:Os08g0373400