Os08g0377300

From RiceWiki
Revision as of 12:58, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os08g0377300| Description = Hypothetical protein| Version = NM_001188622.1 GI:297726374 GeneID:9268556| Length = 4327 bp| Definition = Oryza sa...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os08g0377300

Description

Hypothetical protein

Version

NM_001188622.1 GI:297726374 GeneID:9268556

Length

4327 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0377300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:17808725..17813051

Sequence Coding Region

17808786..17808871,17810166..17810277,17810926..17811112,17812699..17812754

Expression

GEO Profiles:Os08g0377300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008401:17808725..17813051 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008401:17808725..17813051 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggacgagttagggattatcgacgaaggagtcgactggaggacccgccttggccaggatattcgcgatagggtaacacatgatatattggtaagcctgcagatgaaattgaaaacaactacttcaacaacattgattgatcttcaaaatgttgcttccagaatacaggagagaatctacaaaatagctattgactttagtgattatctatggaggactggtcttataaaaggcgatttggatgattcatatcctgtgctgttgaacaattttcttcatgttcgaaagcaagcttcaaccccttcagttgtcttgctccatgagaagaataagcatggcgaaattatccatgcacaaggaaatgttcaggggacatcatctagtggtgaattggtcgttcaaactcacgaccaatcagttgatggcattggtctaaattag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDELGIIDEGVDWRTRLGQDIRDRVTHDILVSLQMKLKTTTSTT LIDLQNVASRIQERIYKIAIDFSDYLWRTGLIKGDLDDSYPVLLNNFLHVRKQASTPS VVLLHEKNKHGEIIHAQGNVQGTSSSGELVVQTHDQSVDGIGLN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>62..147#1442..1553#2202..2388#3975..4030#tcttattgttcttcccctctctgggcacttcttctgcctaacaaaaccaaagaagcacaccatggacgagttagggattatcgacgaaggagtcgactggaggacccgccttggccaggatattcgcgatagggtaacacatgatatgtaagcactccccctcatctctctctctctctctcatgttcttactttttttcccatgagaaattgattatagagtcttcaattgatgatgatttatcaagattggaaaccatcatccatgctatacttgttaatgatctaattaattcatcataccggaagtcagatccaatctgacattttctagctccaagtaacagatagatctgtttggtagagctccaaattttacatggagctggagttgtggatctgaaaaaaggtagctccaccttttctacctctttttttggagcagatccacgcacttcacttttaaaaaaccgaggatctattagtgtttggttcggctctggctataatggacaaggatctagccctaccacaggcccagatcgcccaaaaagcattgttcttggcaaaattttgttggttggattcaaaccttttatattttgattgtactcaaatataaaaggtaaattgtttcatatttagaaaatgacccaagttaatgattcgtcgccaaaataaaatgaactaaggttgcatgtcgataattcaatactaaattttgtggccagctccttgcatgggtctaagcttaatggactagtgttttagtgctgcacatagtctatatattatgtctttcaaattttttgggctagcttattaaattaggtgttaaaactcttagggaagaggaagaacaggggaagaactggagaagtcatggtgttgattgtgcagttgtgtaactgagtccaccttacacaaccaaaaatatatgagatgatgcagctactccaaaaaatagggaagatctgttagtagataatacttgtaggtttaggttgtttttttttgttggatgtaggtggtaaaactcatgaagaagatggtcccatgttcacacattcttcttgttttgtttgtagtatttataattcctccgtgttattggttatcaatgatctcctccaaactattagcacgcatgatgacacaactttgctaaaagatgacacttctggttggacaaatgatatttcagtatttatgagaatgtatctgcgattccaaacatgttactttagcaaagatgcatttctcaaatagtgaatacatagcaggcatgtatttcttgcataaaggcatgctaccccaatccatcaattgcctggctgcttattgtttgttatattagaaccatattttggattatttcggttggaagtaccatagtgaaatatttagtatctcatattaatattcggcattctctttgcagattggtaagcctgcagatgaaattgaaaacaactacttcaacaacattgattgatcttcaaaatgttgcttccagaatacaggagagaatctacaaaatagctattgactttgtatgacggtttgttcttaatagttttttaagcaatataatttccttagatattaattttattttttatgtatcttaatgcacgtaatattgttaaccttaatagtagcaattttgttcatctgttgattattgcaaagtctcaaagctcctgaatgagtacaacttattgccaagaagtctataactacttagagctataacaattgtgtgatacagttaggatgaccatcttacttgagaacatatggttgcaatatgttctatgcaaattttgtcaatctaattaaaaaaaattaattactattccagtattgtagcgcggaagacactaggactgaggttgtatttaattaaagtgttcgtttatacacaattccaaatatttatgttcccctttcgattaacttctttttaatattgtggatagaatcatcactttctgatttattcgcttatacgtgtatcgctagataaattctttcatatattgattatgcacttattcttggcttgccagattgtggacatgccctcttaatttgctatctttgtatgctttctctggtattcataaagttatggttcaatataggatgttatgttttaataaaagttctcatatttttttctttctcgcactacttagagtgattatctatggaggactggtcttataaaaggcgatttggatgattcatatcctgtgctgttgaacaattttcttcatgttcgaaagcaagcttcaaccccttcagttgtcttgctccatgagaagaataagcatggcgaaattatccatgcacaaggaaatgttcaggggacatcatctagtggtatgttcttttttatggtgcctacatgatgtattttctccatagtctacacatgattctaatcttctggaatgctttacgcatgaaaaatatatgccaataaaatttgcaaatccacaacccgattcccctgtttgagttaaagcaattttcatatttgtgtcctttacacattggtaattttggtgcaaaaaccatgaatatttgttattctcatgcaacgcttgattgatgtgtgagcctcaacctccttactgttctaagaaaacactcaaagctacccaagggaaattctttatcatttgtgtaaagtgcatttaagatagcaatatctctgtgaagctagacttcagcacacataaaaattgtaaaattgttgcgagttgtttgtgtggttctcaaagatcatgtacttacactaagtaacagagtatccacttatacactgcaggccacaaggaaccctccaatccctatggaaaaggtaggatcagcgaactccctaacaatctaatccaccacataatgtccttcttatcgatgaaggaggcggtgcgaactagtgtcccgtcccactggtgggtcagcaagaggacttgcttgcagttgatcaagcttgatataaattggttttgcctagatagggaaatttttggtagttctattaacaaactattgcttagccgtgacaatcttgatgctcccatggatacattcaagagagattcttttgcgattgaccgtgctagttcttgggtcaatcatgctatcaagcacaacgctaaagtggttaaatttgccgagtatgaaagatgggaacctttctacttggatccaaaacttgtggagttcagttcttggtatcttaaaactcgagagctgactaatgctgctctaaatgaaacgatatttgatcctctcaacaacgcatgcccaactttagaaaatctggtagtaaaagagtgtttaatggaggtgcaacaaatttcttcaagttcactataaaatctggatctgattggttgctctcttctcaagaatgtatgcatctatactccgagtttggtctcattgtgcatcaagggtcaacaaacgggtagttcttcatttacaaaatgttacctaacattcgcaacaatcactctcattgatgcttcaaatgtcacaagcatagagttgacagctactaatagataggtatcactgatcctttcttgcagacattattttactctcataaccatcacacatttttgtgtgaccatacttatgcgaatgaatttgccatcttatctagaaattaatatagtgatttttttcatagcaaggaagcataaaacattcattttagattgtatgtgtataccactttgccttctcaaaaaatgtatataccacgttgccttctcaaaaattgtatatataccactttgccttctcaaaaaatgtatatacaactttgccttttcaaaaaatgtatataccacttttaaccatgacacatatgtgtgtagtcttgtatatccttgtgctatcatttctagaaacctgaattcctaataatattctgaacctttcaactttaggtgaattggtcgttcaaactcacgaccaatcagttgatggcattggtctaaattagccatggaggttccatcaatattgacttctattagaactgaaggctgaggggcttctgcaaatagtatgcaatgctgaatgaaactactaccaagtgttgcaagctgtgcctgctgtttggaaacgtttgagacccaaataagttttcttgtgttttaattggagtggatcaaattttgttgtgactatatgtgtccgtccagagtgtggatgttatttttgattgtggagtcctagttacttgtgttgtgtgtggttggccattatatggataaaccagtgaatcgttaagaacctc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0377300, RefSeq:Os08g0377300