Os08g0424500
| Gene Name |
Os08g0424500 |
|---|---|
| Description |
Similar to Betaine aldehyde dehydrogenase |
| Version |
NM_001068368.1 GI:115476473 GeneID:4345606 |
| Length |
6153 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0424500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:20467829..20473981 |
| Sequence Coding Region |
20467975..20468083,20468183..20468325,20469378..20469458,20469554..20469702,20470400..20470492 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:20467829..20473981 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:20467829..20473981 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccacggcgatcccgcagcggcagctcttcgtcgccggcgagtggcgcgcccccgcgctcggccgccgcctccccgtcgtcaaccccgccaccgagtcccccatcggcgagatcccggcgggcacggcggaggacgtggacgcggcggtggcggcggcgcgggaggcgctgaagaggaaccggggccgcgactgggcgcgcgcgccgggcgccgtccgggccaagtacctccgcgcaatcgcggccaagataatcgagaggaaatctgagctggctagactagagacgcttgattgtgggaagcctcttgatgaagcagcatgggacatggacgatgttgctggatgctttgagtactttgcagatcttgcagaatccttggacaaaaggcaaaatgcacctgtctctcttccaatggaaaactttaaatgctatcttcggaaagagcctatcggtgtagttgggttgatcacaccttggaactatcctctcctgatggcaacatggaaggtagctcctgccctggctgctggctgtacagctgtactaaaaccatctgaattggcttccgtgacttgtttggagcttgctgatgtgtgtaaagaggttggtcttccttcaggtgtgctaaacatagtgactggattaggttctgaagccggtgctcctttgtcatcacaccctggtgtagacaaggttgcatttactgggagttatgaaactggtaaaaagattatggcttcagctgctcctatggttaagcctgtttcactggaacttggtggaaaaagtcctatagtggtgtttgatgatgttgatgttgaaaaagctgttgagtggactctctttggttgcttttggaccaatggccagatttgcagtgcaacatcgcgtcttattcttcataaaaaaatcgctaaagaatttcaagaaaggatggttgcatgggccaaaaatattaaggtgtcagatccacttgaagagggttgcaggcttgggcccgttgttagtgaaggacagtatgagaagattaagcaatttgtatctaccgccaaaagccaaggtgctaccattctgactggtggggttagacccaagcatctggagaaaggtttctatattgaacccacaatcattactgatgtcgatacatcaatgcaaatttggagggaagaagtttttggtccagtgctctgtgtgaaagaatttagcactgaagaagaagccattgaattggccaacgatactcattatggtctggctggtgctgtgctttccggtgaccgcgagcgatgccagagattaactgaggagatcgatgccggaattatctgggtgaactgctcgcaaccctgcttctgccaagctccatggggcgggaacaagcgcagcggctttggacgcgagctcggagaagggggcattgacaactacctaagcgtcaagcaagtgacggagtacgcctccgatgagccgtggggatggtacaaatccccttccaagctgtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATAIPQRQLFVAGEWRAPALGRRLPVVNPATESPIGEIPAGTA EDVDAAVAAAREALKRNRGRDWARAPGAVRAKYLRAIAAKIIERKSELARLETLDCGK PLDEAAWDMDDVAGCFEYFADLAESLDKRQNAPVSLPMENFKCYLRKEPIGVVGLITP WNYPLLMATWKVAPALAAGCTAVLKPSELASVTCLELADVCKEVGLPSGVLNIVTGLG SEAGAPLSSHPGVDKVAFTGSYETGKKIMASAAPMVKPVSLELGGKSPIVVFDDVDVE KAVEWTLFGCFWTNGQICSATSRLILHKKIAKEFQERMVAWAKNIKVSDPLEEGCRLG PVVSEGQYEKIKQFVSTAKSQGATILTGGVRPKHLEKGFYIEPTIITDVDTSMQIWRE EVFGPVLCVKEFSTEEEAIELANDTHYGLAGAVLSGDRERCQRLTEEIDAGIIWVNCS QPCFCQAPWGGNKRSGFGRELGEGGIDNYLSVKQVTEYASDEPWGWYKSPSKL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>147..255#355..497#1550..1630#1726..1874#2572..2664#2796..2919#3004..3069#3260..3326#4019..4095#4451..4564#4965..5042#5124..5275#5379..5439#5711..5817#5916..6006#agaacagagcactccctctcccaccaccactccacacctgacaccacgcgggctgcctccatcgtcatcgatccatctccgtatctctcaccgaccccaaatcgcacagctccagctcctcctcgatccccgtcgcgatcggcgagatggccacggcgatcccgcagcggcagctcttcgtcgccggcgagtggcgcgcccccgcgctcggccgccgcctccccgtcgtcaaccccgccaccgagtcccccatcggtaccctcctcttcaccctctccaccctctgcttctgcctctgattagcctttttgttgttgttgttgttgctgctgttttttgcgtgtcggtgcgcaggcgagatcccggcgggcacggcggaggacgtggacgcggcggtggcggcggcgcgggaggcgctgaagaggaaccggggccgcgactgggcgcgcgcgccgggcgccgtccgggccaagtacctccgcgcaatcgcggccaaggtagggtggtgactacccccacccccccccccccccccaacgcgacccgcgtgcgtgtgttccgtacagggggaggagctccgcgtggctctccagtaggtttttgagccccaaatcgatcgatatgctctagttttaagtttgctgcttaaattcctcaagggtttagtttgcaaccaaatccttattttagcttcggtataagccccccatatgatgtgcgtgcgtcggcatcggaagtgcgtatcctctgttctggactaggaattggccataggttgatcgacagttcgagtattctgcttctgtttggaataagttggaagcatggctgattgtgtatctggatgctgtttttgtggtgattcgtttcaagctcttgttaattgatgggttcaagcggagagggtgcgcaacaacaagtgtatatggctcacggccatgggtgtgcacatttgattggtgcgcaacaacaagtgtatattgtttgtgtgcttcgttagttggcaggtcctagtcactaaatcactattggattggtactagttacttttgtgccttgacgatgggactggattactagccttttggttgcctttgtggtattccgttgttatgggcctgttgatggatggatccctttaatttctagtgccaaatgcatgctagatttctcacagtttttctcttcaggttatatttctcgtatttccttttcctaaaggattgctttttcatgtattttctggcatatataggttattattattattattctccagaacaagattacccatattatggatcactagtgtacacttttttggatgaaaaacctacttactgaaagtaaaacagtgaccagtgcacactttacttgaactgtcaaaccatcaattttctagcaaagcaggggatgctagccttccagtctaaatgacagtaaactactatacttttgtccgtaggtttggaaatatgctaatttctatcataaaaattttcatggcatatgcgagcattttatgatcaccttttccctttttcttcagataatcgagaggaaatctgagctggctagactagagacgcttgattgtgggaagcctcttgatgaagcagcatgggacatggtatgtggccagttatccactgtatgaatatgtagttgcctacacagcaatctttcctgaacatgaatcctgatgtatgatattccatttgtcaggacgatgttgctggatgctttgagtactttgcagatcttgcagaatccttggacaaaaggcaaaatgcacctgtctctcttccaatggaaaactttaaatgctatcttcggaaagagcctatcggtgtagttgggttgatcacaccttggtatttcacatttttctctcatcctgcgcttatatttatttatgacccaagcatggtactaaatagtactagtaacatgcatatactgaatgagtttacaactttacatgatttttttgaactatgaaagttgaagacatttgagattttattcctcttctcttgtgcaaacatattattgtctcacaaattgtacctagcagctactctctccgtttcatattataagtcgtttgacttttttcctagtcaaaatgtgttaagtttgaccaagtttatagaaaaatttagcaacatctaaaatatcaaagtcatgttttagtgttttttcaggctctcatgtaagcaattttgatgtgccctctcctttcttcttaatataatgatacacagctcttgtgtattcaaaggaaaatatatatatatataatgatacacacctctcctccgtgttaatgcagctcatttgttctgtcccggttcaaatatctatttttctcatatgttgtcagcatgattcacttaatttagtatatagaagatgccattatttatgtctggaatcttactgcagaagggaaaacaattgataacggaattgattgcattctaatttgttgtttctttgttatgttcttatcgacaattacaaatttgattctgagaatcatgttcgggatgtgtatttctactgcaggaactatcctctcctgatggcaacatggaaggtagctcctgccctggctgctggctgtacagctgtactaaaaccatctgaattggcttccgtgtaagtttaacatgttaacttgttaatgtcatacccatgctagttgcaatgacatttgattttaaaatgttgtggcatgtccatgctgcaagcaatgtaatttgaaatctctctctatcattaattaccaggacttgtttggagcttgctgatgtgtgtaaagaggttggtcttccttcaggtgtgctaaacatagtgactggattaggttctgaagccggtgctcctttgtcatcacaccctggtgtagacaaggtacagctattcctcctgtaatcatgtataccccatcaatggaaatgatattcctctcaatacatggtttatgttttctgttaggttgcatttactgggagttatgaaactggtaaaaagattatggcttcagctgctcctatggttaaggtttgtttccaaatttctgtggatattttttgttctctttctactaactctctattatcaattctcaatgttgtccttttcttttaactcctttactttttagaattgtgatcaagacactttgagcatcattctagtagccagttctatcctgtttcttacctttttatggttcgtcttttcttgacagcctgtttcactggaacttggtggaaaaagtcctatagtggtgtttgatgatgttgatgttgaaaaaggtacatgccacttgctatgattaactaattctgaagtgcgggactttgtaaagcacttaactgagctggatgctagacccccaaaagccctttttggtgtcttgggcttgttgcagaaatactggtcccagacgagcaggatgcaagaaaattaactacttttgccactgattagtatttcttagaagttacacctcaaggattagcaatactttcttaaaatgtgctattgattaaaaagatgtcctgtattattttgagcagatcttgtactggttgatcggcttgcatgaaaatattgttgaggattataatgccatgccaactgagtaaagaaaagagttgtaaaatatgttatgcaacatgaatatatatgtgatttcatttttcctttttcttttcgtggcaaggaaggcagttaggaaggactgatgtgaaaagcacaagtactattcttagttctggaaaactgtgttctttattttcctaactacaattcaccttgattagtcagtaacttgatattggcaattctagctgattatgaattctgtttatatttcactaattttgaatctttaattacattttatggttgaaatttaacgttttgtctggttatggactctgtttgtattcactcaatttggatcttccattagatttcattgttggtccttcttcttgtacagctgttgagtggactctctttggttgcttttggaccaatggccagatttgcagtgcaacatcgcgtcttattcttcatgtaagcattgaatatatccgtcaatcataatctattgttgtacttgattttttttctgatcaactcctgagttcagattattatatgatgccattactattgcacagagcgaataaaattgtatttatgcacagcatgtattttgagtaatatatgcattgcctattatttaatatatagattgtagcacttaattttgtgtccatgtctctatgatgtttattactttattattgccggcatgaagcaactttgaactctatgttgatcttgaactaaaattgaaattaattggcttattgctattaatgatatagctttcagcttcttgctcctgaccatgaaagttttgcagaaaaaaatcgctaaagaatttcaagaaaggatggttgcatgggccaaaaatattaaggtgtcagatccacttgaagagggttgcaggcttgggcccgttgttagtgaaggacaggtaccacatgtaaactttttctaaattcaaaaaagaaatgccactgatcaatggtaggtccttccaagccttattgctggattgttgcactgttttgtcaattttgtgtaatatagttctgaatgaattagtcggtgtatgctcttgctagttgctagtatgtggtacagggtcttcctactttgagcaaattcgtgttaaaatgcattgatgaaaaggccacctttccgtaggtttatcttgtcataatttaaaccccaataaaattttaattttttgttttgaccccatggcactttaatgaaatcacttagccatgagcttttgtatatattttcaaagcaccagaatgtttagatggtttgttggaaatcttacacatcctattgccttgtgtcagtatgagaagattaagcaatttgtatctaccgccaaaagccaaggtgctaccattctgactggtggggttagacccaaggtaataatctactacacggttgtatatataggtacccacatatcattatgaagtagaaataatcttgtatgtttttgtcagcatctggagaaaggtttctatattgaacccacaatcattactgatgtcgatacatcaatgcaaatttggagggaagaagtttttggtccagtgctctgtgtgaaagaatttagcactgaagaagaagccattgaattggccaacgatactcagtgagttttttttttaatacagttcattgtcctgttcaatcttgcagcatatgtatatactctgtggcatatgaacttattctgctactactacttttgatagttatggtctggctggtgctgtgctttccggtgaccgcgagcgatgccagagattaactgaggtatatccaagtgaagggggttggcattgtttgattcatatgacatggttgcatcaagctgatattcaagaatctcatttattacttgcattctatgcatctccagttcttccctggactccggtcaatgttaatatagtttgtttgctagtagtatgctactccaattaagttgctcttcacttccacatcatctgatccatgactttatatttgaccccttttttttgcaaaagaaagggaaatacttaacgaaaatttcctactgcaggagatcgatgccggaattatctgggtgaactgctcgcaaccctgcttctgccaagctccatggggcgggaacaagcgcagcggctttggacgcgagctcggagaagggtgggtagcacacaacaatctcactttaaaacaccatttcgatcgtctgatgatctcgacctgacatcatgcctttggtattttcattcacttttcaggggcattgacaactacctaagcgtcaagcaagtgacggagtacgcctccgatgagccgtggggatggtacaaatccccttccaagctgtaatgtaatatgcgcatacgcatgacacgcccatctgttctgatcgtttggaataagaggccatagtatgacgggatggactttgtgcatatcgatgtttgatttgccatgtgctgagcctggaaataaaaaaggttatagttggagact</dnaseqindica> |
| External Link(s) |