Os08g0425100
| Gene Name |
Os08g0425100 |
|---|---|
| Description |
Dynamin family protein |
| Version |
NM_001068371.1 GI:115476479 GeneID:4345610 |
| Length |
10434 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0425100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:20496227..20506660 |
| Sequence Coding Region |
20496464..20496607,20496726..20496776,20496936..20497056,20497216..20497314,20498037..20498098 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:20496227..20506660 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:20496227..20506660 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaggcgatcgaggagctctcggagctcgccgacgccacgcggcaggcctccgcgctgctcgccgacgacgacccgtcggagcagcccgcgcagcggcgcgggggttcctccttcctcaccgtcgtcgcgctcggcaacatcggagcggggaaatccgcggtgctcaatggattgatcggccaccccgttctccctaccggggagaatggtgcgacgagggccccaatatgcgtagatcttcagagagatgcatcactcagcagcaaatccatcatgctgcaaattgacagcaagtcgcagcaggtttctgccagttccctcaggcattcgctgcaggaccggttaaccaaggccggtagttttgggaaggggcgatcggaggagataaatgtgaaattatgcacgagcactgcccctccattaaaactaattgatttaccggggattgatcagcggagcatggatgaatcaatgattgggaactatgctgcacgcaatgatgcaattttgctagttatcgttccagctctacaagcacctgatgtagcatcttctcgagctctaaggattgccagagaactagattcagaaggtagtagaactattggtgtcgtaagtaaagttgatcaagtagccgaagaccagagagctcttcttgctgttcaggccctgcttgtaaaccaaggccctagaactgcagctgacattcagtggatagctacgattgggaactctgttcctattgcctctgttcagtctggagtaggttctgaatcctcaccagaaactatttggaaagttgaagttgaaagccttaaatctatacttcttggatctccgcaaagtaaacttggtagggaggctttagttgattcacttgctaagcagataagaacacggataaaagttagactcccaaatctcctgaatggtcttcaaggcaagtctcaaataatccaggaggaattagcaaaacttggagaacagatggtccaaagttcggaaggaactcgggtcattgctttaggactttgccgggaatttgaggacaaatttcttcaacatattactggtgttgagggtggaggttggaaagttgttgcaagctttgaggggaagttcccaaccaggatcaaacaactccctctggacaagcattttgatatgaaaaatgtgaaaaggattgttcttgaggctgatggttaccaaccatacctgatatcacctgaaaaaggtttaagatctcttataaaaggtcttctagaattagcaaaggaaccatcgatactccttgtggatgaggttcaccgtgtattgctagatatagtatcagccacagcaaatgccaccccaggacttggcagatatcctctatttaagcgtgaggtaattgcaattggatctgctgctttagatggctttaaagatgaggctaaaaagatggtaattgcactagtggatatggaacgagcattcgtgcctccccagcattttatccgcttgttgcagagaagaatggaaaggcaacgtcacgaagatgagctgaaaagtcgctcaacaaagaaggtttcagatgcagaacctagcaaagccacaagtccacaaacccaaacaaaagaaggatcaaatttacaagtcttaggacctgcaggagaaattactgctggtttccttttcaaaaaacgtgcaaaagcaaatgactggagtaaccgctggtttgttctaaatgagagaagtggaaagcttggttacaccaagaaacaagaggagaggcattttcgaggcgtcatcaatttggaggagtgcaatcttgaggaagttttagatgaggaagatcctacgagaagccttaaagatcctaaaaagccaaatgtgccagatattggaactcctggtctcattttcaagattacccataaggttgcttataaaaatgttttaaaagctcacaaggctattatactgaaggctgaaagtatggcggaaaaaactgaatgggttactaagattaggagcattgttgaccaaaaaggagcttctgcaacgagtggtttaccaatgaagcaaagccattcggatggttctctaatgtccacttctaaaaaggatggttctctagacacgatgcttagaaagccagtagatcctgaggaagagcttaaatggatatctcaagaagtccgtgggtatgtggaagctgttctcagcagtcttgcggcaaatgtccccaagctgtggttctttgccaagttgagaaggcaaaggaaggcatgcttaatcagctctatacttcgataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEAIEELSELADATRQASALLADDDPSEQPAQRRGGSSFLTVVA LGNIGAGKSAVLNGLIGHPVLPTGENGATRAPICVDLQRDASLSSKSIMLQIDSKSQQ VSASSLRHSLQDRLTKAGSFGKGRSEEINVKLCTSTAPPLKLIDLPGIDQRSMDESMI GNYAARNDAILLVIVPALQAPDVASSRALRIARELDSEGSRTIGVVSKVDQVAEDQRA LLAVQALLVNQGPRTAADIQWIATIGNSVPIASVQSGVGSESSPETIWKVEVESLKSI LLGSPQSKLGREALVDSLAKQIRTRIKVRLPNLLNGLQGKSQIIQEELAKLGEQMVQS SEGTRVIALGLCREFEDKFLQHITGVEGGGWKVVASFEGKFPTRIKQLPLDKHFDMKN VKRIVLEADGYQPYLISPEKGLRSLIKGLLELAKEPSILLVDEVHRVLLDIVSATANA TPGLGRYPLFKREVIAIGSAALDGFKDEAKKMVIALVDMERAFVPPQHFIRLLQRRME RQRHEDELKSRSTKKVSDAEPSKATSPQTQTKEGSNLQVLGPAGEITAGFLFKKRAKA NDWSNRWFVLNERSGKLGYTKKQEERHFRGVINLEECNLEEVLDEEDPTRSLKDPKKP NVPDIGTPGLIFKITHKVAYKNVLKAHKAIILKAESMAEKTEWVTKIRSIVDQKGASA TSGLPMKQSHSDGSLMSTSKKDGSLDTMLRKPVDPEEELKWISQEVRGYVEAVLSSLA ANVPKLWFFAKLRRQRKACLISSILR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>238..381#500..550#710..830#990..1088#1811..1872#2701..2818#3025..3364#3456..3603#4064..4165#4261..4380#4833..4916#4995..5122#7335..7410#7577..7652#7821..7897#7996..8052#8432..8576#8655..8827#8949..9061#9146..9212#gcgcgcgcacaaaaatactcccagccccccacctcccccactcactcggatcccaccaccatttcgaacggcagcgccctcccctctcctctctcctcgacacacaaccgccgccgccgccgccgccgctgcgtccggtttccccgcgtcgatcgatcgccgtcgccgtcgccggccgggagagcccgccccccctagatcgatccccaaggccgggctgggtcggggccccgagcgatggaggcgatcgaggagctctcggagctcgccgacgccacgcggcaggcctccgcgctgctcgccgacgacgacccgtcggagcagcccgcgcagcggcgcgggggttcctccttcctcaccgtcgtcgcgctcggcaacatcgtgcgtatagtaacctacctacctaacccggccggccccgccctcgagggtcgagacctcgtgttttggcttttgatctgatgggggattgggattgtgattccgtgtgtttgtgcagggagcggggaaatccgcggtgctcaatggattgatcggccaccccgttctcgtcagtacagttttttttccttcgtttgatgccctaattacgtggcctgaatccttcacttgcaaattttttttgcctatattcctctctctacattgtcgatgcaagcaaggtttggtgattgatccgatgggaatggtgtgttgtctatgaatgtagcctaccggggagaatggtgcgacgagggccccaatatgcgtagatcttcagagagatgcatcactcagcagcaaatccatcatgctgcaaattgacagcaagtcgcagcaggtttctgccagtgagttatcttccagctattttccttttccaaatcagtacaggaattctgtgtgtattttttgacataaggaattctgatattttgagagcagttgagatggatgtctgcatgtgtgagtgactgttgagtcttaactattacaaatttataatgcaggttccctcaggcattcgctgcaggaccggttaaccaaggccggtagttttgggaaggggcgatcggaggagataaatgtgaaattatgcacgagcactggttggtttcccctcttctagttgtagtttgtggagctgtgttgaatcgctgattagcttctgcggagaatacattttcttagatatgcaaatagacttacaggattgtattcctgaatagatgcatatggttgaattacaacttctcaaatttgctttgtttgtgccagtagtttattgccattgtgaaagtgttctccaactgtttaaaactaaaagggttagccacatatgtcctttcattttggatatccttgttaccgcgaaatagaaccacaaggtcacatataaactcaacagaatattgctagactatactttggatgcagttcatttataattaagcttagctgcatcctgtcacataattgtgttgcctcattgttcccatccgcattatatgaaagcgttattgtagataaagtgctagaacttttcaacgttatctcgtaaattgtgatgaaatatatatacctaagtgcatgttttccccatcaagcaataattccttacatgacactggatatatgtgtaactctgaaagtttttctcgcattgacaatttgcacctagacccacatgtatatgaggaataaattgcctataagaaatatctcaccaaaacgaaagaatctcatgtttcaactttcaagattacaacaaccatcttatgtacatctaattgtgtatccacttagtctaaatactataattttgtttcagcccctccattaaaactaattgatttaccggggattgatcagcggagcatggatgaatcaatggtcagcactattgatgtcctattttatgattattctctcagttatttacacagttatattgcagttatgttaagtttcttttatctgctaattatacaaatgggtctgttcttttaaaataattttttatgatagttttctgaaaggggttttgtacaacagtttggtacactactagaaatgaaatcattttttgacatggatttggtaaaaactaaaaacaatgacatagggcttgtacatggatagcttctgactattgttagatgtaatgcacacagtacatttacgaggatattgattcacaggagcaaagtttttgttctatcctatctacttggatattgtcttaaggatatggaatggtctattttatctagaatgtttttttttttcagatgaaaatctctccgcatacttctgttgatatatagatccaattaaatgtgattctcggcattagtcaagtaaaaaaaaataacagaccactatcatgtgggaattgttgtgcattttgttcacaacatcaattttttatcatgacgtgaaagaaccactcagctataaaaatatattctcatttcctccaatatagtggaaattgatgtgattagcattcagcacttcatatataccaggcttctggctgaattgttatgcaggaaaatttatagtaaatcaaacttgtttttatcaattttcttagatttagttagttgacgtgctacttgcgatattgtccttgactataactgtaattgcgaagctaatgagtatcttgtgtcattctctatgtatggtttgcttcaacaatctactcatctccagattgggaactatgctgcacgcaatgatgcaattttgctagttatcgttccagctctacaagcacctgatgtagcatcttctcgagctctaaggattgccagagaactagattcagaaggtttgtttgatagcatcaagttttaatatctctaacaaacttccattctcagtgtaattggatcttttttacagaagcagtgattagtccagtgtcctttccagaaactagatctctgttacattacaatatcttcaatgcttaattccaattatttactgaatgttggatgtagttatttactaatttatttgttgatttactaggtagtagaactattggtgtcgtaagtaaagttgatcaagtagccgaagaccagagagctcttcttgctgttcaggccctgcttgtaaaccaaggccctagaactgcagctgacattcagtggatagctacgattgggaactctgttcctattgcctctgttcagtctggagtaggttctgaatcctcaccagaaactatttggaaagttgaagttgaaagccttaaatctatacttcttggatctccgcaaagtaaacttggtagggaggctttagttgattcacttgctaagcagataagaacacggataaaagttagactcccaaatctcctgaatgggtatgaattcatcctagcgcataccattgatttctgtaattttatatcagaatctccaacaatctgctattttattttcataaaattgcagtcttcaaggcaagtctcaaataatccaggaggaattagcaaaacttggagaacagatggtccaaagttcggaaggaactcgggtcattgctttaggactttgccgggaatttgaggacaaatttcttcaacatattactggtgttgaggttactgattctattgcacaactttttggtccttctgctctctaattaattcatattctcatgtaccttgaactattgtgcttctcatcattgaaggacattgaaaactttgatcgtctagtctccataaaagaaaaaaaatactgaacagcagtatatttgtcctcatagaatttggctgctagttctgattatcgttatcttggtttctccacctttcaataaagcaccaaatgttttgcatcccatcaatatttttttttcatatatcaagctatatactccattgttcttttcactaagcgtgtttgtttgaaattgagtccatctagaaagctgtagttggaatattaactgaaagtctagtttttttttgtcaccttttgacttctgaaagctatccatttttaagacatggtataatttcaatcatatatgagatgctatcctaattgtacagggtggaggttggaaagttgttgcaagctttgaggggaagttcccaaccaggatcaaacaactccctctggacaagcattttgatatgaaaaatgtgaaaagggtaattcggttattcttgaagcttctgttacttgactcatcaattgtatggttataatcaatagatattccttttgcctttttcttttgtgccagattgttcttgaggctgatggttaccaaccatacctgatatcacctgaaaaaggtttaagatctcttataaaaggtcttctagaattagcaaaggaaccatcgatactccttgtggatgaggtaacatagttgaggatctgtttccttattctgaactagatagcttcctgttgtagtatattgcagtattatttcttattactcttcaaactctcttctacatgaacctttgaaagacccttgacttacagtctattagtactcttgtctggcactctgatcttgaaacaaatttgagttgcatgcttcatatctatatattccactgatatccgagtgcacttgcataatgcatatttagttcacatcattacatcaaaacctgcaaccaacatttgtgttattctcaattcatatttgttctgtgccttcttctacaagcatgtttgcaaattaacacaccatatgctagttccaagattgtactctcgaaacaacccccccccccccaactctcaacttacaactgtcatcactactcatgtactttctgtttgaattataattgccaggttcaccgtgtattgctagatatagtatcagccacagcaaatgccaccccaggacttggcagatatcctctatttaagcgtgaggtatcttcttaggattcataaagagggaagctttcatgattcaccattagtaacattttttatctccatttccgcaaggtaattgcaattggatctgctgctttagatggctttaaagatgaggctaaaaagatggtaattgcactagtggatatggaacgagcattcgtgcctccccagcattttatccgcttgttgcagagaaggttagtcttattactacgtagtaaccttggttaaaatttcaatgtaacttaatgaaacactgatgatacttgacaaaacatttgtggaacactgatggtactaggtaatactcagtgtctcagagagattcctaatgcctcccaccatctctcttttttcatcatctataggctcaatgcctgcattatctttccctcttaagcttactaatctctatttagatgtgtttttcaatctttatgtgttcacagaataagtactcgaaacttggtcttatattgcaacaaactgcataacctatataatttgaaattctaaaattacaattacttaacaaatattttgtgtttccttatttatcctcagagtcgtacccagcatgaaaaatactcagatgattaacacataggagacaatgccttaattagagttgtaaacaatctgctgatcttgtcaacagcttggtctattgaaaaaaacgagaacaccaagaagggaacatgcgcaaccacaattatagatggccatatggcccgtggcctggcccaaggcaccccattttggcccggcccaagcacggcatggcctgattggggtcgttctcgtgccggcccggcccgacagctgggccgtgcttgggctacgacctcggcatggtgggccggcctggcacggcacgatcgaacaaaaatattatagggatgcaaaatatacttaaatagccatataatgcaaggcccaaagagaagaggaatacaaaatagacttattttccagtcatatgaacacagcccacagagttgatggatgaaaaatacacttattctgtggagaagcacgatgggctgtcgtgccttcgggctggcccagcatggcccgagttgtattgggccattcctgggccgtgtatgcagcccgtgggcatggcacgactaacctcgggcctgggccgtgctgtgccgggcggcccatttggccaactataaccacaaacactttgtctattcttaggcttatgccccggtctaaagtggcaggttaatgtgctactaccatccaatgcactattcagacagctaccaactcaactaaagtggcaagttaatgtgctgctacctactccctccgtttcaggttataaaacgttttgactttggtcaaagtcaaattactctaagtttgactaactctgtaaaaaaagtagttatatttacaacaccagcatagttttattaatctataattgaataaatttttataatatatttgtcttgggttaaaaatattactacttttttttttacaaaattagtcaaacttagagtagtttgactttgaccaaagtcaaaacgtcttataacctaaaacggagggagtactattcaaactgctaccaattcagctcagcccagccaagtctgcagtttagaactgaacattagttggcatactacaaggttgggttactaagagaaagctgtctgcatgtctaacactcgttttttttcaacttttaacatttttcccctaaccaacataagccacatttctctaaccatcagagtagtggacagtctctaacaatgcagaattaccatgtctgggggtatgtgtgtgacatgaaagttccttggacatgcgcatgataagtgcctgctgttcataataataaaataatatattactcccttagttttttaagtagatgattcgttgaccttacgtttgacactttattttattcaatttttctgtgtaaatatgaaaaaaatgtaactcatcaaaccaagtcacaacaaaataaatgatggttacataatttttttaataagacgaatggtcaaatacatatccaaaagtcagcagcgttatctgttaaaaccggagagagtatgtagtcatacttaggcagcatgggcaaccacaattaaatgcatttttttttgccaaatgtacattttcagccagtttggatgttttgctcaaccatctgtgctaaatttatgctgtacggatggatataaaccatatctgtgttgaaatttttaagaaattttgtttgattgttgtatatgttggtgcatggtctttcctgtttctttcaatctacaaagttttgcatatgttgtcttgcaccgtctagttttgcttcctattgctttgaaggctttgtttctatcttgatgtatacgtgttaggttttacatgcagaatggaaaggcaacgtcacgaagatgagctgaaaagtcgctcaacaaagaaggtttcagatgcagaacctagcaaagtacgcttctgtatattgtatattgtgtctacctttacattgaacttttttttcgtacagatattttttccttggccatatgttttaatcattacttctgtgtgtgtaatattctacatcatgctatttccccagttaacgtgtggctttcgttatatgttgtcaggccacaagtccacaaacccaaacaaaagaaggatcaaatttacaagtcttaggacctgcaggagaaattactgctggtatagtcttaggacatatggcagtttgtttaaagcttatttattggacgtagaaatagtcaaaagtatatgcctattagcataatttactctaatttaaatctatgttttttaaagtttccaacaggtttattttcttatttaatagttttttttcctatatcaaaggtttccttttcaaaaaacgtgcaaaagcaaatgactggagtaaccgctggtttgttctaaatgagagaagtggaaaggttggctttctgtttaagcatcttacatcccgtaacgtcatttcaaattttcactgggtttttactactttgatcatgggacaatgaattttatccagcttggttacaccaagaaacaagaggagaggcattttcgaggcgtcatcaatttggaggtacatatcttcagtgctctttgcttgtgattcttctcatcgctcgagtaactttctcgagatgaatgtgatgatgtcatgcacgtagatggattctcggttgtgccagtaaatctataaaggcagaagaaacctaccattttgcatttctccaaagcaccagtttatttctatttttggatctaagcattagttgaaaacattttgattggtgaagtaaaagaaaaataattagctctaactcaattccatagcactagagcaaactgaccgtcagtagattatttttcctttggtgtgaatcccatgataagtcatcgctacattagatttgtactggcttttgcttgttaaagtttttaatgttttcaaattacaggagtgcaatcttgaggaagttttagatgaggaagatcctacgagaagccttaaagatcctaaaaagccaaatgtgccagatattggaactcctggtctcattttcaagattacccataaggttgcttataaaaatgttttaaaaggtacatttaaatcagttctcatttataccaggttgtttcatttcttagtcttcacctgttcattaattaccgtggcagctcacaaggctattatactgaaggctgaaagtatggcggaaaaaactgaatgggttactaagattaggagcattgttgaccaaaaaggagcttctgcaacgagtggtttaccaatgaagcaaagccattcggatggttctctaatgtccacttctaaaaaggatggttctctagtaagtcagaatccttcttttattcttcaaaaagttcatcgtgaaaagattttgaaaatcatcttctagagtagaaaggattaattagtatatcgtttttgtaatcctttcctattttcaggacacgatgcttagaaagccagtagatcctgaggaagagcttaaatggatatctcaagaagtccgtgggtatgtggaagctgttctcagcagtcttgcggcaaatgtccccaagttaagcatgtctggtgtcttgcttaagctttcctggtctcctttctagcttcttgcattaatatcattgatcctgttgagcaggctgtggttctttgccaagttgagaaggcaaaggaaggcatgcttaatcagctctatacttcgataaggttggagctaattgatacacagattgaactcagtataacactttgtttttagtggcccaattcatagttcttgctccttttgtaaccattatgtggcattattgatctgacagcaaaaatgcacctatcttactctgcccttgtttagttcccaactttttcttcaaacttccaacttttccatcacatcaaaactttcctacacacataaacttttaacttttttcttcaaactttcaattttagcgtggaactaaacacaccctctgtttcattaacaatgtgttaactatgtctagttcacaattgtcatttgtggttagcatgcgaagcgtagaaaggattgaagagctaatccaggaggaccacagtgtgaagcacaggcgtgaaaaaatcaaaaagcaatcatcacttctttccaaggttactcgtctgctccgtatccatgataatcgctcagctacttctaattggtcgaatgattctgctggatcaggtaaccatatccttgttcctcattagttgacatagactagggaaccacttgcaagatgcatgaaaactgccccaaggaatagccctggacatttcttacgaaatagtaatcaatacgaatcttacagttagtatattcgactgtaatgttctgtgactcattattctcttctatctttatttcttctcagcgtaaaatcagatcacatgattggctttcgttaccaactcactgaatttccaacttacctctttcagatagtaatccagggagcagtggccagtctggagacgaatggaaatctgcatttgatccatcacaagatgttgatccatctgctgctggaacaaacacggggagccgccgcattccgagccgaatgccgccgccacctccacagggtggttgatcagttcgtagttttctggtcctggggcttctgttttctcagctgcagggagtacattccattatactattgctctaggtgctcttgatcaatggctaatttgggtttcaagaagaaaacagttaacgggaattgaccggtgaagcgttcataggcctttgaataacttgttagttgaagatagaatgtcagtaggacctcgaatattgttaggcacataaccgcagtacgtttatctctgtgtttttttttctcatggaactctggcaaaatcttgtatttcatgataattatgttgtttttgagtattctaccg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
