Os08g0470700

From RiceWiki
Revision as of 13:04, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os08g0470700| Description = Carbonic anhydrase, eukaryotic family protein| Version = NM_001188690.1 GI:297726510 GeneID:9270004| Length = 4264 b...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os08g0470700

Description

Carbonic anhydrase, eukaryotic family protein

Version

NM_001188690.1 GI:297726510 GeneID:9270004

Length

4264 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0470700, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:23235223..23239486

Sequence Coding Region

23236543..23236720,23236821..23236927,23239013..23239224,23239383..23239470

Expression

GEO Profiles:Os08g0470700

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008401:23235223..23239486 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008401:23235223..23239486 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgcattcgagtactcgagctcgcctcctcctcgctgccgccgtactcctgctctcggctgctccggcggccagagctcaggaaaccgacgatgaaaggaagtttggttacgtccccggcacggaaaacgggccggggaactggagtaggctcgatccgagatgggccaagtgcaacacgggcaacatgcagtcgcccatcgacctctcccacgaacgcctgatgcgcaacctcggctacctcgactactcctacctcccagccgaggcctccatggtcaaccgcggccatgacatcgaggtgaagtttatgggaaacgccgggagagtggtgatcaacggcaaggcgtacaagctcaagcagctgcactggcacacgccctccgagcacaccgtcaacggccgcaggtatgacatggagctgcaccttgtacacgacgacggcaacagcaacacggcggtgatcggcaatctctaccaaatcggcaaccccgaccccttcctgctcatggtttgtttgattagcactcgcaattgctacggcaactttgccggtttaactgcgactctgtcaatcttgttataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MHSSTRARLLLAAAVLLLSAAPAARAQETDDERKFGYVPGTENG PGNWSRLDPRWAKCNTGNMQSPIDLSHERLMRNLGYLDYSYLPAEASMVNRGHDIEVK FMGNAGRVVINGKAYKLKQLHWHTPSEHTVNGRRYDMELHLVHDDGNSNTAVIGNLYQ IGNPDPFLLMVCLISTRNCYGNFAGLTATLSILL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>2767..2944#2560..2666#263..474#17..104#aagctaattcccaaacatgcattcgagtactcgagctcgcctcctcctcgctgccgccgtactcctgctctcggctgctccggcggccagagctcaggaaaccggtaataacctcactttgctagctccctccatgtatatacacatgagccgtggccgcacatatatacgaatatatatttttgcctcttaagaggatgtcatccacgacttatcatgttgttttttggaataagatcaacttatcatgttattattgtagacgatgaaaggaagtttggttacgtccccggcacggaaaacgggccggggaactggagtaggctcgatccgagatgggccaagtgcaacacgggcaacatgcagtcgcccatcgacctctcccacgaacgcctgatgcgcaacctcggctacctcgactactcctacctcccagccgaggcctccatggtcaaccgcggccatgacatcgaggtaacaatgtattttcagcttaactagttggctggtccgcgcaattacgcggctaacactcaaccaaattcatatattattcagcatgtttttacttaaaatttattaaatagctatccccgtatcatccccgtatttctaattatgtagtttttaaaagtcacaccagctgctaccccttatttctgtcatatccttctttatttgcttgctcggtctaccactatttctattttttctccttgaaacctttaaaaatagaatcttataggtttttaagtttattatctcgttgggtttcatttttataatttatggaagtcccgtcaaacgctgccattatacttctctatggcccgtccactgtattttctctttattatcattgggattttacaaatcgaacataattatcgtttgagtttatttttcactttctataagtccctccaaaccgtgagcggctttgccattgtactcctttatggctcgcccgttgtctcctttctttcttgccattgagattttaaaatcaagcataattatcattggttttttttaatttttagaagttccaaatctttaaaattggaccttgtagcttttagaatttattgtcttgttgagttttattttttataattattagaagtcacgttaaacgatgccactatactcctctacaacccatccgccgcctactctttattgtcattgggattttaaaaatcgagcataactatcgttggaattcattttttattttctagaagtcctgccaaccgtcggcggctctgcaactatactcctatacaccctccccgctgcttctcttttttattgtcattgagattttaaaaattgaatatgattatcaatggttttttttttactttctaaaagttccagcaaccaccttacccgtttgcttcacggcctacctatcgtccctccttttaatcatcattaggtttctatttggtgttttactaacaatcaaccaccaccactcttctcttttataggcttgttacttaatttatctcgtcgtatgttttatatggtcttctttttcaataatctttatttttatcaccaattttagttatttataaattgtatagtgtttttttaatatttttattttttatttttgaatttcagttgtttcaaaattgtattactacttgaactctcttttaatttttctaattttggatattatttttttgagttttaattaatctagtattgggttcttatatggattcttctttcaatattgtttatttttaattccgaatatcagttaattttaaattgtattcctacttgaactcttcttttcttttgctaatttcggattttatttttatttttattctgaatattaactaatctcgtattgggttcttctatgtactcttctttcaatattccttatttttaattccgaatttcagttatttttaaattatattcctacttggactctctttttattttctaattttagattttattttatttttattttaaattttgattaatctcgtattgggttcttatatggatacttctttcaatgttgcttatttttaattccgaatttcagctatttttgaattgtatttctacttggactcttcttttctttttctccgattaatgtgagaatttctagcccccacagcgaacgtggtactttcttttaaagctgttttaataatacataatagatagatttagattccttagttttctttttttttggattacacgacgaatacacacgcacacacacttctacacacacatccatgaatatatcccctaacatatgcttgaagagatacggaaaccagcgagatatttttggtctcactaaaattctgttgaaaactcacctatatatgtaatattcgtggataccggaatttaaacctgatagccaccacacactactagtactagtgctgcctccctatattccttaattaattttcatataccaagctagtgtataggattgcttaggagtagttgtgtgtcgaagcgatatgatgatccatgctgcatgcgcaggtgaagtttatgggaaacgccgggagagtggtgatcaacggcaaggcgtacaagctcaagcagctgcactggcacacgccctccgagcacaccgtcaacggccgcaggtatacgttttccgcctctccgttcacggcggcgcttgcttgatcgcatcgccggcggcgccgcagttcgatgctcatcgacaagtacccgtgcgtgcaggtatgacatggagctgcaccttgtacacgacgacggcaacagcaacacggcggtgatcggcaatctctaccaaatcggcaaccccgaccccttcctgctcatggtttgtttgattagcactcgcaattgctacggcaactttgccggtttaactgcgactctgtcaatcttgttataaatatttgatgtttaaacttttaaaattttataaccattagtttcacaaacaaaattgcatacatagatttttttttaaaattatactattttaatagtatcataaatatatttcataaatttattttaatataaaattaatggtcgaaatcttacaattttaactgattgttataattggtatatattcacaactgagggaggaagtagcacataataattagtaatgattatacatatttattggtcattgacgaaaaccaatgggtgttatcttgttcttgtagctggagccattcattagaaggatagcagatacaaaagataagtcagagccgatcggtgtggtggatccacagctagccaagagcccagacgccgtgtactatcgttacatgggctccctcacgacaccgccttgcacggagggagtgatctggacggttttcaagagggtaggcttgacatttcataaattcatttcacgttaataattttataggtttttcttttggtaagctttcggtaccttggtaaaaaagaaaaggtgtccatctacttctctcattgtcatgttcgatttcagatgttaaacggatcttaaaaatccaatcttcctcttttcatttttctttacaggcccagactgtggcacagtatcagcttgatcttctcagggaagccgtggctgacgtgagttttgatttcccctaaattttcacccacaaaagtgtatatctggttgaaattctattttatggtcattgggggttataaaatagagggataaagtaaaaaatagataagaggaaatgcatgtaattaatttattttaataatgaaaacgagttacatcttcggtatctatcgttaggcacaaagtcattgatcagataatacatgcacttgacggcttaaaatttgatggcttaaaatccactcccgattgaaagaatatttttagacttgtacttaaaatacacataaatttcttgtagtttgcaaaataggaaactttatagaacaaaaccgtacccctcatgaagaataaatattttcgttgcaataatttgaggtgatgattctttactctttactccacagggttatgagaacaacgcaaggccccttcagaaggtgaacaacagaaacatcagcattttcattccagaccctaagaaggactaatcaattaccaacacatcgccagacatgagatcagattagaataaattaagctacaactgttagttctataaactaagttgcaacaatgctagttatgaaataaaattatacccggagtagggatttactatac</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0470700, RefSeq:Os08g0470700