Os08g0485400
| Gene Name |
Os08g0485400 |
|---|---|
| Description |
Similar to 2-nitropropane dioxygenase-like protein |
| Version |
NM_001068622.1 GI:115476981 GeneID:4345877 |
| Length |
8135 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0485400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:24076165..24084299 |
| Sequence Coding Region |
24076209..24076343,24076455..24076667,24078309..24078404,24078667..24078812,24078926..24079145 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:24076165..24084299 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:24076165..24084299 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggggtggaagggcatcctggggttcgaccacggcgttgtgcaggcgccgctcgggcccgacatctccggcccggagctcgccgccgccgtcgccaacgccggcggcatcggcctcctccgcctccccgactggccggcgccggatcgcgtgagggatctgatacggaggacgaggagcctgacggagaggccgttcggggcggccattgtgctggccttcccgcacgaggagaacctacgggtggtgctggaggagaagctcgccgtgctgcaggtttactggggagagttcccgagggagcgagtcgatgaggcgcacctcgccggtgttaaggtgttgcatcaggttggtagctttgaggaggcagcgaaagctaaggaagctggtgtagatgggatcattgttcaaggctgtgaagcaggggggcatgtgattggtcaggaaggactgttacctttgctgcccagagtggtggatctagtttcagatactgacatttcagttatcgccgctggtggaattgtagatggccgtggctatgctgctgcattggcacttggtgctcagggcgtttgcttaggaactaggttcttgaccactgaagaaagttttgcacatcccttgtataagaaaaggctaatcgagattaattgcacgggctataccaatgtgtttgggcgtgctagatggcctggtgctccccaacgtgtcctgaaaacaaccttctatgatcagtggaagaatctcccagaacaagaaacagaggaaaatcaacctatcataggccacactatcatccatggtgtgggatattcgtcggttcgctggtactgttcctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGWKGILGFDHGVVQAPLGPDISGPELAAAVANAGGIGLLRLPD WPAPDRVRDLIRRTRSLTERPFGAAIVLAFPHEENLRVVLEEKLAVLQVYWGEFPRER VDEAHLAGVKVLHQVGSFEEAAKAKEAGVDGIIVQGCEAGGHVIGQEGLLPLLPRVVD LVSDTDISVIAAGGIVDGRGYAAALALGAQGVCLGTRFLTTEESFAHPLYKKRLIEIN CTGYTNVFGRARWPGAPQRVLKTTFYDQWKNLPEQETEENQPIIGHTIIHGVGYSSVR WYCS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>45..179#291..503#2145..2240#2503..2648#2762..2981#7020..7052#gcggcctccacctcctcccccgcgcgcttacttggatcggcgagatggggtggaagggcatcctggggttcgaccacggcgttgtgcaggcgccgctcgggcccgacatctccggcccggagctcgccgccgccgtcgccaacgccggcggcatcggcctcctccgcctccccgactgggtaccccccaccccacccctctatctgttcccttttcccttggggctcttcttcacagctagtactagtattattctgttcgattttttttttctgattcgctcactgcagccggcgccggatcgcgtgagggatctgatacggaggacgaggagcctgacggagaggccgttcggggcggccattgtgctggccttcccgcacgaggagaacctacgggtggtgctggaggagaagctcgccgtgctgcaggtttactggggagagttcccgagggagcgagtcgatgaggcgcacctcgccggtgttaaggtgttgcatcaggtgagattttcacatgccattgtctgttcaattagcttctatcagtgcttttgccagtggggtagctagagcttcgctagttagtacttcctccattccataaattaggtttacttttagcttctatttgttccaaaataagtttatttttgagtaatcattgtatcggagtttatgaaagtagtaaacaattgtattggggtagataaagtaggcaataattgcattgagatttgataaagtagcggtatttcagtccttttggtttgtattggtatgtgtgggatgggtgaggtgaaaaattaacttatattttgggacagaaggagtatatttgttatgctattgtggttacttatcagggaggttataatagctgctagctagaacttcgctaattagtagtatttcttaattgttatgccagtgccattgtttgtggttacttattattagggaggttgtagttataatgactgctgaatagaccatttgttcccaatatgttgtaaatgattggtgaatcttttgaagatattcttatgtttaacgttgttgcgaatcaggagtgcttcagtactccactctggatcatgttggtcttgtttgctcaaaatgctaactgataagcaaccaatttgccaacgctgaaaggagaaaaaccatttcattttatctagagtagaggaaaaatcatcgatggtaaactggtcaatggctggagatagttaccaacaaattgttaatagtcaaagcatgtgttggaagtcggaacagtagatgccagacaacaaaaagacagcactcatgacaaaaacaatgattgtctaagataacggtataacacgcaaaagatgatcacaaagagcacatgagacaagccatgaattagctaatgcaggtcggttagtccaaacctcaggctcttttggcttggtcatgaggataattttgtagcacagctaatacaagctgaatttactttggctgttgattaatgaaagttctctttcctcgcaaaaaaaaaacaaaaaaaaacagaccacatgaattaccggaaactgctcctaactgttacatgcccacatatgactatatgagccacagtgccacactatattggctcctttcactatcattccttggcttggcttaagtagaaatataggaacaagtgaacactgttagtgttagtacgatttatctgttatagagcattcaggcgttgatactcttcttttggtgcaaagaaagatgtaacaagcaccactgcaaaaaacttttttgtaacaaccctccctccagaagaaccgcacagcttagcccaaccgacgggcgggcccatttacacatacaattccacttatactttcgtcctcgcttcgtgtaaaagggttaacccggaagtgatatggttggagggaagaggccttataagttggttccaccattgctaaactaacaaggtggtactaaacaagcgcacacagctctcatgggccgcacatgcctcatcctaattgggccaggatgtcacatttttgcactttgtgatgatgatacacgaactctttcctgtatacgtcttcacatttgttcagttgattatgaactttgcaatatcccttgttatttgcgtaggttggtagctttgaggaggcagcgaaagctaaggaagctggtgtagatgggatcattgttcaaggctgtgaagcaggggggcatgtgattggtcaggtaagccagtgttttgtagttttggtttgttaaaagtctcaggcagcctttcaagaagcttcttggtcaacttcaggagtgttcatgcatgcatttagaatgtacagtatgcctcgaatctatataaaaggctaaagatttagcttagggcccctgttgtggtgccatctctaaagcataacatacctccctagcttgtcgccatataattatattcatgagatttcttctccaatgccttttttgttgtggggaaaaacaggaaggactgttacctttgctgcccagagtggtggatctagtttcagatactgacatttcagttatcgccgctggtggaattgtagatggccgtggctatgctgctgcattggcacttggtgctcagggcgtttgcttaggaactaggtattcttgcaatcttttctctgcacgagtttctcgatagtccatctgcaatcttttctttgcttaggaactcatagtctgattttcacattactagttccatgaacattcaggttcttgaccactgaagaaagttttgcacatcccttgtataagaaaaggctaatcgagattaattgcacgggctataccaatgtgtttgggcgtgctagatggcctggtgctccccaacgtgtcctgaaaacaaccttctatgatcagtggaagaatctcccagaacaagaaacagaggaaaatcaacctatcataggccacactatcatccatggtgtggtaagtattcggttatttcttttcgttgaatttgtcctcctttatttataagttgcaatcatttttgttatgggcttatggcctttttttctggcttattttgctatctggtataaagtatttcaatgccttcagttccaacatgatacttcatctagacacaatcaaaatcagctcaggcttttaatatgggcaaatagaacctcagtagtctagttcccaatgagaacatgaaggctttgctgctgtaagttcgcaacaaacacttttggttaatatgaatgctatagatgaagttttctcctccctagtctaaaaacagtgtaccacaggattacaggaatttcataggaaaacaatgaattccaatgggaccaagttttatgagtagcagtttagctcagcagttaacaaaaacaaaatagactaagctcacaagacatatcttgccctgaataacagtttgcaagacattccaaactgcgaagttcagacaaacagatttgaaatggttattgtagttcaggattctatttccttgagggagtattacccatttcaacaaggttttatatttgccttcttaccttctgtttttctaagatagagcaccgctacttgtctcttaggacatctggatatggtagggtagcccttaattaattgcttcgcttttggccaaaatggtactgcttgctgttttctaataccgatagacatctacagtggtggcctgtcaattcttctagataaagctttgtatttttacaataggacttccataactgtacagattcaaccatttttagtacatacaaaaaccaacttcaaataccagaattataacgaataaatttaccagaaatataataaatattttctagattagtttgatccaacatctcaaaaaagtcctattataatctcatacttgtctaacaaatagttaattttcatagttatgagccttcatattggctgttatggagatctttagattaaattgtaagtcgtctagcaatgtaaattatttcgatcaaatcatcagattcataaacatgatgaaaacattaacttcttcatgataaggtaataaatgtagatattatttaaaatttatattcttgaagatatactcttggtcattaaaaaatgattcttgatatgcggtagtctaatattattcttgattagattgttgcaattatagctaaggcaaatacgatgtaatatgaatactaagtatgcacaaatttaactaaagaagtaaaatattatctaaaacagaaacaaaatatttgttaacttgacaatctcacattgttccggtgctaaaaaggacacataatgtatgatgttgttaaagaccattacaaatatatggaattactcatggaactcttaacatgcacctagctagctactacccgaaagtaggcatgatccggttgtccgatggttaaactccattggccaggctcttcttatatagggcattatacgcaacacaaaaaaggaactaccttccaagatagtagaaggcatttttgctacgaagtgtagcaaagtcaaggctcgatgggatcatctaggtggaattgcaatagccacgactctaaactaatatggaatctccgatgtcgtttacagatactctattctgtccatccatcatgtactgtgcaaaccattagggatgttatgggcatgttgcctttaacaacctatcggacatgtactggcaggtgacaagcagctcaacctttcatgatccacccactcccacacactgacatcgtcgtcatcgagctctatcagctgcttgtgcatctgatcaacattcatggtagtaagtatgcacgggtaacgtttcatcttctctttcaaattattccttgagacaatagcctaagcaacaatagtgataggcttgccacggtaccaaaatgttgtattttcactcatctagttatacaacgccacacaaatgtccccgcgttcagcggtaatccagcatgagcgtcgttgttgtgaaagaacttaggtaggcgaggcagccgtgctcttcctgttaagcgggttgacgagcacggcaaatagataatctttgttgatggcaaagaggtaaccagggctaaaagtaatgacttgctcgcccatgatagttgggacattcagacatgtaccttgattgtcttctatgtggagagggagtagaaggtgacgttgtcagagtaattcgtcctcatcccaatgctcgtcatctacggttggaaaaagccatgaactttatgtggcataacggctcacctctatgggtacacagtgtggaagcggacaaagtctctagctcacaaagatgagtggagatgactttgtccgcttccgctcggtctgcctgcattggagaaccgttgtgccgtgtaaagggcatgaattcttccagttgttgatgatggtgagccactgggatgaggatgaatactccgacaacatcaccttctactcatcctccatagagaagatatcaagatacaagtccttctatcaagggcaagaaggtagttgcttctggctttggccaccttcttgttgtcgacaaagatgacgacctctttgtcgtgttcatcaacccatttaccagggagaccacgacgatacctctcctacctaagttcttgcacaacaactgtgctttagaccagattaccgatgaaggtggggacgtctgcgtgttgctctgtaactggatgagttgaaatgcggcactgtggtaccgtggcaacgctatcactattgttgattgggctattttctcgaggaataatttgaaagggaagatgacacgctacatgggcatactctttgccatgcacggtgatcgaatgcacatacagatgatagagctcgatgacgatgagatgtcggtgtgtaccgtgtgtgggactggttcatgaaaaaggttgagctgcttagcaccctccagtccatgtcacataggttgctaaaggcaaccggagtgatttgcactgtacgtgatggatggataggatatctgtccacaaccttggagatgccatattagttcaaagccatggctattgctattgtaatggtctttatcaacatcttacattatgttcctttttaagtactggaacaacgtgagattgtcaagtaaaaaatattttgttttcgttctagataatattttacttcttcagttgaatttgtgtgcacttaatatttatatttgcatcatatctgccttagttgtaattgcaacaatctgatcaggaacataaatagacctctgtttttatgacctggagtatatagctttcttcaagaataaaaattttaaatcatatctacatttagtaccttataatgaagaagttaatgtttttatcatctttactaatttgatttttttataaaaataattttcatagcttttaatgtaagcgacttgaaatttaatatgtagatccccatgactgccaacatgaaggtttataactatggaaattaactatttgttacacaagtttcagattataatgagactttttttaagtgctggattgaacaaatcagattatatcgctggtaaatttgttctttataattctagtattttaagttgttcttttagatactaagatggttggaccgatactgttagacagaagcttgtggtatatgatttatactttcatcctaaatcaaacttggtggctttgctggacttgtgtatgcagggatgcatatcccgtagtgtgcgtgttcatcgtaaatagtctaccaagcattctttttaccgtgtttattaaatatatgttgacatagtgttgtttgtattgaaccatacatgtgctgagtaatggtgatctattatgctgttttgtatgatgatggacctcaatagagtagtttggcatagtactcattacaactttaaatgcacactttgtacttcggccacttacactagaaattggacaagtaaataatgatttgttgattccagcacagggatattcgtcggttcgctggtactgttcctaatgcgacaacaacaggtgatattgatagcatggtcatgtatgctggtcagggtgttgggctaatcacagagatcataccagctagtgaagttgtcaaaaggttagtttctgaagcacagcacgtcatcagagaaaagcttttgtgaatttcctgtactgtccaaggagcagtaaatactatctggtttttgtaagcaaggaccaatgaaaataaaagagtccaccaagctgtccatttccccaaacaagtccacggtgttgttacatagtatatctgcagaattacacagtattgattgcttctacatctgtttgtaagtaacaactattgaaatatagattttgcaaatgtattctcttctttcggcttcaatgttgtactaggagtacaaagtatgtccccaaaattgtactagttgtgttgctttattaccaggacaagctgcccaaacactatgagtaactgagtttattacttctacatgcatgctgtggactaatggtctgtgttagactggtagtctggtattttgaatcgagttggacttggttggggtcttgcagctggagcatatggcatgtttttttctgcccagaaactattgatgcactggtcggacctttcaccaacctaataactagagagggcttgcttcagttcttggaccacgctcacctcattgcccatccctttgggcttctgtctatagataatgcttcggaggtaaagcagataaaagaacagtggtgctacaatttctgggaccagcctctgtgggctgagttggacactgacatggatttttgtcctggcaatggttggaatatgtgctcgatttatagctctggaactgaatgtccacatgaagcagtgtgttgaatactgtaagatctttgatcgagctttctgattctattctatacttccctcttatgttaatgtgggagctttctgattttgttctaatacttgcctcttatgttagtgtgaggatatgtaaatgtgacaccttttatgcttattgcagcttcacaaaggtgtatcccatgccttccattgattaccttcattggtaacacatcc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |