BGIOSGA000233

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA000233

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000233, complete gene.

LocusTag

B1793G04.8-1

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA000233-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA000233-PA

Length

7852

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:43990344..43998195

Sequence Coding Region

43997803..43998195,43996320..43996602,43996207..43996235,43996006..43996107,43995646..43995714
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,43994314..43994406,43994126..43994218,43993787..43993924,43993388..43993495
,43992624..43992728,43992483..43992525,43992133..43992290,43991900..43992046
,43990980..43991032,43990766..43990865,43990344..43990670

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:43990344..43998195 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGGACGGCATCTACTCGTCCTCCGCGCCGCCATCGACGGCGGCGGCGACGGCGGCCGCGGCGGCGGCGGCGGTGGGGTCGTCGGTGATCCCGATCGTGAACAAGCTGCAGGACATCTTCTCGCAGCTGGGGAGCAGCTCCACGATCGACCTGCCGCAGGTCGCCGTCGTGGGGAGCCAGAGCAGCGGCAAGTCCAGCGTCCTCGAGGCGCTCGTCGGCCGCGACTTCCTGCCCCGGGGCTCCGACATATGCACGCGGCGACCCCTCGTGCTGCAGCTCGTGCACCAGCCCCGCCGCCCCGCCGACGCCGAGGCGGATGAGTGGGGCGAGTTCCTCCACCTCCCCGGCCGCCGCTTCTATGACTTCCGCGAAATCCGCCGCGAGATCCAGGCCGAAACAGACAGAGAGGCGGGTGGTAACAAAGGTGTGTCAGATAAGCAGATACGACTGAAGATCTACTCACCAAATGTTCTAAACATTACGTTGGTTGACTTGCCTGGGATAACTAAGGTGCCAGTTGGTGACCAACCAACTGACATTGAGGCCAGAATAAGGACCATGATATTGTCGTATATCAAGCACAAGACATGTATCATCTTGGCTGTTTCGCCAGCAAATGCAGACTTATCGAATTCTGATGCTCTTCAAATTGCTCGAAATGCTGACCCTGATGGTTCTCGAACAATTGGTGTTATAACAAAGCTGGACATAATGGACAGGGGCACAGATGCTCGTAACTTTCTGTTGGGAAATGTGATTCCATTACGACTAGGCTATGTTGGTGTGGTAAACCGCAGTCAACAGGATATCAAATCAGATCTCAGTATCAAGGAAGCTCTGGCGCGCGAAGAAAGTTTCTTCCGTAATCATCCAGCGTATAATGGTCTTGCTCAGTACTGTGGTATACCACAATTAGCAAAGAAGTTAAACCAGATTTTGGTCCAGCATATAAAGACTGTTCTGCCAGGATTGAAGTCACGTATAAGTTCTCAATTGACAACTACTGCTAAGGAGCTTTCCTTTTATGGTGATCCAGTCGAGTCCAAGGCTGGTCAAGGTGCTAAGCTTTTGAACATTCTGGCAAAGTACTGTGAAGCTTTCTCCTCGATGGTGGAGGGAAAAAATGAGGACATATCAACAATTGAGCTTTGTGGTGGAGCAAGGATCCATTATATTTTTCAATCTATATATGTAAAAAGCTTAGAGGATGTTGACCCTTGTGAAGATGTTACCGATGAAGACATCCGTATGGCTATACAGAACGCAACTGGTCCTAGGAGTGCATTGTTCGTACCTGAGGTACCTTTTGAGGTCCTTGTACGCAGGCAGATCAGCAGATTGCTTGATCCAAGCCTTCAGTGTGCAGGTTTCATATACGATGAGCTAGTCAAGATGAGCCATCGCTGTCTTGCTGTTGAGCTGCAGCAGTTTCCTCTGCTCCGTAGGAGCATGGATGAAGTCATCGGGAGGTTTTTACGGGATGGGCTTAAGCCTGCGCAGGATATGATAGCACATATCATTGAGATGGAGGCGGATTACATAAACACATCTCATCCAAATTTCATCGGCGGCAGCAAGGCTGTTGAGCAAGCACAGCAGCAAGTTAGGTCTTCTAGACTGGCAGCTGTGGCTAGAAGAGAGGGAGTAGATGCTGATAAGTCACAAGCTTCTGATAAAACTCAAAAGCCGCGTGCGCTTTTGGGTAGAACTGGTGTAAATGGAGTAGTCACAGATCATCTCCAGGGTTTACGGCCTGCTGCTGAGGCTGAGAGGCCAGGATCTTCAGGTAGTGGAAGCACATCTTTCTGGGGATCAATATCAATATTTTCTTCTACTAGTGATGATCGTACACATTCTTCTGCAAAAGACAACTCATCGAACAAATCTTATACAGCTTCTACTTCCCACCTGGAGCATTCACTCTCTACGATACAGTTGAGAGAGCCACCAGTTGTCTTGAAACCTTCAGAAAGCCAGTCTGAGCAGGAGGCGCTTGAAATAGCAATAACTAAGTTGCTACTGAAGTCATATTACAATATAGTGCGGAAAAATGTTGAGGACTTCGTTCCAAAGGCAATCATGCATTTTCTGGTTAACCACACAAAACGGGAGCTGCATAATTACCTTATAACTAAGCTTTATAGAGACGACCTCTTTGCGGACATGCTCAGAGAACCCGATGAAATAACCATAAAGAGGAGGCAAATACGTGACACCCTCAAGGTCCTTCAGCAAGCATACAAGACTTTGGATGAGATACCACTTGAAGCGGACACAGTTGAGAGAGGCTATTCCCTGGATGCCGATGCAACAGGTCTACCAAGGGCTCATGGGCTTTCTTCATCCTTCCAAGATGGAAGCTCGCCATATCGACCCCAAAGCAACAAGTCAAGAAATCTAGCCACTCAGGGGAGCAGCTGCCATTCAATCCCGATGCAAGCGGTAACGGATTTTGATCTCGCCATTCACGACGTCACCCGAACGAACCAGTGGTTGAACCAGGCGATGTACCGTGGTTGCACGCATTCTGCATTCAGTTTGTTTGCACCAGATAGATGTATGCTTTTCTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEDGIYSSSAPPSTAAATAAAAAAAVGSSVIPIVNKLQDIFSQLGSSSTIDLPQVAVVGSQSSGKSSVLEALVGRDFLPRGSDICTRRPLVLQLVHQPRRPADAEADEWGEFLHLPGRRFYDFREIRREIQAETDREAGGNKGVSDKQIRLKIYSPNVLNITLVDLPGITKVPVGDQPTDIEARIRTMILSYIKHKTCIILAVSPANADLSNSDALQIARNADPDGSRTIGVITKLDIMDRGTDARNFLLGNVIPLRLGYVGVVNRSQQDIKSDLSIKEALAREESFFRNHPAYNGLAQYCGIPQLAKKLNQILVQHIKTVLPGLKSRISSQLTTTAKELSFYGDPVESKAGQGAKLLNILAKYCEAFSSMVEGKNEDISTIELCGGARIHYIFQSIYVKSLEDVDPCEDVTDEDIRMAIQNATGPRSALFVPEVPFEVLVRRQISRLLDPSLQCAGFIYDELVKMSHRCLAVELQQFPLLRRSMDEVIGRFLRDGLKPAQDMIAHIIEMEADYINTSHPNFIGGSKAVEQAQQQVRSSRLAAVARREGVDADKSQASDKTQKPRALLGRTGVNGVVTDHLQGLRPAAEAERPGSSGSGSTSFWGSISIFSSTSDDRTHSSAKDNSSNKSYTASTSHLEHSLSTIQLREPPVVLKPSESQSEQEALEIAITKLLLKSYYNIVRKNVEDFVPKAIMHFLVNHTKRELHNYLITKLYRDDLFADMLREPDEITIKRRQIRDTLKVLQQAYKTLDEIPLEADTVERGYSLDADATGLPRAHGLSSSFQDGSSPYRPQSNKSRNLATQGSSCHSIPMQAVTDFDLAIHDVTRTNQWLNQAMYRGCTHSAFSLFAPDRCMLF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..393#1594..1876#1961..1989#2089..2190#2482..2550#2635..2694#2787..2900#3089..3137#3587..3696#3790..3882#3978..4070#4272..4409#4701..4808#5468..5572#5671..5713#5906..6063#6150..6296#7164..7216#7331..7430#7526..7852#ATGGAGGACGGCATCTACTCGTCCTCCGCGCCGCCATCGACGGCGGCGGCGACGGCGGCCGCGGCGGCGGCGGCGGTGGGGTCGTCGGTGATCCCGATCGTGAACAAGCTGCAGGACATCTTCTCGCAGCTGGGGAGCAGCTCCACGATCGACCTGCCGCAGGTCGCCGTCGTGGGGAGCCAGAGCAGCGGCAAGTCCAGCGTCCTCGAGGCGCTCGTCGGCCGCGACTTCCTGCCCCGGGGCTCCGACATATGCACGCGGCGACCCCTCGTGCTGCAGCTCGTGCACCAGCCCCGCCGCCCCGCCGACGCCGAGGCGGATGAGTGGGGCGAGTTCCTCCACCTCCCCGGCCGCCGCTTCTATGACTTCCGCGAAATCCGCCGCGAGATCCAGGTTCCCCTCCCCCCTCGCATTCTCTATCTTCTATCGATGTTGATTTAGGCGTTCTGATGGCTGATTAACTGATAGAGGTACTAGTTTGGAACCTTCGATTGTGCTCTTAGCGTATTCTACTGCTCGAGAGTTCACTGGTAATGTTGTGTTATGACTGCTTGCTAGGGTTTCGAATAGTTTGTGGTGATTTGGATGAATAATTAGTATTGTACTGCTCGTGAGTCTACTGGTAATGTACTAATGTTGTTGTGTAATGGCAGCTTGCTAGGGGTTCGAGTAGTTCTACCAGGTTTGGATGGATCATTAGTAATTTGTTTGGTTTTATGATGTATGTGATGCCGGTTAGGCTCTATAGGTTTAGTGCAATTGGGTACATTCTAACACTACCAGGTTGGATTGGGGGATAACCCTTTTGGGTTATATTCCATCTTCAGATTTAGGGGTGGCGATATTTTCTCATAGTTGCTTTTATGGTGACTTGTGCTGATGTCCATTTGTGTTTCTTCAAAGGTGTGGGTGTATTGCCTTATCTAAGGGTTGGTTTGGTTTGTGGCCTAAATAGGCCTTACCAAATTTTATTAGTACCAAAATTTGGCAAGTTTTGGCATGACTAATTTTGGTAAGACAAAGTTGTGTTTGGATTGAAGCCAAAATAGCCTAAGTTCACTATTGAAATGGCCTATTTTCTTAGGCATGCCAAAATTTGGCTTCAAACCAAATAGACACTAAACACTATTGAAATTGCCAAAAATTGGTAAGCCTAATTTAGGCCACAAACCAAACCAGCCCTAAAATCTCTTTGATTTGTTCATTGCCTTTGAGATGTTTGTACTTTCAGCCTTTGGTATATTGTCAGTAGTTTAAACTTAGTGATTTGCTTGAATGTGGAGATTGTATATGCCTGTGTATTTGGTGACGCTTATCCTATTCTGATTAATTACCATTGCTTTTATTTGTCCGGAATGAACTGGTCGCTGAGTTTAGTGGTTATGTAAAATCTGTTATTGGAGAAGTGTGCACAATAGTACCTTTGATTTAATTTTTTTTCAGTATATGCTAGAAAAATTGTACCATTTGTTGTGTTATGCTTTTATTGATTCAGTTATGCTGGTTTGTTTAGTTATGCCAATGCCTGCAAGTGTTGAACAAACTGTACCATAGGGCATAGAGCACTATTAATCATTCCCCCAATCAATGCAGGCCGAAACAGACAGAGAGGCGGGTGGTAACAAAGGTGTGTCAGATAAGCAGATACGACTGAAGATCTACTCACCAAATGTTCTAAACATTACGTTGGTTGACTTGCCTGGGATAACTAAGGTGCCAGTTGGTGACCAACCAACTGACATTGAGGCCAGAATAAGGACCATGATATTGTCGTATATCAAGCACAAGACATGTATCATCTTGGCTGTTTCGCCAGCAAATGCAGACTTATCGAATTCTGATGCTCTTCAAATTGCTCGAAATGCTGACCCTGATGGTATTCACTACAGACTCAATCCATTAGATAATTCATGTTAATATATTTTGTTTCTTATTAATAATTGATTCATTGTTCTTGTAGGTTCTCGAACAATTGGTGTTATAACAAAGGTTTGACCCTGGTCTTGAGTTTTTTGTCTGGATTAAATAAGCATTGTGTTCATACCAGTGACCCAGTTTGATCTTGGCTTCACTTCTATTATCTTCCAGCTGGACATAATGGACAGGGGCACAGATGCTCGTAACTTTCTGTTGGGAAATGTGATTCCATTACGACTAGGCTATGTTGGTGTGGTAAACCGCAGTCAACAGGTACTGCATTCTGGTCATTCTCATGACTTCGTGAGCGAACTCATTCTGTATGTCTGTATGATAACCATAGCTTCCAGATGGTGTAGCTGTCTAGCATCAGCCTGCTGATTGTTCATAAAATAATGGGTAACAAATAGAGATGTGTATACTACCTTGTGATTACAAACTTGTCCTAGTAGTTTGTAGCATACCAAGGATGTAATCCTCCATAACCTGGACAAATGCTTTTCCATTGTAGTGCTAAGTTTAGTGTTATTAGATTTCTATTATATAGTTTTCTCGGCGATGCAGGATATCAAATCAGATCTCAGTATCAAGGAAGCTCTGGCGCGCGAAGAAAGTTTCTTCCGTAATCATCCAGTAGGCTGCAATGAATTTTGTTATTACTTTAGTGCTTATTTTCTTCTTACATGTTTGTGAAATGCACTTTCCTTGACTTTTTAGGCGTATAATGGTCTTGCTCAGTACTGTGGTATACCACAATTAGCAAAGAAGTTAAACCAGGTATTTATGTAATTAAATTATCAGTTGTAATCAATCTGATAACTTTCATATTTCTGTTGTGATTTAAACGAAAATACATCTGTATGTTTCAGATTTTGGTCCAGCATATAAAGACTGTTCTGCCAGGATTGAAGTCACGTATAAGTTCTCAATTGACAACTACTGCTAAGGAGCTTTCCTTTTATGGTGATCCAGTCGAGTCCAAGGTGGGGTTTGAATTAAAAAAGAAATTTTGTGCAAGTGTTAGAAGCATAAAATTTGTTTGAAATGTTTTTCAACAATATTACCTGACTTTTTTTATTTAGGGCTTAATGAAATCAGGCCAATTCATCTGTGTTCTCAGCTAATTTTTTGTCCTCTTTGTTGATGGTCCATCTGTGTTTCTTTACTGCAGGCTGGTCAAGGTGCTAAGCTTTTGAACATTCTGGCAAAGTACTGTGAAGGTAATTTTTGAATCATGACTAACTGTGCTGGCAATTTTTAAATAATGGTCAATTGTGCCATTTAATACTGTGTATGATTAAAAGTCCTGTGTTATTTTTTGTATAAGTCTTATCATATACTACCTCTGTTTCATATTATAAGTCGTTTTGACTTTTTTTCTAGTCAAACTCTTTTAAGTTTGACCAAGTTTATAAAAATATATAGCAATATTTCCAACACAAAACAAACATATTATCAAAATATATTGAATGCTACATTTAATGAAACTAATTTGGTGTTATCAATGTTGCTATTGTTTTATGAACTTGGTCAAACCTAAAGAAATTTGACTAAGAAAAAAAAGCCAAAGCGACTTACAATATGAAACGGAGGGAGTGTGTCTATTCTTTTGTTTAAGCTGTATGTGATAAATTGTGCCATTTTAAGTTGAAACATTTTTATGTTATAGCTTTCTCCTCGATGGTGGAGGGAAAAAATGAGGACATATCAACAATTGAGCTTTGTGGTGGAGCAAGGATCCATTATATTTTTCAATCTATATATGTAAAAAGCTTAGAGGTTCGTGATTTTGTTGCATGTTCAATTACAACCTTTTCATTATGTTGTACCACATCATTGTTCTATAATGAAGTTATAAAACTTTTTACACAGGATGTTGACCCTTGTGAAGATGTTACCGATGAAGACATCCGTATGGCTATACAGAACGCAACTGGTCCTAGGAGTGCATTGTTCGTACCTGAGGTATACCATCCCACTTTAGGAAGAACGATTGTAAGAGTAATTCATGGATGATGGCCAGTTAAGCTGACAATTTTTCCTTCGCTAACATTTCTCAGGTACCTTTTGAGGTCCTTGTACGCAGGCAGATCAGCAGATTGCTTGATCCAAGCCTTCAGTGTGCAGGTTTCATATACGATGAGCTAGTCAAGGTTAGACCTGACACCTTTTTTTGCCACTTGTCTGGCATTGCCGTATGCTAATGCCTAGTATATCTTTGTGGATATGCTTTTTCTTAATATGCCACTTGCACTTTTGATGCATCTATCTGGTTCACCTCACAGCATCAACTAACATTCTGATGTATTGTTGCTCTGTTACTTCTTGAACTGACAATTTAAGTTTTTGTGTAGATGAGCCATCGCTGTCTTGCTGTTGAGCTGCAGCAGTTTCCTCTGCTCCGTAGGAGCATGGATGAAGTCATCGGGAGGTTTTTACGGGATGGGCTTAAGCCTGCGCAGGATATGATAGCACATATCATTGAGATGGAGGTAATAATTCCTCATCATGTTGGATATTAATGGTTAACAAATTTCCTGGTAGCCATTGGAGTTTAGAAATATGCCACTAGCAATATTTGAATATAGTCTTCCATAAATAGTGCTGATTACTGACCCCCAGACCCACAATTTATGAAGTATGTAGAAACCAAGCTATTTCATCTAAGCTAGTGTTTGGGCCATTGATAGCTGATGTTTTTTTCCCCTGATTTACTCTTGACTTTGCATAGATATGCTATAATCTTTTTCATTGTCATAACCTGCAACTCTATTTTGGTTCAGGCGGATTACATAAACACATCTCATCCAAATTTCATCGGCGGCAGCAAGGCTGTTGAGCAAGCACAGCAGC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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA000233