BGIOSGA000423

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA000423

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000423, complete gene.

LocusTag

OsI_04583

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA000423-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA000423-PA

Length

14081

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:41230201..41244281

Sequence Coding Region

41244084..41244281,41242789..41242986,41242386..41242567,41242166..41242286,41241798..41242010
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,41240680..41240725,41240418..41240609,41239974..41240045,41238989..41239168
,41238507..41238658,41237982..41238111,41236882..41237028,41236099..41236223
,41235274..41235391,41234885..41235019,41234114..41234251,41233948..41234022
,41233485..41233847,41233297..41233361,41233165..41233216,41232326..41232412
,41232191..41232219,41230914..41231000,41230766..41230833,41230366..41230460
,41230201..41230236

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:41230201..41244281 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCCCGCCTCGCCGGAGCAAGCCGTGCGCGAGGTCGGCAAGCGCCTCGCGCAGCCACGCCTCGGCAAGGACGCCCTCGTCAAGCTTCTAAAGGCGAGCAGCGTCGCATCCTTGGTTTCGTCTTGCTTAAATCGGTCTAAATCAACCGCGCTTCCATTTCCGGTGGAACGTTGTTTCGATTTTCGAGCTTTCGAACTGCAAGCTGAAAGTGCTTTATCAGAGTTGAGTCAGTCCTCCTCTCTGCAGGAGGCTCTACATCCTCTGAGTAAATCTCTGGTCCAGACCACATTACTTACCCATAGGGACAAGGATGTCAAACTTCTTGTTGCAGTTTGCTTTATTGAAGTTATGCGTGTCCTTGCACCTGATCCACCTTTTAGTGATGAAATATTTAAGGAAATATTTAGGCTCTTTATCAGTGTATTTGCAGACCTTGCTGAAACTAGCAGTCCATACCTTCCAAGAAGGATTTTGATATTGGAAAATGTTGCTGCACTCAGATGTTCTGTAATTATGCTCGACGTTGGCTGTCAGGACTTGGTTCTTGACATGGTCAGGATTTTCTTCTCAGCAGTAAAGCAAGGTCTTCAGCAGAGTGTATGCCAGGCTATGCTATCTATAATGACCCAGATATTAAATGAAAAAGTTACTCAACCTCTCCTGGATGTGATTTTACGCAATTTAGTAAAAGAGGACAAGGGAGCATCCCACAAGCTGGCCGTTGACATCATCCAAAACTGTGCTGAGAAATTAGAGCCCGTTCTTCGTACTTTCTTGTCTTCGTGCATTTTCAACAAGGATGTGCCAGCTAATGAAACCAGGAAACAACATCATAAGATTATCCTGGAAATGTTCCAGTGTGCACCCCAGATGCTTTTTGCTGTTATTCCACACTTAACTCATGAGCTCTTGAGCGACCGTGTTGATATCCGGCTGGAGGCAGTTCACCTGATTGGGAGGCTTCTTGTATTATCTAATCTCCGGTTTGCTCAAGAAAACCAATTAATTTTTAAGGAATTCTTGAAGAGATTCTCTGACAAATCTGCAGAAGTAAGAATTGCTGCAATTGATGCAGCAAAAGTCTGTTACATGGCTATATCATCTGGAAATGAAGCAGAAGATATTCTTACATCACTTGCAGGCAGGCTATTGGATTTTGATGACAAAGTGAGGATCCGAGCTGTTGCTGCAGTCTGCGATATGGCCAAATCAAATCTAAACTCATTTCCTGCTAAGGTAATATTGCAAGCAGCAGGGAGGCTACGTGATAAAAAGGTATCTGTCAGAAAGCATGTAATGCTTAAGTTGCTAGACCTATACCGAGATTACTGTAAGAAATGCTCAAAAGGGATTGCCACAGTTAATTTTCACTATGAACAAATCCCAGCTCAACTTTTAACACTTTGTTTTGATAAAGATAGTGAAATATTCAGGCCACAGAACATGGAGCTTATACTTGCTGAAGAACTCTTCCCTTCATCACTTTCTCCAAAAGAAAGAGCAATCCACTGGGTTGAGTTCTTCTCTTATTTCAAACCACAGCATATTAAGGCTTTGCACATCATCTTTTCTCTGAAAAGAAGGTTGCAACTGGAGATGCAGGCATATTTATCACTTCGAGCAAAGAAGGAAGAGCCTTCAGATGAAATACAGAAGAAATTTTGTGCATCATTCAGAAATATGTCTGTTGCCTTTGCAGATGCCTCTAATGTTGAAGAGTGCTTAAAAAATTTGCACCAGCTGAAAGACAATAACATATTTAAGGATTTGACTGAATTAAGTTATGAGGGCAGCAGTTTTGCAACAGTCCAGTCGATAAGATATAGTATCTCAAAGAAAGTCAAGTTTGGGCAAGATTTTTTACATGGTTCTGCAACATCATCTCATCTACATGATTTATTTCTTAAGAGAATTGGTAACAAACACCCACTTTACAATTTCTGCAAAGTTCTGTCTGTAAAATGCTCACATTCAATATTTAATTGGGAGATGATCTATGCCATTCTGGAGGTTCTTTTCTCCCACAGAAATGAATTAACCAATCATGTGGAGGCTGCATGTGATCTTTTACTGCTAGTTTCAAAGGTGTTTCCATCATTATTCCAAGGCTCAGAGGAATACTTGATAAAGCTGTTCTCAGAAGAGTCGGTCTTGATAAATGAAAAGACACTGGAAATGTTGGCACACTTGGCAAAATCAGGATGCCATTTATCTATTGATTTCAGTGATGATGTCTACCCATTACTGGAGCAAAAGTGTATAGAAGGAACACGTGCTGAATCGAAGTATGCTGTCGCAGCAATTGATTCACTAATCCAGTCCCCAAATGACGAAAAATTTGCCAGATTATGTGAGAAAGTTGTTGCTGCTCTAGATGATAATTACAATGTACCAACACTATTACAGTCTTTGGGCTTGATATTGGAGCATTCCCCTTCTATGTATAAGTTATACGACAAGAAAATTATGAATTTTGTCCAGGATATTTTATGTTCAACTGAGATTTATTGTCTTAAAACTCTTGTCAAAAGTTGTTTACCAAGAAGCACAGTCCGTGATAGAATTGAGCATTTTCTGAAGATTCTGTTAGATATAATTCTTGAAAAGTTCAAGGCCATTACTCTATGTGAAAATGATAGGCCATATCTGAAACTGGCTGCTGGGAAATCTGTACTACAACTGGCTGCATTATGGGATTCACAAATTTCACCAAAATTATTTCGCAGTGTAGTTCTCATGGCAAGGGATTCTTCATATACTGTTCGCAAGTCATTCATCTGCAAACTCCATGACCTTATGATGGAACATGCAATTCCTATTAAATATGCATGTGCTTTTGCGCTGGCATCAACAGATTGCTCCAGAGATGTTCGTACTGAAAAACTGCATATTCTCTCAAGAATAGGGTTGCTTATTGTCAAAGAACTTGATAAGCACTGCAAGATATCAGATTCTCCACGTCACTTTCCCTTGCCCTCATCTTATTTCAGAGTGTCTGGTAGCGCAAGAAAAACAGATGAATGCTGTCAAGGAGATCTCATTAGTGACAGTTTTGTAAAGAGAATCCTTGGGGCTCATGGACCAGTACACCCGGATGATACAAAATGTTCTGATAATGCTGAGAGGGTATCAACAGAAGTTGCTCCTGACAAGGAAGCTCGTTCCTCATTAAGCAACATCGTGGGACAAAATGCAAGTTGTCATGATAAAGGCAAAAGGAACAAAAAACAGGATCAGACTACTAATCATAGTTTGGAAAAAGAGAAGGTGTCATCTTGTGGTTCTGCTGGCACGAAGTTGTCATCTCCAGCCTCTTTGGGTTTAGCTAAGGAAGCTGATTCTATAGACAGCATCTCTCTCTTAGAAAACCAGAATCGTCCAGAGAGTAGAAGCTCCACTGGGGAAACTAGAGCTTCGGAGACAGATCATAACTATTCTAATCGCCGAGAAACTGTGATGAAAGATACAGGCACGGTGCTTGTTGGGTGTCGCATTAGATTGTGGTCAGCACGTGATATGTGTTATATCTGTGGAACTGTTGAGACATATGATCAGTCAAATGGCTTTCACAAGATTATCTATGAAAACGGCGATAAGGAGTTAGTGCGCTTGGAATGTCAGAAGTGGGAATTCATTAGTGACACAATTTCAACAGTAAAGGACATTCCCAACTCCCATCCCAGATGCTGTTCTTTCAAGAGAGTTCGTGGGAAGGGTTCAGCTGATTCTCAAAACAAAAGGCAAGAGATGTTGCTTCCTGGCTCTTCTATTGTCTGTGATCCTGATGAAGATGGTGATATTGACGACAATTTTGTGAAGCAACCTTTTTCAAATAACAGAACAGGAGTCGCTGGCCTCAAGAAAAACAGCAAGAGAGCGTTGGATTCGAGTAATGCACAGACCAGCTCTGGATTAACTGCTTTTAACCCGGTAGATAACGTTCGGTGTACTAGATCAAGGAAGGTGCAACTGTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPASPEQAVREVGKRLAQPRLGKDALVKLLKASSVASLVSSCLNRSKSTALPFPVERCFDFRAFELQAESALSELSQSSSLQEALHPLSKSLVQTTLLTHRDKDVKLLVAVCFIEVMRVLAPDPPFSDEIFKEIFRLFISVFADLAETSSPYLPRRILILENVAALRCSVIMLDVGCQDLVLDMVRIFFSAVKQGLQQSVCQAMLSIMTQILNEKVTQPLLDVILRNLVKEDKGASHKLAVDIIQNCAEKLEPVLRTFLSSCIFNKDVPANETRKQHHKIILEMFQCAPQMLFAVIPHLTHELLSDRVDIRLEAVHLIGRLLVLSNLRFAQENQLIFKEFLKRFSDKSAEVRIAAIDAAKVCYMAISSGNEAEDILTSLAGRLLDFDDKVRIRAVAAVCDMAKSNLNSFPAKVILQAAGRLRDKKVSVRKHVMLKLLDLYRDYCKKCSKGIATVNFHYEQIPAQLLTLCFDKDSEIFRPQNMELILAEELFPSSLSPKERAIHWVEFFSYFKPQHIKALHIIFSLKRRLQLEMQAYLSLRAKKEEPSDEIQKKFCASFRNMSVAFADASNVEECLKNLHQLKDNNIFKDLTELSYEGSSFATVQSIRYSISKKVKFGQDFLHGSATSSHLHDLFLKRIGNKHPLYNFCKVLSVKCSHSIFNWEMIYAILEVLFSHRNELTNHVEAACDLLLLVSKVFPSLFQGSEEYLIKLFSEESVLINEKTLEMLAHLAKSGCHLSIDFSDDVYPLLEQKCIEGTRAESKYAVAAIDSLIQSPNDEKFARLCEKVVAALDDNYNVPTLLQSLGLILEHSPSMYKLYDKKIMNFVQDILCSTEIYCLKTLVKSCLPRSTVRDRIEHFLKILLDIILEKFKAITLCENDRPYLKLAAGKSVLQLAALWDSQISPKLFRSVVLMARDSSYTVRKSFICKLHDLMMEHAIPIKYACAFALASTDCSRDVRTEKLHILSRIGLLIVKELDKHCKISDSPRHFPLPSSYFRVSGSARKTDECCQGDLISDSFVKRILGAHGPVHPDDTKCSDNAERVSTEVAPDKEARSSLSNIVGQNASCHDKGKRNKKQDQTTNHSLEKEKVSSCGSAGTKLSSPASLGLAKEADSIDSISLLENQNRPESRSSTGETRASETDHNYSNRRETVMKDTGTVLVGCRIRLWSARDMCYICGTVETYDQSNGFHKIIYENGDKELVRLECQKWEFISDTISTVKDIPNSHPRCCSFKRVRGKGSADSQNKRQEMLLPGSSIVCDPDEDGDIDDNFVKQPFSNNRTGVAGLKKNSKRALDSSNAQTSSGLTAFNPVDNVRCTRSRKVQL</aaseq>

Gene Sequence

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