Os08g0500100
| Gene Name |
Os08g0500100 |
|---|---|
| Description |
Similar to Peroxisomal targeting sequence 1 receptor (Fragment) |
| Version |
NM_001068688.1 GI:115477113 GeneID:4345945 |
| Length |
9198 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0500100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:24773293..24782490 |
| Sequence Coding Region |
24773389..24773505,24775121..24775249,24775320..24775476,24775584..24775777,24775915..24776163 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:24773293..24782490 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:24773293..24782490 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgatgcggcacctcatcaccgggcagggcaactgcgcgccggacggggcgtcgtcgtccaaccccttcgggaacctcgccaacgccatcttcggccagtcgtccaaggcgcagtcaataaaggaacttccagggtctgcagttaatgttccaacaacatctgaattagggacagctgctcccttatcgaccatccctggttcagagaatgagttcaagcaagatcaactgccacttgcacggggcgctgatttcatccgtgggggtccttctcatgattgggttgaatcttttcggcctccaggactcccagaatttgctgtgccagatgcacagcttaaagaatttgagcaaatttttaacagcacagggccaacctttggaccaccagtcatggatggtccaccacaaagggtcttatctggtgtcctacgttctttcctagcaagtggtcaagctggtgtgccatttcaacctgttccagtaccagcgcttggtttgtctgaaagtgacaagcaatgtatacgtgatcgtagttgcattatggcacgccacattttggctgaccagcctgaagaatatatccaagcacaggtaaacacattgctgcattcacttgatatcgacagtaattatcgaatgaaaggacccatgcacggaccatacccagagatggaggagtattggaatcagtcccaaagcgccatgagatctggtccaatgcacaatgctgcagacaaatggataactgagtttggcaagcaaaataataaccctgaagagtgggctcattcttttgagcagcaatatggttccaatggttgggcctctgagtttgaacagcatcaatctcagatggccatgacaggaggaatgaatatggcaaacctggcagccatggaacaatctcgtatgcttgcacagacattagctagtaataatgacccaaaatttcagaactctaagttcttccagtttgtttcaaagatgagccgtggtgaacttattatagaagataatcaagtaaaacaaggttcagcatcccaatccagtggctgggctgatgaatttcaaacccagtacaatgctaatgcaaactcttgggcggatcagtttgttcatgaagagatgtcacaaggagcagataagtgggctagtgagttctctactgagtataatcagggtggcctcaacgagaactggattgatgagttctccaaaatgcgtgttgacgatgaatgggcagaagagttcagtggaggaacatttggtgaaagctctgctgatccatgggtagatgagttccagaaccaattatcagcttccaaacagaattctggtgcatctcgaggagtttatgttttttcagacatgaacccatacgttggtcaccctaatccaatgcaggaaggccaggaactgttccgcaaaggcctcctaagtgaagctgttcttgctttagaggctgaagttttgaagaatcctgataatgctgaaggttggagactacttggagtaacacatgctgaaaatgatgatgaccaacaggcaatcgcagcaatgatgcgtgcacaagaagctgatccaacaaacctggaagttcttcttgcacttggtgtcagtcacacgaatgagttggagcagggagaagcattaagatatcttcataggtggcttcagaatcaccccaaatatgggggtatcgcccctccacagccaactgattcaccttatggtcctgatgttattagattgtttaatgaggctgcccaaatgtcacctgaggatgctgatgtccatatagttctaggagtcttgtacaacctatcaagagaatatgataaagctatagctgctttcaagacagcgctgcagctgaaaccacaagactattctctctggaataagctaggtgcgacccaagcaaacagcatccagagtgctgatgcaatattggcctatcaacaggctctggacttaaagcccaattatgtgcgtgcatgggctaatatggggattagctatgccaaccagggattgtatgaagactctattcgatactatgtacgggcggttgctatgaatccaaaagctgacaatgcctggcagtacttgcggatttctcttagtaacgcttcacgagctgacatgatcgctgcatgtgattcacgcaaccttgacgttcttcagaaagagtttcccctgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAMRHLITGQGNCAPDGASSSNPFGNLANAIFGQSSKAQSIKEL PGSAVNVPTTSELGTAAPLSTIPGSENEFKQDQLPLARGADFIRGGPSHDWVESFRPP GLPEFAVPDAQLKEFEQIFNSTGPTFGPPVMDGPPQRVLSGVLRSFLASGQAGVPFQP VPVPALGLSESDKQCIRDRSCIMARHILADQPEEYIQAQVNTLLHSLDIDSNYRMKGP MHGPYPEMEEYWNQSQSAMRSGPMHNAADKWITEFGKQNNNPEEWAHSFEQQYGSNGW ASEFEQHQSQMAMTGGMNMANLAAMEQSRMLAQTLASNNDPKFQNSKFFQFVSKMSRG ELIIEDNQVKQGSASQSSGWADEFQTQYNANANSWADQFVHEEMSQGADKWASEFSTE YNQGGLNENWIDEFSKMRVDDEWAEEFSGGTFGESSADPWVDEFQNQLSASKQNSGAS RGVYVFSDMNPYVGHPNPMQEGQELFRKGLLSEAVLALEAEVLKNPDNAEGWRLLGVT HAENDDDQQAIAAMMRAQEADPTNLEVLLALGVSHTNELEQGEALRYLHRWLQNHPKY GGIAPPQPTDSPYGPDVIRLFNEAAQMSPEDADVHIVLGVLYNLSREYDKAIAAFKTA LQLKPQDYSLWNKLGATQANSIQSADAILAYQQALDLKPNYVRAWANMGISYANQGLY EDSIRYYVRAVAMNPKADNAWQYLRISLSNASRADMIAACDSRNLDVLQKEFPL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>97..213#1829..1957#2028..2184#2292..2485#2623..2871#3151..3264#4357..4527#4887..5059#5333..5579#6001..6085#6356..6465#6708..6932#7840..7905#8386..8480#8735..8813#ccctcccacaaagccaccgcgacgctgcacgactcctctctctctcctcgacctcgacctcgaccggaacgcctctcgccggcggcggcggcggagatggcgatgcggcacctcatcaccgggcagggcaactgcgcgccggacggggcgtcgtcgtccaaccccttcgggaacctcgccaacgccatcttcggccagtcgtccaaggcgcaggtaaagcttagccctagccctagtcacttgctctctactactactggccttttgctcgcggttcggaggcttggctgtggctggttgatggttggggatggatcaattccggcgccgtttaggtcgctcccctttcctctcctccgcgatgtgattgtttggtggaaacgacgcaatttcgtttgactggtcttaaaagttaaaacggaagtaattcgatgtatgtttgtgtactgttggtttggtctggatgtatttagttactacttagttcgatcctgtgatgtttaggttggtgatcatgctgcttcatctgataaaattgtgcagtaagtgaattggtgggtgacagatggcctatcataattcacgacagcgagtggtagtatagatttccctgatttttggctagtttatttatctgtgtttcgtcatgtcgcctacctatgattctgtggggttttggcctagattggaactgaagttgcctgagcaattctggtgaagtagctgaaaagtacatgcctgttcctaaagtgttggtacaattcagtgctttccatgatccatgtaagtagatcatgaggtgtctctaaatagtgaaacttagtccatttagttaaactagtgtgggacaaggattgtgcatggttggcccgcgtcaacccctagtttatctttacctcttttacaagtcttaataagagctcttttatggtgcacctatgattcctgtagctgtaagaaccatatggtaatcatggccattcatctctgaaggtcaattttggcataaatactactaaccaactggaaacagttagcccttcatggaacaaaagggatgcacttgcaacgctctaaatgtgattaatcacttcccttaagccaacatttgcattacacattgacaccctagacacaactgatatatgtatttattccattatcagccggattgcaaatatatgcaatggagattgtccatgaatattgtacaatattttcaacgctttttatggttaaaacatcacaagaaattagactgtttctggatgattccaattcaacttccaaggaagtaggaaagatacatttgttttattctttcattcgaactaaaaaattgtcatcattagcagaaaaatgcatcttaaaacatcacaagagatttcatgctaaagtgtgaaagacagatttgttttattctttcatttgaactaaaagattgtcatcatcgacagaaaaatacatcttaaaacaccacaagaaatttcatactgattccttttcttagatgtatgttgaggagaaacttacctactccaaggtagtaataaccataggtgactaatttacctcctaggtagtaataggtcattttcaattctagccactatataattgcaaatggatgttccaaatataagtggtgtaccttaaaaagttaaaagttaaatcctccagacaataatgcttatgggtctataatacaatgaagcggaaatttgggattacgctgttctaatgtaataaagtagaaagttggggtgattaacatccagattgcattaataatcaagctaactttgtatgtgcccttttctttgtgcagtcaataaaggaacttccagggtctgcagttaatgttccaacaacatctgaattagggacagctgctcccttatcgaccatccctggttcagagaatgagttcaagcaagatcaactgccacttgcacgggtaatggtcattcggtttgctgcttttggtgcccttttgagcatttctaactataattgaacacctctagggcgctgatttcatccgtgggggtccttctcatgattgggttgaatcttttcggcctccaggactcccagaatttgctgtgccagatgcacagcttaaagaatttgagcaaatttttaacagcacagggccaacctttggaccaccagtcatggatggtagatttgtagtttttgttctttccaatttattttattgttgtttatatattcatcacttgataacatactgaagcacattatactgactcccaaaattggttcaggtccaccacaaagggtcttatctggtgtcctacgttctttcctagcaagtggtcaagctggtgtgccatttcaacctgttccagtaccagcgcttggtttgtctgaaagtgacaagcaatgtatacgtgatcgtagttgcattatggcacgccacattttggctgaccagcctgaagaatatatccaagcacaggttaacttataatttttgttacctcagtgaatatgctaaagcacttgcatttgtgtttcatttcattagattgttgcagtggcttcgtttttatcttctctgctgtgacctaatttgacacttctcacctgtaccaggtaaacacattgctgcattcacttgatatcgacagtaattatcgaatgaaaggacccatgcacggaccatacccagagatggaggagtattggaatcagtcccaaagcgccatgagatctggtccaatgcacaatgctgcagacaaatggataactgagtttggcaagcaaaataataaccctgaagagtgggctcattcttttgagcagcaatatggttccaatggttgggcctctgagtttgaacaggtcagagccttatgcatgggctatttgatattttcacatgtaccatttggttaacttcatggatattaactaattgtctaattttattttatatttacaatgggtgtaaaacaaagttatataattttgtgataagctatgtccgttatcatgtttagatatcatcctttccctagcatgtgcagcatatttacaatgggtgtaaaacaaagctatataattttgtgataagccttctaggatttgtgatttaagttatctatttttgtcttgttgcagcatcaatctcagatggccatgacaggaggaatgaatatggcaaacctggcagccatggaacaatctcgtatgcttgcacagacattagctagtaataatgacccaaaatttcaggtatgtatgatgatttgatttgtttatttaactctattaggtctgtatactttcattttgaatgggtaaattttaaatattttagctggtgagaaaaaaatctgcttgagcaacaactcatcctaattattttcaacagtgaagggtataacttccctttgatattttctgcttatgatcttatctacagttgtatgtagttgcaacttggttggggtgaccaatgtaaactttactaggataaacctaaatgtgtcttgttgggctcaatatcgatatgaatccattaggattaagtttactgatcttgttacctaaatcaccataaattgacatataatctagagtttccacgctacttattttattactacgaattccaaccaatttatgtgccccacgattgtggaattgcacataacaggtttaatagtgtgaatatattgatataccactttgctaatgaattgggtccattgatatcttattttatgcacatctcacttgaaataactttttctatgtcatccagtgtactttaggaagcttctggcattttactttttacaaacaactcgtcatttgttaaccccgataggttgtgaagactcattagtttaaaaacttgtgtgcatgcaggtctgtagaataccactcaatatagaacactcaatggaagaggtttctgtttgacaaagttttttccttttctcaatgctatttctgtcagcataaaataagagtgaaaggggagactctactagacgtgctgagatgagatggtgtagtgggcattgttgctatattatttgctaatgcgtcctaggacaccacattgatatgttgtgccattctgcagttctgcacatctgtggtttaataccaactttagttgattctgaacctcatctcagctggctatactgctagcaactttgttatgctatagggtcatttggatcagcctgtctcaactctcaagcacctgatgataccttttgtttcttttttggaagaactctaaattcttccagtttgtttcaaagattcgccgtggtgaacttattcttttgttttacttttttctggaagaactctaagttcttccagtttgtttcaaagatgagccgtggtgaacttattatagaagataatcaagtaaaacaaggttcagcatcccaatccagtggctgggctgatgaatttcaaacccagtacaatgctaatgcaaactcttgggcggatcagtttgttcatgaagaggtaatgcagagagctggatgtgtgtaaatacatgcttgatggggatgtggttttctttggtcaacataaacaaaaactgataaaactatagaagtactggtaaattgtggtgtttataacatggaaccttgctttgtaagtttatgttctgataaatgagtaatataaatatacaataaaattgttggaatatgttcattctgttcatacttgcagtccagttactggagtttctgattggataatattgccattaatacaattcttccggtgctacaccatgtttgactgtataaatattacactgatactgctgcttgtgcactgatgatgtggcatcacttacttttattctccagatgtcacaaggagcagataagtgggctagtgagttctctactgagtataatcagggtggcctcaacgagaactggattgatgagttctccaaaatgcgtgttgacgatgaatgggcagaagagttcagtggaggaacatttggtgaaagctctgctgatccatgggtagatgagtaagtacaaatctcttttccttgttttgtcatggctatctcttcaaggttgaaatgtgttgcttctgatatgtttccacaccaatcattagaccagacagaataccataagaatatcaaatcttctttgatccaatatcttgtctttttgggttaattataggcaaccataaagttccctttttatcaatcatgtaccatgttctatttgacagaagccttttttttttcttcatcagttacacttacacatgctctgtttgtgccttttaggttccagaaccaattatcagcttccaaacagaattctggtgcatctcgaggagtttatgttttttcagacatgaacccatacgttggtcaccctaatccaatgcaggaaggccaggaactgttccgcaaaggcctcctaagtgaagctgttcttgctttagaggctgaagttttgaagaatcctgataatgctgaaggttggagactacttggagtaacacatgctgaaaatgatgatgaccaacaggtgattgtgtctctcccactgaggatatatgtagatgtaaattaccatgtgctgattattttcaacttttcattattagtttttcagcacaggtgcactgcatgcttgtgtgcatcacttgttttcatcacatgttttattagaatattttttttatgaatcttttttcggtaggagcatgcagtgtgctggatctcaatagaaattacgtgaattatgctctatcaagtttttgcatacccttgcaagaacttcataaactgatatatatggaatttgaacggacgaacccatactattgtctgtcatgaaattatggtttatttttagctaaattttaagcaccatgtgatatggcattatgatctatgagttccatgcttatgtttaacacaaggagatgctattactttgctttcaggcaatcgcagcaatgatgcgtgcacaagaagctgatccaacaaacctggaagttcttcttgcacttggtgtcagtcacacgaatggtgagtgcatggtaattcagtgtccggcataatctactaagatgctcctgaaagaaatgaagcggcataaattatggttagaagtaacgaggtttcctcattgatacaagcttttaagttttaaacaactagataaagctaatttatctttgagggggcaaaggtctatttccttctagcattaacttaatattctaaaatttagttctaacaggttctatgccttgatgctttttgtatacatttgagggttctatataattgatgcagagttggagcagggagaagcattaagatatcttcataggtggcttcagaatcaccccaaatatgggggtatcgcccctccacagccaactgattcaccttatggtcctgatgtaagtgcatcccatctgttccataatgtaaataaataataatggcatcttcaccttccaaatggtatcctgcacagatgttctagatgtatgctctagagttctgttggtctgcggtccttttatttttcttcaagtttttttttcctgtcaccccatactgtttgtcatgtatgatatgttttctgatatttctaaaaaagtcatttcgttttgtcactaagcagtttacctctgatcaggttattagattgtttaatgaggctgcccaaatgtcacctgaggatgctgatgtccatatagttctaggagtcttgtacaacctatcaagagaatatgataaagctatagctgctttcaagacagcgctgcagctgaaaccacaagactattctctctggaataagctaggtgcgacccaagcaaacagcatccagagtgctgatgcaatattggcctatcaacaggtaattagttattgtaagatattttatttttcagctttggtgaatgtttcgctataagtgctatagcgtatttacatatctctactactgtaaaagcagagccgtcctcctatcccaccattgtacatcccacataaaaaagaaacaccctgccttaaaaaaccccacttacattatccaccagaaaaaccagatagaaaaaactgaaaagtctgtattccttccaatcccattgtaactcatgggaactagtctggttgaagaagtacagtgctttgtctcgatcatgctgtgtagaatagctacttcatccactctttcattgggctctggttattcctttcggacgatgtttatggcagttgcattcacttgtgtgtgaactgcaaatctaacaggatataattcgtggctggcaataatccatatatgatgtgtatctggaccttttggatttttatttggaaaaaaaatatgacctttaccctctggcggtctgtccattcctctatgggtacccaatttcagtataattcatagtaagagtgcattcagttcaagctatgtgccgcatccctgtacttctagcattacagtaaaaccaatcaattctaatcaaactgtttgcttaggtagcattagtgttgtaataccattggtttggtgtccaatcctgctgagtacagacacatcttcacctagcattagtgttgtaataccattagggaggaaccttcacttattttgctggtacaactatccttttacggcttggtctactgcagtcctgcaagtgtagaacttgttgatgaatctccaatttagagaaaattgtgtaatacaagtatcctagcactttatggtatgtaaatctggaactaatataatcaattgctgctggtttcaggctctggacttaaagcccaattatgtgcgtgcatgggctaatatggggattagctatgccaaccaggtaattcttctctaacatgatgctaccacttgataacaccattagttcggtaattgtatttttaacaaaataattgcagtttcaacaatttccttgcatgcaagtacaaaaccatatctcaatgttgtttatcattgtctgtcagcattattcatttactcaactaacttgcaaaccatcatttttatgagtgagcttgtatgcttccacttgtttgcttttcataataagatgttggctatcatggtttccactcgattctgaaaagatcttcaagtttttgtgcattggatatccacctaaatactaccatccattcaaagcctcggtaatattaatgttaactgttgatttacagagcataataaaggatgagtacaaatatatattatatatccaatgatgccacggcctagctcaaatatcttttattcaaagtggcaacagagatgtaataccccagctttccgtgttatgcagggattgtatgaagactctattcgatactatgtacgggcggttgctatgaatccaaaagctgacaatgcctggcagtacttgcggatttctcttaggtatgtcttgttaattatctatgagatatttgaagttccttggaggatactagagatacatttatttcaaaagaacatcaattgtcgctcacttttaagtactcataacttgcaagtactcaagaaacattgcaaccagttgatattccaatttgagtacatctagaactttccaagcacgttaaatcatttctttgtctacctaaattcaacgctgatttaattgactaacatttttctcttttaaaaaccagtaacgcttcacgagctgacatgatcgctgcatgtgattcacgcaaccttgacgttcttcagaaagagtttcccctgtgagtccaaacattctaggcattgcacttgctcctcaggcccgcccccatgataaagggtacaaggaagtagagaactagcgaaatgggggctgcacattttggaatgatgaaagtgcaaaatggcagtggccgttgtgttgtggttttcggttcgtgtatacgaattgttcattttaacaaggcgcgacatgtatataaaattcaagatgggcacccattcttccgtaggtgtgggaaacgcaaagcagaaggcagttgtcacatgtaattctgtacacagagagggaaagaataaaagaatatcgaacgaatatgtcaaaaggaggcaacacgttcttgtaattttctacagaaaataaagtggtagcaggtttcactgtttcagc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |