Os09g0439000

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Gene Name

Os09g0439000

Description

Sterile alpha motif SAM domain containing protein

Version

NM_001069806.1 GI:115479354 GeneID:4347162

Length

5386 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0439000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:16905884..16911269

Sequence Coding Region

16905884..16906031,16906389..16906492,16906870..16907081,16907157..16907262,16907368..16907481
,16907562..16907779,16908199..16908262,16908344..16908697,16908971..16909129
,16909848..16911269

Expression

GEO Profiles:Os09g0439000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgccggcgaaccccaagctcgcggcgaagccctcgccgtcgccgccgaccgccgccgcagccgcctcccggccgaaagccacagccaaacctcccctcggtgccggataccgcgacaacgacgacgacgacgacgatttccagagccctccccgtgccagcagccgcgccgcccgcgcgttgaagccctccggtaatggcgcggcctcgcgccgccccagcaagaggttgaagccgtcgtcctcgtgttgctccgggaaggagaaccgtccagccgccgccggtagtggcagggctcccgctgggagggccgcctcgaagggcgcgggggttggcgaaaccctaggtgtcgtctcgagggttagcagcggcgttccaggcggggacaaagcgaggggcggaggaatttgcggcctattgaggtgcggatctgatgactttagttcagtttctaatgggaagaaaggattggatagatattggcgtcgcgatggaggtttgcattctcgccccaatccgatggattccacggtttcgatgccggatgccacatgtgatttggaaaatgggggttctcaagtggcgcaaatgctcagctccaatgaccgtatctcagttcagttggaggggaacgctaaggtggagttgggaaagtctgaatctgaccctacgactatgcggaaggaacggaatggctctggggcttgtgaaagtgatcatcctgcaagattgatcgagccgaggcttctgacattggttacaaattgtgattttggaggtgcagactccatggattcaaaagagcttggttcagcgattcatccctctgtttccaaagataggaatgtggagaacgaatctgggggggcatctgtatgtacatttgcacttcataacaggaattgccactcgagttgtgttgaatccgaacttgagatgttgaatgcgaagtatgatttgggtcctcgtgattgcaaggaaagccaagagggtccgggactttgtagcttgatttctgaagagaggacagttgcggcagaaggtgatgcaactttcacattcgaggaaagggggaacacatcaagtggacttgaggcttgtaaggggagtcactgcttggatccagttgaaccaaagcttatggactcatgtgcaacacatgcacttgaaggtgatggttgtgatgattttgagatcggaacacaacttaatgagctcataaacttgtgcatggaggattacacggagggtcctttgagcaacaaggtggcttgccttgaagggaatggaatggattgtgggagttttaattcatcttgtgaagtgcaatgccctttgtgtggatcaaatatttctgacttaagtgaagagctccggctggtgcatactaacagttgccttgatggagataaacctgctaaggaaccgaattccgataaccaaaatgaaccctgcggtgaaagcaatgttgaaaagaggcgtgttatggaatggttaaggaatctggggctatccaagtatgaggagatttttatcaaagaagaagttgactgggaaaccttgcaatggctcacagaagaggatcttctaggtatggggataacctctcttggtccaagaaagaaaattgcccatgctctatgcgagttacggaagaaaaacaatgatgccaatgatttggctgctgatatgttaaatttggagaataccaagaaggctaaaattccaatgaatggaaacaaattaattacggagtactttcggtgtccatcatctgatcaaagacaaaagaaagcatgtaaagtcaacacaccatctaatttgaatagccagaaaaaatccaatgctaaggccactggtggaaggcgtactgttaaaggaaaggttaaagatacacctatttggtgttgtatcccagggaccccttttcgagtggatgcttttcgctacttgagaggagattgctgccactggtttctgacacactttcatgtagaccattaccaaggcttgacaaaaagtttttgtcatgggaaaatatattgttcatcagttacagctaatcttgtacattataagattggtatcccatgggatcgattacatgtattgccactcaatgaaaagattactatcgcaggagttaatttaacatgttttgatgccaatcattgtcctggagcagttattattctctttgagccatctaatggtaaagctgttctacacactggagatttccggttttcttctgagatggcaaacaatcgtgttttgcagtcttctcctatccacactctaatacttgacacaacctactgtaatccacgatacgacttcccaactcaagagattgtaatacagtttgttatcgaggctatccaagctgaagctttcaatccaaagacactttttttgattggcagctatacaattggtaaagaaagactgtatatggaggttgctcgtttgcttcagaagaaaatatatgttggagctgcaaagttgcaaatattaaagcacttggggcttcctcaggaaatcatgcactggtttacagccaatgaagctgaaagtcacatacatgttgttcctatgtggactctggcaagcttcaagcggatgaagtatttgtccactcaatatgctgatcggtttgaccttatagttgcattttgtccaactggttggtcatttggtaaagggaagaaaaggacaccaggcagaaaatggcaacaaggagcaataatcagatatgaagtgccctacagtgaacatagcagcttcacagaactccgggagtttgttaggttcatctcaccagagcacataattcctagtgtaaacaatgatggccctgatagtgcaaatgccatgctggcccaattgttgaatgattag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPANPKLAAKPSPSPPTAAAAASRPKATAKPPLGAGYRDNDDDD DDFQSPPRASSRAARALKPSGNGAASRRPSKRLKPSSSCCSGKENRPAAAGSGRAPAG RAASKGAGVGETLGVVSRVSSGVPGGDKARGGGICGLLRCGSDDFSSVSNGKKGLDRY WRRDGGLHSRPNPMDSTVSMPDATCDLENGGSQVAQMLSSNDRISVQLEGNAKVELGK SESDPTTMRKERNGSGACESDHPARLIEPRLLTLVTNCDFGGADSMDSKELGSAIHPS VSKDRNVENESGGASVCTFALHNRNCHSSCVESELEMLNAKYDLGPRDCKESQEGPGL CSLISEERTVAAEGDATFTFEERGNTSSGLEACKGSHCLDPVEPKLMDSCATHALEGD GCDDFEIGTQLNELINLCMEDYTEGPLSNKVACLEGNGMDCGSFNSSCEVQCPLCGSN ISDLSEELRLVHTNSCLDGDKPAKEPNSDNQNEPCGESNVEKRRVMEWLRNLGLSKYE EIFIKEEVDWETLQWLTEEDLLGMGITSLGPRKKIAHALCELRKKNNDANDLAADMLN LENTKKAKIPMNGNKLITEYFRCPSSDQRQKKACKVNTPSNLNSQKKSNAKATGGRRT VKGKVKDTPIWCCIPGTPFRVDAFRYLRGDCCHWFLTHFHVDHYQGLTKSFCHGKIYC SSVTANLVHYKIGIPWDRLHVLPLNEKITIAGVNLTCFDANHCPGAVIILFEPSNGKA VLHTGDFRFSSEMANNRVLQSSPIHTLILDTTYCNPRYDFPTQEIVIQFVIEAIQAEA FNPKTLFLIGSYTIGKERLYMEVARLLQKKIYVGAAKLQILKHLGLPQEIMHWFTANE AESHIHVVPMWTLASFKRMKYLSTQYADRFDLIVAFCPTGWSFGKGKKRTPGRKWQQG AIIRYEVPYSEHSSFTELREFVRFISPEHIIPSVNNDGPDSANAMLAQLLND</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5239..5386#4778..4881#4189..4400#4008..4113#3789..3902#3491..3708#3008..3071#2573..2926#2141..2299#1..1422#atgccggcgaaccccaagctcgcggcgaagccctcgccgtcgccgccgaccgccgccgcagccgcctcccggccgaaagccacagccaaacctcccctcggtgccggataccgcgacaacgacgacgacgacgacgatttccagagccctccccgtgccagcagccgcgccgcccgcgcgttgaagccctccggtaatggcgcggcctcgcgccgccccagcaagaggttgaagccgtcgtcctcgtgttgctccgggaaggagaaccgtccagccgccgccggtagtggcagggctcccgctgggagggccgcctcgaagggcgcgggggttggcgaaaccctaggtgtcgtctcgagggttagcagcggcgttccaggcggggacaaagcgaggggcggaggaatttgcggcctattgaggtgcggatctgatgactttagttcagtttctaatgggaagaaaggattggatagatattggcgtcgcgatggaggtttgcattctcgccccaatccgatggattccacggtttcgatgccggatgccacatgtgatttggaaaatgggggttctcaagtggcgcaaatgctcagctccaatgaccgtatctcagttcagttggaggggaacgctaaggtggagttgggaaagtctgaatctgaccctacgactatgcggaaggaacggaatggctctggggcttgtgaaagtgatcatcctgcaagattgatcgagccgaggcttctgacattggttacaaattgtgattttggaggtgcagactccatggattcaaaagagcttggttcagcgattcatccctctgtttccaaagataggaatgtggagaacgaatctgggggggcatctgtatgtacatttgcacttcataacaggaattgccactcgagttgtgttgaatccgaacttgagatgttgaatgcgaagtatgatttgggtcctcgtgattgcaaggaaagccaagagggtccgggactttgtagcttgatttctgaagagaggacagttgcggcagaaggtgatgcaactttcacattcgaggaaagggggaacacatcaagtggacttgaggcttgtaaggggagtcactgcttggatccagttgaaccaaagcttatggactcatgtgcaacacatgcacttgaaggtgatggttgtgatgattttgagatcggaacacaacttaatgagctcataaacttgtgcatggaggattacacggagggtcctttgagcaacaaggtggcttgccttgaagggaatggaatggattgtgggagttttaattcatcttgtgaagtgcaatgccctttgtgtggatcaaatatttctgacttaagtgaagagctccggctggtgcatactaacagttgccttgatggagataaacctgctaaggtgattcttctatgtatttggaaaattaaaaattgttgtgatctagtgtaatgaccgtgataattattgctgctgaattgttaccttgttagaaagctcaaagacaatcatatggtaaccttaggcacaattttgcttcttgaaatttcccggttggccttcagttattcctctgcatgaggatcatgttagtatgtttattcactgggttctaatcattgttgtgacgatttttgtgtgtccatcattaagttcttatctgggacaatagatgaatacatcttactacatagtatatactaatagtattcattgtgaatattttgcatcaataagaatatatgatatttttgcgggaatataagcagtggtgaacctatgtagtcctacccggggtcactggatcccgggtagatgattcaatcctagcttaatttatgccgtgttaactagtatatcactcaataattagatgattagtatgtattgccgtattagacctccataatttttattttgggtttgccactgaataagaatataagattgatgctaccatactatggatacatttctaatttctatccttataaagtttagttgagaatggagacaatagcaattatataattcttatgttatttaatagtttccttttccttactatggaatcaacaaattatcatattttaagttttttgaattatctctgttccaggaaccgaattccgataaccaaaatgaaccctgcggtgaaagcaatgttgaaaagaggcgtgttatggaatggttaaggaatctggggctatccaagtatgaggagatttttatcaaagaagaagttgactgggaaaccttgcaatggctcacagaagaggtaatttcctgtggttttgttgatatggaggtttgtttgtcaagtatagagcttaagttatgggacctacttgtaaattggagattaacattgaccatttgcataactgcgtggatttcatgctagttgatttgttctagttaatgtgtcaaaagatgctcgcgttccttcaacatcttagttttttttggcataactggttggtgcatcgatctacacagcttttctggtttccaatgaaaaaactaacttgttgctgcctatgaattgcaggatcttctaggtatggggataacctctcttggtccaagaaagaaaattgcccatgctctatgcgagttacggaagaaaaacaatgatgccaatgatttggctgctgatatgttaaatttggagaataccaagaaggctaaaattccaatgaatggaaacaaattaattacggagtactttcggtgtccatcatctgatcaaagacaaaagaaagcatgtaaagtcaacacaccatctaatttgaatagccagaaaaaatccaatgctaaggccactggtggaaggcgtactgttaaaggaaaggttaaagatacacctatttggtgttgtatcccagggaccccttttcgagtggtatgatttgttttcaataggctgaaccttacattattcttcgtatgccatcaggctccgtaactgaatatattgctgcaggatgcttttcgctacttgagaggagattgctgccactggtttctgacacactttcatgtagaccgtaagtccaagttctttgttatcgaagagtcaatacaaactgaagaacgaaagaaatatataaagtgtttccttgagtttccattaatgaagacttagccattttttttgtctgacttgctattgaatcatttactgctacctccatcccataaagacttcatttttggctattaaccttgacaaagacttgttgtctaggttcatagccagaaatgagtctttttgggacagaggcagtacatcaatttgacattctagcatactacaagaagtggcatgtttgcatctcattgtttgttccctctatctttagctgtacttatctagtgaaataattagtttccacttttctttcttcgtgctaggcaggtttgcctgatgttttaatatctaaaacaaatgactttctgttcacagattaccaaggcttgacaaaaagtttttgtcatgggaaaatatattgttcatcagttacagctaatcttgtacattataagattggtatcccatgggatcgattacatgtattgccactcaatgaaaagattactatcgcaggagttaatttaacatgttttgatgccaatcattgtcctggagcagttattattctctttgagccatctaatggtaaagtaagtgttgttctaagttgcttcatcatctattcagcataactacttaacatgccatgtttctttacttgctcttttaggctgttctacacactggagatttccggttttcttctgagatggcaaacaatcgtgttttgcagtcttctcctatccacactctaatacttgacacaacctactgtaatccacgagtatgtttatcgcctagctgtatcagaagtgtttcccaagtttataattgacatggtcaggctatcatgtggcctttacataatccaaaaaaaaatgttttgcagtacgacttcccaactcaagagattgtaatacagtttgttatcgaggctatccaagctgaagctttcaatccaaagacactttttttgattggcagctatacaattggtactgtctctgtgtctcatctttgatattctggatattgtagtgggtatatacataaatcgttcatggatgcaggtaaagaaagactgtatatggaggttgctcgtttgcttcagaagaaaatatatgttggagctgcaaagttgcaaatattaaagcacttggggcttcctcaggaaatcatgcactggtttacagccaatgaagctgaaagtcacatacatgttgttcctatgtggactctggcaagcttcaagcggatgaagtatttgtccactcaatatgctgtaagaaaagtacttgatcctaccttcgtttgtaagataggggttttagcttgtttgatatgtccctattaatctgatgagttaatttaagaaaatcatggtctttaaagttgaagttgctatttctactccacctaaggataaggactaagatctgagcatcagagcatatatttgtaatctggctctttaaaattctggattgatacaatacctctgtgttccttttctaatgattagtcacattcttttggactaactagctaaagctgagaccttgttctaaacctgaatatccgtgcattagtcttcatatgttctgtttgcttctgaagttgccatttattctgattttctgatggctatattacttacaggatcggtttgaccttatagttgcattttgtccaactggttggtcatttggtaaagggaagaaaaggacaccaggcagaaaatggcaacaaggagcaataatc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External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0439000, RefSeq:Os09g0439000