BGIOSGA001008
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001008 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001008, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_03304 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001008-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001008-PA |
| Length |
11280 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:31536155..31547434 |
| Sequence Coding Region |
31547347..31547434,31545543..31547254,31544686..31544746,31544361..31544457,31544170..31544272 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:31536155..31547434 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:31536155..31547434 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGTGGTGCGTCGTCGCTGTGGATGCTAACCATTGCCCCGGTGCCGTTCAATTCCTCTTCCGCTCATCTGGACCAAATGCGGAGAGATACCACGTACTGCAATCCCAAATTTACGTTTCCTCCACAAAAGGAGTCACTGGAGTATGTCGTGAACTCAATCAAGCGGGTGAAGGAGGAGAGCAGAGCATCTGGAGAGCGCGTGCTGTGTTTGATCGCGACCTACGTGGTGGGCAAGGAGAGGATTTTGCTGGAAGTTGCACGACGCTGTGGCTGTAAGATCCATGTGGACAGTAGGAAGATGGAAATCCTGACTCTATTGGGGATTGGTGGGGAGGATGGAGTTTTTACTGAGGATGCTGCAGCAACAGATGTGCATGTCACTGGGTGGAATATTTTAGGTGAAACATGGCCCTATTTTCGGCCAAATTTTGTGAAGATGAAGGAGATCATGGTGGAGAGAGGATATAACAAGGCTGTTGGATTTGTACCGACCGGTTGGATGTACGAGACCAAGAAGGAAGGCTTTGCAGTTAGAACAAAGGATTCACTTGAGATCCATCTTGTGCCTTATAGCGAGCACTCGAGCTATAATGAGTTGCGGGACTACGTGAAGTTCTTGCACCCAAAACGGGTAATTCCAACCGTGGGGCTTGATGGTGGAAAGCTCGATAGTAAAGAGGCATTTGCTCTGCAGAAGCATTTTGCTGGTTTGGTGGATGAGACAGCAAACAAACAGGAGTTCCTGATGGCATTCCAACGAAGCTCAAGAAATGCTACTCTTGGCCCTGAGGATGCAGTTACTGGATTGAGCCAGCAAGAAGGGGAGGTGCAAGAACTGGAGGAGGCTACTTTGTTACCTGCAAGTTTGGCTTTTGAACGATCAGATAGTTTTCAAGAGAAGATTACAGTGGAAATGAAGAAAGAATTATCAGATTTCCTACCCTCATGGGTCAGCCAGGACCTGATCCTGGACTTGCTAATTAAGTCAGCCGGTGATGTTGTTCAAGCAGCAACTGATTTTTTTGAGAAAGAAAGAGATTTCTTTGAGGAAGCAAATGTTTATAATAGTGAAACGCCTAAGTCAGAGATAGATCTCTCTTCTGATCATGGATCTTCTGCTGATGCAAGTAGTCAGCAAGAAGTTCCTTTATTTTCACAGAAGCCCATGGATCATTCTAGTAAGTTGCTGAATTTGAACGCTATGAGAATGAAGTCAAATCTTTCTAAAAGGGAAAGGAAGAGGGGCTCTAATTCTGCGGACAAACCAAAAAAGAAAGGGCGGTCAACTTCCTTTAAACCCTTGACAGAATCCAGTGGGCGCAAACAGTCCACAATTACGAACTATTTTGCTAGAACCATGCTAGCTGCTTCTAAAAGCGATACATCCGATAAAGTAACTGTAGACGCAAATCAAAACAATGTGAGGAATGACGACCAGTTTACTGAAGTTGTAGAGTCAGAGAAGCAGAGTGTAAGCCAGCTTCTTCAGATTGTCGATGGTGGAATGTCCAGAGAGTCTGCAATTTCATTGCTTGAGAAGGCAAAAGGGGATGTGAATGTAGCAGTTGATATATTTTACAGTAAAACCGACAACAGTAATGTACTTGAAAATGATATGAATATTGTCACACAAAACACAGAAAATGAAATGACAGACAATCTAGTAGTACGGGCTTGCTTCGCAACTCTTCTGAGGCCACTCCAAAGATGCCGAACTTATGTGTACAATCTTATGTGGCACAAGCAGATTCAGTCTGTATATCATTGCCAATTGAAAAGTATCTACCGATCGAGCATGGAGGCATTAGGATCCAGCAGATCTAAAATACATGAGATGTACAAAACGTTCGGCGATCTTGGTGATGTTGCCCAAGAATGCCGCCAGAATCAAATGTTACTTGCTCCTCCTCGTCCCCTCTCAATTCGCGATGTGTTTTCCACACTTCGCAAACTAAGTGGGATAGCAGGTAGTGGGAGTACTGGAAGGAGAAAAATTCTTGTCTTGCATCTTATCCGTTCTTGCAGAGAAATGGAGATGAAATTTCTTGTTAGAACACTGGTCCGTAACTTGCGTATTGGGGTCATGATGAAGACAATTTTACCTGCACTTGCACATGCTGTTGTTATAGATGGAAAATATTCAAATAGTCCTGTGCTATCTTTGGAAGGCATAAAACCACAATTACAGGAACTTTCAACTGAAGTTGCTGAAGCATACAATGTCATTCCTAATCTTGATTTGCTTATTCCCTCTCTCCTGAGAGAAGGCACTGCATTTTCAGCCTCGTCCTTAGCAATGATAACTGGCACCCCTATCCCACCTATGCTTGCAAGAATTACTAACGGGTTGACTCAATCACTGAAATTGTTTAATGGTAGAGCATTTACCTGTGAGTACAAGTATGATGGTCAGCGAGCCCAGATTCACAGATCAAATGATGGATCTGTGCAAATATTTTCAAGGCAAATGAAAGAGTCAACCTCTCGATTTCCTGATCTGGTTGGCATGATCAAAGAGCTGTGCAGCATCGAAGTATCCAGCTTTATACTTGACGCCGAGGTTGTGGGAATCGATAGGAAGAAAGGAAACAAACTGATGTCATTCCAAGAGCTGTCTTCAAGAGAGAGAGGGAGCAAGCACTCCTCAATTGCAATTCAGAACATAAAGGTAGACATTTGTGTGTTTGTTTTTGATATCATGTTCTGCAATGGACAAAGCCTATTGAACTGCTCACTTCGGCAAAGAAGAAAGTACATCCACGACTTGTTCCAGGAGAAGCCAGGACATTTTGAGTTAGCTCAGCAACTTACTGTAGAAGCAGATGAAGCTTCTGTGGATAATTCTACCACTTTGGAGAGAATGAACACCTTTTTCAAAATGGCATGCCAGTCTTCTTGTGAGGGTATTATGCTGAAAATACTGGATGTTGATGCTGGATATTCTGCTTCCAAGCGCTGTGATTCATGGTTAAAGGTTAAGCGTGACTATGTTGGCTTGGGTGATAGCCTGGACTTGGTTCCAATTGGCGCATGGTATGGAAATGGTCGGAAAGCTGGATGGTATAGCCCTTTTCTTATGGCGTGCTACAACCCTGAATACGAAGAGTTCCAAAGTGTCTGCCGCGTTATGTCTGGTTTCTCAGATGAGTTCTATAAAGAGCCACAGCCTGCAGCCACCCTTGCCGACTGCCGCAGGTGCGCCCAACGGCCAGTGGCTGGCGGACTTCCGCTGCTCGACTGCTCCGCCTGTCGATGTGCCACCTCCCGCTCGCCCATGCTGTCGCCTGTCGTCACTCATCAGCTGGACGCCGGCTCGACGCCGCCAATCGCGCGAGATGGGGAATCAATGGAGATGATGAAGGAGTTCTATTCTGGCGACAGAATACTGCCCAAGAAACCTGTTTACTACAAAACAGACGAGCTTCCGGAGTTGTGGTTTTCTGCGGAACAGGTTTGGGAAATCCGAGGTGCAGACCTCACGCTATCCCCTGTTCACCATGCGGCTATTGGTCTGGTCCATCCGTCGCGTGGGATCTCAGTGAGGATGCCGAGGTACATACGCTCTCGTCCAGATCGGAGTCCAGAGGATTGTAGCACGGCTACTGATGTTGCTAGCTTGTTCAAAGCTCAGACCCGGAAGATGGAGGTCAGCAGCGATGGCCAGGACACAAGTCACTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGGASSLWMLTIAPVPFNSSSAHLDQMRRDTTYCNPKFTFPPQKESLEYVVNSIKRVKEESRASGERVLCLIATYVVGKERILLEVARRCGCKIHVDSRKMEILTLLGIGGEDGVFTEDAAATDVHVTGWNILGETWPYFRPNFVKMKEIMVERGYNKAVGFVPTGWMYETKKEGFAVRTKDSLEIHLVPYSEHSSYNELRDYVKFLHPKRVIPTVGLDGGKLDSKEAFALQKHFAGLVDETANKQEFLMAFQRSSRNATLGPEDAVTGLSQQEGEVQELEEATLLPASLAFERSDSFQEKITVEMKKELSDFLPSWVSQDLILDLLIKSAGDVVQAATDFFEKERDFFEEANVYNSETPKSEIDLSSDHGSSADASSQQEVPLFSQKPMDHSSKLLNLNAMRMKSNLSKRERKRGSNSADKPKKKGRSTSFKPLTESSGRKQSTITNYFARTMLAASKSDTSDKVTVDANQNNVRNDDQFTEVVESEKQSVSQLLQIVDGGMSRESAISLLEKAKGDVNVAVDIFYSKTDNSNVLENDMNIVTQNTENEMTDNLVVRACFATLLRPLQRCRTYVYNLMWHKQIQSVYHCQLKSIYRSSMEALGSSRSKIHEMYKTFGDLGDVAQECRQNQMLLAPPRPLSIRDVFSTLRKLSGIAGSGSTGRRKILVLHLIRSCREMEMKFLVRTLVRNLRIGVMMKTILPALAHAVVIDGKYSNSPVLSLEGIKPQLQELSTEVAEAYNVIPNLDLLIPSLLREGTAFSASSLAMITGTPIPPMLARITNGLTQSLKLFNGRAFTCEYKYDGQRAQIHRSNDGSVQIFSRQMKESTSRFPDLVGMIKELCSIEVSSFILDAEVVGIDRKKGNKLMSFQELSSRERGSKHSSIAIQNIKVDICVFVFDIMFCNGQSLLNCSLRQRRKYIHDLFQEKPGHFELAQQLTVEADEASVDNSTTLERMNTFFKMACQSSCEGIMLKILDVDAGYSASKRCDSWLKVKRDYVGLGDSLDLVPIGAWYGNGRKAGWYSPFLMACYNPEYEEFQSVCRVMSGFSDEFYKEPQPAATLADCRRCAQRPVAGGLPLLDCSACRCATSRSPMLSPVVTHQLDAGSTPPIARDGESMEMMKEFYSGDRILPKKPVYYKTDELPELWFSAEQVWEIRGADLTLSPVHHAAIGLVHPSRGISVRMPRYIRSRPDRSPEDCSTATDVASLFKAQTRKMEVSSDGQDTSH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..88#181..1892#2689..2749#2978..3074#3163..3265#3690..3818#4237..4284#4771..4868#4970..5035#5606..5765#5868..5975#6505..6554#7068..7102#7218..7276#8714..8875#8981..9066#9153..9252#9992..10186#10647..10764#11075..11280#ATGGGTGGTGCGTCGTCGCTGTGGATGCTAACCATTGCCCCGGTGCCGTTCAATTCCTCTTCCGCTCATCTGGACCAAATGCGGAGAGGTATGTCCACACGGGCGACTTCCGGTTTTCGCAGTCTATGATAACCGAACCTAATTTGCTGGAGTTCATCGGTGCTGATGCTGTGTTTCTAGATACCACGTACTGCAATCCCAAATTTACGTTTCCTCCACAAAAGGAGTCACTGGAGTATGTCGTGAACTCAATCAAGCGGGTGAAGGAGGAGAGCAGAGCATCTGGAGAGCGCGTGCTGTGTTTGATCGCGACCTACGTGGTGGGCAAGGAGAGGATTTTGCTGGAAGTTGCACGACGCTGTGGCTGTAAGATCCATGTGGACAGTAGGAAGATGGAAATCCTGACTCTATTGGGGATTGGTGGGGAGGATGGAGTTTTTACTGAGGATGCTGCAGCAACAGATGTGCATGTCACTGGGTGGAATATTTTAGGTGAAACATGGCCCTATTTTCGGCCAAATTTTGTGAAGATGAAGGAGATCATGGTGGAGAGAGGATATAACAAGGCTGTTGGATTTGTACCGACCGGTTGGATGTACGAGACCAAGAAGGAAGGCTTTGCAGTTAGAACAAAGGATTCACTTGAGATCCATCTTGTGCCTTATAGCGAGCACTCGAGCTATAATGAGTTGCGGGACTACGTGAAGTTCTTGCACCCAAAACGGGTAATTCCAACCGTGGGGCTTGATGGTGGAAAGCTCGATAGTAAAGAGGCATTTGCTCTGCAGAAGCATTTTGCTGGTTTGGTGGATGAGACAGCAAACAAACAGGAGTTCCTGATGGCATTCCAACGAAGCTCAAGAAATGCTACTCTTGGCCCTGAGGATGCAGTTACTGGATTGAGCCAGCAAGAAGGGGAGGTGCAAGAACTGGAGGAGGCTACTTTGTTACCTGCAAGTTTGGCTTTTGAACGATCAGATAGTTTTCAAGAGAAGATTACAGTGGAAATGAAGAAAGAATTATCAGATTTCCTACCCTCATGGGTCAGCCAGGACCTGATCCTGGACTTGCTAATTAAGTCAGCCGGTGATGTTGTTCAAGCAGCAACTGATTTTTTTGAGAAAGAAAGAGATTTCTTTGAGGAAGCAAATGTTTATAATAGTGAAACGCCTAAGTCAGAGATAGATCTCTCTTCTGATCATGGATCTTCTGCTGATGCAAGTAGTCAGCAAGAAGTTCCTTTATTTTCACAGAAGCCCATGGATCATTCTAGTAAGTTGCTGAATTTGAACGCTATGAGAATGAAGTCAAATCTTTCTAAAAGGGAAAGGAAGAGGGGCTCTAATTCTGCGGACAAACCAAAAAAGAAAGGGCGGTCAACTTCCTTTAAACCCTTGACAGAATCCAGTGGGCGCAAACAGTCCACAATTACGAACTATTTTGCTAGAACCATGCTAGCTGCTTCTAAAAGCGATACATCCGATAAAGTAACTGTAGACGCAAATCAAAACAATGTGAGGAATGACGACCAGTTTACTGAAGTTGTAGAGTCAGAGAAGCAGAGTGTAAGCCAGCTTCTTCAGATTGTCGATGGTGGAATGTCCAGAGAGTCTGCAATTTCATTGCTTGAGAAGGCAAAAGGGGATGTGAATGTAGCAGTTGATATATTTTACAGTAAAACCGACAACAGTAATGTACTTGAAAATGATATGAATATTGTCACACAAAACACAGAAAATGAAATGACAGACAATCTAGTAGTACGGGCTTGCTTCGCAACTCTTCTGAGGCCACTCCAAAGATGCCGAACTTATGTGTACAATCTTATGTGGCACAAGCAGATTCAGTCTGTATATCATTGCCAATTGAAAAGTATCTACCGATCGAGCATGGTTAGTGCCTACCCTCCTTATGGTTCTTAGCATCTTGCTTGACAGTGAGTAATACCATGTATGTGATCTTCTACAGCTTGCTGGACAGCAGGACAGCCTGCACCATACTTACATTTGGCTCGCACTTTTGATCTTGTTGAAAGAGAAAAGGGAAAGATCAAAACTACTGCCATGCTTTGCAACATGTTCCGAAGGTTTTTCCTATAACCCTCTAAGTTACATTGCGTGCAGTTTTTGATTATCATCTATATGTTTATGATTGGGGAATATACTTAACATCTTATATTCTCAAGTGCAGTTTGCTTGCCTTATCACCTGATGATGTGCTACCTGCTGTTTATTTATGTACTAATAAATTTCTCCTGACCATGAAAATATGTAAAGTGTTTTATGTCCTTCACTTTTCCCTTCCCCCTATTTACTGCTCTTTGCTTCTTTCTAAAGCTTTATTTGAAATATGGGACTTCCTGGAGGAACATGGATGTAGGTGTCCTACAAAATCCCTGTGAGGATACTATGTTCCAACAGGCTGAAATTTTCTAGCTGCATTTCAATTAGGATAAGTTGATGCTTTTTCTTAAGTTGAAATTTTCTTAATTAGCTGGCCCTTTCCTTTGGAAGGCTTTCTTTCTTTCATTATTTTCTAATGAGTAACTGTGTCATGTCCTATTATAAATATTTTGGTTTACCCTTCTGTTATGCCTTGTCGTGTGGCACAATCAATACAATAACCCATATTTGTTAATGAAGCTAGGAACTAAACATTGGTGGGAGTTTGGTTGTATCTGCTCTGGAGGAGGCATTAGGATCCAGCAGATCTAAAATACATGAGATGTACAAAACGTTCGGCGATCTTGGTAAGTTTGGAGGTTAGAAGTACCAGCATTGTCGATGTCCATGGTGTGGGGAAAAAAAATTACTGTATGGTGTAGGCTGTGTCTTTGCAAAATAGGAGTTTGATGCATGCATGCAACATTTGGCAGGCTTACGGCCAGGTCCAACTGCCTTGTTTAGCTTCATGTACTGGTTAATTATGCTGAAATGATCCTGTGTAGTGTTAACAGTGGATGTAGTGTAATTTGTAGGTGATGTTGCCCAAGAATGCCGCCAGAATCAAATGTTACTTGCTCCTCCTCGTCCCCTCTCAATTCGCGATGTGTTTTCCACACTTCGCAAACTAAGGTATTACTGACTAACTTACATACGCTATCAACATCTGGAGTTCCTTTAATGACAATCTCCTTTATTTCATCATAATTTTCATTATCAGTGGGATAGCAGGTAGTGGGAGTACTGGAAGGAGAAAAATTCTTGTCTTGCATCTTATCCGTTCTTGCAGAGAAATGGAGATGAAATTTCTTGTTAGAACACTGGTAATGCGCCTTTCTAACTGACAGTTTCTAATTTTATTTTGAGGCTGTTGTATTGCATGGACTGTACATTTTTTTTATTTCATATGCAGATGTGATTATCTTCCTAATTTATCTTCTCAATTGATTTTATTCGACTATTGCTTTTTTATGGACAGTTCATCTACTTACGCACTCAATATTGTTATTAAAATATGATATCTGACTCTCCATATTCAGAAATGTGGTATATAACGAAATTTGCATGTCAATTGTATTATTCATTTTGTTGCTACGATAGTACCATTTGTCTTTTATAACAATCCTACGCCTATTAAGTTAAGCGTATAATTCAATGTTCAACTGATCTCAACTTATTAGAATTACTACGGACAATAACTCATGTTATAATTTATTTTGCTCTGTTGTATGTGTGTTTTACCAACAGGTCCGTAACTTGCGTATTGGGGTCATGATGAAGACAATTTTACCTGCACTTGCACATGCTGTTGTTATAGATGGAAAATATTCAAATAGTCCTGTGCTATCTTTGGAAGGCATAAAACCACAATTACAGGTTTGTCTACCTAGCATGAATTTTCTTTTGTGCAACAATATCTGGGAGTGCTTGATGTTGTTCATAAGACATAAGCTCTAAAGGCCCAAAAGTTGTGAAAAGGTAGTTTAAACTTAATGGTGATGGTGCTTAAGCTTTCCTGCTAAGCCCTCTGAAGCAGCCTACTTGATAGCTTTACTGAATTTTTAAAGATCCTTTGAAGCTCCTATTCTGTTATTAACTAAGGACATGTGGAGGTTTCTCTCTTATCCCTAATAATAAAACATTTTTTTTCCAAAAAATGGAGGAAGCTAAATTAATCAAGGCCAAAAAAACTGAATTGTCCCTTTCCTTGTTCTTGTGATTATTTCTATACCTACCATAGGGAATTTTACAATTTTTCTGGACCAAAATGTTCTTTTTCTTCCTTTTTTGGCAGGAACTTTCAACTGAAGTTGCTGAAGCATACAATGTCATTCCTAATCTTGTGAGTAATCAAGCCTATTTCATTTGATATATCATGGTGCATGATCTAATTACTGGCTTCTATCCTTCTCAAATCTGTCGATATCTAGCTTTCATTGCCAGAAAATTAGACCCTCCATAAATGAAGTTTGTGGATTTATCAAATTAATAAGTAATGGCAACAACAATTTTCCGCAGTATGTGCATTAGAATATTGAAACACAAGATTATATTATTGAATTTCCCTCTGTAGTACTTGGTCCTTGCACCCTGACTTTTTTAAAAGGTAATAATGTGGTGTCTTTTTGAAGTTATTATCTCCCTTTAGTACTTGACAACATAGTGATCATTAGCCAATCCACGTGCTTATAGAGATTGATGCATGTTATGGCCTGGATATTCTACAGAATTGGAAAAAATACTAATATTGTGAACTCTTTACATCAGATAATGATTGGATAAACTCAATCAAAAAGGCATTTACCTGTTTAGTGACATTATTTAT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