Os08g0509400

From RiceWiki
Revision as of 13:07, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os08g0509400| Description = Similar to Amygdalin hydrolase isoform AH I precursor (EC 3.2.1.117)| Version = NM_001068737.1 GI:115477211 GeneID:43...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os08g0509400

Description

Similar to Amygdalin hydrolase isoform AH I precursor (EC 3.2.1.117)

Version

NM_001068737.1 GI:115477211 GeneID:4345996

Length

6786 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0509400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:25348155..25354940

Sequence Coding Region

25348422..25348587,25350820..25350928,25351268..25351370,25351493..25351523,25352829..25353425
,25353779..25353865,25353992..25354070,25354197..25354272,25354354..25354412
,25354588..25354648,25354773..25354940

Expression

GEO Profiles:Os08g0509400

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008401:25348155..25354940 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008401:25348155..25354940 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>agctcgatcgtcggcagccaggctaatcttgccatggatcgtcggctccttctctctgctctactgttcatcgctctggcttgcagctccaaccgcgtccatggcgcactcaacaggcacagcttccccgaggggttcctcttcggcaccggcacctccgcgtatcagtacgagggtgctgtcgacaagcgaggtcagaacatctgggacaccttcagccgcattccaggtaaaatcgcagatggtagcaatgcagatatagcgaatgacttctatcatcggtacaaggaggatttgaacctcatcaccgcgatgaacatggattccttccggttctccattgcatggagcaggattttaccaaatggaaccattagtggaggaataaacaaagaaggggtcgaattctacaacagcctcatcaacgaggtcatagctaaaggactgaagccttttgtcacaattttccactttgacactccacaggctttggaggataaatatggcggcttcttgagcgaaaacatcgtgaaggactacgtggattatgcggacctttgcttcagcctgttcggcgaccgcgtgaagctatggaacacgttcaacgagccgacgatcttctgcatgaacggctacgccaccggcatcatggcgccggggcggtgctcgccgtacgcgtcggcgtcgtgcgccgccggcggcgactccggcagggagccgtacgtggcggggcaccacctcctcgtcgcccacgccgaggccgtccgcctgtacagggccaggtaccgggcggcgcacggcggcgaggtcggcatcacgcaggtgtcgcactggttcgagccgtacgacgccggctccgccgccgaccggcgcgcgcggcggcgcgccctcgacttcatgctcgggtggttcatgcaccccgtggcgcacggcgagtacccgccggcgatgaggaggctcgtcggcggccggctgccggcgttcaccgccgagcagtcggagatgctcaggggttcgttcgacttcatcggcctcaactactacacctccaactacgccgtggccgcgccaccgcccaacaagctccacccttcctacctgactgacaattgggtcaacgcgacaggttaccgcaatagcatcccgattggtccaccggcttacacgccgatcttctttaactatccgccggggctacgcgagctgctgctgtacgtcaagaggagatacaacaatcccaccatctacatcaccgagaacggcactgacgaggcgaataacagcacgatccccatatccgaggcgctcaaggacgagacgcggatcggcttccactacaagcacctccagttcgtgcacaaggccatccaggagggtgtgaaggtgaagggttactttacatggacgttcatggactgcttcgagttcggcgatgggttcaaggaccggttcggcctcatctatgtcgaccgcgccacgctcgcgaggtttcgcaagaagtccagctactggttcgcggatttcctccgtcgatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>SSIVGSQANLAMDRRLLLSALLFIALACSSNRVHGALNRHSFPE GFLFGTGTSAYQYEGAVDKRGQNIWDTFSRIPGKIADGSNADIANDFYHRYKEDLNLI TAMNMDSFRFSIAWSRILPNGTISGGINKEGVEFYNSLINEVIAKGLKPFVTIFHFDT PQALEDKYGGFLSENIVKDYVDYADLCFSLFGDRVKLWNTFNEPTIFCMNGYATGIMA PGRCSPYASASCAAGGDSGREPYVAGHHLLVAHAEAVRLYRARYRAAHGGEVGITQVS HWFEPYDAGSAADRRARRRALDFMLGWFMHPVAHGEYPPAMRRLVGGRLPAFTAEQSE MLRGSFDFIGLNYYTSNYAVAAPPPNKLHPSYLTDNWVNATGYRNSIPIGPPAYTPIF FNYPPGLRELLLYVKRRYNNPTIYITENGTDEANNSTIPISEALKDETRIGFHYKHLQ FVHKAIQEGVKVKGYFTWTFMDCFEFGDGFKDRFGLIYVDRATLARFRKKSSYWFADF LRR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6354..6519#4013..4121#3571..3673#3418..3448#1516..2112#1076..1162#871..949#669..744#529..587#293..353#1..168#agctcgatcgtcggcagccaggctaatcttgccatggatcgtcggctccttctctctgctctactgttcatcgctctggcttgcagctccaaccgcgtccatggcgcactcaacaggcacagcttccccgaggggttcctcttcggcaccggcacctccgcgtatcaggttaattcaccaccgctccatctttgattcctacaccgcagcatcgaatcttttcaggttcttgctcagctcactcgccattgttcttcttgaacgattttctctgacatagtatgatgtgcagtacgagggtgctgtcgacaagcgaggtcagaacatctgggacaccttcagccgcattccaggtcatctttggtgctttgcctcgatatgtttcagagattatttgcagctaaattgtttgcagctaagcgcgttatcttgaacttagcagcagcatttgcggtcgagatgctaattaatcaaccaggaattattggatttgattgtaaaaagagcatgcttttttttctcttgcaggtaaaatcgcagatggtagcaatgcagatatagcgaatgacttctatcatcggtacaaggtgattccttttctgcttatgaggaatttgtaattttgtgtccgtttagttgagtccatggtaaattctgaaactgtgcaggaggatttgaacctcatcaccgcgatgaacatggattccttccggttctccattgcatggagcaggattttaccaagtcagtgagcatacaaacccaaagaattcgatttatcattagccattaccatcttgattatagctcaaccttatcattaagctggttttgaaattttttaactggtcagctgcttaattatttcagatggaaccattagtggaggaataaacaaagaaggggtcgaattctacaacagcctcatcaacgaggtcatagctaaaggcatgcaagtccattcttatctctttctttacatgtataaaaatataacatatttccttgatatctcatttcttaaagaaatttaaaaggaactcattttaccctgacaaatgttcatgcctgcaggactgaagccttttgtcacaattttccactttgacactccacaggctttggaggataaatatggcggcttcttgagcgaaaacatcgtgtaatttactccataaatcactatcactattcgctgctaattatttcatctattctaatatataaatatttctatccatttttcaaaacgtgtacagacgaaggaatgtctagatacatttttaaaaacacaaaaggaattaaaacgaagatagtaattaattaaccttgagctcgatggagaactcatgaacattcatattaaggttttgagttcaaatatctataggagcgaatttcagattaaattatttaaggggttaagttttcgatttaaaaggctatatatattccgttaaatgtagagaccaggtaaagaaaacctttcctaaaaatttttttaaaaatgaacaggaaggactacgtggattatgcggacctttgcttcagcctgttcggcgaccgcgtgaagctatggaacacgttcaacgagccgacgatcttctgcatgaacggctacgccaccggcatcatggcgccggggcggtgctcgccgtacgcgtcggcgtcgtgcgccgccggcggcgactccggcagggagccgtacgtggcggggcaccacctcctcgtcgcccacgccgaggccgtccgcctgtacagggccaggtaccgggcggcgcacggcggcgaggtcggcatcacgcaggtgtcgcactggttcgagccgtacgacgccggctccgccgccgaccggcgcgcgcggcggcgcgccctcgacttcatgctcgggtggttcatgcaccccgtggcgcacggcgagtacccgccggcgatgaggaggctcgtcggcggccggctgccggcgttcaccgccgagcagtcggagatgctcaggggttcgttcgacttcatcggcctcaactactacacctccaactacgccgtggccgcgccaccgcccaacaagctccacccttcctacctgactgacaattgggtcaacgcgacaggcatgcatacaaccccatctgttttttaagggcatttaacttttttttcactatttatgatgtgataattaagaatttaccactcatagcctataacatgtgtatttttatatgtctatgatatatgagttcataggcaaattcttaattgctacttataaaagtggcaaatagttaaatatcttgtcttttaagaccaccatatatacttcaagagaaaattttacgaatagtaaatctaaattttatactccctctccgtttcatattcatatatatatatatatatatatatatatgctaatgaatctatacacatatatgtctagatttattaacatctatatgaatatgaacaatggtaaaaagtcttataatatgaaacggatgaagtaatatacattaaaagatgtggtatattgtgataccgtcttaaggatgataaaatcatctatagttcaatgtccatgctttaatatggcggtagaaaaacaaccagaattgtttaaattgaatctaaaatgatgttattgtgctaatttgtatataatcagaaaaccaacttattcgtgtttatattagtaagattataagtaaagatccaaacacaattttgtatgaataataagttaatgatcatgagaataaaggaaacaacaaagatagtaattgtttttcttgttgggcactttttggttgcttgaggattggtcagaagttcatccactcatatcattatttaggccgagtttagttctaaaatttttctttaaactttcaacttttccatcacatcaaaactttcctacacacataaacttctaactttttcgtcaaatcgttctaatttcaaccaaacttccattttttgcgtgaactaaacacacccttaagagtcctactatattcccgtgcatatagaatagtggtgatggttggtggtagacccataaccgtcactaatagaatcttttaaaagttggatcaaccaaggcaaatctagataaaaatgtgtaatattctgtactacatttgttttttaatgaaacataggaagtacaatagtacacattaacttggggtgtgtttagttcacgctaaaattaaaagtttggttaaaattggaacgatgtgatggaaaagttagaagtttacgtgtgtaggaaagttttaatgtgatggaaaaattagaagtttgaagaaaaattttagaactaaactcggccttggttgaaatcgttgcagttaattaagatttgtgcgtgaaaagtttaacaaaaactcgttgttcgattcaattcgcaggttaccgcaatagcatcccgattggtccaccggtaggttgctcaaatgaatgaatgaatgaatgatttacgacgacaaatagtagagtggcttgtacagttgtactgtatcgagtctgtttaactgaactttcgccgtatctctgaatgatcaggcttacacgccgatcttctttaactatccgccggggctacgcgagctgctgctgtacgtcaagaggagatacaacaatcccaccatctacatcaccgagaacggtaacttatgtctgtttttttattcaggaaaagcagggagaatggtaataaatctcaacagtaacaatcaacagttctccagcagaatgagtactccattcgtctaaagataaattaatttttcacatatcccaaaggtatcaatactaaataaaaagactaggacacctctattttattaaattcaaatgtaattatttcttaatgtatttatccactgttttttataaacttcaatgttatgattacttaaaaacaaacctatttttaacaaacattaagattaaaaataatcttattgtaggacggtagaagtatgaatttgttgcgtacgtgcaggcactgacgaggcgaataacagcacgatccccatatccgaggcgctcaaggacgagacgcggatcggcttccactacaagcacctccagttcgtgcacaaggccatccagtacgagcgcattactcaacccatttttttttcaatatttttagataataatccggcatttatttcagctaaagttataaccacttattaaataaaactagaatagtggcccacgcgacgcgtgggcattcgtattgttaaaacatgatattatagattatttggaaattatatctcataagggtaaactataggctgggcatatctaaatatcattcatcgacttatatgataataaatcaaggtcatatgagttcgacttgtggataagtaagtaaatattatgtatactatctgaatacatactgtacactattgctataaacacaaactgtaatggtaagaaatttaaagttattgtgattgaatcgccttatgaggatgcgatttagtaacaaccaaattaagggtagattaacggttggattgttgtttcctttgtagaagttcaaaatgttcatatttttccacacatttaaagaattgaaggctttttatgttggaacacaaatcatctacacaattgcttggtttagtagtgcaaaaatatcagcaattatttgaagcttttttttgtttttcacatgttaaattgttttctttgaaataatatttgtttgaaataacagagaaattatataaattttattagtatgcggtttatcgacagtcatgatcactttggcaattacttttagctatctcgggtacgatgctttgtcatatgtgcagaaggcaaataagaacacgtgtgttgtgtagaggattgaagagaggtctttagaagtttttctttcattttttatgaaagatatatatgactgcctaactgattaataggtccatcagtttaagtgaaaattgatgggaaaatatttttattaaaaaaagtataaaacagtgggtccactaatttaagtatgaattagttattatagatcataaattggtaactaatggtataaaatatagttgtgtaacctttattttaaaccgtgtgtttttaaaataatggttctaaataaaattatattatattgttaatataatgggtaaaataatataatcctataaattttatttccaaatattatggatctaatttatttacatatatattaattatgatatatataatttatgtttataaagttataattctttaaaatttaatatcactaattatagttacgatctcatctatacatgtatggagaaaagaggggaggagatggaagcggatgtaatttttaatgatatatgtaacatatttttttttgtttttattcgtatggtacagttgtatacgtactttttggctttttttatgagccgtatgtaagtacctttctctcgtgcgctgagagagattaggtgtgaggttattaatagatttaatttaatgatccaatccactaatttaaatgaaaaatcgatgactagatgtttttcttttttttttctcagattttctagaattttttctaatctattaaagtgcattttagaaaaaatattaatagttaatatgtgtattgaattattaatttggttttctatctcatctaaccaagaagggaaaaagggggaaaaagagagtaagtatgtacgtgcacatatgtggaactttttgtacgtgcaaatctttcacagataaacataattagaaaatcttaagatagatataggtgttaactaaaaaaataggagtagttacctagaaaataggagaggaagagagaggctggagggagggagtacgtacctgcgcttgccgcatgcacgatggggatgagtaccgtattttttgtttgctaagagatctaatatggttaaaatatactggtccaccgatttaacggaaaatcaatggttaaaatatatgggtccaccgatttaacggaaaatcaatggctagatatttattagatttttcatgattttctatattttattagagtgccacgtggcgactagagagtgtttataggatgacacgtggtggtttaggagcgtttgtaggaagtttaatggacttttagtatataatagatagattagttcaaacatggcgacattcgaatatagatacatcccaaaataaaccaactttaattaacgtatcctccatattcgtagttctatatgaagtttgtttattttggagcgaaggaaatagtaatttcaattacttgatcaatgagtgtgacgagttattttcacttgtcacagggagggtgtgaaggtgaagggttactttacatggacgttcatggactgcttcgagttcggcgatgggttcaaggaccggttcggcctcatctatgtcgaccgcgccacgctcgcgaggtttcgcaagaagtccagctactggttcgcggatttcctccgtcgatgatgatgattcaaatgcttcaagctcctgatcgacagtgattcgatccgatctatatctccagtgtactcgatgaagctagcttcaggcagctgcctttttttttcttttttcttttaaaataagagagagaggcaaggctaggcaggcagctgatagaattaccaaacctgatgtgtgcagtgtgctgcccaaataattgccatgtgcatggaaaatgattgtgttttctcatggatattgatttgattactggtacagcgagatgtc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0509400, RefSeq:Os08g0509400