BGIOSGA001280
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001280 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001280, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_02720 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001280-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001280-PA |
| Length |
7009 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:26359714..26366722 |
| Sequence Coding Region |
26366087..26366722,26363156..26363293,26359714..26362542 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:26359714..26366722 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:26359714..26366722 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACGTGTTTAGATGCATCCACGTTCTAATAGCCTTAGCCTTGCTTTTGTTCACCCCAATCATCTCCAATGAGGCCTCAGCCAATGCCAATAGCACAGGTGGTTGTATTCCAAGTGAGAGATCTGCACTTATCAGCTTCAAATCAGGATTATTAGACCCTGGAAACCTCCTTTCGTCATGGGAGGGTGACGATTGTTGTCCATGGAATGGCGTGTGGTGCAACAACGAGACCGGGCATATTGTTGAGCTAAATCTCCCAGGAGGTAGCTGCAACATCTTGCCCCCATGGGTTCCGCTGGAACCAGGACTCGGAGGCAGCATAGGCCCCTCGTTGCTTGGCTTAAAGCAACTGGAGCATCTCGACCTCAGCTGCAACAATTTCAGTGGGACGCTACCGGAGTTCTTGGGTTCTCTCCACAACCTGAGATCTCTCGACCTATCCTGGTCGACATTCGTTGGGACAGTGCCACCGCAGCTGGGTAATCTCTCCAACTTGCGCTACTTCAGTCTTGGTTCTAATGATAATTCTAGCTTATATTCAACGGATGTATCCTGGTTGTCACGGTTATCTTCTCTCGAGCATCTAGACATGAGCCTTGTGAATCTCAGTGCGGTTGTGGACTGGGTTTCGGTGGCGTTCCGCTCCGCAACTCTCGTGCTGACCTATCTACCACACAAGGTCAAGGAGCTGTCGGATGAAATTCCTCGCAGCTCATCAGCTCTCACAGCATTGAGACGTTTCAACTTGTTCTCGATGACCAGGCATTTCGGTAACACGTTTTTCATGTCTTCAACTGATCTTTCTTGGTTGCCACGTCTCACCTTTTTGAGGCATGTTGACATGACTGACGTTGACCTCAGTTCCGTGAGGGATTGGGTTCACATGGTGAACATGCTTCCTGCTCTTCAAGTTCTTCGTTTGTCCGAGTGTGGCCTTAACCATACTGTATCTAAACTATCCCATTCAAACCTCACAAATCTTGAGGTCCTTGATCTATCATTCAATCAATTTAGCTACACGCCACTCCGACACAACTGGTTTTGGGATCTCACTAGCCTCGAGGAGCTTTATCTCTCAGAATATGCATGGTTTGCACCTGCAGAACCTATCCCTGATAGATTGGGTAACATGTCTGCCCTACGTGTCTTAGATCTAAGTTACAGTTCTATTGTTGGTTTGTTTCCGAAGACCTTAGAGAATATGTGTAATTTGCAAGTATTGCTAATGGATGGCAACAATATTGATGCGGACTTAAGGGAATTCATGGAACGGTTGCCAATGTGCTCGTTGAATTCTTTGGAAGAGTTGAATTTAGAATACACAAATATGAGTGGAACATTCCCAACGTTCATTCACAAAATGAGCAATCTCAGCGTTCTTCTATTGTTTGGAAACAAGTTGGTTGGCGAGCTACCTGCTGGTGTCGGAGCGCTGGGTAATTTGAAAATATTGGCTCTTAGCAACAATAACTTCAGAGGTCTAGTGCCGCTTGAAACAGTAAGTAGTTTGGATACTTTGTATCTTAACAACAACAAGTTCAACGGTTTTGTGCCTCTTGAAGTTGGAGCAGTAAGTAACTTGAAAAAGTTGTTTCTTGCGTACAATACTTTCAGCGGCCCTGCACCATCATGGATTGGAACACTAGGTAATTTGACAATATTGGATCTTAGCTACAATAACCTCAGTGGTCCAGTACCGCTTGAGATTGGAGCTGTAAATTTGAAAATTTTGTATCTTAACAACAATAAGTTCAGCGGTTTTGTGCCTCTTGGAATTGGAGCAGTAAGTCATTTGAAAGTGTTGTATCTTAGCTACAATAATTTCAGCGGCCCTGCACCATCGTGGGTTGGAGCATTAGGTAATTTACAAATTTTGGATCTTTCCCACAATAGCTTCAGTGGACCTGTACCACCAGGGATTGGATCACTCAGTAATTTGACAACATTGGATCTTAGCTATAACAGGTTCCAAGGCGTAATCTCTAAGGATCATGTTGAACATTTATCTCGTCTGAAGTATCTGGATTTGTCAGACAACTTCTTGAAAATAGATATACATACAAATTCTTCTCCGCCATTCAAACTAAGAAACGCAGCTTTCCGATCATGTCAGCTGGGGCCGCGCTTTCCATTGTGGCTTAGATGGCAGACTGACATTGATGTTCTTGTTCTTGAAAATACAAAATTGGATGATGTTATTCCGGATTGGTTCTGGGTGACATTTTCCCGAGCTTCATTCTTGCAAGCATCAGGAAATAAGTTGCATGGCTCATTACCGCCAAGTCTAGAACACATCTCAGTTGGTCGCATATATCTCGGTTCCAACTTGTTGACAGGTCCAGTTCCTCAACTCCCTATAAGTATGACTCGCTTGAATTTGTCTTCAAACTTTTTGTCAGGGCCATTGCCATCTCTCAAAGCTCCACTGCTGGAGGAGCTGTTGCTTGCCAATAATAATATTACAGGCAGCATCCCACCATCCATGTGCCAATTGACTGGTTTGAAACGTTTGGACCTGTCAGGAAACAAAATAACAGGAGATCTTGAACAAATGCAATGCTGGAAACAGTCAGATATGACCAATACAAACTCTGCAGATAAATTTGGTTCTAGTATGCTCAGTCTTGCCTTGAACCACAATGAACTTTCAGGTATATTTCCTCAATTTCTTCAAAATGCCTCACAATTATTGTTCCTGGATCTTTCACACAACAGGTTTTTTGGAAGTTTGCCAAAGTGGTTACCAGAAAGAATGCCAAACTTGCAAATCTTGAGGTTGCGGTCAAATATTTTCCATGGCCATATTCCCAAGAACATTATTTACCTTGGTAAACTTCATTTTCTGGACATAGCACACAACAACATATCAGGATCCATACCAGACTCCTTAGCAAACTTCAAAGCAATGACTGTTATAGCTCAGAATAGTGAGGACTATATTTTTGAAGAGAGCATACCAGTAATCACGAAAGATCAACAGCGTGACTACACCTTTGAAATCTACAATCAGGTGGTTAATCTTGATTTTTCATGTAACAAGTTAACAGGGCATATTCCAGAAGAAATACATTTACTTATTGGACTTACCAATTTAAATTTATCAAGTAATCAGTTCAGTGGAACAATCCATGATCAAATTGGTGATTTGAAGCAGTTGGAATCCCTTGACTTGTCCTACAATGAATTATCTGGTGAAATCCCCCCAAGTTTGTCAGCTCTAACTTCTCTAAGCCACTTGAACCTATCATACAACAATTTATCAGGCACAATACCATCAGGATCACAGCTACAAGCACTCGATGACCAGATTTATATATATGTTGGAAATCCTGGTCTTTGTGGGCCTCCTCTCTTGAAGAACTGTTCAACTAATGGTACACAACAAAGTTTCTATGAAGATAGAAGCCATATGAGATCTCTCTACCTCGGGATGAGCATAGGATTTGTGATTGGTCTATGGACTGTGTTTTGCACCATGATGATGAAGAGAACCTGGATGATGGCTTACTTTCGGATCATTGACAATTTATATGATAAGGCCTATGTACAAGTGGCTATAAGCTGGAGTCGCTTGATGCGGAAAAACCAAGATGCAGCGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDVFRCIHVLIALALLLFTPIISNEASANANSTGGCIPSERSALISFKSGLLDPGNLLSSWEGDDCCPWNGVWCNNETGHIVELNLPGGSCNILPPWVPLEPGLGGSIGPSLLGLKQLEHLDLSCNNFSGTLPEFLGSLHNLRSLDLSWSTFVGTVPPQLGNLSNLRYFSLGSNDNSSLYSTDVSWLSRLSSLEHLDMSLVNLSAVVDWVSVAFRSATLVLTYLPHKVKELSDEIPRSSSALTALRRFNLFSMTRHFGNTFFMSSTDLSWLPRLTFLRHVDMTDVDLSSVRDWVHMVNMLPALQVLRLSECGLNHTVSKLSHSNLTNLEVLDLSFNQFSYTPLRHNWFWDLTSLEELYLSEYAWFAPAEPIPDRLGNMSALRVLDLSYSSIVGLFPKTLENMCNLQVLLMDGNNIDADLREFMERLPMCSLNSLEELNLEYTNMSGTFPTFIHKMSNLSVLLLFGNKLVGELPAGVGALGNLKILALSNNNFRGLVPLETVSSLDTLYLNNNKFNGFVPLEVGAVSNLKKLFLAYNTFSGPAPSWIGTLGNLTILDLSYNNLSGPVPLEIGAVNLKILYLNNNKFSGFVPLGIGAVSHLKVLYLSYNNFSGPAPSWVGALGNLQILDLSHNSFSGPVPPGIGSLSNLTTLDLSYNRFQGVISKDHVEHLSRLKYLDLSDNFLKIDIHTNSSPPFKLRNAAFRSCQLGPRFPLWLRWQTDIDVLVLENTKLDDVIPDWFWVTFSRASFLQASGNKLHGSLPPSLEHISVGRIYLGSNLLTGPVPQLPISMTRLNLSSNFLSGPLPSLKAPLLEELLLANNNITGSIPPSMCQLTGLKRLDLSGNKITGDLEQMQCWKQSDMTNTNSADKFGSSMLSLALNHNELSGIFPQFLQNASQLLFLDLSHNRFFGSLPKWLPERMPNLQILRLRSNIFHGHIPKNIIYLGKLHFLDIAHNNISGSIPDSLANFKAMTVIAQNSEDYIFEESIPVITKDQQRDYTFEIYNQVVNLDFSCNKLTGHIPEEIHLLIGLTNLNLSSNQFSGTIHDQIGDLKQLESLDLSYNELSGEIPPSLSALTSLSHLNLSYNNLSGTIPSGSQLQALDDQIYIYVGNPGLCGPPLLKNCSTNGTQQSFYEDRSHMRSLYLGMSIGFVIGLWTVFCTMMMKRTWMMAYFRIIDNLYDKAYVQVAISWSRLMRKNQDAA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..636#3430..3567#4181..7009#ATGGACGTGTTTAGATGCATCCACGTTCTAATAGCCTTAGCCTTGCTTTTGTTCACCCCAATCATCTCCAATGAGGCCTCAGCCAATGCCAATAGCACAGGTGGTTGTATTCCAAGTGAGAGATCTGCACTTATCAGCTTCAAATCAGGATTATTAGACCCTGGAAACCTCCTTTCGTCATGGGAGGGTGACGATTGTTGTCCATGGAATGGCGTGTGGTGCAACAACGAGACCGGGCATATTGTTGAGCTAAATCTCCCAGGAGGTAGCTGCAACATCTTGCCCCCATGGGTTCCGCTGGAACCAGGACTCGGAGGCAGCATAGGCCCCTCGTTGCTTGGCTTAAAGCAACTGGAGCATCTCGACCTCAGCTGCAACAATTTCAGTGGGACGCTACCGGAGTTCTTGGGTTCTCTCCACAACCTGAGATCTCTCGACCTATCCTGGTCGACATTCGTTGGGACAGTGCCACCGCAGCTGGGTAATCTCTCCAACTTGCGCTACTTCAGTCTTGGTTCTAATGATAATTCTAGCTTATATTCAACGGATGTATCCTGGTTGTCACGGTTATCTTCTCTCGAGCATCTAGACATGAGCCTTGTGAATCTCAGTGCGGTTGTGGACTGGGTTTCGGTGGTGAACAAGCTTCCATCTCTTAGATTTCTCCGTTTGTTTGGATGCCAGCTTAGCAGCACGGTCGATTCTGTTCCGAACAACAANCTAACATCTCTTGAAACTCTGGACCTTTCACTTAATAATTTCAACAAGAGGATTGGACCAATTGGTTTTGGGGATTAACTAGTCTTAAACTTCTAGATATCTCAGATAGCGGTTTCTATGGACCATTTCCAAACGAGATAGGCAATATGACCTTTATTGTGGATATTGATTTATCAGGCAATAATCTTGTGGGAATGATACCATTTAACCTGAAGAACCTATGTAACTTGGAGAAATTTAATGTTGCTGGAACCAACATCAATGGGAATATAACGGAAATATTCAATAGATTGCCTAGATGCTCATGGAATAAGTTACAAGTGTTGTTTCTACCGGACTGCAACTTGACTGGAAGCCTACCAACAACACTAGAACCCTTGAGCAATTTGAGCATGCTTGAGCTTGGTAATAACAATATCACAGGTCCCATCCCACTTTGGATAGGAGAGCTCAGTAATCTAACAATGTTGGGCCTCAGCTCCAACAATCTAGATGGGGTCATACATGAAGGCCATTTATCAGGCCTAGAAAGTCTAGATTTGTTGATCTTGTCTGATAATAACCACATAGCCATCAAGGTGAATTCTACCTGGGTTCCTCCTTTCAAGCAAATAACAGATATTGAACTTCGGTCCTGTCAGTTAGGGCCTAAATTCCCAACATGGCTCAGGTATCTAACAGATGTATACAATCTTGATATCTCAAACACAAGCATATCAGACAAGGTTCCTGACTGGTTTTGGAAAGCAGCGTCATCAGTAACACATTTAAATATGAGAAACAATCAGATTGCAGGTGCCCTTCCATCTACATTGGAATACATGAGAACGATCGTAATGGATCTCAGTTCTAATAAGTTTAGTGGTCCAATACCCAAGCTTCCTGTCAGTCTAACCAGCTTAGACTTCTCAAAGAACAATTTATCCGGGCCTCTACCATCAGACATAGGAGCGTCAGCTCTAGTATCACTTGTTCTGTATGGCAACTCCCTTTCTGGTTCAATTCCATCTTATTTGTGCAAGATGCAGTCTCTGGAACTGTTGGATATATCAAGAAACAAGATAACTGGGCCAATTTCTGATTGTGCAATCGATTCAAGCTCAGCAAACTACACATGTACGAATATTATCAATATAAGCTTAAGAAAAAATAACCTCTCAGGACAATTTCCTTCGTTCTTTAAGAACTGCAAAAACCTTGTTTTTCTGGATCTTGCTGAAAATCAATTCTCTGGGACACTGCCTGCATGGATTGGGGAAAAATTACCTTCTTTGGTATTCTTACGGCTGCGTTCTAATAGCTTAGTGGTCATATTCCAATTGAACTTACCAGTCTGGCGGGTCTTCAATATTTAGACCTTGCACATAACAACTTTTCAGGATGCATACCGAATTCTTTGGCGAAATTTCATAGGATGACACTCGAACAAGATAAAGAAGACAGATTTTCAGGGGCTATTAGACATGGAATTGGGATCAATGATAATGACATGGTTAATTATATTGAGAACATATCTGTAGTCACAAAAGGTCAAGAACGCCTATATACAGGTGAAATCGTATACATGGTGAACATTGATTTATCTAGTAACAATCTTACTGGAGAGATTCCTGAAGAGATTATCAGTCTTGTTGCGTTGACAAACCTGAACTTATCATGGAATAGCTTAAGTGGACAAATTCCTGAGAAGATTGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGGCGAACACGAAGTTCATCGCCATCATCAGCGACAGCGCGTCCTTGCCGGCGGCGACGACGTACATCCCCTGCGCGCGTCCGACCAGCCTCGAGGAGGTCAGGTTGGGACCGTCGGTGAGCGGGTTGTCGATCACCACCACCGTCCCGAACCACGTCGCCGAGGCGTTCGTCGTCGGCGCCTCCGCCACCTGCGCCACCGTGGAGTTGGGAGCACCGCCGCAAACACGAAGGAGGAGGAGGCAGCCATTACTTAGCTCTGTGTTGGTCGCATGGTTCTAATTAAGATAGCTTAATTAGCTAGCTGTCTGATCTATTTGTTTGCCTATGATAGATGTGGTAGAGGGTATAAATGTCCTATTTAACACCGTTAACTCCATCCAAAACAGGGGCAAAAGTATTTTTCGGTTTAAAAAAGTGAGGGAAAAAACGAAAACCCTAAAAAGTAGGGGCAAAATCAATATTAAAGATCAAAGTGGGAGCAAAAACGAAATTGTCCCTATATTTTAACATCAAAAATCGGTGCATTGATTTGCACCAGTTCTTTTTAAAAAATGGGGAAAACGTTATATCCGGTTTTATATTTAAGGGACAAGAATTTCAAAAAAAGACAAAAATAGACTTATTTAGGTAGAAGTTCTATCTGTCGGTAATACCGTGCCCCGACAGGCTTTCCACTGACACATCCTCTCTATCGCCAGAGGCCTTTTCCGACGGACTATTGATGTTAAAGGTGGTCTTCGCCGACAGATTAGTTGTTGCCAATTTTGGGACATGGTGTAGTGGTAGTATATATGATCCATCCAAACTCCTACTTTGATCCAGATTCCAGCACAAAACCTAAGGTGCGAATGAGTGGGGCAGTGTTTGCTAATGAGCCAGATTTCATAGCCGCTCCTAAAGCTTTGGGCTTCCAAATGGGCGAAGTCCTCCATCTGCTCACTTGTCGCCACAACACATAGGCGTTCCGCTCCGCAACTCTCGTGCTGACCTATCTACCACACAAGGTCAAGGAGCTGTCGGATGAAATTCCTCGCAGCTCATCAGCTCTCACAGCATTGAGACGTTTCAACTTGTTCTCGATGACCAGGCATTTCGGTGTATGTTGGCAACCAAAATATTTCCTCCATTTCAAAATGTATGACGTCGTTCAATTTTTCGTATAACGTTTAACCATTCGTCATATTCAAAAAAATTTATACAAGTATTATTTATTTTCTTGTAACTTGTTTTACCATTAAATAAAATATAATTTTAACTTATACTTTTACATATTTATTTTTTTAATAAGACGAATGGTCAAATATTTTTAACTAAAAATCAACAGTGTCATACATTTTGAAAAGAATGTACTCTCTCTGTTTCAGGTCATAAGACGTTTTGACTTTGGATCAAGTTTGTAGAAAATAATAATAACATTTTCAAGCCAAGACAAATTTATTATGAAAATATATTCGATTATTGATTTCATAAAACTAATTTAGTATTATAAATATTACTATATTTGTCTATAAACTTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGTTTTCATGGGCTCTTTCAAGAACTTGAGATATCTCAACCTCTCCTGGGCAGGTTTCGGTGGGAAAATACCTTCGCAAATTGGTAATATTTCCAGCTTACAATACCTTGATGTTAGCTCGAATTATTTCTTCCATGAACAGAACACGTTTTTCATGTCTTCAACTGATCTTTCTTGGTTGCCACGTCTCACCTTTTTGAGGCATGTTGACATGACTGACGTTGACCTCAGTTCCGTGAGGGATTGGGTTCACATGGTGAACATGCTTCCTGCTCTTCAAGTTCTTCGTTTGTCCGAGTGTGGCCTTAACCATACTGTATCTAAACTATCCCATTCAAACCTCACAAATCTTGAGGTCCTTGATCTATCATTCAATCAATTTAGCTACACGCCACTCCGACACAACTGGTTTTGGGATCTCACTAGCCTCGAGGAGCTTTATCTCTCAGAATATGCATGGTTTGCACCTGCAGAACCTATCCCTGATAGATTGGGTAACATGTCTGCCCTACGTGTCTTAGATCTAAGTTACAGTTCTATTGTTGGTTTGTTTCCGAAGACCTTAGAGAATATGTGTAATTTGCAAGTATTGCTAATGGATGGCAACAATATTGATGCGGACTTAAGGGAATTCATGGAACGGTTGCCAATGTGCTCGTTGAATTCTTTGGAAGAGTTGAATTTAGAATACACAAATATGAGTGGAACATTCCCAACGTTCATTCACAAAATGAGCAATCTCAGCGTTCTTCTATTGTTTGGAAACAAGTTGGTTGGCGAGCTACCTGCTGGTGTCGGAGCGCTGGGTAATTTGAAAATATTGGCTCTTAGCAACAATAACTTCAGAGGTCTAGTGCCGCTTGAAACAGTAAGTAGTTTGGATACTTTGTATCTTAACAACAACAAGTTCAACGGTTTT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