BGIOSGA001440
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001440 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001440, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_02374 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001440-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001440-PA |
| Length |
6356 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:22951004..22957359 |
| Sequence Coding Region |
22957245..22957359,22956538..22956683,22956398..22956433,22956178..22956285,22955184..22955284 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:22951004..22957359 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:22951004..22957359 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCACCAATTACTTCTCTGCTTCCTAAGTTCATCTCCCTGAGCATGCTCATGTCTTCCTATATGGCAAGTCTATCCCCTACAGTGAAGGTCCTGCACCCCTCACTTTCCACCGTAAGCGTGAAATGGCAGAAGGAGACCTTCCCAGGCATAGAGATAGACACCAGCCAGCCGCCTGTTGTCTTTAAGACCCAGCTATACACTCTGACTGGTGTACCACCTGAAAGGCAAAAAATTATGGTGAAGGGTGGAATATTGAAGGATGATGCAGATTGGTCTACTTTGGGAGTGAAAGATGGTCAAAAATTGATGATGATAGGTACAGCTGATGAGATTGTGAAAGCTCCAGAGAAAGGACCAGTATTTGTAGAGGATCTACCAGAAGAAGAGCAAGTGGTTGCACTGGGACACAGTGCTGGTCTTTATAACTTGGGGAATACATGTTACATGAATTCCACTTTGCAGTGCCTGCATTCTGTTCCAGAGCTGAAGTCAGCTTTATTGAGTTATTCAGATAATGTGAGGGGTAATGGTGTTGACCAAGCCTCCCATAATTTGACTGTTGCAACTCGTAATACTTTCGGAGAGCTTGATCAAAGTGTTCGGCCTGTTGCACCTCTACTCTTCTTACAGACGCTGCGTAAAAAGTATCCCCAGTTTGCGCAACAACAAAATAATGTTTATATGCAACAGGATGCAGAAGAATGCTGGACCCAATTGGTGTATACACTTTCTCAAACTCTTACATCAGAAACAAGTGAACCTCCTGCTGGTCAAATGAAGGAACTTTTTGGGATTGATCTCGTGAGCAGGGTCCATTGTGCAGAAAGTGGTGAAGAGAGTTTAGAGAGAGAATCAGTTTATTCTTTGAAGTGTCATATATCTCATGATGTAAACCACCTTCATGAAGGACTTAAGCATGGTTTGAAGTCAGAACTTGAGAAGGCTTCACCTTCACTGGGTCGCACTGCTCTTTATACAAGAGAGTACTTGACTGTGCAGTTTGTTCGTTTCTTTTGGAAAAGGGAATCAAACCAGAAGGCAAAGATTTTACGGAAAGTTGATTACCCGCTGGAACTGGATGTTTATGACTTTTGCTCAGATGAACTGAAACAAAAACTCCAAGCTCCCCGACAGATGCTGAGAGATGCAGAAAATGCTAAGTTTGGATTAAAAGCACAAGGAAAGGCCAGCAGCTCAAAAGAAAATGAGAAACAGTTGACTGGCATCTATGATTTAATTGCTGTTTTGACGCACAAAGGGAGAAGTGCAGACTCAGGCCATTATGTTGGCTGGGTTAAGCAAGATGACGGGAAATGGATTGAATTTGATGATGACAACCCTAGCATACGCAAGGAGGAAGAGATTTTAAAGTTATCTGGTGGAGGCGACTGGCACATGGCTTACATTTGCCTGTACAAAGCTCGTGTTATCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPITSLLPKFISLSMLMSSYMASLSPTVKVLHPSLSTVSVKWQKETFPGIEIDTSQPPVVFKTQLYTLTGVPPERQKIMVKGGILKDDADWSTLGVKDGQKLMMIGTADEIVKAPEKGPVFVEDLPEEEQVVALGHSAGLYNLGNTCYMNSTLQCLHSVPELKSALLSYSDNVRGNGVDQASHNLTVATRNTFGELDQSVRPVAPLLFLQTLRKKYPQFAQQQNNVYMQQDAEECWTQLVYTLSQTLTSETSEPPAGQMKELFGIDLVSRVHCAESGEESLERESVYSLKCHISHDVNHLHEGLKHGLKSELEKASPSLGRTALYTREYLTVQFVRFFWKRESNQKAKILRKVDYPLELDVYDFCSDELKQKLQAPRQMLRDAENAKFGLKAQGKASSSKENEKQLTGIYDLIAVLTHKGRSADSGHYVGWVKQDDGKWIEFDDDNPSIRKEEEILKLSGGGDWHMAYICLYKARVI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..115#677..822#927..962#1075..1182#2076..2176#2257..2383#3367..3426#3514..3578#3746..3799#4271..4379#4554..4618#4722..4791#5318..5398#5480..5554#5971..6070#6151..6225#6307..6356#ATGGCACCAATTACTTCTCTGCTTCCTAAGTTCATCTCCCTGAGCATGCTCATGTCTTCCTATATGGCAAGTCTATCCCCTACAGTGAAGGTCCTGCACCCCTCACTTTCCACCGGTAACGATGGAGAACCCGTCCATCTCGGCCACAATTACATAGTATCTTAGTTATCTTGCCATACTTAGGTAATGGATTGAATATTGTCTGTTAAAGTTTGTGGTATTGTTTTAAGAAATGCTAATGTACCAATGTAATTTAGTAAATTGAGTGGCGGTGGAAAAAATTGTGTGTTATTTGGTACCAATGTAAATCTTTATTATATAGATGAAATTATCCCTACTAAATGGGGGTGAACATGTATTTCCTAAAATTCAACTCTACTGCGAATTAGTTCTAGCTGGAATTTCCGGTCTAAATCTGGAATTTCAAATTTGAACTTGAAAGTTCTGGTCTCAACTTAGATGCTATGGTCAACACCAACAAAAAACACATCAATATGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTCCATGGCTACACAATAATCTCATGTATTTGTTCCACTAGTCAAAGCAGTTTATGTGTTGTTTCTTCACCCTTCCTTCGTACTCAATTTCTTACCATGATTGCTGCTTTTGGAATGCTTTCCAGTAAGCGTGAAATGGCAGAAGGAGACCTTCCCAGGCATAGAGATAGACACCAGCCAGCCGCCTGTTGTCTTTAAGACCCAGCTATACACTCTGACTGGTGTACCACCTGAAAGGCAAAAAATTATGGTGAAGGGTGGAATATTGAAGGTAATACATGCTCACGTGCTTATGGACACAACTGATTTTCATGTACTTCTATATTTAATCTTTCTTTGTAACAACGTGGTCAATTTTCTGTATTTGTAATGCAGGATGATGCAGATTGGTCTACTTTGGGAGTGAAAGATGTGAGATTATCAACCTGTCTTCCATTCACATTTTTATTCTACCAGACCCTTAATACATTCAAGTATTCAACTACATGTATATAATGTTAAGGATTGGAAATGCACTCTGCAGGGTCAAAAATTGATGATGATAGGTACAGCTGATGAGATTGTGAAAGCTCCAGAGAAAGGACCAGTATTTGTAGAGGATCTACCAGAAGAAGAGCAAGTGGTTGCACTGGTGCGTTTGACCTCTCAATTTATGCTTATCTCTACTATAATAAAAGAAGCTAGTAGTTATGGTGGCGGCGAGTTCGCCAACCCACTACTAGTCTACTACTATGGGATCTTCCATGCATAACTATATGCATACATGTCTTTATTAGTTGCATAGATATATGCATACATATTTTTATTAGTTGAATCTTCTCTGTATAATTATGTCATTTGGGGATTGATGTACAATTGGAAAGTACTCCCTCCGTCCCAAAATAACTGCAGCTGTGTAGTTCAAATTTGAACTGTGGCTGCACTTATATTGGGACGGTGGGAGTATATAGTTTCTTTTGAGTTCAGAATTTATAATATACTTGCTCTCGATTGTTGCAATGCATGGGTATTTGGTTAATCTGTTCTGAAATTTATTAGGAGTGGCAACCTTGCATGGGCGCATGGCCTCTCAGAATAACAACTCAATAAATTTGTCTAATATCATATGTCCGTATGAACCATAACACTTTTGTCTGCAAACCAAGATAAAGGACTGGAGACAACAAATACCCAGTACACTTGCAGTGTTATCTGTTAACATAGATGTGTTAAGAACATATGCTATTGTCTTTCCATTGCCATTCGACAGCTCGTCATGCATAATTCCTGAAACAACCTGCTTAATGTATCTTATATGCTTAAATTAATCAAGAATCAATATAATCATGGTATCTAGAGTGGAAATTGTGATTGCGGATAAGCTAAAGTGATATTGTTGTTATAGATATCTTATGTTGTAATAAATTCGCAATGTCAAAAAATTCAAATTGCTTAAGAGCGCTATTATATTTGGCATAAGCATGTTGGTCTTATTTTGGTGTTCTTAATCTGTGCTGCAAGTGAGATTTCTCTTTGGAATTTCAGGGACACAGTGCTGGTCTTTATAACTTGGGGAATACATGTTACATGAATTCCACTTTGCAGTGCCTGCATTCTGTTCCAGAGCTGAAGTCAGCTTTATTGAGGTTCCACTGAAAATTGCTTTGAAGTAAGTTTTGAAGAAAGGAATTTCTTCTTGGCTAACTCATATGTTTTACTTGTGCAGTTATTCAGATAATGTGAGGGGTAATGGTGTTGACCAAGCCTCCCATAATTTGACTGTTGCAACTCGTAATACTTTCGGAGAGCTTGATCAAAGTGTTCGGCCTGTTGCACCTCTACTCTTCTTACAGGTCAGCATTCAGCTTACCCCATTTGGCCATTACATCTAAAGCTAGAGAATCTTCAATTCGTTTCTGTGATTAGGAGAGCTCCAGAGCTCCTTTTATGTTACTGTTCTATTTATGACATCTTCACAAATTAGATAAGAAATATTCTTTTTTATATGTAGGCTGTTGTTGCATGGGTCAGGTCAAAAAAATAGAACAATACTTCTATTATATGTTCTAAGTATCTAGAGTAGATTAACTACATGAAAATGATATCAGTAGATTTCTGATGTAAAAGAAGATTTCTGATGCAAAGGAGTTTCATGACACTACATTTTTGCTGGCATATCATTATAGAAAATGATGCTTGTAGTTTTCTATTAAAGTTGGAAACCATGAACTGCTGTATGAAATAAAAAGTCCATCATAACAACTATGTGTATTTCTAATACAAAATTTGATACTGTTTTCCTATGTGTATGCTCGAGTGGAACTTGAGTTGTAATTATTTGAGTGTTTACAAGGAATGACATGTTTATATGAAATTACTTGAACCGAATTTCGTGACATCCCTTTGGTAGAAAGGTGATTGTAGCCTTTTTTTTTCTGGTGGGGCCACATGAACACAATGAAATTTTGGCATGAAATATCTATTTTGAGATAGCAATCTACTTAAGTTAAAAAAAAATTCAAAATTTATAATTCAGGGCTTGACAGTTCTATGTGGACCCCAATGAAGTTTGACATTGTTTTAACATTTTTGGTTAGATTAGAAAAACAACTGCCATTCTTCCAATTCCCAATGGACTTCCATGTCAAGCTGTTTTTGGTGGCTCTGAATGCCAGTTTCTTTACTGTTTTGGTTTTATGTTTTGCCACATTGTAGCATATAGATCGAGGATATCTAGATGAGTTTGTCTACAAGGTTTAAATGTTTTGGGAAAAACTATAATTTATAATGCTTGGATTTTTTGTACTAACTTTTTGTTTGATCTACACTTGAGCAGACGCTGCGTAAAAAGTATCCCCAGTTTGCGCAACAACAAAATAATGTTTATATGCAACAGGTTTGTTTGGTTCACCTATGATTAAATTTTAAGTTTTTCTACTGTTTATCTGTATGATTAAATATTGTTCACTTGAACAAATTGCAGGATGCAGAAGAATGCTGGACCCAATTGGTGTATACACTTTCTCAAACTCTTACATCAGAAACAAGGTAATTTATTGCAGTTATTCACCTAACAGCTCATATGCAATTGTGGAGTGATGTTTGTTTTCCTGGGGATGCTCCCCCCTCCCCCCCCCTTCCCTTTTTCCTCCCTCTCTCTCTGAGTACACAGTAGTGTTTGGCTGCTCCGCTTACCATTTTGTCTTTTTTGGTAGTGAACCTCCTGCTGGTCAAATGAAGGAACTTTTTGGGATTGATCTCGTGAGCAGGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACTCATCTGTTTTAATTGGGGGTGTGTGTTCTTTTCTGTTGTACAAAGGTACTGTACTGTATCATACAGTTCACTATGAGTTAACAATTCTGTTGTGGTTTCTTCTGTTTATGGATCTTTGCTGATTGTGCTAGTTTGTCGGTGCATTTCCAAAATGGTACTAGTAATATAGAGCTTGGATCCCTGCTTAAAACTTTTAGCATATCCACCACAAGTAGACCTGATGGTTTTTTCCATCTTTTTTATGCACAATTTTTGTGCCGTTTTCTGATGTCATGTCAGATGAGGACACTCATTTGACATTTTATTCCCGAGGCAGCAGAACTAGTTACCTGTATTGAATTAAAAAAAACTATTTGTTCATAAGCACGATGACAATGCTCCAGTGTGCTTCTATTTATTAATGTTGGCTTCTATTTTCAGGGTCCATTGTGCAGAAAGTGGTGAAGAGAGTTTAGAGAGAGAATCAGTTTATTCTTTGAAGTGTCATATATCTCATGATGTAAACCACCTTCATGAAGGACTTAAGCATGTAAGTTATGTTACCATTATTAAACTCATAATTTCTATTTTATATCGAGTAGCTCATTGCTGATTCTGACAGGATAGTTTTTTATGTGTACATTATTTTTATACTATGCTTGCATAAAACCTCAGAATTTGTATGAGAAGGCCCATGTAATTATTCTTGTATTCTTTCCTGCAGGGTTTGAAGTCAGAACTTGAGAAGGCTTCACCTTCACTGGGTCGCACTGCTCTTTATACAAGAGAGTCAAGAATAAATGAGTTGCCTAGGCAAGAACCTAAATATTTTCTTGATTATATTATCTCTTATTTTATTCAGAAATTATAAGTATGCCAATTCTGTGTTCAGGTACTTGACTGTGCAGTTTGTTCGTTTCTTTTGGAAAAGGGAATCAAACCAGAAGGCAAAGATTTTACGGGTATGTTTATTTCTCG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