BGIOSGA001442

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA001442

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001442, complete gene.

LocusTag

OsI_02368

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA001442-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA001442-PA

Length

11938

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:22864537..22876474

Sequence Coding Region

22876075..22876474,22875855..22875929,22875183..22875217,22875015..22875093,22874823..22874912
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,22867954..22868144,22867784..22867851,22867024..22867100,22865859..22865901
,22864537..22864632

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCGGTCCACCGCCGCCGCCGCCGATGTGATCGATCTCTCCAGCGACGACGACGACGAGGTGCCCGTCCCCAGCACCAGCGCCGCCGCAGCCGCAGCCGCGCGCCGCGTCGCGCCCTCCACGTCCCCTCGCGACGTCACGCCGTACGCGCTCGTCGATGTGAAGCCCGCGCTGCTGTACCCGCTCCAGCCACCGGGCGTCGTCGTCGGTGGCAGCGGCGCGCTCGTGCCCGTGAAGGAGGAGCTCCCGTTGCTGACGCCGGTGCCCCTGCTGGCCGCGGGCTATTCCCCGTCCACCCCCTCCACCAAGGTCGCCCTCCCGGCGCCGCGCCTCTGCCGCCAGTTCTGGAAGTCGGGCGACTACGTCGTCGCCCAGCGCAACCCCGACGCCGATGCACCCGGTGGGCGGAACCGACTTCGGATTAATCCCAGGTTCCTGCACTCGAATGCTACTTCCCACAAGTGGGCTTTTGGTGCCATTGCCGAGCTTCTTGATAATGCAATTGACGAGGTTAACACTGGGGCAACATTTGTTCGTGTTAATGAATTTACAAACCCACGAGATGGGAGTTCCTCATTGTTAATTCAAGATGATGGAGGGGGAATGGATCCAGAGGCACTGAGACGCTGCATGAGCTTTGGATTTTCAGATAAGCAGTCCGATGCTTTAATCGGGCAATATGGAAATGGATTCAAAACTAGCACAATGAGGCTTGGAGCAGATGTGATTGTTTTTACACAAAACCAAAATAACTGGGTGCCAACAAGAAGTATCGGTCTTCTTTCATACACATTTTTGATGGAAACTGGCTGCGATGATGTTTTGGTTCCAACAGTTGATTATCAGTATGATATATCAACAGCTTCATATACTCAGATGCTGCGTCATGATCAGAAGCTCTTCTCTTCAAATTTAGCGATCCTCTTGAAATGGTCCCCTTTTGCTAGTGAAGCTGAGTTGCTCAAACAATTTGATGATATCGGAGAGCATGGAACAAAAATAATTGTATTCAACCTCTGGTTCAATGATGATGGGGATATGGAGCTTGATTTCAACTCCGATAAGAAGGCATACACATCTGTCTTGTACCTTCACATTCCTGATAATTTCAGAATAGTCTTGCGTGGACATGATGTGGAATCACATAATGTAATAAATGATTTGATGTATCCTGAATGCGTGTTGTATAAACCACAAATTGCTGGGCTTGCAGAGCTATCTGCAATAACCACCATTGGATTTGTCAAAGGCGCCCCAGAAATTGATGTACAAGGCTTTAATGTGTACCACAAGAATCGTTTAATAGCGCCATTTTGGAAAGTTGCGAACAACTCATATGGCAAAGGGCGAGGAGTTGTGGGCATTCTAGAGGCAAACTTCATCAAACCTACCCATGACAAGCAAGATTTTGAAAAGTCGGTCCTTTATCAAAGGCTGGAGAGCCGCTTGAAAGAAATGACATATGAATACTGGGACCTGCATTGCCATCGTATTGGTTATGACAACAAAAAATTACCTAAATCTTCCCGTGCACTTAATCGTGCTAATCAGATGAATGCTGGCAGTTCCCCGCCAATTGTTCCACGTCAGCTATTGGCTGCTGATATTCCGACAAGCAGCTGTGCTGTCCCTACATTTATGGCCCCTGCATTAAGGCAAAAACAGATGGGATTGAAGAGAAATATTGATGCCCTTGGATCCAAGACAGACAGTGCTGACCAAGATGGATCTCACTTGGACGTTTCTCAACGGAGAAGGTTTAACGAATACAGGACTTTGACACTAGAGAATGACAAGTTGCGTGGCGAATGCTTGCAATACGAGGAGTCAGCAAAACAACTTGCTCTGAAGGAACAAAAGCTCCGATCTCAAATTGCTTTGGAAAGAAAGAAATATGAGGAATTATTACAAGAGCTCAGGTCGTTGGATGTGAAGACAGAGAAATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRSTAAAADVIDLSSDDDDEVPVPSTSAAAAAAARRVAPSTSPRDVTPYALVDVKPALLYPLQPPGVVVGGSGALVPVKEELPLLTPVPLLAAGYSPSTPSTKVALPAPRLCRQFWKSGDYVVAQRNPDADAPGGRNRLRINPRFLHSNATSHKWAFGAIAELLDNAIDEVNTGATFVRVNEFTNPRDGSSSLLIQDDGGGMDPEALRRCMSFGFSDKQSDALIGQYGNGFKTSTMRLGADVIVFTQNQNNWVPTRSIGLLSYTFLMETGCDDVLVPTVDYQYDISTASYTQMLRHDQKLFSSNLAILLKWSPFASEAELLKQFDDIGEHGTKIIVFNLWFNDDGDMELDFNSDKKAYTSVLYLHIPDNFRIVLRGHDVESHNVINDLMYPECVLYKPQIAGLAELSAITTIGFVKGAPEIDVQGFNVYHKNRLIAPFWKVANNSYGKGRGVVGILEANFIKPTHDKQDFEKSVLYQRLESRLKEMTYEYWDLHCHRIGYDNKKLPKSSRALNRANQMNAGSSPPIVPRQLLAADIPTSSCAVPTFMAPALRQKQMGLKRNIDALGSKTDSADQDGSHLDVSQRRRFNEYRTLTLENDKLRGECLQYEESAKQLALKEQKLRSQIALERKKYEELLQELRSLDVKTEK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..400#546..620#1258..1292#1382..1460#1563..1652#1741..1816#2307..2385#2483..2617#3931..4029#4583..4729#5714..5806#6847..6898#6992..7103#8331..8521#8624..8691#9375..9451#10574..10616#11843..11938#ATGCGGTCCACCGCCGCCGCCGCCGATGTGATCGATCTCTCCAGCGACGACGACGACGAGGTGCCCGTCCCCAGCACCAGCGCCGCCGCAGCCGCAGCCGCGCGCCGCGTCGCGCCCTCCACGTCCCCTCGCGACGTCACGCCGTACGCGCTCGTCGATGTGAAGCCCGCGCTGCTGTACCCGCTCCAGCCACCGGGCGTCGTCGTCGGTGGCAGCGGCGCGCTCGTGCCCGTGAAGGAGGAGCTCCCGTTGCTGACGCCGGTGCCCCTGCTGGCCGCGGGCTATTCCCCGTCCACCCCCTCCACCAAGGTCGCCCTCCCGGCGCCGCGCCTCTGCCGCCAGTTCTGGAAGTCGGGCGACTACGTCGTCGCCCAGCGCAACCCCGACGCCGATGCACCCGGTAAGCTAAGGCTAGCTAAGCACCTAGGGTTCTCCCATTTCGCTTCGCTTCTTAGCTTTCCGTTTGGATTTTGGTGGAGGCAAATTTGACGGTTTGAAGAGGCTGACTGATATGGGGTTGCGATTCGGTGCTGGTGTATGTGCAGGTGGGCGGAACCGACTTCGGATTAATCCCAGGTTCCTGCACTCGAATGCTACTTCCCACAAGTGGGCTTTTGGTGGTATGAGAATTGACAAATCTTATTAGTGGAAACAACTCCATTTTAGGCAATGACTTGATTCTAATACCTTTAATTCGTTCATTCGTTCGCATAATTGCAACCAAGTTTCTACTAACGGTATTTCCTTTAGTAAGAAGTTGTGATGTGTAGTGTGTATTTAGTTGCATTGGATCATATTTCTTGTTTGCCGAACAGCACCAATCAATTTCTAGTTGTAAACATGTAATTTGGCTAAAGTAAATAAAACTTTTTCTTCTTAAGGAAGTATTAACTTCAGTATAAACAAATTGAATATTGTACATGTTTTGATTATTTTTGAGGATTTAAAATCGTCTTTGCCATGTAAAACGCTGTGAAGCCCGTCTTTGCTGGCACGGCTCTACTTTTTGAGCTCAGGATCTGGTACCATAACAAACAAGTGGACTACTCTATATGCGGCCGTTATATACCTACTTATATTATTGTGTATCTATAAAAATGTGTTAGCGTTTTTATAACCTAACCCGTCATGCAGGTATTTGCGGTTCCATTATATTATTCTCTTAAAGTAATCAATCATATTAGGACATTGCATTGCATTATATGGCACTATTTTCCCACTGATTTATGTTCAGTATTATGCTTATCATTTTTTCAGCCATTGCCGAGCTTCTTGATAATGCAATTGACGAGGTAATTAACAAGCGCACCCAGTTCCAAACTTCCAATGGCTAAAATATATTGATATTATGTATGATTTATTATCCCACTATCTCTATCAGGTTAACACTGGGGCAACATTTGTTCGTGTTAATGAATTTACAAACCCACGAGATGGGAGTTCCTCATTGTTAATTCAAGGTTGGCAGATTCAGTAATATAAATATATGCAGATCCTCTAAGTTCATAGAAAATCTTAATTGGATAAGTGAGAAAGACCTGTGTTTTTTTCACATGTGCTAGATGATGGAGGGGGAATGGATCCAGAGGCACTGAGACGCTGCATGAGCTTTGGATTTTCAGATAAGCAGTCCGATGCTTTAATCGGGCAATGTATAGCCTTGTGTACTTTTTCTGCAGTTCTTTGGAAAATTGATATCTAGAACCCTTCTTTTGGATTTACTGCTGTTTGTTGTATCAGATGGAAATGGATTCAAAACTAGCACAATGAGGCTTGGAGCAGATGTGATTGTTTTTACACAAAACCAAAATAACTGGTATACCTCCTTTTCTAATTCTGGAAGTTTGGTTGTTCAATGTTACACCAGAAAAAGCATTCTGTGATGTCACCATGGTATTTTGTAATGTAATAAACTCTGAGGGACTACCTGGAAATCTAACAACACAGCTTAGGGATAGAAGAGAAGCAAAATCAAACAGCAGTTATGACTTATAAGTGCTTAAACATTATGTCAAAAGAAATAAGTGGCCATACAACCTTTTGCAACGTTTTCATTCTGTGGGTTCTAGAAGAAATTGTTTGCATACAGTTGCTTTAACTTTTCTTATTGTGTATCTGGAAACAACTGTAAGTGAAAACTAATAGGAGAATTATGCATTTTATATGTTACTTTCTGCATGCTGCTGGCCAGTCAAACATTTATCATCCGATCCCACTAAGCCTTTTTGCCCAGTCTGGTTTATTATGTAAAATTTCTGTCCACCCTGGTTCATATATCTATTTAATTATCTTTTTTGTGTCTGTAGGGTGCCAACAAGAAGTATCGGTCTTCTTTCATACACATTTTTGATGGAAACTGGCTGCGATGATGTTTTGGTTCCAACAGTAGGTTCACAAATGCTTTGACATTTTAAAAATGAGTGATCATTGGTCAATATGTGTAGTTTTATTTCACCCTTGTGACACCCTCTTTCTCATGCAGGTTGATTATCAGTATGATATATCAACAGCTTCATATACTCAGATGCTGCGTCATGATCAGAAGCTCTTCTCTTCAAATTTAGCGATCCTCTTGAAATGGTCCCCTTTTGCTAGTGAAGCTGAGTTGCTCAAACAAGTATGTTACTAAAGTTTCATTACTTTGTTACATAATGTCATATACTGATATTTATATAAATAATGTGTTGAAGAAGTTATGGAAGGAGAGAATTCCTTGTATTCCCTTGAAATTACAGCCAATTCCTTCCATACCCCTGAGTTTTGGTCATTTCATTATATACCCCTGAATTTTGGTTTTGATCCCTCCCATATCCATTCTGTCAATTGACCATTAGTTGTCCATTTAATGGCAGTGGAAAAGCCCGTTTTATGCTTGGACACAGAAAGAATGTAGAAATTTGTGAAGTGTATTTTGGAAATATAGAAGTTTGTTGTGTGACTATAATATCATAACTTTGCTGTATGTTGTTGTGTTTCACAAATTTATTTCAATATATATATATATATATATATAGTTTTTAAAAATATGTGTAGCATTTTTTTTTAAAATGTACAAAACAGTGATACTGGTCTTGCATTTCTTGTACATAATGTCAATAATAGACGCTAAATCTATTATATATAGCATAAAAATTAGCTGTACATATACTCTTTTTAGAAAGACAAATATTAAATTTTCTTAGTCGTTATCTAAAAAGTAAACTTTGCTGTGAATAATAGTTGTCACAACAAACTTATAGTTTTGTACATCAAACTCCAACACTTCGAACAATATGCTCCACGAATTTATACATTTCTTCTTTCCTAAGGGCAAAATGGACTTCTTCATAGCTATTAATCGGTCAACTGATGTAATGGGTATGGAAGGGATCAAAATCAAAATTCAGAGGTATAGAAGAGAGTGAGAAAGGGCATGGAAGGAAAGGGCTGGAATTTCAGGGGCACGCAAAAAATTCTCTTATGGAAGATACATCGATACATCAGGCTGATACAAAAGAGGATGTATATTTTAGTGCATGCAGGAAACTCCATATGTTGAGTTTCCTGTATAGTAGTCTTTAGCCCCTAAATGACTTATAAAAAAGATTTTGCTAATTCTTTAAGTCATTGGAAGTTTTGGTAAATAAAATATTGAAATGGTTGAAGATCATTTTTTCAATGCAATATACATACACCAGAACTGAAACACGGTATGAATTTATGTTATACTGAAAATTATGAGTATTATTTGTGGCAAAAGATTTATTGATGCATTACGGGTCATTTCTTTAAAATTGAACCAAACACTTCTCTTTGTTCATATCAATTCCTTTTCCCCTTCTATAGCATATATTATATATATTTTGGTAGATTTCCATTGTTTAAAACAATCTTATCATCCTAATTGAGATTTTTTTTCAAGTTTGTTCAAGTGATTTTTACTTGATACAGTTTGATGATATCGGAGAGCATGGAACAAAAATAATTGTATTCAACCTCTGGTTCAATGATGATGGGGATATGGAGCTTGATTTCAACTCCGATAAGAAGGTAAGTAATGCTGGCATATTTTAGGGCTCTATTGGGCGCTGTCCAATGATATGTGTTTAGGAGCTTCTATGCTTCAGTATGTGGGAATTTGAAAAGTTGTAATGCACAAATAAATGGTGAGTTCCACTCATTGCGTGTTTCAAGTCGTGCAAAACTTATCGAAGGGGGTGAAGTATGGAAGCACTTCCCCAACCCCCACCCCACCCCCACCAAATCACATGGCACATTTGTGGGCACGTTTCAGATACACCATCCTCCTTCCAACTTTCTCATATAGTTATATGACTGGTTTATACATAAGCTGTATGTATTACGCTAAGTTGTAATTGATCAATTCGTATTTAATATTTTAGGATATCCTCATTACTGGGGCACACCAGGAAGGTGAATACCAACAAGGCAGATAAGGTCGCAACACAGAACTACGTTTCAACTCGACTCCGTTATTCTCTTAGAGTTAAGTATTGATCCCCATTTACTAGTTTGCTAAAATCAGTTTTACTATTTCATTGTGCTGATATGTTTATTTTTGTTTCTATCTGAATTTGAACAGGCATACACATCTGTCTTGTACCTTCACATTCCTGATAATTTCAGAATAGTCTTGCGTGGACATGATGTGGAATCACATAATGTAATAAATGATTTGATGTATCCTGAATGCGTGTTGTATAAACCACAAATTGCTGGGCTTGCAGAGGTACGTGCAACTCACATTTGTGAAGCAATACTATGCATTTTCACCCATTTTGATCAATGGG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External Link(s)

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