BGIOSGA001558
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001558 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001558, complete gene. |
| LocusTag |
P0436D06.46 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001558-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001558-PA |
| Length |
13834 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:19416357..19430190 |
| Sequence Coding Region |
19429983..19430190,19428473..19428582,19428275..19428385,19428139..19428196,19426436..19426525 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:19416357..19430190 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:19416357..19430190 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGCAGCGAGGCCGGCGGCGCTGCGGCGAGCTCTGCCTCCGCGCCCCCGCCGCCGCGGAGGACGCCCCTGGAGAGGACCGCGGACGCGGCGGAGGAGTTGTATCGCCTCCGCGACACCTTCTTCCCCCGAGACCCCGTCGAGAAGGCCGCGGCCCTCCGCGCCCTCGCCGACGACGCCCTCGCCGTCCTCGACTCCCTCCCGCCAGAGCAAAGGAAAACACCGCAACAACGTGCTGTTTATGAATTCTTGAGGGGAAAAATATTGGATGTTTTCCCTGATTATCATAAGGAGGCTGAAGATCATTTATCCAAAGCAGTAAAGTTGAATCCATCTCTTGTAGATGCATGGCTGTGTTTGGGTAACTGCATATGGAAGAAAGGGGACCTGGATTCAGCAATGAACTGCTTTTCATTAGCATTAAGCAAGGGGGCAGACAAGAAAATACTATGCCAGCTCTCAATGCTTGAAAGAAGTATGGCTCAAGGTAGTGAAGGCCAAGCACAGCTAGTGGAAGAGAGCATTAAGCATGCAAAAGAAGCTGTAATGCTTGACATCAGAGATGGAAATTCTTGGTATAATCTGGGTAATGCATATCTGACAAGCTTTTTCGTGAGTGGATCCTGGGATCACATGAAGCTTCATCATTCAGTCAAAGCCTATCAAAATGCTGAAAAGGATGAGACTACGAAATGTAATCCAGACCTCTACTATAATTGTGCCACAGCTGACAAATACCTAGAGAACTATGAAAGAGCACTTCGTGGATTTGAAGCTGCAGCTTTAAAAGATCCTGGTCTTGGTGCTGATACAGAAGTTCAGAAGATCATCAGTCTCCTTGATAAGCTAGATAGTGCAATGAAGGGACAATTACGATCCAAGAGATTAGCATCATCAGTGTCTTCTTTGAGTGAAGTCAACATAAAATCATCTCACAAGAAAGCAACCATAGGCATCCTATCAGAGGGTTTGAACAAGACAGTTGCTGTGTTGGGGAAAGTCATTCTTTTGATAAGACACGACAACATTGCTCCAATGTATTACTTAACATGCGACTTGGATCAGTCTTATTTCATACTCTCAGTCTATGGTCTACGGAATGAAGCAATTAAAGAAGGTGATCGAGTGGCATTGTTGGATCCTTACTACAGAATTCTGGATATATCTTGGAAAGAACAGCGCTATCAGTTCAAATCAATCCGTGTGGACTTTCCAGAACAGATTCTTGTTAATGAAAAAGCTCCACCACCTCATCATGTTGTACGAGCTTCAATCCATGCACACAATAAACCATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSEAGGAAASSASAPPPPRRTPLERTADAAEELYRLRDTFFPRDPVEKAAALRALADDALAVLDSLPPEQRKTPQQRAVYEFLRGKILDVFPDYHKEAEDHLSKAVKLNPSLVDAWLCLGNCIWKKGDLDSAMNCFSLALSKGADKKILCQLSMLERSMAQGSEGQAQLVEESIKHAKEAVMLDIRDGNSWYNLGNAYLTSFFVSGSWDHMKLHHSVKAYQNAEKDETTKCNPDLYYNCATADKYLENYERALRGFEAAALKDPGLGADTEVQKIISLLDKLDSAMKGQLRSKRLASSVSSLSEVNIKSSHKKATIGILSEGLNKTVAVLGKVILLIRHDNIAPMYYLTCDLDQSYFILSVYGLRNEAIKEGDRVALLDPYYRILDISWKEQRYQFKSIRVDFPEQILVNEKAPPPHHVVRASIHAHNKP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..208#1609..1718#1806..1916#1995..2052#3666..3755#6136..6230#8036..8089#8199..8336#9329..9386#9488..9602#10596..10665#12990..13061#13718..13834#ATGAGCAGCGAGGCCGGCGGCGCTGCGGCGAGCTCTGCCTCCGCGCCCCCGCCGCCGCGGAGGACGCCCCTGGAGAGGACCGCGGACGCGGCGGAGGAGTTGTATCGCCTCCGCGACACCTTCTTCCCCCGAGACCCCGTCGAGAAGGCCGCGGCCCTCCGCGCCCTCGCCGACGACGCCCTCGCCGTCCTCGACTCCCTCCCGCCAGGTACCTTCAAGTCGCGGTCTCCATGGCCAGACTATTTCTTCGATTAGTAGCACTGCGCAGTAGTGCTGAGTGCTATTGAAATGGATTCGGTTTGTGATGGTTTCGCTCCAATTGGATTCCGCTAGCATGTAGCTTGAATATCAGAAATGAAATGTAGAAGCCGTTACATGTACTGAGCGTGTTGCAACTTGTAAGCTCTGATGTTTTTATTGATTGCGCATGCTCCATTGGTGCGGAGATGATTTATTAGATACTAATGCAATTTTTTATGCATTGCACCATCTCTCTACTGTTGATGCTAAGTTATTGGTGTGCTGCCTAATATGTTGTGTATTACTATAATTAGGTATTGTATCCCGAATTCAGTACCATGCTCTAGGATGGATGTCAACAGTGTCTGTGTTGGATTTGATGCTGGCTAGTCTGTCTTTCTAAACATCTGTACTCCAGAATTTTGGTGCCCGCATAATGTCTGTTCCAGCATTCATCAATAGGAAATTCTGCTGCGAAACGCAGGCATATATAATCTTATTGTTGTGCATGTATAGCTGTAAACTTTCATGTTTGTGAGTTGGTACAGTACTCATTTTATGTCCAAATGCCTGCATGGTTCCACCTATGCTGCCTTACGTATGTTATCATGAGAACAAGGGGAACTACCATTGCTGTGGCACAACAAACTATGTAAAGCATTAACAAGTCAAGTATTATGCACTATGATGTTCTTGACAATTTCTGAATTCTAATACACAAATGCCTTGAATTATGATATCCAAATTCTTGGCCCCGATCTTCTGTGGTAAGAGAAATTTTTGGGGAATTGCTGACAGCAGCCTCTCAATATCTAAACAACAGCAATGACCAAACCTATTTAGATGGTTGGATCACATCTGATTATACATATTCTATTCACTTGGGGTCCCAACATGATACTCCCTCCGTTTCAGGTTATAAGATATTTTGATTTTGGTCAAAGTCAAACTGCTTCAAGTTTGACTAATAAGTTTATAGAAAAAATAGTAATATTTTCGACACAAGATAAATTTATTATAAAAATATATTTAATTATTAGTTTAATAAAAATAATTTAGTAATGTAAATATTATTACTATATTTGTCTATAAACTTAGTCAAACTTGAAGCAGTTTGACTTTGACCAAAGCCAAAACATCTTATAACCTGAAACAGAGGGAGTATTTCCGCGCTTTTCTTTTCTGTAAGTTGGGACATGCAACAGGTATCATCAGATAGTTTGTGCTTTGATGAGTTGCTAAGTTCGATTGTAACCTTTTGGGACATTCAATTCCTTTTTTCTGTTGGCTACTTGTTATCTAGGTGATCGATCATTCTGTATGTTCATTTCATGCTCTTTTCAGTATATTTTTTTCTTTAACTTCCAGAGCAAAGGAAAACACCGCAACAACGTGCTGTTTATGAATTCTTGAGGGGAAAAATATTGGATGTTTTCCCTGATTATCATAAGGAGGCTGAAGATCATTTATCCAAAGCAGTATGTAGCAGAAGACTACACATTACCTTGTATATGATGTCTATCGGTTAGAAACTTAAACAAACATTGTTCTACTGGATATATTAGGTAAAGTTGAATCCATCTCTTGTAGATGCATGGCTGTGTTTGGGTAACTGCATATGGAAGAAAGGGGACCTGGATTCAGCAATGAACTGCTTTTCATTAGCATTAAGCAAGGTACATTTTTACCTGTAAGTAGCTACTATGTTTTTTTTTTCATGTGTCCAAATTCTCTAGCATAATATCATTTTTCAGGGGGCAGACAAGAAAATACTATGCCAGCTCTCAATGCTTGAAAGAAGTATGGCTCAAGGTGAGATTCTCCTCATATAGTAACTTCTCACTTCTCAGCTCATAGTATTTTATGGAATTAATTCCCCCCACAGCATATAAATTATGATACAGTGTTATGTCACTGATGAACTAATCATACTTTTTTGTACACAAGAACAAAATTCTGAGTATGTGTTTCAATCAGCTCAAGTGTTTTAGTCTGAGCTTTAGGTTTAATGAACTAATTGCTGCTCATGTCAAAATTACGTTTGAACTATTTAATAGATCAACAAGAAACACCACACAAGACAGGAGAGGTTGGGGGGGGGGGGGTCAGATAGGGAGGTTGAGCAATCTTCTGTGGGTGAGATCGACCCTTATGGCCATTCCACAACTCATCTGTTTCTGATGAATAATATACTTGAACTCTGGTATGTTCTGTCCAAAATTGTAAGGCACAAATCTTCAAGTACTATTATCAATATTGAAATATTGGTCCATTGCAAACTAGATCCCCGGCATGCTTAAAATATGTGCTTCTCACTTCTCGGTGGAGTGTTAGGGCATCTCTTTATAAACAGACACGAGCTTTGCTCGTTAGCCTAGCTTGACCTTGGCTCGAATTGATTCTTCTGTTGAAATCAGAATCTCTTACTCCTTAGATGAAATATTATTTAGCTAGACCAAACTTTGAGATTTCATAAGCAGCTCATGAACATCAATAATCAGATTCCTTAGATGAAATATTATTTTACCAACACTAAAGACAACGTGAGTTTGCACACGGGGCTAAACTAATCGAAACAAAACCTAAAGAAAGAGGGGATCGTTGCCTTGGTAAAATAAAGGGCCGGAAGGTCGGTGGCGGCAGCCAGTACATGCACACCGAGCCATTCAACTCAATTACATGATATGTGGGCCCAGGATAAATCAGCTAGATGATGTGACATGGACTGGGCTTGAGACTTGATCCTTGGTCTCGTAGAAAAATAAAAGGAGTTGTGCCTGCAGATTTCACCTGAACTCGTGTGTTTGACCTGCTCCTGTGCATGCATATACGGCTTGGCCTGATTGCATTGAACCATAGCGCACAGGCAGCTGGTACTTGGCTGTTCCTGTACATGCATGCCTTGTTTGTATATATATATACACTTCACTCTGTTGTGTCTTCTCTTCTTTGATCTTGAATAACATCTCTAAATGTGAAACACAAGACAGGCAAAGTATTATTAGCAATCTATTCTTATGCAAATAAATATTTATCCTTATGAACAGATTTTCCTGATAATTAAATAACATAGAAGTGGAGCCAATCTTTTCTTTCCCAGGGCATTAAAAGTGATTTGGGCAGGCACATGGAAAGAGAGGGGACGACATATGTCAGCAGAAGTACTATGTAAAAAAAAAGAGATAGAGATGGCAGACCCAATACCATCACACACTTATCTCGATGCAGATCCAATGTCCAAAAATTTGACTAGTTTCAACACAAAACTGTCAACAAATTATAGCAAACATTGTGTACTAAATGCTAATATTGAATGTCCGAGTCCCTAGTCCCTACTATAAAAAATGTACTACGCCACTTGACTATATCTGTACAGCATTTTCCTCATCTTGTTGCACCCCATTTATGCAGAGTTCTCTTTTCAGGTAGTGAAGGCCAAGCACAGCTAGTGGAAGAGAGCATTAAGCATGCAAAAGAAGCTGTAATGCTTGACATCAGAGATGGAAATTCTTGGTGTAAGAATCTTTTCATTCAAAATAATAGTTGCATATGTTCTGTTTCCTTGGTGTCACATACCACGGTGACATGCCGGCGTTCCCTTGTTGCTTGATTCAACCAGAGTTTAGATTCATATTTTGTGGCATGGTGTAATCAATAAATGTTTTAACCCTGAATTTGATTTTGTTTAGTAAGATTCCAAAACAGCCAGTTGTGATAGACCTGTTATGGGTTAGGGTTGGTAAACACCGCCTGGGGGATTGCCGGGCGGCGACGGCTTCTAGGGATGAGAAGGGATATAGGTTGGGGGAGACTAATTCTGATTCATTTCTCAATTAGAATGATGATGCAATCCATCCTTATATAGGTGGAGGAAAGGACCTAGTCTAATCCTATCCAACAGACTCTTAACCAACTGAGCTACTGTAATACTGTACCGCTCCCTGGGGACTCGACTCCTCAGCCCACTGCCCATGACATAGACATTTATCTAGTTTCAAACAAGAAATGCGTTCTCATATCATTATATACCCCAAAGCTTGTCTTGTCTTTTTTGTAAGCTGTTGCATGAACATCAGAGGAGCCGGAATATTCAGGAACTATATTTGCTGACAGCGTTTCGTGTACAGATTGGTTATTGTGCTTGTGGAGGAGAATTTTAAATTGCCTGGTGGCACATGCACGCTTTTGATCAAAGCTTGGCTAACCCACTCTAGTTATTTTTGCGATATGCATTCTTGTTTTCAATGCGCACAACCCTCAGGTGAAATGGAACGAACAAAAACAACTAGCTCCTAAAATTAAGCATCGTCTTTTCTGTTTGGAGCAGACCAATGCTAGTGTTTTATTGCTTCAAGATAAAACTGAAATTGTGCAATATTTTATTCTGAACTTTGCCTTCTTTCCTTTAGAAGGCTGTCGTCTTATGTACTGCACATATATATTTACTTTAGTCCATTGGATATATGCCAGAAATTGAGATTTGCCCGAACAATTACTTCAGTTGTAAACTTGTACTCTTAATACTATGTGATCACTAGTACTACCTCAAAACACATTATCACTTTCTTCAGGAGTGATCCTGGAGTGTGCTTGTTGGTTAA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