BGIOSGA001838

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA001838

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001838, complete gene.

LocusTag

OsJ_01411

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA001838-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA001838-PA

Length

8183

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:11811478..11819660

Sequence Coding Region

11819203..11819660,11818962..11819088,11818017..11818047,11817151..11817816,11816736..11816947
,11815337..11815381,11814948..11815044,11814438..11814528,11813366..11813444
,11813004..11813127,11812614..11812702,11811478..11811603

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:11811478..11819660 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:11811478..11819660 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAGCAAAATCGCCCCCCTTCACCTCACTAACCCTAGTTCGACTCCTCTCCTCTCTCTCCCGTCTCTCCGCCCGATTCCAATCGGGAAGGGGATTCCAATCGCTGTAGCCGCCGCCGCTCATGCGCAGGCCGGTCTGGGCCGAACTGGGCCTGTATTGGGCTTCTGCATTGCTGATGGCCCCGAAACGGCCTGCGACGTGGCCCAACAAGATGGCTACACTGTCACTCACTCACTCCGCCGCTTTTCCCTTGACCCCTTCCTCTCGTCGTCGTCGGTGCGGCGCCGCCAGGGAAAATGGAGTCATCGAGGCTGCGGAGGCGGCGGCGCTGCCGCGTCCGGTGCCTCCTCGCTCCTCCCGTTGCCGCCCGTGCGCAGCAGCTGCAGCGCGTCGCATCTTTCTCCAAACCCACGCAGATCTCCGCTTTTTCCCGGCGGCAACCACGCCGCGGCAAGCAGGAATTCTCTGCTTCCTAGATCTCTAATCATTTACTTTGGAGTTCTTAGCAATGTTTTTGGGTATTGGATTCTATCACTTGAGAAAATGAGAACCGCCATCCCGCACACACCAAATGATGAAGAAATGGTGTGGATGACTTCATATATGATATACTTTGTTCTAGTTATAAGCCTGTGCAGAATATGCAGAAGAAAGAAGTACAAGATACACGACGCAGGAGATTTGCAGCAGGAAAACATGTTCTCTGTCTTAAACTTTGATGGTGGAAATGCATACGAGCAAATTATTGAAGCGACGGAGAACTTTAGTGAAAAATATTGCATTGGAGCAGGTGGTTATGTGTCTGTCTATGTAGCTAAATTATCAAATGGTAAAAATTTTGCAGTCAAGAAGATAAATGCAACAGAGAATGGCCGTTTGATAAACGAGCAAATGTTCTATCGTGAAATAGAGGCCACAATGCAAATACGCCACAAGAACATTGTAAAAGTCTTTGGCTACTGCTGTACAGCACGAGATAAGTTTATTGTCTACGAGTATATGAAAGGAGGAAACTTGTTGACAGCTCTCAAGTCCTACAGAAGTGCAAGCGAGTTGGATTGGAAGCGCAGGTTATGTATTGCTCAGGATGTTGCTCATGCCCTATCTTACTTGCATCACGACTGTTCAGATCCTATAGTCCATCGAGATGTAACAACCAAAAACATTCTGCTAGATCTGGAGTTCAGAGCTTGTTTATCAGACTTTGGGATAGCTAAAATACTGGATGCTGATGGATCAGGACACACAAGGCTCGCTGGTACAAAAGGATATCTTGCACCAGAGCTGGCATACACTACGAAGGTGACAGAGAAATGTGACATTTATAGCTTCGGGGTGGTAGTTCTTGAGCTGTTGATGGGATCTCACCCTGGAGACTTTGTTTCGTCGATCTCATGCCCTAGCAAGAAAAGCACACCGATGAAGGATTTGTTGGACACCAGACTCCCGCCTCCAGAAGGTGAAGTTGCAAGCGAGATATTTGGATTGATCACGGTTAGAGGCGATGGCGAGATCCTAAGCCAGGTGGTATCTTCCCAAGTTGTCCAGAAAGCACTTGATGATGCAAATGTGTCAGAAAGTGATCTTTCTGCAGTGGCTGTCACCGTAGGACCAGGACTTAGTTTATGCCTCAGAGTTGGTGTTCACAAAGCTCGAAAAATAGCAAAATCATTTCACCTGCCTATTGTTGGAGTTCATCATATGGAGGCACAGGCATTAGTTTCCAGATCAACAGATGATATTCCTATTTCATCTGCTACAAAAGATGACAGACAAATAAGGGCGAACATTGCTGCCTCTTTTCAGTTATTAAAGGTTGTTTCAGGAGGCGTTGCATCAAACCAGTATGTCAGAACTCATTTGAATCAGATTGCTGAGAAGAATGGCCTACAGCTCGTATGCCCTCCACCAAGGCTTTGCACTGACAATGGTGTCATGATTGCTTGGACTGGTATTGAGCATTTCATTGCAGGCAGATTTGATGATCCTCCTGCTGTTGATGAGCCTGATGATTTGCAGTATGACCTGCGTCCAAGGTGGCCTCTTGGTGAGGAATATTCAGATGGAAGATGTGTTGCACGATCAATGAAAACTGCTCGAGTCCACCCATCACTCGCATCGATGATACAGGGTTCTGTTCATTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSKIAPLHLTNPSSTPLLSLPSLRPIPIGKGIPIAVAAAAHAQAGLGRTGPVLGFCIADGPETACDVAQQDGYTVTHSLRRFSLDPFLSSSSVRRRQGKWSHRGCGGGGAAASGASSLLPLPPVRSSCSASHLSPNPRRSPLFPGGNHAAASRNSLLPRSLIIYFGVLSNVFGYWILSLEKMRTAIPHTPNDEEMVWMTSYMIYFVLVISLCRICRRKKYKIHDAGDLQQENMFSVLNFDGGNAYEQIIEATENFSEKYCIGAGGYVSVYVAKLSNGKNFAVKKINATENGRLINEQMFYREIEATMQIRHKNIVKVFGYCCTARDKFIVYEYMKGGNLLTALKSYRSASELDWKRRLCIAQDVAHALSYLHHDCSDPIVHRDVTTKNILLDLEFRACLSDFGIAKILDADGSGHTRLAGTKGYLAPELAYTTKVTEKCDIYSFGVVVLELLMGSHPGDFVSSISCPSKKSTPMKDLLDTRLPPPEGEVASEIFGLITVRGDGEILSQVVSSQVVQKALDDANVSESDLSAVAVTVGPGLSLCLRVGVHKARKIAKSFHLPIVGVHHMEAQALVSRSTDDIPISSATKDDRQIRANIAASFQLLKVVSGGVASNQYVRTHLNQIAEKNGLQLVCPPPRLCTDNGVMIAWTGIEHFIAGRFDDPPAVDEPDDLQYDLRPRWPLGEEYSDGRCVARSMKTARVHPSLASMIQGSVH</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..458#573..699#1614..1644#1845..2510#2714..2925#4280..4324#4617..4713#5133..5223#6217..6295#6534..6657#6959..7047#8058..8183#ATGAGCAAAATCGCCCCCCTTCACCTCACTAACCCTAGTTCGACTCCTCTCCTCTCTCTCCCGTCTCTCCGCCCGATTCCAATCGGGAAGGGGATTCCAATCGCTGTAGCCGCCGCCGCTCATGCGCAGGCCGGTCTGGGCCGAACTGGGCCTGTATTGGGCTTCTGCATTGCTGATGGCCCCGAAACGGCCTGCGACGTGGCCCAACAAGATGGCTACACTGTCACTCACTCACTCCGCCGCTTTTCCCTTGACCCCTTCCTCTCGTCGTCGTCGGTGCGGCGCCGCCAGGGAAAATGGAGTCATCGAGGCTGCGGAGGCGGCGGCGCTGCCGCGTCCGGTGCCTCCTCGCTCCTCCCGTTGCCGCCCGTGCGCAGCAGCTGCAGCGCGTCGCATCTTTCTCCAAACCCACGCAGATCTCCGCTTTTTCCCGGCGGCAACCACGCCGCGGCAAGCAGGTGAGAAGAGCTCAACTCGCTGCATGCAAGTTGCTCGATGAAATGCTTCCATGGAGCCAGCTTCTAGTTTCTCGTGTACATGTACAATTTACTTTTTTTCCGTTTTCTTTACAGGAATTCTCTGCTTCCTAGATCTCTAATCATTTACTTTGGAGTTCTTAGCAATGTTTTTGGGTATTGGATTCTATCACTTGAGAAAATGAGAACCGCCATCCCGCACACACCAAATGATGAAGAAATGGTATGCATACGTTTAGTGTGTTTGTAGCGTTGTTGACCTTTGAGTAATGTGCTGCAAGTGAGATGACCGATTCTTTGTTAGTTCCTCAAGGCAACCAACACATGATCCGTATCCTAGCTTAGATTGAAGCATACGGAACTAAGCAGAAACCCGGGCGATAGTAATAAGTTTATTGCATATTTTCTGCACATGGACTTAGGAAGGTTTCCTCAATTTTTTTTAATGAACTTTGGAGGGACTTCTTCAGTTTGTTTAGCTCAATTTTAATTCCTCGGTCAGAGGAACTAAGCAGAAACCCGGGCGATAATAATAAGTTTATTGCATATTTTGTGCACATGGACTTAGGAAGGTTTCCTCAATTTTTTAATGAACTTTGGAGGGACTTCTTCTGTTTGTTTAGCTCATTTTTAATTCCTCGGTCAGAGGCTTTTAACCAAACACGCTCAAAGTCAAGAGTCCAAATATAACTATCATAGTTTCACGGCACGTTGACAGTTGACACTAGATTGCCAGCTTGCTCATCAACCAAATATCACCATACAATTTCCAGTAGGAAAACCAACTACATACTCTATAATTGTTTAACCCATCTTGTTGTACTTTAGTCTAGTTAATTGATAGTTATACATGCTAAACCCAGGACTAGTATTAGGGTGCTAGCTACGCATACAAGATCCAGAAACTGCTCACACGTTACAGGAATCAAATACCAAAGCATCCAGTGACTGTGTCGCTGTTCGTTCTTTGGTCAGAAGTCCCTTACATGCATATATCTCATTCTCTTTGGCTCTCCTCCTCGCAACCTACCACAAAACTCATCCTTCAAGTTTCCGTGTCTTCTCGATTCAGTCTCACAATCCCCAACATGTATTTGCCATGGCTCATTGTGTTACTCTTTGTCTTGGCTGCTGCAGGTGTGGATGACTTCATATATGATATACTTTGGTATATGATATACTTCATATCTTCATCATGTTGCATATGTGTTCCCTCATAATTTGTTGTGCAAATGTGTGGTTTTGTTAACAACTAAAACTGTGGGTTTGTGAAACTGTTTCTTATGAATGTGTAGTTCACTGATTGCCTTTTGCATTAGAACTTATAGTTTTCTGAAATTTATCTTACTCTGTTTGTTGTTCTTGCAGTTCTAGTTATAAGCCTGTGCAGAATATGCAGAAGAAAGAAGTACAAGATACACGACGCAGGAGATTTGCAGCAGGAAAACATGTTCTCTGTCTTAAACTTTGATGGTGGAAATGCATACGAGCAAATTATTGAAGCGACGGAGAACTTTAGTGAAAAATATTGCATTGGAGCAGGTGGTTATGTGTCTGTCTATGTAGCTAAATTATCAAATGGTAAAAATTTTGCAGTCAAGAAGATAAATGCAACAGAGAATGGCCGTTTGATAAACGAGCAAATGTTCTATCGTGAAATAGAGGCCACAATGCAAATACGCCACAAGAACATTGTAAAAGTCTTTGGCTACTGCTGTACAGCACGAGATAAGTTTATTGTCTACGAGTATATGAAAGGAGGAAACTTGTTGACAGCTCTCAAGTCCTACAGAAGTGCAAGCGAGTTGGATTGGAAGCGCAGGTTATGTATTGCTCAGGATGTTGCTCATGCCCTATCTTACTTGCATCACGACTGTTCAGATCCTATAGTCCATCGAGATGTAACAACCAAAAACATTCTGCTAGATCTGGAGTTCAGAGCTTGTTTATCAGACTTTGGGATAGCTAAAATACTGGATGCTGATGGATCAGGACACACAAGGCTCGCTGGTACAAAAGGATATCTTGCACCAGGTAAACAAAATTTATTATGTTGAACCTACTGTTTTGATTATTATTTTTCTTATCTTATGTATTTTTCTTGTTGCATGAAGCTGCATTATATTACTAAAAAATATGCTCTACGCTATACTTAATATGCATGAAGAAGTTACCACAATATTAACATAAATTAATATTTAGTACATTTTAATCTGACTGAACTCCTGATACTTCAGAGCTGGCATACACTACGAAGGTGACAGAGAAATGTGACATTTATAGCTTCGGGGTGGTAGTTCTTGAGCTGTTGATGGGATCTCACCCTGGAGACTTTGTTTCGTCGATCTCATGCCCTAGCAAGAAAAGCACACCGATGAAGGATTTGTTGGACACCAGACTCCCGCCTCCAGAAGGTGAAGTTGCAAGCGAGATATTTGGATTGATCACGGTTGCTATACAGTGCCTTCACCCCAATCCATCAACTCGTCCGACGATGCCATCCACAATTCATTTGTTCTCCAAGTTTTCTAGGGCGGTTGATCTTGATTATCTGCATGCTGACATCATGGAGTTCTGCCTTCTTTGAACCTTGACCTTTGTATTCATTTTCTACTTGTGGAATGTTCCCGAGGATAAAGGGAACTACACAGGTATTCTACATTTTATGCCTTTGTTGATGTGGGAAGGAAGGGAGCTAATAGGTGTGTTGTTTTACAAGAATTGCTATCATCTTTCTTTCCCCATAATTGTGGTGTTGTTTATAGTTGAATATTTGTTTTACTTTGATATTGTATATCTCATTTAATATGCAAGTTTACAAAATAATGTTTAATGATGTAACCTATGTTTAACAACGTTGTAGAATTGTTTCATAAATTTTGAAAAAAAAATCATTTTACTTCTCGGAACTATTTCACCGGAGCACTTAACCCTCTAAACTATTGTTGGGTTCATTTTACATCCTCAAGATATTGAAAGCGGTTCACTTCACTCCTCTAACGCTCTCTCTCTTTTTTGTTTTTATCTATAGAAGTCATCGCACTGAAAATTTGGTAGAAAATATAGTTGCATTCACAACTTACGCCTCAACTTTTTTTATATTTTTTTCTCACTGTTTATGTATGTTGGAAGCAGTTAAAACTGATTTAAACATCAACATTTTAAAGTTCAAGCAAACAGCCATGAAAAAATTTCAAAATATTTTTGAACTTTGATAAAGGTGTCATCTATGGCTCTAATAAATTTTAGCTTAAAATATAACTTTTATAAAAGAGTAACAAAAAAAATAGAGCTGTTATTAAGGAGTAAACTGAATCATTTTTAATAGTTTAAGGGGTAAAATGAGCCCAAAAAATAGTTCAGGGTTAAGTGATCCATTGAATTAGTTCGGGGAGTACTAAAATGAACTTTTTTTCTAAAATTTTTATGGCAATTAGGAATAAATGCAAAGTATATATGGGTGTAATTGCGTAAAAAGTTGTGTAAATTCGGTCATGTCAGACAAATGTCAGCCCAAACTAGGCCCGTTTAATGCTAAGACTTGTCAGTCCGAAGGCCCAATCTAACTTGCGGGCTTGCGGCCTGTGCGAAAACTCTCGTGGTCAAATCTGAATATCCGATACTTCCGTTTCAAATGCAATCCAAGGCCGAAGCTGAGAGAGTGCAAAGCCGAGCCACGGTGGAATGGCGGCCACCCCCCCCCCCTCCCTTTCCCCCATGGCAGACCGCTTGTAGCTGTGGTGGAGCCATGTCTAGGATTTGTTCTTAGTGCCTTGGCTCTCTGTTGCCTTTGTTGGTTGCAGGTTAGAGGCGATGGCGAGATCCTAAGCCAGGTGGTATCTTCCCAAGTGAGACACTATGCCCCCCACCTCCCTGTCCAGCACACTTCATTTCTGTATATTTGTCATGTTATATTCTGTGCGCTGCTGATAGTATTGCTTTGTGCTTACAACATTTGGAAGGAAGATTTACTCGTGAGGTGGGGAGGCGTCGCTCCGAAGATGGCTGAGGAAGCTCATTTGCTTGCGATTGATCGGGTTTGGCTTTCAGTTTCAGAGTTTCTGTTCAGAAGTTGTGCGGATCTTGCTGTTTTTTACATTTATGTTAAAGAGTTGCTAACTTTTTGTACTTTCCTTGCAGGTTGTCCAGAAAGCACTTGATGATGCAAATGTGTCAGAAAGTGATCTTTCTGCAGTGGCTGTCACCGTAGGACCAGGACTTAGTTTATGCCTCAGAGGTATTTGATGCTTTTGTATGTTTACTCCTGATCAATAGGATTATCTGGTATTTACTGTTATGTCTTATATGCTGGCATGGTTCTGAATTTTCAGTTTGTTACAGAATCTTGTTTGCATCTTTCAATCATTCCCCACAACCAAAACCC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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA001838