BGIOSGA001966
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001966 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001966, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_01237 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001966-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001966-PA |
| Length |
8551 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:9411939..9420489 |
| Sequence Coding Region |
9420360..9420489,9419370..9419556),complement(9418578..9418751,9418289..9418436),complement(9417326..9417438 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:9411939..9420489 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:9411939..9420489 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGATGGCGGAGGAGAAGCGGGTGGGGGAGGCGCGGGCGCCGCTCGCCGTGGAGGCGCTCCGGGGGAAGATCGTGGAGAAGGTGAAGGGGAACCGCGTCACGCTCATCGTGGGGGACACCGGATGCGGAAAGAGCTCTATGGTTCCACAGTTCCTCCTGGAAGAAAACATGGAACCCATTCTATGCACGCAACCAAGGAGGTTTGCAGTAGTAGCCATTGCTCAAATGATTGCCGAATCTCGCAATTGTCAGGTAGGAGAAGAGGTCGGGTATCACATAGGACACTCGAATGTGTCCAATCTCAATTCAAAAAGGTCAAGAATTGTTTTCAAAACAGCTGGTGTTGTATTGGAGCAAATGCGTGACAAGGGCATTGCTGCATTGAACTATAAGGTTATTATTCTCGATGAAATACATGAAAGGTCAGTGGAATCTGACCTTGTCCTCGCCTGTGTCAAGCAGTTTATGATGAAAAAGAATGACTTGAGGTTGATTTTGATGTCTGCGACTGCTGATATCACAAGATATAAGGAATACTTCAGAGATCTTGGAAGGGGTGAAAGGGTTGAGGTGATTGCCATTCCTAGCAGTCCACGCAGTAGCATTTTTCAGAGAAAAGTCCTATACCTTGAGCAGATTGTTGATATTCTCAAGATGGACTCGGAATCACTATCAACAAAATACTGCTCTGGACCCAATGCTGCCGCTGATGCTGGTCTAAAACCAGATGTGTATGAACTTATTCATAGCATTGACACCGATGAAGCTCTTCAAACTATGAAGGTCTCAAAGTCCTGTCGTAAGGTTATACTGGCAACAAACATTGCAGAATCATCAGTCACTATTCCAGGAGTTGCTTATGTTATTGACTCCTGTAGATCACTGCAAGTTTATTGGGATCCAATCAGGAAAACAGACTCAGCTGAGCTTGTATGGGTTTCCAAATCTCAGGCTGAACAGCGGAAAGGCAGGACAGGGCGAACCTGTGATGGTCAAATTTATCGCTTGTGCAAAATGTATAGAAACAATTACTTTGAGGAGGAGGGTATCGACCTGCAAACTGGCAAGAAGGAAGCTGCACTTGTTGGAAATCTTTGTGCATTTCAATTCTGGCAGCGTATGTTTAAGGACAAGTATCGTCTGGATTGTCTGATAAATGTGGTGAACACTCATGAACCGAAGGCATCTAATGGTTTTGTTGCTAAACCTGAAGATGAGTGGTGTGCATTTCATAACCTTGTGCCAACAGCACTTAACTACATCTCTGAAATTTATGATGATATTATGGGCACACTTCACCGATTTAGACCTAGTTTTCTTGTGAAAATAAATCCTCCAATGTACCTTCAGCCTTCCGAATTCCACCACATGTGTCTTCGCCATGAAGTGCTGGAACTAGAGAATGTGAATTCACTTCCATTAGAAGCTGAGAATTCTCACTTGGATTCACATCGGAGGTGTTCTGCAACCCCTTATGTTTCTCCAGCTGATTTTGGAACCACTACTGTTGTTAAAACACTGAAGACACTTATCAAGGAGATGAAGACACAATCTGCGGCAGACAGGGTAACTTATAGAGAACTAGTTCATGGTTATGTTCAACCAGCGTTGGAAAATGAGATGTGTGTGTTCTTTCTTAATGGATCTTGTAATCGAGGTGATACATGCCATTTTTCTCATTCTTCTCGTGCTCCAAGACCAATATGCAAGTTCTTCCTCACATTACAGGGTTGTCGAAATGGTAGCTCGTGTTCATTTTCACATGACTCTGGTTCTTTGGTTTCTTCATCTATCACATCTGGAATCTGCTCTCAGGAAAACAGAGCTACTTCAGTATGTTGTAAAAGGTTGCTGCCTGCTGCTGGTGATGGGCATATTCTTGTCATGAATGATAAAAGTTTACAGTTCGCTTGTAAACTTTGTAACTATTATGACCCCACTAAGATTATTGCCTGTACACCTGGTCCTCATTCATTCGAGTCTGATTCAGTGACTAAGGGCCTCAAGATTCTACAGAATTTGGCTGATCCCTCTTATCTATTCATTGGAGGTGACCATAAACTATCAGTTCCATGGACAAAATTGAGTCGAGTATTTTGGTTTGCTGATATTGATTCCAACGAATCAATTAGCGAGCAAGTTGTCTTGCAGAAGTTTTTCCAGCATATTGCCATCAAGACCTTGTCAGAGAAGATGTCAGATTTGCAGGTCATCGTGATCATGAATAACGCAAAATTTGTTCAGTTACAGGTCGAAAGATTGGCAAGAGAGTGCTTCTTATTTCTGGGTGAATCATTTATGTTTGATGAAGCAACTCTTGGATGGTTCTCGGATACCCCTAATTACCCAAGAGGGATGCAAGTATCAGCACCAGTTGCTTACATCTTTAGCATGCATCCTCCTACTGGCATTCAGTTTGGTGATTACGCATCAGAACTGCGCAAAGTTTTATACAGCAACTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAMAEEKRVGEARAPLAVEALRGKIVEKVKGNRVTLIVGDTGCGKSSMVPQFLLEENMEPILCTQPRRFAVVAIAQMIAESRNCQVGEEVGYHIGHSNVSNLNSKRSRIVFKTAGVVLEQMRDKGIAALNYKVIILDEIHERSVESDLVLACVKQFMMKKNDLRLILMSATADITRYKEYFRDLGRGERVEVIAIPSSPRSSIFQRKVLYLEQIVDILKMDSESLSTKYCSGPNAAADAGLKPDVYELIHSIDTDEALQTMKVSKSCRKVILATNIAESSVTIPGVAYVIDSCRSLQVYWDPIRKTDSAELVWVSKSQAEQRKGRTGRTCDGQIYRLCKMYRNNYFEEEGIDLQTGKKEAALVGNLCAFQFWQRMFKDKYRLDCLINVVNTHEPKASNGFVAKPEDEWCAFHNLVPTALNYISEIYDDIMGTLHRFRPSFLVKINPPMYLQPSEFHHMCLRHEVLELENVNSLPLEAENSHLDSHRRCSATPYVSPADFGTTTVVKTLKTLIKEMKTQSAADRVTYRELVHGYVQPALENEMCVFFLNGSCNRGDTCHFSHSSRAPRPICKFFLTLQGCRNGSSCSFSHDSGSLVSSSITSGICSQENRATSVCCKRLLPAAGDGHILVMNDKSLQFACKLCNYYDPTKIIACTPGPHSFESDSVTKGLKILQNLADPSYLFIGGDHKLSVPWTKLSRVFWFADIDSNESISEQVVLQKFFQHIAIKTLSEKMSDLQVIVIMNNAKFVQLQVERLARECFLFLGESFMFDEATLGWFSDTPNYPRGMQVSAPVAYIFSMHPPTGIQFGDYASELRKVLYSN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..130#934..1120#1739..1912#2054..2201#3052..3164#3308..3362#3968..4114#4207..4263#6018..6137#6432..6576#6903..7168#7262..7450#7581..8102#8339..8551#ATGGCGATGGCGGAGGAGAAGCGGGTGGGGGAGGCGCGGGCGCCGCTCGCCGTGGAGGCGCTCCGGGGGAAGATCGTGGAGAAGGTGAAGGGGAACCGCGTCACGCTCATCGTGGGGGACACCGGATGCGGTAACCGCGCTGCTCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTCTCTCGTTTCGACCCCATCCGATTGGCTCCCGTGGTCGGTGGGGGTTTGGGGGGGAGGTTTTCGCGTTTGGTTATGGGTGCGCATTTTTGCCGGATTTTTTTTTGTTTCATCGGCGAAAAGTTGGTGCTTGGTTCGTTCATCTATGTTTTTCTCTCACCTCATGGGTTTTCCGGCCTATGGTAGGATGGCATGGTATTGGGGGGGTTTTTCAGTTTTGGATTGTAATTTCTGCCGTGCCGCGGAAATGCGGGATACTGAAAAAGGAGGGGTTTTTTTAGTGGGTTTCAGGCTCGAGTGCTGGAGGTTTTAGCGATTTTTCAACCTTGGATAGGGTTTTTTGCATCTTTATTGCAAGGGTTTTGGTAAAAGTGATGTTCTTCAAATTTGATAAGATAACGAATGATCTACGAGAGATGTTTCCTTTCCCTTGTTTCTGTTTCTTCTTCTGACAATAGTGTGGATTTATCTTCTAAAAATTCTGCTTTTAGGGAGTCTAACTTTACTATAACTAGATTTGCATCCCAGAGGTTTCTGATCTGAGTGTTGCATTGTTACGAACTCAGAGCCACAACTAGCCCCTTTTTTTGCATTTTTTTTTCTACAAATTTAGGTCACATTGCATTTATTCTCTGTTTTTTTTTCTGTTGCACGTTCAGCTTGTTGAACCAATGATGGGTAACATTGCCATGTTTTTTTAATCATTATCTGGGATGTAAAATTCTGCCTAATTTGGACCTACTAACGGATCGATATGCTGTTTCATTGCAGGAAAGAGCTCTATGGTTCCACAGTTCCTCCTGGAAGAAAACATGGAACCCATTCTATGCACGCAACCAAGGAGGTTTGCAGTAGTAGCCATTGCTCAAATGATTGCCGAATCTCGCAATTGTCAGGTAGGAGAAGAGGTCGGGTATCACATAGGACACTCGAATGTGTCCAATCTCAATTCAAAAAGGTAATTCCTCTGTGATCCATGATTAGTGAGTTTTCATAATAACCTTAATAAGGACACAAGCAATGAACGAGCTGAGACACATTTAATTTGTATCTATACAACCGTAGTGAAAATACTACCACTAATTGTAATTTGTATCTATACAAGCACAGTGAAAATGATATCACTAATTGTAATTGAACTACAGTGACAAGACATTGACCTCATTGGCACCGTATTTGCTGATATTAGGCAGTTGGATTTCTTCTACAAATTCTGCTGATCTCAATTAAAATTGTTATGCATGATACCTTTTGTAGCAAAGGATATTGAGCATATTGAAAGATTAAGTTCTTGTAGTATATAACTTCTTTTTTGTGAGAATTTTAGTATATAGAGAAGGGCATTCAAGCAAATTTGCTTTATCCTGGCTGGCCATCCATGTCATAGAACGACATAACATGCAGGCCCATTTATATCCACATTGCTAGTGCGATTGAAATCTGGATATATCATATAAAACAGTGCTACACATTCTCTCTAGTATCTTATCCACCTCAGTTGCATACTTGTATCATATGTCCTTACCCACTTGTCGATTGACTTCTAACTTTCAAACCTGTTCGACGCACGAATCAGGTCAAGAATTGTTTTCAAAACAGCTGGTGTTGTATTGGAGCAAATGCGTGACAAGGGCATTGCTGCATTGAACTATAAGGTTATTATTCTCGATGAAATACATGAAAGGTCAGTGGAATCTGACCTTGTCCTCGCCTGTGTCAAGCAGTTTATGATGAAAAAGAATGACTTGAGGTAATTGCTGCAGTGACCTGTTTTAATGCTTTCCGTTAAACCATCTTTTAGTAGTGATGATTCCAATCCACTTTAAAAACTGACTGCCTTACTTTCTTCCTGCTGATTGATAAGACGTGTGTCATTCCTCTCTTGACATAGGTTGATTTTGATGTCTGCGACTGCTGATATCACAAGATATAAGGAATACTTCAGAGATCTTGGAAGGGGTGAAAGGGTTGAGGTGATTGCCATTCCTAGCAGTCCACGCAGTAGCATTTTTCAGAGAAAAGTCCTATACCTTGAGCAGGTAAATGTTACATCTGACTTTAGAAAGTCAGCTATCCATGTTTATTGTTCTCAATTACCATTAAACTTCAATAAGAAAACAAATTAATTTCTAGTTTAAGTTGCATATTATACCTTATTTTTCCTCCATGGTATGTAATTAACAATTTACCACACATACAGCAGTTTATTCCTGTATTTTCTACAGGCTCAGTTTTGTAGCATGGATTTTACTATTCTATCATTGACCTATCATAATAATCTACTTTTTAAGCTGTATTTCCTAAATACAGCAACTTAAAATTATGATTTTGAACTTTTAACAGTACTACTGTCTGTTCCTAGTTTAGGCCAACTTATTGATATTTCTGAAATCGAGTATATTTATTTTATTCCTTTCTTTCATAAAAGTACTTTCTTCAAAAAAGAGCATGTCTCTAAAAATGCCGAGTGGTGTTAGAGCTCTCTCTCTCGAAGGCACTCCTTTGGTTTTCGAGTTGAAGGTACAGACATAAAGGGGGTATGCTAAGCTTGCTAAATAAGGGCCTTTAAACAACTCTAGTTTTCTTAAACAAAATGCACGGGAACTTACGTTCACTAACTGGATACTAAAACGGACAAAGGAAGTGGAGATCAGGCGATGTAGACTCGAAATGACAGCTTCTCGCATGGTTTGCAAGGCCGAAACCCCCTGTTTTAATGACATAATTGACTTGTGCACCTGACCAACAACATGAGTTTTACTATTATCATCATCATTAGAAGTATGTTCCTTTACCTGTCGCTGCTAGTTGTTTTTCTATTTTAATGTAATCTACTGTATAGCTTACCGCTCACATGTTTAGTACGTAATGCTATGAAATGCTGGACAGATTGTTGATATTCTCAAGATGGACTCGGAATCACTATCAACAAAATACTGCTCTGGACCCAATGCTGCCGCTGATGCTGGTCTAAAACCAGATGTGTATGAACTTATTCATAGGTTATTGTTGCATATACACCAAAATGAGCCAGACATTGGGAAGAGTATTTTGGTGTTCCTTCCTACATACTATGCTTTGGAGCAGCAATGGATTCGTCTGCTATCTGCTAGTCAATGTACAAAGTACACATTCTCCATCGCAGCATTGACACCGATGAAGCTCTTCAAACTATGAAGGTCTCAAAGTCCTGTCGTAAGGTACAATTTTCTGCATTGAAATTCAGCTTTGTGTTTTAGTTAAATGTTTCTGAACTGTTAAGATTTTCTCCTATGAACAGACACAATGATAGACATTATATAGACAGTGCATAGAATTATTGCTGTCCTGTTATCACTATCCTTGTTTTCTACTTGCAGGTACATAGCTGCAAGCCTGCAATACTCTTCAGCATAAATTGCAAATTTATTTAAAACCCATTGCATGTTTTTAATTACCTTTAAAGTTGTGTTCTGAATATATTAATGAGGTTTGCCACTTTGCCATCATCTGCAAAAAGCAAGTTCTGATTTATTTTCCTTTCCAACATTGTTTTCCACTAGCACTAGCTTTAGAACACAGGATTCAGTCCCCGGCTACAGGGGCTCTGTCCACTGCATCCTCCCACAGCAACAGATCCAGAGACCAGGAGTACCAAGTGACCCTGATAATCATATAATTTGCACTTAAAAATAATGTAACATTGATTTGGCCTGTAATGTTCAAAATTTACATGATTGAATATTCTCCTCTGTCTAATTGGTTTCGATTGAACTCACTCAAATGCGATTGAACTATAATCTTCTTGTTTGTATCTTTGTTGCAGGTTATACTGGCAACAAACATTGCAGAATCATCAGTCACTATTCCAGGAGTTGCTTATGTTATTGACTCCTGTAGATCACTGCAAGTTTATTGGGATCCAATCAGGAAAACAGACTCAGCTGAGCTTGTATGGGTTTCCAAATCTCAGGTATATCTCACAAATATACTGATGTTTTTCGTTTGCAACTAAAGTTTGACCCTAAAGATTGTACGTTACAATTTTTTTGTAATTATTTCTAGGCTGAACAGCGGAAAGGCAGGACAGGGCGAACCTGTGATGGTCAAATTTATCGCTTGGTAACTGGGCCATTTTATAACAGTTTAACTGATCATGAGTATCCTGCCATTTTAAGATTGTCCTTAAGAGAGCAAGTACTCATGATTTGTTGTGCAGAGTCCAGAGCTATGAACGATCCTCATGGTAATTCTTTTCATGCATATATTTCATTCGTGTCTTTTTTCTGACAAGTTCAGCCTTTGTTACATTTGCATAAATTTATGCTCCATGTTTTTTAATGTTTTGTGATGGAGCACCATTAGCATTATTTATATTCTTGAGAAGCTACAATTGATTTTCCTTCTTTTATTTACTAAGGTTCTGTCCACTCTTTTTTACTTGTCATCTAGGATATCGATAGTCTTAGCACATGTTTTTATCATTAGTTTAATACTTTTTTTTTCTAATTGAGTGTTTATAAAAAATATCGATACTATAGCTAAATGAAGTATTTTTCATGAAAAATCTACTAATATCATGTACATATTTAATATATATTTGTTTTGCATATATTAGTGATTTAAGATGAAGGTTTGCCTGCATGCATTTTAGAACAGCATCTTTTTGTAAATGCAGGATACTAAGTTATGATAA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