BGIOSGA002120

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA002120

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA002120, complete gene.

LocusTag

OsI_00916

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA002120-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA002120-PA

Length

5852

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:6971963..6977814

Sequence Coding Region

6977500..6977814,6976550..6976736),complement(6976135..6976202,6975952..6975993),complement(6975081..6975407
,6974822..6974986),complement(6974042..6974270,6973728..6973969),complement(6973307..6973628
,6972431..6972696),complement(6971963..6972157

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:6971963..6977814 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:6971963..6977814 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGGTTACCTACTGCTGCTGCGCCCGCGTGCTGCTTCCCCTCCACTTCGTCGTTGTCCCCGCGGCTACTGCTCCTCCCGCTCCAACCACCACCACCACAGCCGCCGCGGCGACGGCGGCGGCTTGTTTCCCCCGGGGTTTGCTTCGGTTCTCCGCTGCCGCTGCACGCCCGCTTCCACTGGCCCCACGCGGTGGCATCCTCCTCCATGCGCCGCCGCGGGCGGCGACGCAGGGCCACGGCCCCTCCCGCCGCGGCAGCCGCAGGGGAGGCCACCGGCGACGGCGGCGGCTCTGGTCCCGGCGCCGAGGATAAGAGAGTTGAAACGGACCTCAAAACACTTGCTAGAAGATTTTGGAAAGTTGCTGCCCCTTACTGGTGGTCAGAAGATAAAGTGCAAGCGAGGCTGAGGCTTGCTGCAGTATTTGCTCTTACATTAGCAACTACTGGAATTAGTGTTGGATTTAACTTTCTGGGTCGTGACTTCTACAATGCCCTTGCTGACAAGGACCAGGAACAATTTACCAAGCAACTGCTGTATTACTTGGGAGGTTTTGCTGTAGGAATACCGATTGTTTATACAAGAATTATATCACATATCACTAGATTTTCCTTCTTTGTCTTGAGAGACTATGCAAGGGAGACCCTTTCTTTAAGATGGCGATCTTGGATGACAAGTTATTACATGAAGCGCTACTTTAAAAATAGAACTTTCTATAAGATTCAATCTCAATCACTAATTGATAACCCGGATCAACGGATCAATGATGATCTCAGTGCATTCACTGGAACCGCGCTTGCATTTTCTCTGACATTTTTAAATGCTGCCGTGGACTTGATATCATTCAGTAACATCCTTTATGGGATCTATCCACCATTATTCATTGTTCTTATTGTCTACTCCCTTGGGGGCACTGGAATTAGTATCTTCCTTGGTAAAAATTTGGTCAACTTGAACTTCATGCAAGAAAAGAAAGAAGCAGATTTTCGTTATGGACTTGTCCGAGTTAGAGAAAATGCTGAATCAATTGCTTTTTATGGCGGTGAAGAAAATGAATTGCAACTTTTGTTGGATCGATTCAGGAGGGCTTTTGAAAACCTTAGCGAATTGCTAATAGCATCTCGTAATCTGGAGTTTTTCACCAATGGCTACCGTTATTTAATCCAGATCCTGCCAGCTGCAGTTGTTGCTCCGATGTACTTCTCAGGAAAAATTGAATTTGGAGTAATAAATCAATCAGTGTCTGCTTTCAATCATATCCTTAGTGATTTTTCTCTCATTGTGTTCCAGTTTCAGTCAATTAGTGCATTCTCGGCGGTTATTGATCGTCTAGGTGAATTTGATGATCTGTTGGATGGAAATGGTTCATCTTTATCCAAGCCTGATAACATTGATGGGATCAACATAATTTTCAAGAGCACTGGTCCTACTGTACTGAGTTCCAATGGATCACTGACACAATCTAATCCATCCATGGTTCTTGAGATTTGTAATTTGACATTATTAACACCCAGGAGTGGAAACATTCTTATTACTGACCTCACTATGGAACTCAAAGAAAAGGACCACCTACTGGTAATGGGGCCCAGTGGAAGTGGGAAAACCTCTTTGTTACGTGCTTTGGCTGGCCTTTGGACCAGTGGTACTGGGGACATCATATACCATGTGAGAGGTTCCATGGAGCTTCAAACATCAAATTCAGGTCCTGATGAGCCATCCAACATACAGTCAAACGGTGAAGAACTGCTACAAAGTTCAAAGCAGAGAAGGGATAATGGTATATTCTTTGTTCCACAGAGACCATATATGGTTTTGGGAACCCTTCGTCAGCAATTGCTCTATCCTACATGGACTGAAGATGTTTGTCATTCATCAAATAATGATCCTCAAAGTACAGACCCTCTTACCTTTGAAGTCTCCACATCAGATGGAGTTGGTTCCAAGTCTGAGATGCCCGCAACTGATGAACTGATCAGAGTACTTGAGGCTGTTAAGTTAGGCTATATATTGCCTCGTTTCAATGGTTTGGATTCTATGCATGATTGGGCCAGCGTTCTCTCTCTGGGGGAGCAACAGCGTCTTGCATTTGCTCGGTTGTTACTTGCAAAACCAACTTTAGTCCTCCTTGATGAGTCCACAAGTGCACTAGATGATATGAATGAGCGTCATCTATACAGTCAGATTGAAGCTGCAGGGATTACTTACATAAGCATTGGTCACCGGAAAACACTGCACAAGTTCCACAACAAGGTCTTGTACATTTCAAATTCCGATTCAACGGATAGCAACCCACGTAATTGGTACCTAAAGCCCACAGAACAGATGTCGATTGAAGAGTCATCCTCATTTGCTTCATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGLPTAAAPACCFPSTSSLSPRLLLLPLQPPPPQPPRRRRRLVSPGVCFGSPLPLHARFHWPHAVASSSMRRRGRRRRATAPPAAAAAGEATGDGGGSGPGAEDKRVETDLKTLARRFWKVAAPYWWSEDKVQARLRLAAVFALTLATTGISVGFNFLGRDFYNALADKDQEQFTKQLLYYLGGFAVGIPIVYTRIISHITRFSFFVLRDYARETLSLRWRSWMTSYYMKRYFKNRTFYKIQSQSLIDNPDQRINDDLSAFTGTALAFSLTFLNAAVDLISFSNILYGIYPPLFIVLIVYSLGGTGISIFLGKNLVNLNFMQEKKEADFRYGLVRVRENAESIAFYGGEENELQLLLDRFRRAFENLSELLIASRNLEFFTNGYRYLIQILPAAVVAPMYFSGKIEFGVINQSVSAFNHILSDFSLIVFQFQSISAFSAVIDRLGEFDDLLDGNGSSLSKPDNIDGINIIFKSTGPTVLSSNGSLTQSNPSMVLEICNLTLLTPRSGNILITDLTMELKEKDHLLVMGPSGSGKTSLLRALAGLWTSGTGDIIYHVRGSMELQTSNSGPDEPSNIQSNGEELLQSSKQRRDNGIFFVPQRPYMVLGTLRQQLLYPTWTEDVCHSSNNDPQSTDPLTFEVSTSDGVGSKSEMPATDELIRVLEAVKLGYILPRFNGLDSMHDWASVLSLGEQQRLAFARLLLAKPTLVLLDESTSALDDMNERHLYSQIEAAGITYISIGHRKTLHKFHNKVLYISNSDSTDSNPRNWYLKPTEQMSIEESSSFAS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..315#1079..1265#1613..1680#1822..1863#2408..2734#2829..2993#3545..3773#3846..4087#4187..4508#5119..5384#5658..5852#ATGGGGTTACCTACTGCTGCTGCGCCCGCGTGCTGCTTCCCCTCCACTTCGTCGTTGTCCCCGCGGCTACTGCTCCTCCCGCTCCAACCACCACCACCACAGCCGCCGCGGCGACGGCGGCGGCTTGTTTCCCCCGGGGTTTGCTTCGGTTCTCCGCTGCCGCTGCACGCCCGCTTCCACTGGCCCCACGCGGTGGCATCCTCCTCCATGCGCCGCCGCGGGCGGCGACGCAGGGCCACGGCCCCTCCCGCCGCGGCAGCCGCAGGGGAGGCCACCGGCGACGGCGGCGGCTCTGGTCCCGGCGCCGAGGATAAGGTGATGGAGGTGTCTCTGCTCCGTGGAGTTCCCCGCTGTGCTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGGGTTCGTGCGCGCGTGATCTGCTTCGGTGCTTGTTTATAGCTTAAACTGCGAGTTCAGAGTTCAGAGTTCGTTAGGTGTACCGTGTACATCATCTGCAATTCGAGGTTTAGGTTTGTGCTGTAATTCCGCGGCGAGCTGTAGGTTTTTTTTTTTCCGATTGGCGATTTTTCTGTGGTGTGGTGTGATAGGTGCTGTGGGTTTTGCTATCCGTGGGCAGTCGTCGGCTTCGAAATCAACCATGGGATGGGATGACGTTTTGAAATGTTCATTCATACATGCATAGCCAAAGTATCAATTGTCTGATCTCTTGTGATTATGCCATTTCACTCATTTGGTTCAATCTGGCTGTGGTAACTAGTAATTTCGATTTAGAATGTGAACTGTCAATCGTGAAACCGTATGAGCCTTGTGATCCGCGATTGTAAATGTATTTCTAGTATGTGTACAAGGTGCAGTGTCGTCTATTAGCTGTTATAACTAATTTATTAGAAATTAGTACTACTTCATTTGTGTTTTTGGTTCAGTACATGTTATGTTATGGCCTACGGGCTAACAGCTAGTGGTGTGCTATATGCCTATTGTTTCCTTTCATCTATGGTGGAGGCAGTGCCTTTCTGTAGCGATTAGTGCTTCTTACGCTAGTCTGGCTTCTATTTGTTCTGTTGCTAATTAATGTGTCTTTTTTATCTCGTTCTGGTAGAGAGTTGAAACGGACCTCAAAACACTTGCTAGAAGATTTTGGAAAGTTGCTGCCCCTTACTGGTGGTCAGAAGATAAAGTGCAAGCGAGGCTGAGGCTTGCTGCAGTATTTGCTCTTACATTAGCAACTACTGGAATTAGTGTTGGATTTAACTTTCTGGGTCGTGACTTCTACAATGCCCTTGCTGGTATGTTCTGTCTTGTTTAAATTGTTATCTTGTAGATTCATTGTACGTTCTGAACAAAATTACACACACGGATTTGCAGTGCACATAACAATGCGAGGGAACAAGAGAGGGAGAGGTCCTTTATATCGTACACACTAAATCTATTGTACTAAAATGGACACACCCTCATTTGAAAATTTCGGGGATCTGCAAGACTCAAACTAGACAAAATATAAGGACACTTCTGCTTTTTATTGTTACAAGTGTTACTGAAGGTGGCATGCCATTGTCATCAAAAGTCCAAAGTGGATGTACAATAGCTTCTATTTTTTTTATGCTAACACACATTTAGTGTTTTCTCTTGCAAGACAAGGACCAGGAACAATTTACCAAGCAACTGCTGTATTACTTGGGAGGTTTTGCTGTAGGAATACCGGTGAGCATATTGCTGCTCTTTTGTAGGTATTGCTCTTCAAGCTGTTAGCCTGTTACAACTATTTGTATCACTTAGACACAGATTGAGAAAATATCAGACTGTGCTAACTTATGACCAACCCTTTTTTCATCACTTGTTTAGATTGTTTATACAAGAATTATATCACATATCACTAGATTTTCCGTAAGTAACATCACAATATTATAGTTCCATTCATGTAACTATATTACCAAATTTGGTATTGCTGTCAATGTACATTTTGATTCTCAAAGATGATAAAAGTTCCAATAATGTTAAATAATTAGAATTAGAGAGTAATATTTGGAAGGCAACACTGTCATAGTTGGCTATTTCAAGTATCAATGGTTGTTATCATGGCACTGGAGATCTCTGAGTTCTGCTTGTTCTTCTTTTTTTTATGGTATGTATCTCAAGAATCTAGCAAAATTCATTGTTACTATTTGATCTGGAACCCAGCAGCTTGTCTCCATCTGGCAAACTACCCCTTTTATGACCACAAACCATTCAGCAATCTGATTTTCCCACTAGATGGATTAGCTTCTAGAATCTTACTTCTGTTCCTTTTTTCCAGCAGTGTGTCTAGAATTGCTACTACTTCTATTTGTATCTATCAATCAAGGATATGTACTTTCTGTGTTGCAGAATCAGCAACCTGTATTCCTATGAGTATAATTGTGTTCTGATTTCTGCTCTCACTATACTGCAGTTCTTTGTCTTGAGAGACTATGCAAGGGAGACCCTTTCTTTAAGATGGCGATCTTGGATGACAAGTTATTACATGAAGCGCTACTTTAAAAATAGAACTTTCTATAAGATTCAATCTCAATCACTAATTGATAACCCGGATCAACGGATCAATGATGATCTCAGTGCATTCACTGGAACCGCGCTTGCATTTTCTCTGACATTTTTAAATGCTGCCGTGGACTTGATATCATTCAGTAACATCCTTTATGGGATCTATCCACCATTATTCATTGTTCTTATTGTCTACTCCCTTGGGGGCACTGGAATTAGTATCTTCCTTGGTAAAGTAAGTTGCTTATCAACATTATTTATCTCCAACTTGCATTGAACATACTCTTTCTTTCTTTAAAACTAATTGCTGGCTATTCTTGTACGGACAGAATTTGGTCAACTTGAACTTCATGCAAGAAAAGAAAGAAGCAGATTTTCGTTATGGACTTGTCCGAGTTAGAGAAAATGCTGAATCAATTGCTTTTTATGGCGGTGAAGAAAATGAATTGCAACTTTTGTTGGATCGATTCAGGAGGGCTTTTGAAAACCTTAGCGTAAGCTTTGCTTGTATAGACTTTCTTTCACCATACATCATTATTCATTTTACACTACTTGTTTGTTCTGACATTTAGTTTTATAGTATTGGAATAGGATGTCATAGCTACTAAAAGCATCCTAGAACATATAAAACATACATATTCCTTTATGTGGCTGTGGTATTTCATGGGTTACATGCCAATTTTAATACTCAGATTTTTGTTTGATGTAATATACTATTAAAACCATGATGTAATAATAACATTTTGGTTTTACATGTGCTGTAATATTCTTCTTACAACTGAATTAGTAATATAGTACACCTAGTAACTGGTATCCAAAAGTTATTTTGAAAACTTATCCAAATGTTAGATAATCTATGAATTCCAAAACAAAACCTTCAGCCATACTGATAGTAGTAGTTGCTTTTTATGAGACTAATATCCCTGAAAAACTGTCACTTTGCAGCAGCTCCATGTTTTTTGAATGTTCAGATGGAAACTTATGATGTGTGAGTCATTTTTCTAAGCAGGCCGATTTATATTATCTTTTCCTGTTCTGTTTGCAGGAATTGCTAATAGCATCTCGTAATCTGGAGTTTTTCACCAATGGCTACCGTTATTTAATCCAGATCCTGCCAGCTGCAGTTGTTGCTCCGATGTACTTCTCAGGAAAAATTGAATTTGGAGTAATAAATCAATCAGTGTCTGCTTTCAATCATATCCTTAGTGATTTTTCTCTCATTGTGTTCCAGTTTCAGTCAATTAGTGCATTCTCGGCGGTTATTGATCGTCTAGGTGATGCCTTTTTCTCTCTCAGCATTGCTTGCTAACATATCTAGACTATTCTAATTGAACAATAATCTTCAGGTGAATTTGATGATCTGTTGGATGGAAATGGTTCATCTTTATCCAAGCCTGATAACATTGATGGGATCAACATAATTTTCAAGAGCACTGGTCCTACTGTACTGAGTTCCAATGGATCACTGACACAATCTAATCCATCCATGGTTCTTGAGATTTGTAATTTGACATTATTAACACCCAGGAGTGGAAACATTCTTATTACTGACCTCACTATGGAACTCAAAGAAAAGGACCACCTACTGGTATTTGGTTTCTTTAGCTACTCGCCTACTTGTAAATAGGAGAAATAAATGTTATCACTGCCATCTGACAGAGGAGAAATGTTCATTTTTTGCCTTTAGGTAATGGGGCCCAGTGGAAGTGGGAAAACCTCTTTGTTACGTGCTTTGGCTGGCCTTTGGACCAGTGGTACTGGGGACATCATATACCATGTGAGAGGTTCCATGGAGCTTCAAACATCAAATTCAGGTCCTGATGAGCCATCCAACATACAGTCAAACGGTGAAGAACTGCTACAAAGTTCAAAGCAGAGAAGGGATAATGGTATATTCTTTGTTCCACAGAGACCATATATGGTTTTGGGAACCCTTCGTCAGCAATTGCTCTATCCTACATGGACTGAAGATGTTTGTCATTCATCAAATAATGATCCTCAAAGTACAGGTAATTATTCCTATATTGCACGATGAACAATCAAGTGTAAACTTCTTTCTTGTTAGAGACCACAACAACAAACCATTTGCTTGGTAGAATCCACATCGGTGTGAAAACTACATTTACATGAAAGTTTTGTATACACTGTGCAACTTAAGCCATAGAGGTACCATACCATCATATAAAACTTTCAATTATTTTAAACATGTACATGGGGACAAGAACTGACCCCATGGGGTAACTCTGAATTTAAGTGACTTTATTACAGTGCTATGACGTTTGTTCAAAAAAATATAATGCTATGACATTCTCGAATAATGCATCTTGAAAGAAGTGAAGTATAAAATTATTATAACGTTCAAACTCACTT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA002120