BGIOSGA002227
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA002227 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA002227, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_00713 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA002227-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA002227-PA |
| Length |
5737 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:5175316..5181052 |
| Sequence Coding Region |
5181017..5181052,5180436..5180472),complement(5179697..5179828,5179361..5179410),complement(5178135..5178224 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:5175316..5181052 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:5175316..5181052 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTGCTCTAATGGCGATTTCTCGGTTTGTTCGCAGCAGACAGTACTCTACACAAATGTTTTCAAGTCACAAGATATAACACCGTTTATGGCCGCTGCTGAGTCTGGTGATGTTCCTACGGTGGAGTATTTTCTTGATCATAGTGGCGATGTAACAAAAGCAGATGTTAGAGGATGCACAGTTCTCCACCATGCTGCTGGCACAGTATTTGTTTCCCCCAAGATTTATGGCCCATCTCATTCATTGCAGGATGCTTCTAACGTAATTGTCAATAATGGAGCCGGTAGTCCCCTGATGAGTTCCCTTATCTACCGATCATTGAAGTGTATGAAGCTACTCATAAAGGCTGGTGCTGATGTTAATGGCAAGGGTACAGTTGTAACCCCTTTGATGCTTGCTGCGTCGCAAGGAGGCTATACTAACTTCATTCAGTTTCTTCTGAAGGCTGGAGCAAACCCTAATATTCCTGATGATGATCAACATCAGAAGGAGAGTAGAAAAGTCGTTTTGAAGGCACAGGCAGATTTGCTATTCAAGCAGAAGAATTACGGCGCTGCAGCAAAAATATATGATCTGGAGTACAAACATGCGTGTGATGCTCTCATGGATGCGCAAAAAATAGATACGGGGAATGTTGAGATTGAGAGGGAACTAAGGCAATCTTCCGTTTCTCTCGAGAAAGCTAGGGAATTGATGGCGATACCTCCAGATGAGCAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MCSNGDFSVCSQQTVLYTNVFKSQDITPFMAAAESGDVPTVEYFLDHSGDVTKADVRGCTVLHHAAGTVFVSPKIYGPSHSLQDASNVIVNNGAGSPLMSSLIYRSLKCMKLLIKAGADVNGKGTVVTPLMLAASQGGYTNFIQFLLKAGANPNIPDDDQHQKESRKVVLKAQADLLFKQKNYGAAAKIYDLEYKHACDALMDAQKIDTGNVEIERELRQSSVSLEKARELMAIPPDEQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..36#581..617#1225..1356#1643..1692#2829..2918#3040..3168#4927..5028#5383..5483#5695..5737#ATGTGCTCTAATGGCGATTTCTCGGTTTGTTCGCAGGTGAGAGCGCTCTCCTGAGGCCTGAGGGCGGCCTTCGACGGGAACCTCGGACGCCTCAAAGGTTGCTACTACCTCTCCTCCTCCTCCTCCCCTTCTTCTTCTCCGCCGCGTCGATCCCCTTCCCCGATCGATGCGTCTACGCATTGGCCCCCTTTTGCATGCGCCTGTTGCGTGATTTTCCTTCCTTAGGTTTGGGTGATTCCTCCTGTGTGGAACGCTTGGCGATGACTGTAGTACTGCTAATTAATTTGGCCATGGAATTTTTGAAGGAAGGGCGCTTGCTGCGTTGCTGTTGCCTTTGGGAATTTCCCACATTTTATTTTATTTTCGGTGATGTTATGGCTGCGTGGATTTTTCACCCTGCGTGAAGGAATTAACAGCCAGGTCTATGGATTACTGGAGATGCATGCCATCTTATCTAGAAATTGCAAGACCTGACTGAGGCTTTTATTGTAGCAAGTCCTTGCATTGGATAAATGCGACAATGTTGTGATCATCTTTCTATTACAATTACCTCTCCCAAGTGCTAATGTGTGATGTGTAGCAGACAGTACTCTACACAAATGTTTTCAAGTCACAAGGTATAGGTTCACATGACTCAGTGAGGTTCTTGCACGTTGCACGTTTTCGTCGCTTTTCTTTTCACGTTCTACCTAGTTAATCTGTTCATTTTCAGATTATCTTCCTCACTGTGATGACTTTTCTTTTTGTTCTTATTTGGGAGAAGGTTTTATAAAGAGCCTTGGGATTCAGAAAGGAAAGACTTAGGGTTGCAAGCGGGTCAACCCGTGAACCCGCTTATAGGCAAAATTAGTAGGTAACCCGTATAAATGAGTTTATGGATCGACCCACTTGCATCTCTAAGTGCGGCAAATCGGACCACGACGTGAAAACACACGGGTTATCACTTATTTTACATATAAGTAGGTTTGCGAGTTGGCCCGCTTGCATCCCTAGATGCCGTCTTAGCTCTTAACAAGCATGGGATTGGGGTGCTGCACGCCGCGGCATGCCAGGGCCATCTGAATGTTTGCAAGTTCTTGGTGGAGGAATTGGGGGGTGACGTGAATATTGCTGGAAAAGAAGGTCATTATCTAACTGTACCATCCTTTCGTGAAATTGACGGTTGCCATGTCTATGCTTTGGCAGTATAATGTGCCAAGTGTACTGATGTGCTGTTTATTACAGATATAACACCGTTTATGGCCGCTGCTGAGTCTGGTGATGTTCCTACGGTGGAGTATTTTCTTGATCATAGTGGCGATGTAACAAAAGCAGATGTTAGAGGATGCACAGTTCTCCACCATGCTGCTGGCACAGGTCTCCCTTGATATGAACACTATCCATTTCCTTGTTATATTACCAATTATATTGTTGTACAAGATTCTACGATACTGCATTACTATTAATAGATTACATTTAATCCAACCATGTCGTCACAGTTATCTTTTATTGTGTTGCTAATCTAGATACTTTTAGTTTATATATCACCACTCAAAGTTGTATTGGTTTGCTCTGTTTATACTCGGTCACATCTCACATGCAATCTATTGTGATTTGTCCATTGTATTGGTAAATGTTTATTCAAATAACTCAATTTATATAGTATTTGTTTCCCCCAAGATTTATGGCCCATCTCATTCATTGCAGGATGCTGTAAGGTAACAGAGTTCTTGCTTTCAAAAGGAATACCTGTTGACATAGACTGTGGCCTTGGAACACCACTCTTTCATGCTGCTAACAATGGCAAGGATAAGACACTGAAGATTTTGTTGGATCACAAGGCAGATGCATGTAGTTGCTACTATTTCTTATTTCCTCTTCTTTTTTTTTTCACTGCTAGTTTGATAGCTAGATGTTTGTTTTGCTTTCCACTTAGATAGTTAGCTCATTAGCTGATGTACACTGATGCGTGTTTGCATGGGACTGTTCTGTTTGCTTGGATTGACCCATTCTCAGATACTGCAGTGCATAATCTATCATTTTGGTTTTTATTTAGACATTTTATAGAGGATCTTAGATCATATGGGATTTCCAGGTCTTAAAAAGGATTGTTTTTTTTTGTTATGAAATGAATTATTGTGATGAGAGTTAGGATAGCGTGCTACTTAACCTGTGTAGTGCGCCTCACAGAGGCCCCTGATCGACACAGCCACCCCGCGCGCGTAGCATCTTCCACCTGCGTTGTGATTATTATTATACCGCTGACCTTTGAGTAATACTTCCAAGTCCTAAAATTGCCATTTGGCATGCTCTAAATAAGGTTGGCTGATGTTCTTTTGGGAAAGAGCATGAGAATTTAGGTGTTCAATTCATGGCACTTATATAAGCTATTATCCTGCTCTTTTATCTACTCATCTCTTAATGATTGAAATGCTTTAGGATCATCATGGCATATTTGTACCTCCATCTATCTCATTGCTGACCTTCTGGTTTGATATTGACTTCACTAAATGTCCACTAAAATCTCTTCCATTCCAATGCAGTAACTTCAGTTTGGCTTCATGAAATTTGTGTAAATGTGGCATTACATATATCTGAACTCTGATTATAATAATTATGGTTTCATGTGTAATATATTTTTTCTATTTTAGTTAAAAGTCTGTAAAATATGCACATAATGCAACTTTAATTCTTTCAACAGCGAAAGTTGCTAACTTCAACAGTTAGACTTATAAAAAGTGGCAAACATTAATCAGAAAAAAAAAGGTTAGAGCATTATATTGCTTCCCTTTTTCTTTCACATATTTTTCTGGTTGTACTGAGGCTAAATTCTTATATTCTGCTTTCAGTCTAACGTAATTGTCAATAATGGAGCCGGTAGTCCCCTGATGAGTTCCCTTATCTACCGATCATTGAAGTGTATGAAGCTACTCATAAAGGTCAGTGTTTTATTGAGTCTATATTTGATCAACTAATGCGGTGTTTTAATTTTGCTAACTCAAGACATTTGTTCCATGAACTTATGGAGCTAAATATTCTATTGCACAATGCTTTTCTCAGGCTGGTGCTGATGTTAATGGCAAGGGTACAGTTGTAACCCCTTTGATGCTTGCTGCGTCGCAAGGAGGCTATACTAACTTCATTCAGTTTCTTCTGAAGGCTGGAGCAAACCCTAATATTCCTGATGATGTATGTTTTCTATTCTTCTGAGTCAGTTATTGGTTCTCCACTCTGGTCTATAAGTCTGTGATTCTTGTGTGTTTTATTACAACTCTGATTATTTTAGGGAGTTATTTTAGCAATAAGTTGAGGCTGTTTTGACTAAGGTCATGTTACTTTATGATTAAGATACAGATTTTACTTCGGTTTTCGTTAGCACATTTTTCAAATTGTTAAACTATGTATTTCGTGTGAAAACTTTATATATAGAAGTTGCTTTGAAATATAAAATAAATCCATTTTCAAGTTTAAAATAATTAAAACTCAATTAATCATACACTAATGGTTTTCTCGTTTTACGTACCCCATATTTAATCTTCATCCTTATCACATCCGAACAGGGCTTAAGTTAACAAAAACATTGCACTTATCATTTGCATATTTTATAGTTTCCTATGGATTATCTGAACCTGTGTTCGTTTATATTATTGTATGTGTAAGTATATCTTACGAGTTGTGCAAAGCATGGATGACCTTTCAGTAACCGATGAGTTCTCAAATCCAGCCTATATCCAAAAGACCATTTTGATAGAAGGTCATATCAATGTCCAAAAATCCCATGGCCAGCTTTGAACCTAACACCATGGTTTTTTGGGTCGTAATGAGTCGTTTGGTTGAAACTTGAAAGCCACAGATTGTGATAATAGGCCATACACTGATTTCACCAATATTGTTTGTTTTAGGTTCCTTGCTGAATTACACTGTATGAAGCGACTTTTCTTCATTTTGTTGTGCTTGTGCAGTTGGGTTGGTTGCCAATAGAGCGCTGCATTACATGATTGCAGGGAAGAAGTTGAAATGCTATTTCCATTGACTTCTTCAATTCCAAATGTCCCAAACTGGAGTGTCAATGGAATATCGCTCATGCAAAAGTCAAATACAAAGCCAATGGTACATTTTATACAGTTACACACTTTTGATCTTTCTGTACTAAAGATACTGCTATGCTCTCTGTTCATATTTCGTGTTGCTTACCATGCACTTTGCATTGCAGAGCTCTATTTCACCACTTCACGTAGTTCTCTGATGCTTGTTAAGTTGTTAGGCTGTAAAACTGGGTTAGCTTACATATCAATGGCATTTAATAGTACTAGATAGAAGGATCATGTCTTAATAGTACTGGTTTAGCTTTGTTATCATACATATTCCTTTGAAGTAGAACAAACCCGTTTTGTCCTTCAGCCTTTGGAGTAGTTGTGAAGTCTTCAATTTCGCTGGAGTACTTAATAACCTGACTTTAAAAGTCTGGTCCACATACAAATTTTAATAATAAATATAAGTGGCATCTTGAGCTCTTCATATATAATAATACATCTAGCCCATCTGTCTGTTGACTTGATTGTCAGCAACTTAGAAAGTCAAATTTGGACCTTAAGTTGTTAATTCAAATGTGAAACAGAAATCAGAGGGGGGGGGGGACTTTTCCCTTGTAAGTATCACATATTGTGACTTATGTAAATGATGAAAATTAGAGCTATACTTGAGTGGTAGTGACTTCTGCAACTGATCAAAATTAGAGTTCTGTTTGAGTTATCGATATCATCGAGTACGCTTAAATTACAGCATAAGAATGCCACAGGACTAACCACAAATCATGAAGAATGTTGGAGATAAAGATGCTTAGTTTCTTTATTAATGGAAATCATCCTAAATAAATGTTCTATTATTCAAAATTTCAAAAGTTTACTTCAGATTGCATCAGGATACTATTGTTTACGTTGTGTTTAGGATCAACATCAGAAGGAGAGTAGAAAAGTCGTTTTGAAGGCACAGGCAGATTTGCTATTCAAGCAGAAGAATTACGGCGCTGCAGCAAAAATATATGATCTGGTAATTTCTTGCACCTTATTTCTGATTGTTAACGCTAATCAATTATTGTTGTTATAAAGTTTTTGTACGTTATTCTTAAGCTTGGGAATGATTTGTTTATCTGATGCTTGAGCATAGGCTTGCTCACGGACCGACTGCAGTTTTGTACGCAAACAGGAGCATCTGTAGATTGCTCATGGGTGATGCTGAAGGTGCTTATCTGATGCTTACAAATGCTGAATGATGCGGCCTAACTGGGCAAAAGCTCGCTATCGTCAGGGTGCAGCTCACATGCTACTCAAGGTAAGACTCACTGCAGCTAACGTATTGTGATCCATGTATTATGGTCCGTGTCCTGATTTACTCTAAAACCAGGAGTACAAACATGCGTGTGATGCTCTCATGGATGCGCAAAAAATAGATACGGGGAATGTTGAGATTGAGAGGGAACTAAGGCAATCTTCCGTTTCTCTCGAGTATGCCTTCCAAATAAAAATGTGGTTGCGCAGGGAACATGACCATTAGTACTAGCATATTCCGTTGTGCTTGTGCCCACATTTACTGCAACTGAAGCAACTCAACACTCGACTGTTCTTTTCGGTTTTATATGCCATTCTTCCTTCTTTGGGTCAATTTTACGCTTTGGGTTGTTATAACTGACATTTTATTCGTCCAAATGTTTTGTAGGAAAGCTAGGGAATTGATGGCGATACCTCCAGATGAGCAGTGA</dnaseqindica> 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