BGIOSGA002279
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA002279 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA002279, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0089K24.35 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA002279-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA002279-PA |
| Length |
5568 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:4341589..4347156 |
| Sequence Coding Region |
4347111..4347156,4346953..4347006),complement(4346109..4346279,4345875..4346006),complement(4345403..4345542 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:4341589..4347156 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:4341589..4347156 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCGCCGTTCGTCTACTGCCGCCCCACCGACGACGGCACCAGTGAGAGCGCTCTCCTGAGGGCGGCCTTCGACGGGAACCTCGGACGCCTCAAAGGTATTTTAAAGAGCCTTGGGATCGAGAAAGGAAAGACCCAGTATGCAGTCTTAGCTCTTAACAAGCATGGGATTGGGGTGCTGCACGCCGCGGCATGCCAGGGCCATCTGAATGTTTGCAAGTTCTTGGTGGAGGAATTGGGGGGTGACGTGAATATTGCTGGAAAAGAAGATATAACACCGTTTATGGCCGCTGCTGAGTCTGGTGATGTTCCTACGGTGCAGTATTTTCTTGATCATGGTGGTGATGTAACAAAAGCAGATGTTAGAGGATGCACAGTTCTCCACCATGCTGCTGGCACAGGATGCTGTAAGGTAACAGAGTTCTTGCTTTCAAAAGGGATACCTGTTGACATAGACTGTGGCCTTGGAACACCACTCTTTCATGCTGCTAACAATGGCAAGGATAAGACACTGAAGATTTTGTTGGATCACAAGGCAGATCCTAACGTAATTATCAATAATGGAGCCGGTAGTCCCCTGATGAGTTCCCTTATCTACCGATCATTGAAGTGTATGAAGCTACTCATAAAGGATGGTGCTGATGTTAATGGCAAGGGTACAGTTGTAACCCCTTTGATGCTTGCTGCGTCGCAGGGAGGCTATACTAACTTCATTCAGTTTCTTCTGAAGGCTGGAGCAAACCCCAATATTCCTGATGATTTGGGTTGGTTGCCAATAGAGCATGCTGCATTACGTGATTGCAGGGAAGAAGTTGAAATGCTATTTCCATTGACTTCTCCAATTCCAAATGTCCCAAACTGGAGTGTTAATGGAATAATCGCTCATGCAAAAGTCAAAAATACAAAGCCAATGGATCAACATCAGAAGGAGAGTAGAAAAGTCGTTTTGAAGGCACAGGCAGATTTGGTATTCAAGCAGAAGAATTACGCCGCTGCAGCAAAAATATATGATCTGGCAATAGCTCACGGACCAACTGCAGTTTTGTACGCAAACAGGAGCATCTGTAGATTGCTCATGGGTGATGGTGAAGGTGCTCTTTCTGATGCTTACAGATGCCGAATGATGCGGCCTAACTGGGCAAAAGCTTGCTACCGTCAGGGTGCAGCTCACATGCTACTCAAGGAGTACAAACATGCGTGTGATGCTCTCATGGATGCACAAAAATTAGATTCTGGGAATGTCGAGATTGAGAGGGAACTAAGGAAAGCTAGGGAATTAATGGCGAAACCTCCAGATGAGCAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAPFVYCRPTDDGTSESALLRAAFDGNLGRLKGILKSLGIEKGKTQYAVLALNKHGIGVLHAAACQGHLNVCKFLVEELGGDVNIAGKEDITPFMAAAESGDVPTVQYFLDHGGDVTKADVRGCTVLHHAAGTGCCKVTEFLLSKGIPVDIDCGLGTPLFHAANNGKDKTLKILLDHKADPNVIINNGAGSPLMSSLIYRSLKCMKLLIKDGADVNGKGTVVTPLMLAASQGGYTNFIQFLLKAGANPNIPDDLGWLPIEHAALRDCREEVEMLFPLTSPIPNVPNWSVNGIIAHAKVKNTKPMDQHQKESRKVVLKAQADLVFKQKNYAAAAKIYDLAIAHGPTAVLYANRSICRLLMGDGEGALSDAYRCRMMRPNWAKACYRQGAAHMLLKEYKHACDALMDAQKLDSGNVEIERELRKARELMAKPPDEQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..46#151..204#878..1048#1151..1282#1615..1754#2967..3056#3178..3306#4267..4419#4749..4850#4968..5135#5216..5295#5526..5568#ATGGCGGCGCCGTTCGTCTACTGCCGCCCCACCGACGACGGCACCAGTTCGTCCAGCCTCCCCCCACCTCTCCGCATCTCCTCCTAGCTCGATCGGCTTGCTAGCTCCTCGGCCATGTGGTCTAATGGCGATTTCTCGGTTTGTTCGCAGGTGAGAGCGCTCTCCTGAGGGCGGCCTTCGACGGGAACCTCGGACGCCTCAAAGGTAGGTTTGCTTCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCCTTCTTCTCCGCCGCGTCGATCCCCCCCGATCGATGCGTGTATGCATTACCCCCCCTTTGCATGCGCCTGTGTTGCGTGCTTTTCCTCCCTTAGGTTTGGGTGATGCATGTGTGTCCTTGTGTGGAGCGCTTGGCGATGGCTGTACTGTTAATTGATTTGGCCATGGAATTTTGGAATGCAAATTCTGTATCTAGCACTCGTTGCCTTTGGGAATTTCCCACAATTTATTTTCGGTAATGTTTATATGTTGCATGGATTTTTGACCCTGCGTGAAGGAATTAACAGCCAGGTCTATGGATTACTGGAGATGCATGCCATCTTATCTAGAAATTGCAAGATCTGAGGCTTTTATCGTAGCAAGTCCTTGCGTTGGATAAATGCGACAACGTTGTGATCATCTTTCTATTACAGTTACCTCTCCAAGTGCTAATGTGTGATGAGTAGCAGGTAGTACTCTACAAAAATGTTTTTCAAGTCGCAAGTATGAAGTATAGGTTCACATGACTCAGTGAGGTTCTTGCACGTTGCACGTATTCGTCGCTTTTTCGAGTTCTACTTTGTTAATCTGTTCATTCGCAGATTATCTTCCTCACTGTGATGACTTCTTTTTGTTCTTATTTGCGAGAAGGTATTTTAAAGAGCCTTGGGATCGAGAAAGGAAAGACCCAGTATGCAGTCTTAGCTCTTAACAAGCATGGGATTGGGGTGCTGCACGCCGCGGCATGCCAGGGCCATCTGAATGTTTGCAAGTTCTTGGTGGAGGAATTGGGGGGTGACGTGAATATTGCTGGAAAAGAAGGTTATTATCTAACTCTACCATCCTTTCATGAAATTGGCGGCTGCCATGTCTATGTTTTGGCAGTATAATGTGCCAAGTGTACTGATGTGCTGTTTATTACAGATATAACACCGTTTATGGCCGCTGCTGAGTCTGGTGATGTTCCTACGGTGCAGTATTTTCTTGATCATGGTGGTGATGTAACAAAAGCAGATGTTAGAGGATGCACAGTTCTCCACCATGCTGCTGGCACAGGTCTCCCTTGATATGAACACTATCCAATTCCTTGTTATATTACCAATTATATTGTTGTACAAGATTCTACGATACTGCATTACTATTAATAGATTACATTTAATTCAACCATGTCGTCACAGTTATCTTTTGTTGTGTTGCTAATCTAGATACTTTTAGTTTATATATCACCACTCAAAGTTGTATAGGTTTGCTCTGTTTATACTCGGTCACATCTCACATGTAATCTATTGTGATTTGTCCATTGTACTGGTACTAACTGTTTATTCAAATAACTCAATTTATATAGTATTTGTTTCCCCATGATTTATGGCCCATCTCATTCACTGCAGGATGCTGTAAGGTAACAGAGTTCTTGCTTTCAAAAGGGATACCTGTTGACATAGACTGTGGCCTTGGAACACCACTCTTTCATGCTGCTAACAATGGCAAGGATAAGACACTGAAGATTTTGTTGGATCACAAGGCAGATGTATGTAGTTGCCACTATTTCTTATTTCCTCTTCCTTTTTCTCACTGCTAGTTTGGATAGATAGATATTTGTTTTGCTTTCCACTTAGATAGTTAGCTTATTAGCTGATGTACACTGATGCAGTGGCGGAGCCAGGATAAAATTATAGCGGGGGCTCCTCAGACTTTTGGGCCTTCTAACAATCTCAGATAAAGTCTATTTTAGCCCCCTTTAATAGATATATGGATTTAAATTTTAGGGGGGTCTTAATGGGGGCTCTAATGATCTATTAGGGGGTAGGGGGTCTATAGACCCCCCAGCCCCCACGCTGTCTCCGCCACTGCACTGATGCGTGTTTGCATGGGACTGTTCTGTTTGCTTGGATTGACCCATTCTCAGATATTGCAGTGCATAATCTATCCTTTTGGTTTTTATTTTGACATTTTATAGAGGATCTTAGATCATATGGATTTCCAGGTTTTAAAAAGGATTATTTCTTTTCTTTTTTTTTTGGTTATGAAATGAATTATTGTGATGAGAGTTAGGATACCACGCGTAGCACACGCTACTGAGGCCCCTGATCGACGCGGCCACACCGCGTACATAGCATCTTCCACCTGCATTGTGATTATTATTATACCGCTGACCTTTGAGTAATACTCCTAAGTCCTAAAATTGCCATTTGGCATGCTCTAAATAAGGTTGGCTGATGTTTTTTTGGGAAAGAGCATGGGAGTTTAGGTGTTCAATTCATGGCACTTATATAAGCTATTATCCTGCTCTTTTATCTACTCATCTCTTTAATGATTGAAATGCTTTAGGATCATCATGGCATATTTGTACCTTCATCTACCTCATTGCTGACCTTCTGGTTCGATATTGACTTCACTAAATGTGCACTAAAATCTCTTCTATTCCAATGCAGTAGCTTCAGTTTGGCTTCATGAAATTTGAGTAAATGTGGCATTGCCTACATCTGAACTCTGATTATAATAATTATGGTTTCACGTGTAATATATTTTTTCTATTGTAGTAAAAAGTCTGTAAAATATGCACATAATGCAACTTTAATTCTCAACAGCGAAAGTTGCTAACTTCAACAGTTAGACTTATAAAAAGTGGCAAACACTAATCAGAAAAAAAAAGTTAGAGCATTATATTGCTTTTCCTTTTTCTTTCACATATTCTGCTTTCAGGCTGTATTTAGGCTAAATACTTATATTCTGCTTTCAGCCTAACGTAATTATCAATAATGGAGCCGGTAGTCCCCTGATGAGTTCCCTTATCTACCGATCATTGAAGTGTATGAAGCTACTCATAAAGGTCAGTGTTTTATTGAGTCTATATTTGGTCAACTAATGCTGTGTTTTAATTTTGCTAACTCAAGACATTTGTTCCATGAACATATGGAGCTAAATATTCTATTGCACAATGCTTTTCTCAGGATGGTGCTGATGTTAATGGCAAGGGTACAGTTGTAACCCCTTTGATGCTTGCTGCGTCGCAGGGAGGCTATACTAACTTCATTCAGTTTCTTCTGAAGGCTGGAGCAAACCCCAATATTCCTGATGATGTATGTTTTCTATTCTTCTGAGTCAGTTGTTGCTTCTCCACTTTGGTCTATAAGTCTGATTCTTTTGTGTTTTATTACAACTCTGAGGATGTTTTGTCTAAGGTCATGTCAGTTTATGATTAAGATACAGATTTTACCTCGGTTTTTGTTAGCAAAATTTTCAAATTGTTAAACTATGTATTTCGTGCGAAAACTTTCTATATAGAAGTTGCTTTAAAATATCAAATAAATCCATTTTCAAGTTTAAAATAATTAAAACTAAATTAATCATACACTAATGGTTTTCTTGTTTTACGTGTCCCATATTTAATATTCATCCTTGTCACATCCTAAGAGGGCCTAATTTAACAAAAACATTGCACTTATGATTTGCATATTTTGTAGTTTCCTATGGATTATCTGAACCTGTGCTCTTTTATTTTATTGTATGTGTAAGTATATCTTACGAGTTGTACAAAGCATGGATGACCTTTCAGCAACCGACGAGTTCTCAAATCCAGCCTATATCCAAAATACCATTTTGATAGAAGTTCATATCAATGTCCAAAAAGCCCATGGCCAGCTTTGAACCTACAGACCATGGTTTTTTTGGACGCAATGAGTCGTTTGGTTGAAACTTGAAAGCCACAGATTGTGATAATAGGCCATACACTGATTTCACCAATATTGTTTGTTTTAGGTTCCTTGCTGAATTACGCCGTATGAAACTATGGGCCTGTTTGGTACAGCTCAACTCCTATATATAACTCCAGGAGTTGAGTCTGGAGTGGAGTTGTGGAGCTGCCTAAACCCAGCTCCACAACTCTAGTACATTTTGTGAGAGAGCTCCACCCAACTCCACTCCCAGTTTTGGTGGAGCTGAAACTGTTTGGCTGAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGGAGGGGTGGAGCTGGAGCTGTGCCAAACAGGCCCTATTTTTCTTCATTCTGTTGTGCTTGTGCAGTTGGGTTGGTTGCCAATAGAGCATGCTGCATTACGTGATTGCAGGGAAGAAGTTGAAATGCTATTTCCATTGACTTCTCCAATTCCAAATGTCCCAAACTGGAGTGTTAATGGAATAATCGCTCATGCAAAAGTCAAAAATACAAAGCCAATGGTACGTTTCGTACAGATATGCACTTTTGATCTTTCTGTACTAAAGGTCCTGCTATGCTCTCTGCTCATATTTCATGTTGCTTACCATGCACTTTGCATTGCAGAGCTCTATTTCACCCACTTCACGTCTTTGATGCTTGTTAGGCTGTAAAACTGGTTTAGCTTACATATCAACGGCATTTAATAGTACTAGATAGAAGGATCATGTCTTAACAGTACTGGTTAATAGTACTGGTTTAGCTTTGTAATCCTAAATAAATGTTCTGATATTCAAAATTTCAAAAGTTAACTTCAGATTTGCATCAAGATACTATTGTTTACGTTGTTTAGGATCAACATCAGAAGGAGAGTAGAAAAGTCGTTTTGAAGGCACAGGCAGATTTGGTATTCAAGCAGAAGAATTACGCCGCTGCAGCAAAAATATATGATCTGGTAATTTCTTGC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