BGIOSGA002616
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA002616 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA002616, complete gene. |
| LocusTag |
P0482C06.18 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA002616-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA002616-PA |
| Length |
7247 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:550852..558098 |
| Sequence Coding Region |
550852..550961,551038..551257,552129..552329,552439..552509,552582..552741 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:550852..558098 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:550852..558098 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGTTCTGTCGCCGGCGACGCCGCCCGCCTTTCTTATCCACCCACTCGCCGCGACGATTCCGTCGTCGACATGTACCATGGCGTCCCTGTCACCGACCCTTACCGTTGGCTGGAGGACCCAGAGTCGGAAGATACCAAAGAATTTGTGGCAAGTCAGGTGGAGCTAGCAGAGTCTGTGCTTGCGGGCTGCTTTGACAGGGAGAACCTTCGCCATGAGGTCACTCGCCTCTTCGACCACCCGCGCCACGGGGCGCCGTTCCGTCGCGGCGACAAGTACTTCTACTTTCACAACTCCGGACTCCAAGCCCAGAGCGTGCTCTACGTGCAGGATAGTTTGGATGGAGAGGCGGAGGTTCTTCTGGATCCAAATGCACTAAGCAAGGATGGGACAGTTGCTCTTTCGACGTATTCTGTTAGCAAGGATGGCAAATACATAGCTTATGGCCTAAGTGAAAGCGGCAGTGATTGGGTCACTATTCGTGTGATGAACATTGCTGATAAGCAGACTTTGTCTGACAAATTGTCTTGGGTGAAATTCTCATCTATCAGTTGGACCCATGATGGAAAAGGTTTTTTCTATGGTCGATATCCTGCACCCCGAGAAGTGGAATTGGATGCTGGAACTGAAACAAACATTAATCTTAATCATGAGATATATTACCATGTCGTGGGATCTGATCAGTCCGAAGATATATTATGCTGGAAAGATCCTGAACACCCTAAGTATTCCTTTGGTGCATCGGTCACAGAGGATGGAAAGTACATCATACTAGGTACTTATGAAGGTTGCGATCCTGTCAATAAGCTGTACTACTGTGAAATTTGTACTCTTCCTCAAGGGATAGAGGGGTTCAAAGAGACAAAGGGGATGCTTCCATTTGTCAAGCTTATAGATAACTTTGATGCCCAATATCATGTTGTGGCCAATGATGGTGATGAATTTACATTTTTGACCAATAGAAATGCTCCTAAGAACAAGCTTGTAAGAGTAGATATCAAGAAGCCAGAATTGTGGACTGATATTCTTCCTGAACATGAAAGAGATGTGCTCGAATCAGCTGACGCGGTTAATGGTAACCAGTTATTGGTATGTTATATGTCAGATGTTAAGCATATTCTGCAGATAAGAGACCTTGTAACTGGGAACTTGCTTCATAAGTTGCCTCTAGAAATTGGTTCTGTTTCAGAGATCTCCTGTAGACGGGAAGACATGGACGTCTTTATTGGCTTCACAAGCTTTCTTTCCCCTGGTATTATTTACAGGTGTAACCTCACATCTGCGATCCCAGAAATGAAGATATTTCGTGAAATTTCAGTTCCTGGATTTGATCGAACAAATTTTGAGGTTAAGCAGATTTTCGTCAATAGTAAGGATGGAACCAAAATTCCTATGTTCATAATGTCAAAGAGAGATATTGAACTTGATGGATCACATCCAACTTTGCTATATGGTTATGGTGGATTCAACATAAGTCTTACTCCTTCTTTCAGTGTTAGTCGTGTTGTTTTATGCAAGAACATGGGTTTTGTTGTCTGTGTTGCAAATATTCGGGGTGGTGGGGAATATGGGGAAGAGTGGCACAAAGCTGGAGCACGTGCAATGAAACAAAATTGTTTTGACGACTTCATTGCTTGTGCTGAACTCCTCATTTCTGCTGGTTATACGAGTTACAGGCAGTTATGTATTGAAGGTGGAAGCAATGGTGGTCTTCTGATTGCTGCTTGCGTTAATCAGCGGCCTGATCTCTTTGGGTGTGCTCTTGCTCATGTTGGTGTTATGGACATGCTCCGTTTTCACAAGTTCACCATTGGTCATGCCTGGACTACCGACTATGGTTGTTCAGACAATGAAGAGGAATTCCACTGGCTTATCAAATATTCCCCCCTTCATAATGTGAGGAGACCTTGGGAGCAAAGTTTTGTTAACTGTTGTCAGTACCCAGCAATCATGCTGTTGACTGCTGATCATGATGATCGTGTTGTGCCATTGCACTCATTGAAGTTGTTAGCAACACTGCAGTATGTCTTGTGCACTAGCATTGAGGATACACCACAGGTCAATCCAATAATTGGTCGCATTGACGTCAAGTCAGGGCATGGAGCTGGCAGACCAACTAAAAAAATGATTGATGAGGTTGCTGATCGGTATAGCTTCATGGCGAACATGTTAGATGCGTCATGGACGGAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSVAGDAARLSYPPTRRDDSVVDMYHGVPVTDPYRWLEDPESEDTKEFVASQVELAESVLAGCFDRENLRHEVTRLFDHPRHGAPFRRGDKYFYFHNSGLQAQSVLYVQDSLDGEAEVLLDPNALSKDGTVALSTYSVSKDGKYIAYGLSESGSDWVTIRVMNIADKQTLSDKLSWVKFSSISWTHDGKGFFYGRYPAPREVELDAGTETNINLNHEIYYHVVGSDQSEDILCWKDPEHPKYSFGASVTEDGKYIILGTYEGCDPVNKLYYCEICTLPQGIEGFKETKGMLPFVKLIDNFDAQYHVVANDGDEFTFLTNRNAPKNKLVRVDIKKPELWTDILPEHERDVLESADAVNGNQLLVCYMSDVKHILQIRDLVTGNLLHKLPLEIGSVSEISCRREDMDVFIGFTSFLSPGIIYRCNLTSAIPEMKIFREISVPGFDRTNFEVKQIFVNSKDGTKIPMFIMSKRDIELDGSHPTLLYGYGGFNISLTPSFSVSRVVLCKNMGFVVCVANIRGGGEYGEEWHKAGARAMKQNCFDDFIACAELLISAGYTSYRQLCIEGGSNGGLLIAACVNQRPDLFGCALAHVGVMDMLRFHKFTIGHAWTTDYGCSDNEEEFHWLIKYSPLHNVRRPWEQSFVNCCQYPAIMLLTADHDDRVVPLHSLKLLATLQYVLCTSIEDTPQVNPIIGRIDVKSGHGAGRPTKKMIDEVADRYSFMANMLDASWTE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..110#187..406#1278..1478#1588..1658#1731..1890#3780..4373#4483..4863#5187..5262#5350..5413#5948..6083#6997..7110#7182..7247#ATGGGTTCTGTCGCCGGCGACGCCGCCCGCCTTTCTTATCCACCCACTCGCCGCGACGATTCCGTCGTCGACATGTACCATGGCGTCCCTGTCACCGACCCTTACCGTTGGTAAGTACTCCAACCTTGCTTCTTGGGGGAGGTCTTATATTTTTGGCTACTTATGTTGTGTGCGGCGTGCACGCAGGCTGGAGGACCCAGAGTCGGAAGATACCAAAGAATTTGTGGCAAGTCAGGTGGAGCTAGCAGAGTCTGTGCTTGCGGGCTGCTTTGACAGGGAGAACCTTCGCCATGAGGTCACTCGCCTCTTCGACCACCCGCGCCACGGGGCGCCGTTCCGTCGCGGCGACAAGTACTTCTACTTTCACAACTCCGGACTCCAAGCCCAGAGCGTGCTCTACGTGCAGGTATGCCATCAAACTCGATTAATAAAGCACGCAGTGGATCTAAGGTTTGGAGCTTTGCGGGACATGTTGTTGTCCTGATGATGTGAAAATAATTGGAGATGGGTTTCAATAGATTTCGTGAATATACATCTTGACTTTAGAAACTACTGTGCTGTAGGAGCTGAGGCTAGTTCAGTTGGTGAATGTTGCAATGTATACATCTCTATTGCCTAAGCCGGAGACCTCTTTGGCTTGGCTGCTTGCACACCTAATTCTTCTTGATTAAATTGAATCTAGTTTATTAAAGTATCATTAGTTCTCTGATAAAATTAAAGGCAAAATCTATAGTCATGTGATTGTTTGTTGGTATGCAAGCTTTGCGATACTCATTCTTTTCCAACCTAGACAATGTGCAATTGGACAGGACTTATTATATACCAACTGTGCTTGTGTAATATTTGCTATGCACATGTTTTGGTTCCTTTGCCCACCCTTCCTTAGCCTCGATGAGTAACATTAGTGGGCATTTGTTCCAGTTTGATTTTAGGCAAGGAAGTCCACCCTACCAAGTCTAGGCTAGCAAATGAACCAAACATGCTTTACATAAAAATGAACCCTGTGAGAATGTTCAAATCTCATAGTCAAGTTCCACAGCACTGAGCAATGCTGATTGTTTTGCTTTCTCTGTCATATTCATGCTTTCAGTTTCTCATAAGATTATTTGGTGTTCTTAAAATAAAGAAACAAGTCCACATATTCCGTTTAGTATTTCTTTTACCCTTTTTCGAGTGCTAGTTTTGTTTATGTTTGAATTCTGTCAATAAAAGGCTGCATAATTGTCTTGATTCGATGAAAGGGTTAGAATGAATATAGCATGTACTTATCAATTCAGGATAGTTTGGATGGAGAGGCGGAGGTTCTTCTGGATCCAAATGCACTAAGCAAGGATGGGACAGTTGCTCTTTCGACGTATTCTGTTAGCAAGGATGGCAAATACATAGCTTATGGCCTAAGTGAAAGCGGCAGTGATTGGGTCACTATTCGTGTGATGAACATTGCTGATAAGCAGACTTTGTCTGACAAATTGTCTTGGGTGAGCAGATGCAGCTTGTAACTATTATTTGAAATTGTAGTGCTTATGTGTTACCTATTGGTTCTTATAACCAAATCCAACATATATGTTCCATCAATTATTGGTGCAGGTGAAATTCTCATCTATCAGTTGGACCCATGATGGAAAAGGTTTTTTCTATGGTCGATATCCTGCACCCCGGTAGGTTTACAAACTTCTGTATTTCTAATGTACTGTAATAGATTGCTTAGTTTCTCTTACTCCTTTTGTTAGAGAAGTGGAATTGGATGCTGGAACTGAAACAAACATTAATCTTAATCATGAGATATATTACCATGTCGTGGGATCTGATCAGTCCGAAGATATATTATGCTGGAAAGATCCTGAACACCCTAAGTATTCCTTTGGTGCATCGGTCACAGAGGATGGAAAGGTAACAACACTTCCTCTCCTTCCCATTTGTGTACCAGTCATATCTATATGCTTATTTACTTCTTTCATCTTTTGGATGAGACTACAAACTTGATTCCTCTTCTTCTATGGTTGATGCTTCATCTTCTAGTTTAAATGACAGTACAGACAATTTTACTACCTGAACTTCTCTCGAAAATATTTTATTCAGTCCCTTGCTTCTGATGGAGCTTCCTGCATTATCTAGGATTATCTTAATTTCTCAAGTGCTCACTAGAATATTTGGTGCTTCTTGGCTTTCTACATGGCAATAAATATTACATGATCGTATAATGGATTTTCTCAATCAACATGCATGCACTCATAGCACTACTTGCAGAGACAACATAATTCAAGTAGTAATAGAGTAAGATAAACATGTTGAAGAAGATCCATGCCTTGCTCACAGAGGCCAGCTCCTGTCATGAACCTACAACTCCTTGGAACCTTACATATACCTGCTTGTCTAAGTGAACTAAACAACTAATACGAATAAATACTAACAAAACTCAATCTATCTATCTAAACCTTACTAATCGTGCACTTTTTAGGAGCTCTCAAGTCAACCAAAAAGATCTAGCCGTTGATATAATAAATCATAACATCACAACCATAGATCGTAATATTTTTAACAGCCACATAAATCGGATCGTAGAATCCTATATGGTTTATAAGTAGGAAATATCTCCCATAGATGTATGGTCTTGATGTCCGATCCGACAAATTAGGTCCATAGCAAACCAATAAACCGATGGAAGTTACTCCTATCTCCTAATGAATAATCATGCATGAATACGTATTGTTGTACAACCCCTGATGCTTGAATACGTATTGATGTCCAGCAAAATAGTAGATCCATAGTCATAACAATTAATTTCGGTAATCTCTATATTTGTGTAGAGAACAAACTATTTCCTAATTAATCTTCCTCCAAACTAAATAAACATACCATTAAAAATAATATGCACTTCATTTTATTAAAATTTAGTAACTCCAAAATTCTAGATTAAAAAATATGATGTTTTTTTATTTTAATTACGAAATTTTGATTTTTTTTAAATAATGTTGAAACTGTTAGTAAGCTAAAGTTGACGTGCACTTTTAATCTAAATTACTACAATTTAGAAAATAGCCTGTGTATGTTAAATTCTATATATGTACAATATGAATAATAATAATAATAGTAACCCACACAACGCGCAAGTTGATGACTATTATAACTTAAAATTTCTACAGTTGCTAGCTCATGGTTATATATGACATGCAAAAAGAATGAATCTTACCTGTCGTCTAAGTGAAATAAATAGCCAATACGAATAAATACCAAATAGAGCTCAAAATTGCTTGCAATTTTTATAGTAGCTAGCTCATGGTTTTATGTGAATGAATTGCAGAAAGAACAACTCAAACCCAAGGTCCTGAGCAAACATTATGGCTATTCAAAGATTTATTTGGCTTAAAGTGCAAAAATGATTGCATATTAGTTTCGGAATCCTTATTCATCCGAATTTCAAAATCTCTGTGCAAAGGCTTTATATGATGAGGAGTATAAAATGCAATGGGCAAACCCGTTTTGAACCACCTGAAATGGAGCTAGCATAAATTAGTTTTGGAGCTTGAAATTAATTGAATTTCCAATGTGAAAATTATTGATTTTCTGATTTTTGCGAGGGTTGAATATTCCATTGAGTTCATTGCATTAGCATTTCGTGATGGATGTTGCAGTAGAGTGTGATCTTTATGGTCTACATGTTTGTTGCACCAACCTTAAAAAGCAGAGTATCTCTTCACATCTTTAATTAATGACTTTTGTCTAAATCTTTTAATAGCCCACAAAAACAGTTCTCTCATAACCTCATCTTTTGTTGACAGTACATCATACTAGGTACTTATGAAGGTTGCGATCCTGTCAATAAGCTGTACTACTGTGAAATTTGTACTCTTCCTCAAGGGATAGAGGGGTTCAAAGAGACAAAGGGGATGCTTCCATTTGTCAAGCTTATAGATAACTTTGATGCCCAATATCATGTTGTGGCCAATGATGGTGATGAATTTACATTTTTGACCAATAGAAATGCTCCTAAGAACAAGCTTGTAAGAGTAGATATCAAGAAGCCAGAATTGTGGACTGATATTCTTCCTGAACATGAAAGAGATGTGCTCGAATCAGCTGACGCGGTTAATGGTAACCAGTTATTGGTATGTTATATGTCAGATGTTAAGCATATTCTGCAGATAAGAGACCTTGTAACTGGGAACTTGCTTCATAAGTTGCCTCTAGAAATTGGTTCTGTTTCAGAGATCTCCTGTAGACGGGAAGACATGGACGTCTTTATTGGCTTCACAAGCTTTCTTTCCCCTGGTATTATTTACAGGTGTAACCTCACATCTGCGATCCCAGAAATGAAGATATTTCGTGAAATTTCAGTTCCTGGATTTGATCGAACAAATTTTGAGGTTAAGCAGGTACATGCCATCACTGTCTTAGGTTGCCATATCATTTTCTATACAAAGAATACAAATGAAACTAAATACTTCGTTAAAATGTGGTTTCTAACTGTTTTTGGTTTTTCAGATTTTCGTCAATAGTAAGGATGGAACCAAAATTCCTATGTTCATAATGTCAAAGAGAGATATTGAACTTGATGGATCACATCCAACTTTGCTATATGGTTATGGTGGATTCAACATAAGTCTTACTCCTTCTTTCAGTGTTAGTCGTGTTGTTTTATGCAAGAACATGGGTTTTGTTGTCTGTGTTGCAAATATTCGGGGTGGTGGGGAATATGGGGAAGAGTGGCACAAAGCTGGAGCACGTGCAATGAAACAAAATTGTTTTGACGACTTCATTGCTTGTGCTGAACTCCTCATTTCTGCTGGTTATACGAGTTACAGGCAGTTATGTATTGAAGGTGGAAGCAATGGTGGTCTTCTGATTGCTGCTTGCGTTAAT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