Os08g0537600
| Gene Name |
Os08g0537600 |
|---|---|
| Description |
Arf GTPase activating protein family protein |
| Version |
NM_001068901.1 GI:115477540 GeneID:4346168 |
| Length |
8710 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0537600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:26959282..26967991 |
| Sequence Coding Region |
26959791..26959905,26960034..26960530,26961754..26961847,26961937..26962079,26962736..26963068 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:26959282..26967991 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:26959282..26967991 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcttttcgccaagctcgatgactcgcccatgctccgcacgcagatacagtcactggaagaaagtgctgaaattctcagggagagatgtttgaagtttcataaaggttgccgcaagtatacggaaggattaggagaagcttatgatggagatattgcatttgcaagctcactcgaaacatttgggggaggccacaatgaccctataagtgttgcttttggtggacctgttatgaccaaatttacaattgccttgagagaactaggcacatacaaggaagtcctccgctcccaggttgagcacatgctaaatgacagattgctgaattttgtggacattgatttgcatgatgttaaggatgcacggaagcgtttcgacaaggctagcctcttgtatgaccaggttcgtgataagtacctgtcactgaagaaaggcacacgagctgacataacaactgccattgaagatgaacttcacaacgctagatcttcatttgagcaagcccgtttcaacctggtcacttcaatttcccatattgaggcaaagaagagatttgaatttttggaggctgttagttcaactatggattctcatcttcgatattttaaacaaggatacgacctattgcatcagatggagccatatattaatcaggttcttgcttatgcacaacaatcaagagaaagggcaaacaaggagcaagcctctcttgtagagagaatgcatgaatacaaaaagcagatagatcgggaaattcgtttatcaaatggtttgactgatgcccataatggtgatggaattcaaacgattgctagaagttcacataaaatgattgaggcagtgatgcagtcggcctcaaaaggcaaggtccagaccattcgtcaaggttacctctcgaaaagatcttcaaacttgagagctgattggaaaagaaggttttttgtccttgatagtcgaggaatgctgtactactatcgcaagcaaattaataggacacctggtggttgttccagtcacccaagaagcattggcaaccccactgaacatggttctgggttgctgagcagactattctcatctcattaccatggcattatacatgatgagaaatctgttgcacggcatactgtaaatttgctgacatcaaccattaaagtggatgcagaacaatcagatctgaggttctgcttcagaataatttcacccacaaaggtctacacactacaggcagagagtgcaatagatcaaatggattggattgaaaagattactggtgtcattgcatctttgcttagctcacaatccccagaacagtgttttctgctaagccctaagagctgtggccatgatggcagtgccagtgaaagtagctcctttactagccaggatctggaaccttccatgtatgatgacttaacattggaaaagaacactggaaatgggcaacatgatgtcagaggcacacattatcacaagactaacatgaaacctgaaaaaccaattgatttgcttaggaaagttgatggcaatatcatttgtgttgattgtggttctatggaacctgattgggcatcattaaaccttggtgcacttctgtgcatagagtgctctggggtacacagaaatctcggagtgcatatatcaaaggtaagatctctgacgcttgatgtcagagtgtgggaaccatctgtaatcaatctctttcaatcattaggcaacaagtttgtcaatgatgtttgggaagaagttttaccttcgtcaaaaaatggtgaatctgatgacaagttgcgcgctcatggattagatacggcatggcacttcactgtcagcaagcctaaacactcagatcctttctctgccaaagagaagtttatccatgccaagtatgctgacaaggaatttgtacgaaagtatagcatggatgagattcagctagctcagcagatgtgggataatgtaactgcaaatgacaagagagctgtatacagtctcatcgtgcaatcccgcgccaatgtaaatttagtttatggagagatgtcctatagttcacgttcgactactggaagatcatctcagcaagagcactcttcctcaccatctgatggaagccctgtatttttcgattgccattcacatgaaaaagtttctcctagagagcccctttctcctgccagcacaagttcacgtgtagatgatggggaagaaagatgcgaaggtttctcgttgcttcatcttgcatgtcatgttgcagatgttggaatggttgaattacttttgcagtacggagctaatgtaaatgcaattgattcaagaggccggacaccccttcatcagtgtatattgaaaggaagacacatacatgctaagcttctactctccaggggggctaatccacaagttgcggaccaagatggcaggacggcattacagtgtgccatcgacggtggaacaagcgacgacgagattcttgtgttgttagaagattatactagataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLFAKLDDSPMLRTQIQSLEESAEILRERCLKFHKGCRKYTEGL GEAYDGDIAFASSLETFGGGHNDPISVAFGGPVMTKFTIALRELGTYKEVLRSQVEHM LNDRLLNFVDIDLHDVKDARKRFDKASLLYDQVRDKYLSLKKGTRADITTAIEDELHN ARSSFEQARFNLVTSISHIEAKKRFEFLEAVSSTMDSHLRYFKQGYDLLHQMEPYINQ VLAYAQQSRERANKEQASLVERMHEYKKQIDREIRLSNGLTDAHNGDGIQTIARSSHK MIEAVMQSASKGKVQTIRQGYLSKRSSNLRADWKRRFFVLDSRGMLYYYRKQINRTPG GCSSHPRSIGNPTEHGSGLLSRLFSSHYHGIIHDEKSVARHTVNLLTSTIKVDAEQSD LRFCFRIISPTKVYTLQAESAIDQMDWIEKITGVIASLLSSQSPEQCFLLSPKSCGHD GSASESSSFTSQDLEPSMYDDLTLEKNTGNGQHDVRGTHYHKTNMKPEKPIDLLRKVD GNIICVDCGSMEPDWASLNLGALLCIECSGVHRNLGVHISKVRSLTLDVRVWEPSVIN LFQSLGNKFVNDVWEEVLPSSKNGESDDKLRAHGLDTAWHFTVSKPKHSDPFSAKEKF IHAKYADKEFVRKYSMDEIQLAQQMWDNVTANDKRAVYSLIVQSRANVNLVYGEMSYS SRSTTGRSSQQEHSSSPSDGSPVFFDCHSHEKVSPREPLSPASTSSRVDDGEERCEGF SLLHLACHVADVGMVELLLQYGANVNAIDSRGRTPLHQCILKGRHIHAKLLLSRGANP QVADQDGRTALQCAIDGGTSDDEILVLLEDYTR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8087..8201#7462..7958#6145..6238#5913..6055#4924..5256#4744..4830#4425..4652#4180..4311#3884..4096#3328..3369#3147..3242#3000..3047#2851..2916#2471..2515#2316..2378#1918..1988#1496..1596#1211..1287#286..330#gacgacgccaccgccatctctcgctctctctctctctctctctctctcttgcgcgctcgcgcggacgctccaccaaccaaccaaccaaccaacccacccccacccgcggttgctggaggaggaggaggtggcggcggccgcggaggaggaggaggtcaggcagcgacgaggaggaagaggagggggaggtggaggtgggggtggtggtggagatagggttggaggcggttgcggcattgaaggtggaggaggaggaggaggtggtggtggtcagcagcggcagccatgcttttcgccaagctcgatgactcgcccatgctccgcacgcaggtgagcctcctccgcctccgggatctcggttgttcaacggggggttcattgggtggggctctgggttggaatgtggtggcgcgaggtgggagtgcgcctatcccgtggggacgggttaccgggttgcctctctcaagcgtggggcagtttcgcttcaatgctttgcaatggcttctcgattcggtctcgctgcatatgctcttcttcggaagagagccaaaaaacttttgtgctgattacattgttgcgaatgggtgggggaatggctttgctcttgatttttgtttttttttatcggaaaggatttttgcgcctgattttagcgcagtgtttggaattcatggttgatttggcgcttcttttttctttttattttttttgatgatccaaatgtgtttgatcagctactttctttttgtaaccgaaggcgaatgctcctcattggtgaatggtgataggtctggattgtcgtatctcactggttttattattatgcctatctgcattatcgtgtgttactcactaccttttgaacttgcgtcgctgtgtttgtttccccctgtgccgtctatgccagcctgaaaatttttgctagctagccacatactgctcctataactgaatgcttgtttccaagcaattgggacaatgaactgtttctcatcatgtaaacggattaagaagtatccataaagctcttgaattttttattgattatagaatgggagatttcctcattaaagagatgcaattgtttgggtataatccatttcaacacatatttgtagcacaaacttcttttatgtgacattttttttccatgttggatttgcttcattcatgaacaatgtatgcatttttttggcattctgaaaagcagatacagtcactggaagaaagtgctgaaattctcagggagagatgtttgaagtttcataaaggttgccgcaagtatacgtaagtgatcatctacatctaattgatttgtatttcttcacaatacctgacacatgatatggttgaactgcttcagtcaaaaaaaaaaagagaggttgaactgccattcattgcattacacgcttatatttaaacccatatttactcgtagttttctgccaacttgctgctatccaggacacattaatttacatatcccttttttcagggaaggattaggagaagcttatgatggagatattgcatttgcaagctcactcgaaacatttgggggaggccacaatgaccctataagtgttgcttttggtggttagtcatgttattctcctgcatatcttttatctgatgttttcggtgatatttgttttgtttaaatttttcatatgagtatgcaaggtgttttctttatgtatttcatgtgtgtttagttaattttacaaagaaaaagggtattatctaactaagctatatagattaaagccaacaacagttgagtaaagagtttatccatctactgtattaaaagtttacttttcatcccttaattactgttttcattttactagaactgtcttgtctttagtatggtcatttcctctaatatgcatactgaacatttctcctctccaggacctgttatgaccaaatttacaattgccttgagagaactaggcacatacaaggaagtcctccgctcccaggtagtggcacttctcatcatattttcttatatatgtgctgttacaggatttcagtcaaattcttatgctttcttttcatgcgggtgcttatcaaatttgcttctttgatggagtgctgatgaaattctaactcttctgtctttttctccaacacttgagatgttttcatctatgaacaacacaaacctacatgtttatgaattttagatgaagtgatggacactattttgtgatcccaaccttcacttcagccatttcattctaggaacacgcggcctatgttttcttaccttgctgtcatctgtgttaatgtctatttgctggcaggttgagcacatgctaaatgacagattgctgaattttgtggacattgatttgcatgatgttaaggtaccagtataatttcatgtgaaaacagaattttgaaattcatggtgagattaattaaatggcatgcctttctgcttcatacatttactcaggatgcacggaagcgtttcgacaaggctagcctcttgtatgaccaggtatgttattcgattttttctattgccaaaaaagataactaattttcaggtcacactttattatgataaattcgtggttcctctgtatttgtaattggtctctctctctctctctctctctctctgcttcttgcaatcaaagtgacaaaggggttcatttcgttttgttttgtgatatgtcaaatttcaatgagctaatggtttcttcctctcagctaattttacttccttgttattttctttgttcaatctactgccatacagtgtgtgctgcttatttaatgttatggaggagagactattattgattagccagctggctgatttgatcgcaggttcgtgataagtacctgtcactgaagaaaggcacacgagctgacataacaactgccattgaagatgtaaaatcttttccctttcttacaaaaccctttttaagttaaggcaacttcccccaaactgacttacacttggccttacccaggaacttcacaacgctagatcttcatttgagcaagcccgtttcaacctggtatgtgaaacagttgatcagactttgttcttgtattttcttactgtgtgccttttttcttatcatatcatcatttgccatacctgcactattttttaggtcacttcaatttcccatattgaggcaaagaagagatttgaatttttggaggctgttagttcaactatggattctcatcttcgatattttaaacaagtaccagattgcatatttttcctctttctgctactatgttatgcaaagagtgagacttatcttatctgttgctatattcattcagggatacgacctattgcatcagatggagccatatattaatcaggtaactcgaccacgctcgcttattagtttcctagtcttctagtatacaaatagttttacattgtagctacaagatcatgaaatgcaaatattagtgccccagatttctgccctcaattcatctcattgagattggatttattctgtagctgatcaatatttcaattatcaagaaggtttgacattgtcatcctggaaaagttcagttgtttagtgctttatgcaccttttggtagctttttcagcctaatattgtttttttttctcctggagataaatacattcagatgatctaattactggattttaattggttctgtccttggttgacaattgcccttgagtggagaatagcagttttttaatctttttgtagaaaccgctgcatcaatgatcatattgatctttttaagacacagcgaagctgcttactttttaatgctgcacgcacaaacttcttatgttatgaagtggacaagaattttttctttagctgttctttggtcctcctgcaggttcttgcttatgcacaacaatcaagagaaagggcaaacaaggagcaagcctctcttgtagagagaatgcatgaatacaaaaagcagatagatcgggaaattcgtttatcaaatggtttgactgatgcccataatggtgatggaattcaaacgattgctagaagttcacataaaatgattgaggcagtgatgcagtcggcctcaaaaggcaaggtaccacttcctggttcactaggaattaaagcttcatgcagacattctagtactgtcattcctgaaacaaagtatatgttcaggtccagaccattcgtcaaggttacctctcgaaaagatcttcaaacttgagagctgattggaaaagaaggttttttgtccttgatagtcgaggaatgctgtactactatcgcaagcaaattaataggacacctgtaggtcccccttgcactagtgaaatactcatgcagctgcaggattctgtccaagatgtacaatatacttaagttcctgtcctttattctttgtttcacttttggtcttccagggtggttgttccagtcacccaagaagcattggcaaccccactgaacatggttctgggttgctgagcagactattctcatctcattaccatggcattatacatgatgagaaatctgttgcacggcatactgtaaatttgctgacatcaaccattaaagtggatgcagaacaatcagatctgaggttctgcttcagaataatttcacccacaaaggtctacacactacaggtatgagtacaatattgaagatgatattgtcttcatgtcgaatataattcgatatttcctatttaagtgacaccatctattttttgagcaggcagagagtgcaatagatcaaatggattggattgaaaagattactggtgtcattgcatctttgcttagctcacaatccccagaacaggtcactattcgatgacccagattttattgtttatgtatttgacatgttgaattttcgtttaccaaaatgtgatggtctgtacttctgtttcagtgttttctgctaagccctaagagctgtggccatgatggcagtgccagtgaaagtagctcctttactagccaggatctggaaccttccatgtatgatgacttaacattggaaaagaacactggaaatgggcaacatgatgtcagaggcacacattatcacaagactaacatgaaacctgaaaaaccaattgatttgcttaggaaagttgatggcaatatcatttgtgttgattgtggttctatggaacctgattgggcatcattaaaccttggtgcacttctgtgcatagagtgctctggggtacacagaaatctcggagtgcatatatcaaaggtaattaagataattttaactgtacattctcctgtctccttgtgtgaaattccatgcagatcactttctacgtctgcatttgtaatatttgagtctagaacatcatagctttttgtgtattacatggcatgcttggggactatgttacatggggcaaaacaatgattgtccttttggccaatatgctacctggggcaaaaaatgatgattattctttggccaataagagggttaaaacaacaaaagactcaaaattgtaacagcaaattagtccaaaacaaagaactaaaagctcttagaaacgcaaagcattttgtgagttgtatttttgcggacatattcccaaggactgctataggagcatttttttcccttactgaaaatacatatattgcttgcatcattctttctgttttcttaaacagctttctggtggtctttagatgaaactcggcctcatggtacaattattgttgttgcagattataggaataatttcttatggttgacatcaatttgtatatgcatatcaccaattagattctaacagtgcctatatatttcattgaatattcaaatgtcgttgtgcattttggtttagtcattttagtatcattaactattttatagaacttaagtgtacattatattggcaggtaagatctctgacgcttgatgtcagagtgtgggaaccatctgtaatcaatctctttcaatcattaggcaacaagtttgtcaatgatgtttgggaagaagttttaccttcgtcaaaaaatggtgaatctgatgacaagttgcggtaatattacaattgttgtaaattactttacatgtttttactgccttatctatttctttccagttaatcagcactacattgttccgcagcgctcatggattagatacggcatggcacttcactgtcagcaagcctaaacactcagatcctttctctgccaaagagaagtttatccatgccaaggtacttactacctttttgcaattgagtttcatgatcagtaaaagtaatgtgagaaccaaatggtctttatggatgttcattgcaagaatgattggataaacatgattcatgatagttaacttctcaggagtaaaggcacttccttgtctaaccatgactctctttccataatgattagcagtgatctagaagaatttcataataagtcctctcttgattcaacacctcacatatatttgagagatggctttgcaacagtatatacaacttcagtgcttatgttttctttacttattcatccccaaaattttcccactccctgccagtccactacataggatggtatgatggtaggaaaagtgaatgccaaccacatgaataacatacactaaaccatagttactcttggaattggaaaatattttagttgttttatacaagcagtgtactcacaattacagaggacattatgtcttttctagaatcacaaagtggcttccttcgcatgaaaattatcaagcaaggaactccctgctgacagtgcctctgcacataatcacatatcatgcgaatacattggccttctatggtctttgtatgtgtgcttgtgtgagcctcactccatgatcttgtgaatggctgcaaacctaaccaagagaaaacaaaggatgttggttgaggttaacttaggctgatgtagaggcaacatactcatatgcagctttggttctttattacccatgggttggacttattattaatttgacaggtagttttacttcatttgcttgccctaaaaactcttttatcttgttcatggacttattttctgccacatatcatatatgtgacctaagttgtcgtctgatgctatgatacatattggcaaacaatcacaatgaaaaggggaaaactgtaatcctgaaaactgtagcattgcatataaatcaataccattttggttacatcacatgtttgatagtgcacttgtagtttaacaaaataagaataagtttttagtcactgtgatagtcagttgactatcatggaccttatgttcaagttcccaagagattattgaaaattacaactcatgagccagacaatctataatgctttgtcaataggtttattatttattattgtcctacttgtaagttgagcttaggtgctccttcaattgcataaaatatactgagttttttatgttttaaaaattccagtatgctgacaaggaatttgtacgaaagtatagcatggatgagattcagctagctcagcagatgtgggataatgtaactgcaaatgacaagagagctgtatacagtctcatcgtgcaatcccgcgccaatgtaaatttagtttatggagagatgtcctatagttcacgttcgactactggaagatcatctcagcaagagcactcttcctcaccatctgatggaagccctgtatttttcgattgccattcacatgaaaaagtttctcctagagagcccctttctcctgccagcacaagttcacgtgtagatgatggggaagaaagatgcgaaggtttctcgttgcttcatcttgcatgtcatgttgcagatgttggaatggttgaattacttttgcagtacggagctaatgtaaatgcaattgattcaagaggccggacaccccttcatcagtgtatattgaaaggaagacacatacatgctaagcttctactctccaggtatttcagtacttacatcttcagcatttatcttgcaatatgccccctaatccaaagactagtccactgcaaaagatcaactacataaaggtggtctcacttttcttcgctccgcaaaatttatgcaggggggctaatccacaagttgcggaccaagatggcaggacggcattacagtgtgccatcgacggtggaacaagcgacgacgagattcttgtgttgttagaagattatactagataaaatctggtggggaaaaagccctcacttcagtagcatttcttctgtgacacagaccacgcccgttgtgaagtcaagagtaacccggctccaggcttctcccagcttgtgttgctcaatgacccaagtttgtggcgtgaagtagcctatgggttcttctgaagcttcagcaacatgatgtgcctgctccttttcttctcctatatatataccatttcgttgccggattctcttagcgtaggctattcttatttatattcatcttgcaaacggcttggtttttgtttgcagatgattcatgcatagtatgtaagtttgtatatccatcatatcgagttgcttctttctctgtttttttgtatcatctcagaacctgaagtaggtccactagtttccatgaaggatggttggatgtacataccgagatgtgccattgtgatttattatggaatgtgaaatatcacctttttgaaaaggggggcaatttcgttcttgcctctactttgatgtcc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
