BGIOSGA002890
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA002890 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA002890, complete gene. |
| LocusTag |
P0406H10.19 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA002890-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA002890-PA |
| Length |
12955 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:4604605..4617559 |
| Sequence Coding Region |
4604605..4606268,4606754..4606952,4607064..4607123,4607366..4607470,4608222..4608362 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:4604605..4617559 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:4604605..4617559 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCCCACTGCCTCCGGGCGTCGCCCATCCTCTCCCCGCCGCCTCCCCTCCTCCACCCGTCCCGCCGCCGCCGCCACCGCGAGGGAGGCTGCATCCACACCTCCCCGGGGACGAGGCCCCTCGTCGCGCGCGCCCGCTTCGACCCGCCGCCGCTGCTCCGCCTCAAGGTCTCCGACTCCAGCGACTGCCCCGCGCCGCACCACCCGCACTCGCAGCACCAGCCGCTGCTCCCGACGCGGCGGCGGCAGCAGCAGCCGCCGCCGCCGTACCAGGCTCTCGTCGCCTCCCTCGCGCCGTTATGGCGGGAGGGGCTCTTCCTCGTGCGCTGCTCCGTCTTCGCGGCGGCGCTCTCCGTCGCCGCCGCGCTCTCCTGGTACGCGCAGCTCCGCGCCCGCTCCTTCGTCGAGTCTCGCCTCCTCCCCGCCGCGTGCGCCGCCCTGGGGGAATACCTCCAGCGGGAGGTCCACCTCGGCAGGGTGCGCAGCGTCTCCCCGCTCGGGATCACCCTCCACACCTGCTCCATCGGCCCGCACGCGGAGGAGTTCTCCTGCGCCGAGGTGCCCGTCATGAAGATCAGGGTCAGGCCATTCGCCAGCCTCAGGCGGGGGAGGGTCGTCGTCGACGCCGTGCTGTCCGAGCCCTCGGCGCTCGTGGCCCAGAGGAAGGATTTCTCATGGCTGGGGCTCCCCGCGCCATCCGAGGGCTCACCCAAGAGGCATTCGGGGGAGGAGGGGATCGATTACCGCACCAAAACGAGGCGGCTCGCGAGGGAGAAGGCCGCCGAGCAGTGGAATGAGGAGAGGGATAAGGCTGCAAGGGAAGCCGCCGAAATGGGATACATTGTTCCTAGTGCCCAATCGATTTCGCCTTCGATCGATGAGATGATGGAAGACGATGGACCTGTTGATACTGGGAAATCCAGCCCACACCTATGTCCAGATGAAATGCACAGGAAGGACCATCACATTGATGCAGGCATTGACTCCGGCTCGAAACATGCCGATTTAGAGAAATCGTTCGGCGTGAAAGCTCGTATTCCAGGGATCAGCTTCTGGTCTAGGATGATTCCAAACCCTAGCAGGCGCAGGTACAGGAGGAAGGCTCATAGCAAGTTGATATCGGACACTGACAATTCTTCTCAGCAAAGGATCCTTAGGCGTAGCGCATATGCTGCTGTTGCATATTTTCAAAACGAGTGTAGTGGTAATCCTGATGACTCTTTGCCTGGTCCTGGTGAAAGCTCATCTGATGGAGGTCATACAAATGGTGGTGGTGAGGAAGGTAGTCCAAATGATGGACCAACTGAATACTCTGAGACAACATCTATGGATTATGGTGAATTACCGCCAGAGAAAAGCAATTTCGCTAGTACAATGCTGATTGGCAATACAGATGTCTTGAATGGAAGTTCTCATAATCAACAACCTAGTCAGATTAGTTCACACTCTTGGGAAAATAATGAGCAAGTATCTGAAGCCCCTGTTTTGAAGAAACGTAAAAATATATCCGAAGATGATTACCGGCAAGAATTCGATTTTGGGGCTTTTGGTTCATGCACATATGCTCACAACTGGCTATCATTTTGGCCCTTCCAATTGAAGGGGTTTCCTGTCAGGTTCAATGCACCATCAGCTTCTCTGAATGTTCAGATCCAGAAGTTGAGGGAAATGAAACATGCTAATGGACACATCAAGTTCAAAAACAGTTATAATCGTGTACATGTGCATGTCACTGGGAACTGCATGGAGTGGAGGCAAGACCGGACTTCTCAAGGAGGGGGTTATCTTTCTACTGATGTTTTTGTTGATATAGCTGAGCAAACATGGCATGCTAATTTGAATGTAGTCAATGCTTTTGCTCCGCTGTTTGAGCGGATCCTCGAAATACCAGTTGTTTGGAATAAAGGGAGAGCTACTGGCGAGGTGCATCTCTGTATGTCGAAGGGTGATAGTTTCCCGAGCATTCATGGCCAGCTTGATGTGAAGGGCCTAGCTTTTCAGATTTTAGATGCTCCATCATCGTTTTCAGATATAGTGGCAACTCTATCTTTTCGTGGTCAAAGAGTATTTCTACATAATGCAAGTGGTTGGTTTGGTGATGCTCCGGTAGAAGCTTCTGGTGATTTTGGTCTAAATCCTGAGGATGGAGAGTTTCATCTAATGTGCCAGGTTCCATCAGTTGAAGTTAATGCACTTATGAAAACAATGAAAATGCGACCCTTAATGTTTCCGTTGGCTGGTGCTGTTACTGCCGTATTTAACTGTCAAGGGCCTCTTGATGCTCCTGTTTTTGTTGGAAGTGGGATTGTCTCAAGGAAGTCTCTTTCAGTATCTGGTATGCTTCCATCGGCAGCCTCTGAAGCTGTGATGCAAAACAAAGAGTCTGGTGCAGTGGCCGCTTTTGATCATATTCCCTTCACTCATGTTTCAGCAAATTTCACTTTCAACCTTGATAACTGCGTTGCTGATTTATATGGCATTAGAGCATGCCTTTTGGATGGTGGAGAAATTCGAGGAGCTGGTAATGTTTGGATTTGCCCAGAGGGGGAAGGTGATGATTCTGCTATGGATATTAATTTGTCTGGGAGCATTTTACTTGACAAAGTTTTGCATCGCTACATTCCTGGAGGCATCCAGTTGATTCCACTCAAAATTGGAGAGCTCAATGGAGAGACTAGACTTTCTGGTTCCCTTATTAGGCCGAAATTTGATATCAAATGGGCTGCACCAAATGCAGAAGATTCTTTTTCTGATGCGCGTGGCAATATTGTTATTGCACATGACTATATTATGGTCAACTCATCATCAGTTTCTTTTGATTTGAATACTCGTATTCAAACATCATATATTGATGATTATTTGCTGCATAAGGAGATGTATCAAAGGAAAAAAATTATGCCACTGATTGTGGAGGGTGTGGATTTGGATTTACGCATGAGGGGCTTTGAGTTTGCTCATATAGCTTCTTCGATACCTTTTGATTCACCACGGCCTCTACATTTGAAAGCATCTGGAAGGTTTAAATTTCAAGGAAAAGTGGTGAAATATAGCCAGTTAGTTGATGAGAAGAACCATGGTGCTATACAAGGTACCATTGACCAAAGTAAGCTTGAGAACGATGTATCAAGGCTTGTTGGCGAGATTTCTCTGTCAGGAATTAAACTTAACCAACTTATGCTGGCACCACAATCTACTGGTTTTCTTTCCATATCACCAGATTCTGTAATGTTAAATGCTACAGGCAGACCCGATGAAAATTTTTCCATAGAAGTGAATGTGCCATTATTTTTCGGCACACATGAGGCCATTCAAGACGGAAGGCTGTTGTCAATATTCCTCCAAAAGGGGCAGCTGAGATCTAATATCTGCTATCACCCTGACAATTTGACTAGTTTGGAGGTTCGAAATTTGCCACTTGATGAGCTGGAGTTTGCTTCATTACGTGGGTTTGTTCAGAAGGCAGAACTCCAGCTTAATTTCCAGAAAAGAAGAGGTCATGGTTTGCTGTCAGTTATCCGCCCAAAATTTAGTGGCATGCTTGGGGAATCACTTGATATAGCTGCTCGATGGAGTGGTGATGTTATTACTATGGAAAAATCAGTCCTAGAGCAAGCTAATAGCAAGTATGAACTTCAAGGGGAGTATGTTTTTCCTGGAACACGTGATAGATTCCCTATGGAAAGTCAGAGTAATGGTTTCATAGAGAAAGCGATGGGAGGGCATCTTGGTAGCATGATGTCTTCGATGGGCAGGTGGAGGATGAGATTAGAAGTACCTGGTGCTGAAGTAGCTGAAATGCTTCCGTTGGCAAGACTTCTATCACGAAGTACAGACCCAGCTATTCGTTCCAGATCAAAGGAACTTTTTATGCAAACTTTGCATTCTGTTGGATTCAATGCTGAAAGTCTTCGTGACCAGCTAAAGGCATTAGAAATGTATCCTGATTGGTTGGATGATGATACAATTGAGGATATAACTCTTCCTGGCTTAGCTGAACTGAGAGGTTATTGGCGTGGTTCTCTTGATGCCAGTGGTGGAGGGAACGGCGATACTATGGCTGATTTTGATTTCAATGGTGAAGATTGGGAGTGGGGCACTTACAAGACACAGCGTGTTCTGGCATCTGGTTCATTCAGCAATAATGATGGCCTGCGTCTTGATAAGTTATTTATTCAGAAGGATAATGCCACTCTTCATGCTGATGGATCAATTCTTGGCCCATTAACAAATCTTCACTTTGCTGTGCTTAATTTCCCAGTTGGTCTTATACCCGCATTAGTTCAGGCTATAGAATCATCAACCACAGACTCGATTCATTTTCTGAGGCAATGGTTGACACCAATCAAAGGCATTCTACATATGGAGGGAGATTTGAGAGGTACTCTAGCAAAGCCTGAATGTGATGTTCAAATAAGACTTCTTGATGGCACCATTGGAGGCATTGATCTCGGAAGAGCTGAAGTATTAGCTTCTGTAACCCCAACAAGCCGTTTTGTTTTTGATGCAAACTTTGAACCGACCATACAAAGTGGGCATGTTAACATTCAAGGTAGTGTTCCTGTTACTTATGTAGACAGCAACTCCATTGAGGAAGACCTGGAAGGGGGAGATGGTAAACAAGGTATAATAAGAATCCCTGTTTGGGCGAAAGACAGAGGCTTGACAAATGACATCAGCGAAACAAGAATCATGAGAGACAAGCCTGATGAGGGTTGGGAGTTTCAATTAGCTGAAAGCCTAAAGGGTTTAAGCTGGAATATGCTAGAACCAGGTGAAGTGAGAATAAATGCAGATATAAAGGATGGGGGTATGACACTGATAACTGCACTGAGTCCTTACTCAAACTGGCTTCAAGGCTATGCTGAAGTTCTTCTCCAGGTTAAAGGCACTGTTGATCACCCTGTTGTTGATGGGTCTGCCTCATTTCACCGTGCAACTGTGGCTTCTCCTTTCCTTCGGACACCACTGACAAATTTTGCTGGCAACGTTCA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|
| Protein Sequence |
<aaseq>MSHCLRASPILSPPPPLLHPSRRRRHREGGCIHTSPGTRPLVARARFDPPPLLRLKVSDSSDCPAPHHPHSQHQPLLPTRRRQQQPPPPYQALVASLAPLWREGLFLVRCSVFAAALSVAAALSWYAQLRARSFVESRLLPAACAALGEYLQREVHLGRVRSVSPLGITLHTCSIGPHAEEFSCAEVPVMKIRVRPFASLRRGRVVVDAVLSEPSALVAQRKDFSWLGLPAPSEGSPKRHSGEEGIDYRTKTRRLAREKAAEQWNEERDKAAREAAEMGYIVPSAQSISPSIDEMMEDDGPVDTGKSSPHLCPDEMHRKDHHIDAGIDSGSKHADLEKSFGVKARIPGISFWSRMIPNPSRRRYRRKAHSKLISDTDNSSQQRILRRSAYAAVAYFQNECSGNPDDSLPGPGESSSDGGHTNGGGEEGSPNDGPTEYSETTSMDYGELPPEKSNFASTMLIGNTDVLNGSSHNQQPSQISSHSWENNEQVSEAPVLKKRKNISEDDYRQEFDFGAFGSCTYAHNWLSFWPFQLKGFPVRFNAPSASLNVQIQKLREMKHANGHIKFKNSYNRVHVHVTGNCMEWRQDRTSQGGGYLSTDVFVDIAEQTWHANLNVVNAFAPLFERILEIPVVWNKGRATGEVHLCMSKGDSFPSIHGQLDVKGLAFQILDAPSSFSDIVATLSFRGQRVFLHNASGWFGDAPVEASGDFGLNPEDGEFHLMCQVPSVEVNALMKTMKMRPLMFPLAGAVTAVFNCQGPLDAPVFVGSGIVSRKSLSVSGMLPSAASEAVMQNKESGAVAAFDHIPFTHVSANFTFNLDNCVADLYGIRACLLDGGEIRGAGNVWICPEGEGDDSAMDINLSGSILLDKVLHRYIPGGIQLIPLKIGELNGETRLSGSLIRPKFDIKWAAPNAEDSFSDARGNIVIAHDYIMVNSSSVSFDLNTRIQTSYIDDYLLHKEMYQRKKIMPLIVEGVDLDLRMRGFEFAHIASSIPFDSPRPLHLKASGRFKFQGKVVKYSQLVDEKNHGAIQGTIDQSKLENDVSRLVGEISLSGIKLNQLMLAPQSTGFLSISPDSVMLNATGRPDENFSIEVNVPLFFGTHEAIQDGRLLSIFLQKGQLRSNICYHPDNLTSLEVRNLPLDELEFASLRGFVQKAELQLNFQKRRGHGLLSVIRPKFSGMLGESLDIAARWSGDVITMEKSVLEQANSKYELQGEYVFPGTRDRFPMESQSNGFIEKAMGGHLGSMMSSMGRWRMRLEVPGAEVAEMLPLARLLSRSTDPAIRSRSKELFMQTLHSVGFNAESLRDQLKALEMYPDWLDDDTIEDITLPGLAELRGYWRGSLDASGGGNGDTMADFDFNGEDWEWGTYKTQRVLASGSFSNNDGLRLDKLFIQKDNATLHADGSILGPLTNLHFAVLNFPVGLIPALVQAIESSTTDSIHFLRQWLTPIKGILHMEGDLRGTLAKPECDVQIRLLDGTIGGIDLGRAEVLASVTPTSRFVFDANFEPTIQSGHVNIQGSVPVTYVDSNSIEEDLEGGDGKQGIIRIPVWAKDRGLTNDISETRIMRDKPDEGWEFQLAESLKGLSWNMLEPGEVRINADIKDGGMTLITALSPYSNWLQGYAEVLLQVKGTVDHPVVDGSASFHRATVASPFLRTPLTNFAGNVHVISNRLCISSMESRVGRKGRLSMKGTLPLHNSEPSANDKIELKCEVLDIRAKNILSGQVDSQLQVTGSILRPDVSGMIRLSHGEAYLPHDKGNGAVATRLSSNKSISVPAGFDQRTVSRDVSHFLGSLSTSPDGQQSETERTPEHGSFKPNIDARLNDLKLTFGPELRIVYPLILNFAVSGDLELNGMVHPKYIRPKGVLTFENGEVNLVATQVRLKNDHLNVAKFEPDLGLDPILDLVLVGSEWQFKIQSRASMWQDNLVVTSTRSVDQDVLSPSEAAKVFESQLAESLLEGDGQLAFKKLATATLETLMPRIEGKGEFGQARWRLVYAPQIPSLLSVDPTVDPLKSLANNISFATEVEVQLGKRLQASVVRQMKDSEMAMQWSLIYQLTSRLRVLFQSTPSNRLLFEYSATSQG</aaseq> |
| Gene Sequence |
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