Os08g0541300
| Gene Name |
Os08g0541300 |
|---|---|
| Description |
Leucine rich repeat, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001068921.2 GI:297608905 GeneID:4346191 |
| Length |
3454 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0541300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:27174415..27177868 |
| Sequence Coding Region |
27174431..27177253 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaaaatactatgaatggattgcttatggctttggctctgttgtgcttaaccatcaatttcagggagatagctgcgtgcatctccacagagagggatgctttggttgccttcaacaccagtatcaaggatcctgatgggcggctacactcatggcatggcgagaactgttgcagctggagtggtgtcagctgcagcaagaagactggccatgtcatcaagctggacctcggcgagtacactctcaatggtcagatcaatccatcgttgtctggtctgacaagattggtgtacctcaacctgagtcaaagtgacttcggtggggtgcccatcccagaattcatcggctgtttcaagatgttgaggtatcttgatctctcgcatgctggttttggtgggactgtccctcctcagcttggcaacttgtcaaggctcagctttcttgatctgagctcatctggttctcatgtgatcactgcggacgatttccagtgggtttcgaagctaacttccctgaggtatctcgaccttagttggttgtaccttgctgcttctgtggattggctgcaggctgtgaatatgcttcatttgctggaagtgcttcgcttgaatgatgcaagccttccagctacggaccttaattctgtttctcagatcaacttcactgcccttaaagtaattgatctcaagaataatgaactgaattcttccttaccagattggatttggaatctatcttccctttcagatttggacctgtctagttgtgaactttcaggcaggattcctgatgagctagggaaactagcagcactacagtttattggactagggaacaacaagctgaatggagcaataccacgttcaatgagcagattatgcaacttagttcacatagatctttctagaaacattttgtcaggaaatctctcagaagcagcaaggagcatgtttccctgcatgaagaagttgcagatccttaaccttgctgataacaaattaactggacagctatctggttggtgcgagcacatggcaagtctagaagttcttgatctcagtgagaattcattatctggagtattaccaactagcattagcaggctatcgaacttgacatacttggatatttccttcaacaaacttattggtgaattatcagaactccactttaccaatttatcaagattggatgctttagttttagcatcaaattctttcaaggttgtagtcaagcatagctggtttccaccctttcagctcacaaagctaggactgcatggttgcctggttggaccacagtttccaacctggctgcaatcacaaactagaatcaagatgattgatcttggcagtgcaggcatcaggggtgcattgccagattggatctggaacttctcttcgccaatggctagcttaaatgtctcgatgaacaacataactggtgagttgcctgcaagtttggtgcgatcaaaaatgctgataactctgaacattaggcataatcaacttgagggatacattcctgatatgccaaatagtgttcgagtgctggatctatcccacaacaacttgtctggatcattaccacaaagctttggagacaaagaattgcaatacctgtcgctctctcataattctctcagtggagtaatcccggcatatctatgtgacataatatcaatggaactgattgacatatccaataacaatctttcaggggaacttccaaattgttggcgtatgaattccagtatgtatgtcatagacttctccagcaataatttttggggtgaaataccatccactatgggctctctaagttcccttacagcattgcatctcagcaagaacagcttatctggattgttgcccacctcattgcagtcatgtaaaagattgttagtccttgacgttggagagaataatttgtcaggatacataccaacatggataggcaatggcctacaaactctactacttctgattttagggtcaaatcagttttccggtgaaatacctgaagaattatcccaacttcatgcccttcaatatctggatcttagtaacaacaaactctctggctctataccacgttctctgggaaaactaacgtcctttctctcacgaaatctagaatgggactcatcgccttttttccaattcatggtttatggcgttgggggcgcttacttttctgtgtacaaagatactttacaggcaaccttcagaggttacagacttactttcgtgatatcattcctccttaccagtattgatctttcagagaaccatttaaccggggagatacccagtgaaataggaaatctttacagactagcgtccttaaatctatcaaggaatcacattgagggaagtattcctgaaacaatcggaaatctggcctggttagaatcacttgatctctcatggaatgatctatcaggcccaattcctcagagcatgaagtcactgttatttttgagcttcctgaatctatcctacaaccacctctcaggaaagataccatatggaaaccaacttatgacttttgaaggagactcttttttgggaaatgaagatctctgtggggctccacttacaagaagctgccacaaggacagcgacaaacacaaacatcatgagatttttgacacgctgacatacatgtttactctgctgggatttgcgtttggattctgcaccgtttcaaccaccttcatattcagtgcagcttccaggagagcctattttcagttcactgacaacatatgcaactggttggttgctgtacttgagaggaagctcagtttaattagataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MENTMNGLLMALALLCLTINFREIAACISTERDALVAFNTSIKD PDGRLHSWHGENCCSWSGVSCSKKTGHVIKLDLGEYTLNGQINPSLSGLTRLVYLNLS QSDFGGVPIPEFIGCFKMLRYLDLSHAGFGGTVPPQLGNLSRLSFLDLSSSGSHVITA DDFQWVSKLTSLRYLDLSWLYLAASVDWLQAVNMLHLLEVLRLNDASLPATDLNSVSQ INFTALKVIDLKNNELNSSLPDWIWNLSSLSDLDLSSCELSGRIPDELGKLAALQFIG LGNNKLNGAIPRSMSRLCNLVHIDLSRNILSGNLSEAARSMFPCMKKLQILNLADNKL TGQLSGWCEHMASLEVLDLSENSLSGVLPTSISRLSNLTYLDISFNKLIGELSELHFT NLSRLDALVLASNSFKVVVKHSWFPPFQLTKLGLHGCLVGPQFPTWLQSQTRIKMIDL GSAGIRGALPDWIWNFSSPMASLNVSMNNITGELPASLVRSKMLITLNIRHNQLEGYI PDMPNSVRVLDLSHNNLSGSLPQSFGDKELQYLSLSHNSLSGVIPAYLCDIISMELID ISNNNLSGELPNCWRMNSSMYVIDFSSNNFWGEIPSTMGSLSSLTALHLSKNSLSGLL PTSLQSCKRLLVLDVGENNLSGYIPTWIGNGLQTLLLLILGSNQFSGEIPEELSQLHA LQYLDLSNNKLSGSIPRSLGKLTSFLSRNLEWDSSPFFQFMVYGVGGAYFSVYKDTLQ ATFRGYRLTFVISFLLTSIDLSENHLTGEIPSEIGNLYRLASLNLSRNHIEGSIPETI GNLAWLESLDLSWNDLSGPIPQSMKSLLFLSFLNLSYNHLSGKIPYGNQLMTFEGDSF LGNEDLCGAPLTRSCHKDSDKHKHHEIFDTLTYMFTLLGFAFGFCTVSTTFIFSAASR RAYFQFTDNICNWLVAVLERKLSLIR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>17..2839#agttttatccaccaacatggaaaatactatgaatggattgcttatggctttggctctgttgtgcttaaccatcaatttcagggagatagctgcgtgcatctccacagagagggatgctttggttgccttcaacaccagtatcaaggatcctgatgggcggctacactcatggcatggcgagaactgttgcagctggagtggtgtcagctgcagcaagaagactggccatgtcatcaagctggacctcggcgagtacactctcaatggtcagatcaatccatcgttgtctggtctgacaagattggtgtacctcaacctgagtcaaagtgacttcggtggggtgcccatcccagaattcatcggctgtttcaagatgttgaggtatcttgatctctcgcatgctggttttggtgggactgtccctcctcagcttggcaacttgtcaaggctcagctttcttgatctgagctcatctggttctcatgtgatcactgcggacgatttccagtgggtttcgaagctaacttccctgaggtatctcgaccttagttggttgtaccttgctgcttctgtggattggctgcaggctgtgaatatgcttcatttgctggaagtgcttcgcttgaatgatgcaagccttccagctacggaccttaattctgtttctcagatcaacttcactgcccttaaagtaattgatctcaagaataatgaactgaattcttccttaccagattggatttggaatctatcttccctttcagatttggacctgtctagttgtgaactttcaggcaggattcctgatgagctagggaaactagcagcactacagtttattggactagggaacaacaagctgaatggagcaataccacgttcaatgagcagattatgcaacttagttcacatagatctttctagaaacattttgtcaggaaatctctcagaagcagcaaggagcatgtttccctgcatgaagaagttgcagatccttaaccttgctgataacaaattaactggacagctatctggttggtgcgagcacatggcaagtctagaagttcttgatctcagtgagaattcattatctggagtattaccaactagcattagcaggctatcgaacttgacatacttggatatttccttcaacaaacttattggtgaattatcagaactccactttaccaatttatcaagattggatgctttagttttagcatcaaattctttcaaggttgtagtcaagcatagctggtttccaccctttcagctcacaaagctaggactgcatggttgcctggttggaccacagtttccaacctggctgcaatcacaaactagaatcaagatgattgatcttggcagtgcaggcatcaggggtgcattgccagattggatctggaacttctcttcgccaatggctagcttaaatgtctcgatgaacaacataactggtgagttgcctgcaagtttggtgcgatcaaaaatgctgataactctgaacattaggcataatcaacttgagggatacattcctgatatgccaaatagtgttcgagtgctggatctatcccacaacaacttgtctggatcattaccacaaagctttggagacaaagaattgcaatacctgtcgctctctcataattctctcagtggagtaatcccggcatatctatgtgacataatatcaatggaactgattgacatatccaataacaatctttcaggggaacttccaaattgttggcgtatgaattccagtatgtatgtcatagacttctccagcaataatttttggggtgaaataccatccactatgggctctctaagttcccttacagcattgcatctcagcaagaacagcttatctggattgttgcccacctcattgcagtcatgtaaaagattgttagtccttgacgttggagagaataatttgtcaggatacataccaacatggataggcaatggcctacaaactctactacttctgattttagggtcaaatcagttttccggtgaaatacctgaagaattatcccaacttcatgcccttcaatatctggatcttagtaacaacaaactctctggctctataccacgttctctgggaaaactaacgtcctttctctcacgaaatctagaatgggactcatcgccttttttccaattcatggtttatggcgttgggggcgcttacttttctgtgtacaaagatactttacaggcaaccttcagaggttacagacttactttcgtgatatcattcctccttaccagtattgatctttcagagaaccatttaaccggggagatacccagtgaaataggaaatctttacagactagcgtccttaaatctatcaaggaatcacattgagggaagtattcctgaaacaatcggaaatctggcctggttagaatcacttgatctctcatggaatgatctatcaggcccaattcctcagagcatgaagtcactgttatttttgagcttcctgaatctatcctacaaccacctctcaggaaagataccatatggaaaccaacttatgacttttgaaggagactcttttttgggaaatgaagatctctgtggggctccacttacaagaagctgccacaaggacagcgacaaacacaaacatcatgagatttttgacacgctgacatacatgtttactctgctgggatttgcgtttggattctgcaccgtttcaaccaccttcatattcagtgcagcttccaggagagcctattttcagttcactgacaacatatgcaactggttggttgctgtacttgagaggaagctcagtttaattagataatgtgagaggaagctcaatatcagcagagtatcattggcaccacgctgtcaggagtcccatcatcactttctatcacttggaaaaaccttacactactactccctccctccttgaatatttgacgtcgttgacttttttaaatatgtttgaccgttcatcttatttaaaaaatttaagtaattattaattcttttcctatcatttgattctttgttaaatatacttttatgtatacatatagttttatatatttcacaaaagtttttaataagacaaacggtcaaacatgtttaaaaaaaatcaacggtgtcaaatatttagggagtatttattagaacgtctggtgactcgaatagcttgtttgatcgcatcaactatatatattactaccaggatgatgatgtttgtacaataattcggccaagccctgcaatctggccatgtttttatgttttatgtcagaagaataaaccctacggtggtagtagggattacgaaccagcgattgagctgcataatcgcaaatttgcaatgtatgcagttgtgtttttactctctgatcatgtgttttctgtctgacagtttacacatgttattatcgaaagtataattatg</dnaseqindica> |
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