BGIOSGA003072
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA003072 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J033025F17, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003072, complete gene. |
| LocusTag |
P0431F01.23 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003072-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003072-PA |
| Length |
11400 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:7819232..7830631 |
| Sequence Coding Region |
7819232..7819340,7820226..7820341,7820420..7820485,7820894..7820984,7821271..7821338 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:7819232..7830631 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:7819232..7830631 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCTAGCTTCACTCACTTCATCTCGCTTCCGTTGGGTATCCACCCACAACTTGTTGATAAGCTGAATGAATTCAAGAGGTCAATCCTGACTTCTAATGAATATAAAGCTGCAGGTTTCCGCATCGACGAGTCAATATTTGCTATTCCCGAATCACTTCACCTAACGGTTCTTATGTTGGATCTAAAGGGTGAGAACATTGCTAAGGCTTCCAGTGTGCTCCAGTCAGTATCGGACAAACTAATGGAAGCCTTGAAAAACAGACCTATCTCCATACAGCTTAGAGGTCTGGCATGCATGAAAGGCTCACCAGATGAGGCCTGGATAGTATATGCTCCTGTGCTGGAAGTTGGTGAACAGGGACGCCTACAACAAGTTTGCGACATTATAATTGATGCCTTTACCAGCTCAAACCTAGCACCTACAAGTGATGAGAAGCGAGAACTGAAGTTGCACGCTACCGTGATGAATGCAAGGTTCAGGAAGAGCTGTCCGGATGCTTCATTTGATGCTCGGAAGATATTCGAAAAATACGCGGAACATGAATGGGGCGAATATCTCATTCCCGAGATTCATCTTTGTCAGAGACGCAGGTTTAGTCCTACATCGATAATTGATGATGAGGGAGCACGATTTAAAATGTTTAGTCGGCTCGCTCGCCCTCTATGCGCCGCGGGTTCCGCGCCGCGCTTCCTCCAGGGATCTGTTAATCAAAATAGTATTCACTCACTTGTAATGGAAGGTGCACAAGGAGCCTCAAATAATTCGGCAAAACACAAGAAAAGAAAGTCTGCTGTGCAGAGATGGAGGCCAATCTCCACAGAAGCCGCTACTCCAAAAGCTGACCTTAATGAGATGTCAGGTCCTGTAAGCAAACAAGTGGAAGAGAATTCAGCCTCAGATGGAACAACTAATGTTGTTATTGAAGTTTCCACCTACAATGCATCCTTGCCAGAAAATAAATTAGCCACAGAAGATACTATGGAGGATGCTAGCTTCAATAAGGACATAGATAGGTCCAATCTATCTGAAAAGTGTTCCTCTTCTGTTCAGGTAGATGCTCCTCTGATGCGCTTTGTGAAAGGAAAAGGTGGAACCATGCAGAAGCAGATTGAAGATGAAACTGGGGTCAAAATTATATTTCCATCTTCTAAGGAGGAAACATGTGTTGTTCTTGAAGCTAAAACTACTGAAGATATTAGAAAGGCTTCAGAGAAAATTGCAAAGGTTCTTGAAGAGGCCGTGAAAAGTCCAATACTAGATTACTCTCACTTCATTTCGCTTCCATTGGCTATCCACCCAAGCCTTGTTGAGAAGCTGAACCACTTCCAGTGCTCAATCCTTGGGACTTCTTCTAATGTAGATAGTGATAAGGGTGAGGACCTAAGTGAAGGTTCTATGGATGAAATTGACCATGAACAGAAGCAAGAAAGGAGCCCTAGTGTTTCAATAAAGATGCAAGCCCATGAGGAGTCTGTCAGAGTTAAAATGGATATTAAGGGCTCCCAACCAGACTTCGGCATTGACAAGTCAATATTTATTAAACCCAAAACCTTTCACCTAACGGTTCTTATGTTGAAGCTATGGAATAAGGATCGCATTGCTAAGGCTTCTGATGTGCTCCAGTCAGTATCGTCCCAAGTAATGGAAGCCTTGGAAAACCGACCAATCTCCATACAACTTAGAGGTCTGACATGCATGAAAGGCTCACCAGCTAGGGCCAGGGTAGTATATGCTCCTGTGCTGGAAGTTGGTGAAGAGGGACGCCTACAACGTGCTTGCAAAGTTATAACTGATGCCTTTGTCAAGTCGGGCCTAGTACTTGAAAGGGATGCGAGGCAAGAATTGAAGTTGCACGCGACCATAATGAATGTGAGGCACAGGAAGAGCAAGAGATGGAACCAAAGAAATGACTCATTCGATGCTCGGAATATTTTCAGAAAATATGGGGAACATGACTGGGGCGAATACCTCATTCCCGAGATCCATCTTTCGCAGCGATTCAAGTTCGATGAAAGAGGGTACTACTACTGCTGCTCTTCAATCCCCTTGCCTGCGGCGGAGATGCAAACGGAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSFTHFISLPLGIHPQLVDKLNEFKRSILTSNEYKAAGFRIDESIFAIPESLHLTVLMLDLKGENIAKASSVLQSVSDKLMEALKNRPISIQLRGLACMKGSPDEAWIVYAPVLEVGEQGRLQQVCDIIIDAFTSSNLAPTSDEKRELKLHATVMNARFRKSCPDASFDARKIFEKYAEHEWGEYLIPEIHLCQRRRFSPTSIIDDEGARFKMFSRLARPLCAAGSAPRFLQGSVNQNSIHSLVMEGAQGASNNSAKHKKRKSAVQRWRPISTEAATPKADLNEMSGPVSKQVEENSASDGTTNVVIEVSTYNASLPENKLATEDTMEDASFNKDIDRSNLSEKCSSSVQVDAPLMRFVKGKGGTMQKQIEDETGVKIIFPSSKEETCVVLEAKTTEDIRKASEKIAKVLEEAVKSPILDYSHFISLPLAIHPSLVEKLNHFQCSILGTSSNVDSDKGEDLSEGSMDEIDHEQKQERSPSVSIKMQAHEESVRVKMDIKGSQPDFGIDKSIFIKPKTFHLTVLMLKLWNKDRIAKASDVLQSVSSQVMEALENRPISIQLRGLTCMKGSPARARVVYAPVLEVGEEGRLQRACKVITDAFVKSGLVLERDARQELKLHATIMNVRHRKSKRWNQRNDSFDARNIFRKYGEHDWGEYLIPEIHLSQRFKFDERGYYYCCSSIPLPAAEMQTE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..109#995..1110#1189..1254#1663..1753#2040..2107#2797..2834#2920..3024#4379..4426#5718..5775#6385..6526#6738..6949#7067..7104#7222..7301#7397..7464#8852..9125#9659..9771#9852..9917#10134..10224#10682..10749#11097..11134#11211..11400#ATGTCTAGCTTCACTCACTTCATCTCGCTTCCGTTGGGTATCCACCCACAACTTGTTGATAAGCTGAATGAATTCAAGAGGTCAATCCTGACTTCTAATGAATATAAAGGTAAGGATAGGGACCTAAGTGAAGTTCTATACTTCTATAGTTCTATGGATGAAATGTACTATTAACACAAGCAATTAGAAAGGCCTAGTGTTTCAATAGAATGCAAGTTCAAGCATAGGAGTCTGTCAGAGTAAAAGAGGATAAATAAGGGCTTCTGCCCTGGTCTAAAATCTTTGCTGATTTTGCAAGTGCTTAATGTTCCATTTCAACTCTAGAAAGTCCACTTTTGGAACTTCCTAGTGTTGTGTCTGTGTCAATAATTGCATTTTTATATAAGTACTCCACAGCCCACACATGTGTAGGTTGTTTGATGAGGGAACACACGACCGTTTTAGGCTAAATAGAAATAATAGTAAAGAAGTTTATATGCATATGGATTTTTGTAAATACCCTCCAACTCCAATTGCGTGAACAAAGCATAACAGAGAAATTTGAAGATGGCCATGTTCTCATTTCTTTCAGTACAAATCAACTAACTAGGGCATGTTTATGAAGAAAGCAAGATGCGCAGCTTTAGTTTAAGTTGTCAATTCGACAGTTTTGTATCTGAAGTTCTGTTCTTATTCGTAACATACCACACTGTTGATTTTGGAAATGATAGATTCTACTGAATTGCTGATGTGAGATAACTGCACCAGTAGCTTGCTATTTAATAATGAAAATAATAAGGTGAGCTAGTGGAAATTATTGAAGTTTGGTGGGTCAGGAAAAAAGAAAAGAAACTCTTGTTTGCAGAACAAATCTTGTATCTGTATTTCGGTTTCTACATTTTTGTTGTATACCTGTGGCATCTTGGCAGTACTAAATGCATTGCTTGTTATACCATTTCCACATTACAAATTCTACACTCTTCAGCATTGAACTAAGTTTTTTTATCACTTGCAGCTGCAGGTTTCCGCATCGACGAGTCAATATTTGCTATTCCCGAATCACTTCACCTAACGGTTCTTATGTTGGATCTAAAGGGTGAGAACATTGCTAAGGCTTCCAGTGTGCTCCAGGTATTTTTCATTTTAGGATTATTATGTTATTGCCTGAGACGACAGTAAGGAACTTAATGCGTTACCTGGTGGATGCAGTCAGTATCGGACAAACTAATGGAAGCCTTGAAAAACAGACCTATCTCCATACAGCTTAGAGGTCTGGTAAGTTGCCATTCTTGAACAGTTTTGGCTGTAAGCTCATTTGGGCGTATACATTTGGAAGAACAAATATAGATATTCGAGGCAGAGAACAAAGGATTTGTTCCTGAACACTTTGCTCACCATAGTTTGTTCTGAGAAACGTCCAGTGGTCTTCTGACTAGCTCCACAAGATGGTGGGCTAGCCAACCTGGGTTCGAAGCCTCACCCCTTCTAATTATTTGATATTAGGTCATTTCCTAATATTCGTGTTTTTTTTCCTCACCATAGTCTGTAATCTCCTTTGATAAAGATGCTATTGCTGTGAAGCACATTTTAATTAATACTAGTACCTATTCATAAAAGGTATATGCACCTTTTATCCCACTTTTTCCAATGATTCAAAGTTCCAACAAGAATATTTCATTCCAGGCATGCATGAAAGGCTCACCAGATGAGGCCTGGATAGTATATGCTCCTGTGCTGGAAGTTGGTGAACAGGGACGCCTACAACAAGTTTGCGGTATCCTTTGAACTTCTAACAAACATTCTTGGGGACATATGATGTGAAAACTCATGTTTTCAATACAATCTTAATTACAAAGTCGCACCTGTACAGTTTGAGATGTCTTACTGATGGAACATGTTTTTTAGGTGGTAGAGGCCCTCATAAATCATGTATTCAACATGTGAGCCATCGCTTAACATACAGCCCACATGAAAAGCTTGCATTTATTGCACTTGTAGTTGATAAATTCCAATCTTTTTTATGCAAAATGTTGTTCCTTCACTTCCTTTTACTTAATCAGACATTATAATTGATGCCTTTACCAGCTCAAACCTAGCACCTACAAGTGATGAGAAGCGAGAACTGAAGGTTAGTAAATACTGCCTCCAACCAAAAATGTATGACGTTGGTTAGTATATTTTTAACTAACCAACATCATACAAAAAGAAACGGATGGAGTATATATATATATATCTAAGCATTTCTCTCTTTCGTTTCCATGACATCAACATATACTCCCTCCGTTTCTAAATATTTGACGCCGTTGATTTTTTTAAATATGTTTGATCGTTCATCTTATTCAAAAAAATTAAGTAATTATTAATTCTTTTTCTATCATTTGATTCCTTGTTAAATATACTTATATGTATACATATAGTTTTACATATTTCACAAAAGTTTTTGAATAAGACGAACGGTCAAACATGTGCTAAAAAGTCAACGGTGTCAAATATTTAGAAACAGAAGGAATAGTTTTTCTCTGAAGCTAATAGTTGTTCTGAAAGCTGTATTGTCTACCAAAATCATATTGAAATGGCAGATAACATCTTATTGTCAATAAAACTGTAGTCTAGTTCAACTATTGGATGAGTCTAGAATGCACATTTTGCACAATATTGTTGTGTTATATTTTATTTCCAAAAAAACTTTGTTACTAACTTAAGTACTTCCATTATTGTTCTTGATTTTCCTTTTGTGGTTGTTTGGCGAAATATTAAGCATTTTACTGAAACAGCAACATTTGACGCTAAAATTGCCATCCTCTTCTCAAACTGCAGTTGCACGCTACCGTGATGAATGCAAGGTTCAGGAAGAGGTAACACAGTAAATCTTCTCTCTGCATCTTGATAATTCATCGTCTATGTACCACGAGCTTACCTTGACTACCTTGTTCTCTGCAGCTGTCCGGATGCTTCATTTGATGCTCGGAAGATATTCGAAAAATACGCGGAACATGAATGGGGCGAATATCTCATTCCCGAGATTCATCTTTGTCAGAGACGCAGGTTTGATGAAAGTGGACACTACTACTTCTGCTCTTCGCTTCCCTTGCCCGGGAATATGCAAGCGGAGCGAGCCTCGGAATAACCATTTCGCGGTGCTGAAATAATTCACCAGTATCATCCCCCAAGGATGAAACTGCGGTTTACTATTACTGAACCAATAATGTGCCATTGTTGGTGTGGCATTCTTGAGTGAGTGAGTTCATATAGGTCTTTTCTTTTGATAGTGGAATAAGCAGCCATGCATAATCCTGTGTGGCAACTCTTCGGTTTTTTTTTCCTTCTTAATATGAAGCAGGAGCTACCTGCACTCCTTTATGAGGTTTAGTACCTCAAAAATAATCCTGTATGGTGTTGTAAACCTGTTGTTGGTCTGGACCTTGTACAATCACACTACTGCAAGTTTATTTCTCTGTTGTTTTTACTAATATATCTTCAGTTTGAACTCATCAATCATCTTAGCTCCCATGTGCCGTTTTGCTGCTGTTCTGGGCTGGAGGTAGCCGTGCTATTGCATGTTCAGCGTTCTTGAAATTCTTTTCAAAACTCAATCCATCATTTTGAGAGTGTTTTCGCGGCTGGCTTTCTCACTGGCAGGTGGGCCCTGGTCCTGCATGTCAGTGGGAGCATTGAACCGCAGAAATGAAATGTGATCTCCCCCTTGAAAGCCTTGACTCTTAGAGCTTCGATCACTCCTACGTGATGCTGCCTGTGGGTGTGATGTCTGACAGAGAAAGAACATCACCGGCCTACGAACCAAAATTTGAATATGTATGCAGAAGTGCAGAGAAAAAGACAGGGTTGCAGCTGTATCTTGTTAATTTGGCACCAGGAATTATCTTTTTTTTTTCCTGCATCAAAGCAGATGTCAACAGTGCAAAAACATACTATCACTTAGCACAAGAGTGGCCAGAGTATGTGATGAGAGAATCATGTATATAAGAAAAAAGTTAGCAATGTTGAACTTATTAGAATGGCCAATCAACAATAGCACCGGTTCAAGTTGGATCGGAGTAAATTAGCGCGCACTATACAATTACAAAAAGGTCGGTAGCTAAGCTGATGACAAGGAAGAATTTCAAAAAGGAAAATATTAGATTGTAGAATAATTAGTATGAGATGATCACGGCAAGAACAATTTTTCGTAGCTGATAGAAGGAATGAGAGAACCTAAGGCTATAGGCTAACAATTACATAGATTTACTCTACAAAGCACAAAGGTCTATAAAGGTATACGGTCACTAGTTTTTCTTGTCTACAGTTTGCCATCAGTAACAGATATCGGTACCTGAGAGAGAACCTAAGGCATTCTAATTTGAAGTCAAAATGCACCTTGCAAAATCGTTGGTAATGTTAGGTTTAGTCCTACATCGATAATTGATGATGAGGGAGCACGATTTAAAATGTGAGTGTGGTCCTCATCCATCAGACTAGTCTTTTTGTGTTGTGTAGACCCAGGACCTAAAGTTGTGGCTCCAGTTGGGCCTGTGATAGAGCAGGTCCAATGTGACCTGGGTGGCCCATAGTTAGTGGACCAGGCTGCGCACTCTAATAGGTAAAATAGCACTGTCATGTTCTAAAATATAAGATTTTTTTTATTGGATAAGACTCTCATGTTCTAAAATATAAGATTTTTTTTATTGGATAAGACACATACGTCTCTTATATTTTAGGATGGCAGGGGTAATAATTAGTTTCATATCAAAATTCATCGATAATGCACAAGTGATT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